Synchronisation in der embryonalen Entwicklung
Studie zeigt, wie Zellen sich während der Entwicklung synchronisieren, was die Gewebebildung beeinflusst.
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Inhaltsverzeichnis
Synchronisation ist ein wichtiges Konzept, das in vielen verschiedenen Bereichen der Wissenschaft, einschliesslich Biologie, auftaucht. Ein besonders spannendes Beispiel für Synchronisation findet während der Entwicklung von Wirbeltierembryonen statt. In diesem Prozess beginnen Gruppen von Zellen im Mesoderm, einer der Schichten, die während der Embryonalentwicklung gebildet werden, ihre Aktivitäten zu koordinieren. Diese Zellen verhalten sich in einem rhythmischen Muster, das beeinflusst, wie sie wachsen und sich in Strukturen wie die Wirbelsäule organisieren.
Die Segmentierungsuhr
Ein spezifischer Aspekt dieser Synchronisation ist die Segmentierungsuhr, ein System, das hilft, Somiten zu bilden. Somiten sind die Bausteine für Strukturen wie Wirbel, Muskeln und Haut. Die Segmentierungsuhr funktioniert durch einen molekularen Mechanismus, bei dem Zellen bestimmte Gene rhythmisch ein- und ausschalten. Im Laufe der Jahre hat die Forschung gezeigt, dass mehrere Signalwege und Proteine für diesen Prozess entscheidend sind.
Einer der wichtigsten Signalwege ist der Notch-Signalweg. Dieser Weg wurde in vielen verschiedenen Arten gefunden, darunter Hühner, Mäuse, Zebrafische und Schlangen. Die Aktivität des Notch-Weges hilft den Zellen, miteinander zu kommunizieren, sodass sie synchron bleiben können. Das funktioniert über einen Rückkopplungsmechanismus mit Proteinen, die als Hes-Familie bekannt sind. Diese Proteine helfen zu regulieren, wann Gene ein- oder ausgeschaltet werden, und erhalten das rhythmische Verhalten der Zellen aufrecht.
Fragen zur Synchronisation
Während Wissenschaftler bedeutende Fortschritte beim Verständnis der Details gemacht haben, wie diese molekularen Oszillatoren funktionieren, gibt es immer noch einige grundlegende Fragen, die unbeantwortet sind. Zum Beispiel, wie wissen die Zellen, was ihre Nachbarn tun? Beschleunigen oder verlangsamen sie sich basierend auf der Aktivität benachbarter Zellen? Ausserdem, ist die Kommunikation zwischen den Zellen gleich, oder variiert sie je nach Situation?
Um diese Fragen zu untersuchen, wollten Forscher die Regeln der Synchronisation zwischen zwei Oszillatoren herausfinden, die ähnliche, aber leicht unterschiedliche Verhaltensweisen aufweisen. Sie verwendeten ein theoretisches Modell namens Kuramoto-Modell, das oft zur Untersuchung von Synchronisation genutzt wird. Laut diesem Modell passen sich zwei Oszillatoren durch eine Art Verbindung an, die entweder helfen kann, sie auszurichten oder eine Differenz zwischen ihnen zu erzeugen.
Experimenteller Ansatz
Um ihre Ideen zu testen, entwarfen die Forscher ein Experiment mit einer Methode namens Randomization Assay For Low input (RAFL). In diesem Setup nahmen sie Zellen aus zwei verschiedenen Embryonen und mischten sie zusammen, während sie ihre ursprünglichen Phasen im Auge behielten. Das machte es möglich zu sehen, wie sich die gemischten Zellen im Laufe der Zeit verhielten und wie sich ihre Rhythmen veränderten.
Die Forscher überwachten die Oszillationen in Echtzeit und verglichen das Verhalten der gemischten Zellgruppen mit den unmischten Gruppen. Dadurch konnten sie die Auswirkungen der Synchronisation kontrolliert untersuchen.
Ergebnisse zur Synchronisationsdynamik
Durch ihre Experimente fanden die Forscher einige interessante Muster. In vielen Fällen, wenn sie Zellen aus verschiedenen Embryonen mischten, dominierte eine Zellgruppe und zog die andere Gruppe in Synchronisation mit ihrem Rhythmus. Dieses Ergebnis war überraschend, da es darauf hindeutete, dass es ein Ungleichgewicht in der Synchronisation gab. Die "gewinnende" Zellgruppe behielt ihren Rhythmus bei, während die "verlierende" Gruppe ihre Aktivität anpasste, um mit dem Gewinner übereinzustimmen.
Diese sogenannte "Gewinner-nimmt-alles"-Synchronisation wurde im Rahmen des Kuramoto-Modells nicht erwartet, das ein anderes Ergebnis prognostizierte, bei dem beide Oszillatoren ihre Phasen im Durchschnitt anpassen würden. In Fällen, in denen die Oszillatoren fast in entgegengesetzten Phasen waren, verschob die verlierende Gruppe ihre Phase dramatisch, um sich mit der gewinnenden Gruppe auszurichten.
Theoretische Modellierung der Kopplungsregeln
Um diese ungewöhnliche Form der Synchronisation besser zu verstehen, griffen die Forscher auf mathematische Modellierung zurück. Sie erstellten ein vereinfachtes Modell, das das Verhalten der Oszillatoren in der gemischten Gruppe erfasste. Dieses neue Modell, das Rectified Kuramoto (ReKu)-Modell genannt wird, wurde entwickelt, um die in den Experimenten beobachtete Asymmetrie zu berücksichtigen.
In diesem Modell war die Reaktion der Oszillatoren aufeinander nicht einheitlich. Stattdessen bevorzugte es einen Oszillator gegenüber dem anderen, basierend auf ihren anfänglichen Phasen. Das Modell erlaubte die Möglichkeit, dass ein Oszillator unverändert blieb, während der andere sich seinem Rhythmus anpasste. Diese doppelte Asymmetrie in den Kopplungsregeln half, die Dominanz zu erklären, die in den experimentellen Daten zu sehen war.
Untersuchung anderer Modelle
Obwohl das ReKu-Modell die experimentellen Beobachtungen gut erklärte, schauten die Forscher auch auf andere Kopplungsmodelle, um zu sehen, ob sie die Ergebnisse erklären konnten. Eine Alternative war das Kuramoto-Sakaguchi (KS)-Modell, das eine Phasenverschiebung in der Kopplung einführt. Dieses Modell konnte jedoch das Verhalten, das in den Experimenten zu sehen war, nicht erklären, insbesondere bei Phasenverschiebungen, die nahe beieinander lagen.
Eine weitere Alternative war das Puls-Kopplungsmodell, bei dem ein Oszillator nur zu bestimmten Phasen starke Signale sendet. Während dies zur Synchronisation führen könnte, benötigte es eine sehr starke Kopplung, um Ergebnisse zu erzielen, die den experimentellen Ergebnissen ähnelten. Daher kamen die Forscher zu dem Schluss, dass die doppelte Asymmetrie im ReKu-Modell entscheidend für die Erklärung der beobachteten Synchronisationsdynamik war.
Verknüpfung der Ergebnisse mit biologischem Kontext
Diese Ergebnisse haben weitreichende Implikationen für das Verständnis, wie Synchronisation in lebenden Systemen funktioniert. In lebenden Embryonen können sich, während die Zellen sich entwickeln, ihre rhythmischen Verhaltensweisen im Laufe der Zeit ändern. Dies führt zu Mustern, die beeinflussen können, wie Strukturen wie die Wirbelsäule und Muskeln entstehen.
Interessanterweise zeigten die Experimente, dass Zellen ihre Rhythmen anpassen können, um sich zu synchronisieren, aber das muss nicht unbedingt das Gleiche bedeuten, was in vivo (in einem lebenden Organismus) passiert. Die Prozesse in echten Embryonen könnten komplexere Interaktionen beinhalten, bei denen die räumliche Organisation der Zellen beeinflusst, wie sie sich synchronisieren.
Insgesamt hebt die Forschung die Wichtigkeit hervor, diese Synchronisationsmechanismen in Embryonen zu studieren. Sie gibt Einblicke in die Zellkommunikation und wie individuelles Verhalten zu koordinierten Aktionen in Zellgruppen führen kann, was für eine ordnungsgemässe Entwicklung entscheidend ist. Das Verständnis dieser Mechanismen könnte auch neue Wege eröffnen, um zu untersuchen, wie ähnliche Prozesse in anderen biologischen Systemen ausserhalb der embryonalen Entwicklung ablaufen.
Titel: Nonreciprocal synchronization in embryonic oscillator ensembles
Zusammenfassung: Synchronization of coupled oscillators is a universal phenomenon encountered across different scales and contexts e.g., chemical wave patterns, superconductors and the unison applause we witness in concert halls. The existence of common underlying coupling rules define universality classes, revealing a fundamental sameness between seemingly distinct systems. Identifying rules of synchronization in any particular setting is hence of paramount relevance. Here, we address the coupling rules within an embryonic oscillator ensemble linked to vertebrate embryo body axis segmentation. In vertebrates, the periodic segmentation of the body axis involves synchronized signaling oscillations in cells within the presomitic mesoderm (PSM), from which somites, the pre-vertebrae, form. At the molecular level, it is known that intact Notch-signaling and cell-to-cell contact is required for synchronization between PSM cells. However, an understanding of the coupling rules is still lacking. To identify these, we develop a novel experimental assay that enables direct quantification of synchronization dynamics within mixtures of oscillating cell ensembles, for which the initial input frequency and phase distribution are known. Our results reveal a "winner-takes-it-all" synchronization outcome i.e., the emerging collective rhythm matches one of the input rhythms. Using a combination of theory and experimental validation, we develop a new coupling model, the "Rectified Kuramoto" (ReKu) model, characterized by a phase-dependent, non-reciprocal interaction in the coupling of oscillatory cells. Such non-reciprocal synchronization rules reveal fundamental similarities between embryonic oscillators and a class of collective behaviours seen in neurons and fireflies, where higher level computations are performed and linked to non-reciprocal synchronization.
Autoren: Alexander Aulehla, C. Ho, L. Jutras-Dube, M. Zhao, G. Mönke, I. Z. Kiss, P. Francois
Letzte Aktualisierung: 2024-01-31 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.29.577856
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.29.577856.full.pdf
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