Herausforderungen bei der Behandlung von Mykobakterien-Infektionen
Forschung hebt die Komplexität von Persistenzzellen bei mykobakteriellen Infektionen hervor.
Bennett H Penn, N. A. Bates, R. Rodriguez, R. Drwich, A. Ray, S. A. Stanley
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Inhaltsverzeichnis
- Verständnis der Persistenzzellen
- Studienfokus: Mykobakterielle Pathogene
- Aktuelle Forschung zu Mycobacterium abscessus
- Hunger-induzierte Persistenzzellen
- Identifizierung von Schlüsselwegen in M. abscessus
- Validierung der Ergebnisse mit Gen-Deletionen
- Untersuchung von ROS im Antibiotikatod
- Klinische Implikationen
- Fazit
- Originalquelle
Antibiotika sind Medikamente, die Bakterien töten oder deren Wachstum stoppen. Das Hauptziel von Antibiotika ist es, schädliche Bakterien loszuwerden, die Infektionen verursachen. Viele gängige Infektionen reagieren gut auf Antibiotika, und die Patienten erholen sich oft nach ein bis zwei Wochen Behandlung. Allerdings sind einige Infektionen schwieriger zu behandeln und erfordern viel längere Antibiotika-Kuren, manchmal über Monate oder sogar Jahre. Mykobakterielle Infektionen, wie die durch Tuberkulose, sind ein gutes Beispiel für diese Herausforderung. Die Behandlung dieser Infektionen dauert lange, um Rückfälle zu vermeiden.
Ein Grund, warum Mykobakterien schwer mit Antibiotika abzutöten sind, ist ein Phänomen namens "Persistenz". Einige Bakterienzellen, die als Persistoren bekannt sind, schaffen es, auch bei Anwesenheit von Antibiotika zu überleben. Forschungen aus den 1940er Jahren zeigten, dass, während die meisten Bakterien schnell absterben, wenn sie Antibiotika wie Penicillin ausgesetzt sind, eine kleine Gruppe von Persistenzzellen viel länger leben kann. Diese Persistenzzellen sind nicht resistent gegen Antibiotika und vermehren sich nicht, wenn das Antibiotikum vorhanden ist; stattdessen gehen sie in einen speziellen Zustand über, der es ihnen ermöglicht, vorübergehend zu überleben.
Die meisten Bakterien können Persistenzzellen bilden, und dieser Mechanismus kommt oft in stressigen Situationen zum Tragen, wie wenn Nährstoffe knapp sind oder die Umgebung saurer wird. Interessanterweise findet man diese Stressfaktoren auch in Körperbereichen, wo das Immunsystem gegen Infektionen kämpft. Das bedeutet, dass das Immunsystem manchmal die Fähigkeit von Antibiotika einschränken kann, bakterielle Infektionen zu beseitigen.
Verständnis der Persistenzzellen
Persistenzzellen wurden viel in einem häufigen Labormikroben, Escherichia coli, untersucht. Forscher haben verschiedene Wege gefunden, wie diese Zellen entstehen. Einige wichtige Systeme, die bei der Bildung von Persistoren helfen, sind spezifische Proteine, die steuern, wie die Bakterien wachsen und sich teilen. Allerdings gibt es noch viel, was wir nicht darüber wissen, wie diese Prozesse ablaufen. Zum Beispiel ist unklar, wie Stress die Bildung von Persistenzzellen auslöst und wie diese Zellen am Leben bleiben, wenn wichtige Prozesse durch Antibiotika gestoppt werden.
Selbst der Weg, wie Bakterien nach Kontakt mit Antibiotika sterben, ist nicht vollständig verstanden. Traditionell wurde geglaubt, dass Antibiotika Bakterien töten, indem sie deren Schlüssel-Funktionen stoppen. Zum Beispiel zerstören bestimmte Antibiotika die Zellwand, was dazu führt, dass die Bakterien platzen. Allerdings deuten einige Studien darauf hin, dass auch andere Faktoren, wie die Ansammlung von reaktiven Sauerstoffspezies (ROS), eine Rolle beim Abtöten von Bakterien spielen könnten. Andere Forschungen fanden jedoch keinen Zusammenhang zwischen ROS und antibiotikainduziertem Tod, was zu Unsicherheiten in diesem Bereich führt.
Studienfokus: Mykobakterielle Pathogene
Die Untersuchung von Persistenzzellen in mykobakteriellen Bakterien bietet einige Vorteile. Mykobakterielle Persistenzzellen können sehr lange überleben, wenn sie Antibiotika ausgesetzt sind. Zum Beispiel benötigt das Bakterium Mycobacterium tuberculosis lange Behandlungszeiträume, oft vier Monate oder mehr, während nicht-tuberkulöse Mykobakterien bis zu anderthalb Jahre Behandlung benötigen, oft mit hohen Rückfallraten. Einige Arten, wie Mycobacterium abscessus, stellen aufgrund ihrer natürlichen Resistenzen gegen viele Antibiotika noch grössere Herausforderungen dar, was zur Verwendung von Medikamenten führt, die schädlicher für die Patienten sind und oft viel längere Behandlungsdauern erfordern.
Frühere Studien haben untersucht, wie Mykobakterien auf Antibiotika reagieren, wobei einige den Fokus darauf legten, wie Bakterien Resistenzen erben können, während andere untersuchten, wie Persistenzzellen entstehen. Techniken wie Transposon-Mutagenese und CRISPR haben Forschern geholfen, wichtige Gene im Zusammenhang mit Antibiotika-Reaktionen zu entdecken. Diese Studien hoben die Rolle der bakteriellen Zellmembran hervor, die steuert, wie gut Antibiotika in die Bakterien eindringen können.
Allerdings hat sich das Studium von Persistenzzellen als schwierig erwiesen, da es während der Experimente zu weit verbreitetem Zelltod kommt. Dies kann die Auswirkungen bestimmter Mutationen verbergen. Eine erfolgreiche Studie konzentrierte sich auf das Antibiotikum Rifampin und identifizierte viele Mutationen im Zusammenhang mit Persistenzzellen. Es ist jedoch unklar, ob diese Muster auch auf andere Antibiotika oder Bakterien zutreffen.
Aktuelle Forschung zu Mycobacterium abscessus
In dieser Forschung wurde der Prozess der Bildung von Persistenzzellen in M. abscessus untersucht, um Gene zu finden, die sowohl für die spontane als auch für die verhungerte induzierte Bildung von Persistenzzellen erforderlich sind. Durch einen umfassenden genetischen Screen wurden mehrere Wege identifiziert, die mit dem Überleben von Persistenzzellen verknüpft sind. Eine der wichtigsten Erkenntnisse war, dass ein spezifisches Enzym namens KatG Bakterien helfen kann zu überleben, wenn sie bestimmten Antibiotika ausgesetzt sind, was darauf hindeutet, dass ROS tatsächlich Faktoren im bakteriellen Tod sind.
Hunger-induzierte Persistenzzellen
Um Antibiotikaresistenz besser zu verstehen, benötigten die Forscher zunächst geeignete Bedingungen für die Untersuchung von Mykobakterien. Genetische Screens stehen vor Herausforderungen, wie hohen Zelltodraten, die die Ergebnisse verschleiern können, und der Möglichkeit, dass spontane, antibiotikaresistente Mutanten entstehen. Um diese Probleme zu lösen, schufen sie Bedingungen für Hochdichtkulturen, die die Wirksamkeit von Antibiotika aufrecht erhielten.
Sie testeten mehrere Antibiotika, die zur Behandlung von M. abscessus-Infektionen eingesetzt werden, darunter Tigecyclin und Linezolid, sowie solche, die zur Tuberkulosebehandlung verwendet werden, wie Rifampin und Isoniazid. Die Forscher entdeckten, dass unter nährstoffarmen Bedingungen (Hunger) die Anzahl der Persistenzzellen im Vergleich zu gut ernährten Kulturen erheblich zunahm. Dieser Trend wurde bei mehreren mykobakteriellen Arten beobachtet, was darauf hindeutet, dass Hunger ein häufiger Auslöser für die Bildung von Persistenzzellen ist.
Identifizierung von Schlüsselwegen in M. abscessus
Unter diesen Bedingungen führten die Forscher einen Transposon-Mutagenese-Screen durch, um Gene zu identifizieren, die für die Bildung von Persistenzzellen als Reaktion auf Antibiotika unerlässlich sind. Sie arbeiteten mit Tausenden von Mutationen, um zu sehen, welche Gene zum Überleben während der Antibiotikabehandlung beitragen. Sie fanden Hunderte von Genen, die mit der Bildung von Persistenzzellen verknüpft sind, von denen einige bereits bekannt waren und eine Rolle bei der Antibiotika-Reaktion spielten.
Interessanterweise waren, obwohl die Bakterien mit translation-inhibierenden Antibiotika behandelt wurden, mehrere Gene, die mit der Bekämpfung von oxidativem Stress in Verbindung standen, ebenfalls für das Überleben notwendig. Dazu gehörten Gene, die mit dem Management von ROS verknüpft sind. Die Studie deutete darauf hin, dass, wenn Bakterien Antibiotika ausgesetzt werden, sie ROS ansammeln könnten, was zu Zellschäden und Tod führt.
Validierung der Ergebnisse mit Gen-Deletionen
Um die Rolle von spezifischen Genen wie KatG und anderen, die im Screen identifiziert wurden, zu bestätigen, kreierten die Forscher Mutantenstämme, die diese Gene nicht hatten. Sie testeten diese Mutanten, um zu sehen, wie gut sie bei der Exposition gegenüber Antibiotika überleben konnten. Die Mutanten, denen KatG fehlte, zeigten erhebliche Defekte in der Bildung von Persistenzzellen, was die Idee untermauerte, dass dieses Enzym eine entscheidende Rolle beim Überleben spielt.
Untersuchung von ROS im Antibiotikatod
Da die Studien darauf hindeuteten, dass KatG bei der Handhabung von ROS hilft, tauchten die Forscher tiefer ein, um zu sehen, ob diese toxischen Moleküle zum Tod der Bakterienzellen beitrugen. Sie verwendeten spezifische Farbstoffe, um die ROS-Spiegel in den Bakterienzellen zu erkennen. Die Ergebnisse zeigten, dass die ROS-Werte dramatisch anstiegen, wenn Bakterien mit Antibiotika gestresst wurden.
Um weiter zu untersuchen, versuchten die Forscher, die Bakterien unter sauerstoffarmen (hypoxischen) Bedingungen zu züchten, um die ROS-Produktion zu reduzieren. Sie fanden heraus, dass die Bakterien unter diesen Bedingungen besser überlebten, was darauf hindeutet, dass die Ansammlung von ROS zur Tödlichkeit bestimmter Antibiotika beiträgt.
Klinische Implikationen
Die Erkenntnisse aus dieser Forschung haben wichtige Auswirkungen auf die Behandlung von Infektionen, die durch Mykobakterien verursacht werden. Angesichts der hohen Rückfallraten, die mit der Behandlung von M. abscessus verbunden sind, hebt die Studie potenzielle neue Strategien hervor, die auf die einzigartigen Eigenschaften von Persistenzzellen abzielen könnten. Dieser Ansatz könnte darin bestehen, Medikamente zu verwenden, die Bakterien nicht direkt abtöten, sondern sich stattdessen darauf konzentrieren, das Überleben dieser Persistoren zu reduzieren.
Fazit
Zusammenfassend beleuchtet diese Forschung das komplexe Verhalten von mykobakteriellen Infektionen und wie sie auf Antibiotika reagieren. Sie hebt die Bedeutung von Faktoren wie Hunger und oxidativem Stress hervor, die das Überleben von Bakterien beeinflussen. Durch das Verständnis der Mechanismen der Bildung von Persistenzzellen und der Rollen spezifischer Gene und ROS können neue therapeutische Strategien entwickelt werden, um diese herausfordernden Infektionen effektiv zu bekämpfen.
Titel: Reactive Oxygen Detoxification Contributes to Mycobacterium abscessus Antibiotic Survival
Zusammenfassung: When a population of bacteria encounter a bactericidal antibiotic most cells die rapidly. However, a sub-population, known as "persister cells", can survive for prolonged periods in a non-growing, but viable, state. Persister cell frequency is dramatically increased by stresses such as nutrient deprivation, but it is unclear what pathways are required to maintain viability, and how this process is regulated. To identify the genetic determinants of antibiotic persistence in mycobacteria, we carried out transposon mutagenesis high-throughput sequencing (Tn-Seq) screens in Mycobacterium abscessus (Mabs). This analysis identified genes essential in both spontaneous and stress-induced persister cells, allowing the first genetic comparison of these states in mycobacteria, and unexpectedly identified multiple genes involved in the detoxification of reactive oxygen species (ROS). We found that endogenous ROS were generated following antibiotic exposure, and that the KatG catalase-peroxidase contributed to survival in both spontaneous and starvation-induced persisters. We also found that that hypoxia significantly impaired bacterial killing, and notably, in the absence of oxygen, KatG became dispensable. Thus, the lethality of some antibiotics is amplified by toxic ROS accumulation, and persister cells depend on detoxification systems to remain viable.
Autoren: Bennett H Penn, N. A. Bates, R. Rodriguez, R. Drwich, A. Ray, S. A. Stanley
Letzte Aktualisierung: 2024-10-31 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.13.618103
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.13.618103.full.pdf
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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