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# 健康科学# 腫瘍学

前立腺がんケアのための言語モデルの進展

新しい言語モデルが前立腺癌治療における理解とコミュニケーションを改善する。

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目次

前立腺癌はアメリカで男性に診断される最も一般的な非皮膚癌だよ。早期に見つかるか、前立腺の周りにはあまり広がっていなければ、5年生存率はほぼ100%なんだ。でも、前立腺癌の診断を受けると、多くの男性がメンタルやフィジカルヘルスが明らかに低下することが多いんだよね。

多くの男性はこの病気について混乱することがあって、それは知識不足から来ることがあるんだ。直腸検査とかの身体検査について話すのが恥ずかしいと思ったり、医者と性に関する問題を話すのが嫌な人もいる。医療提供者の性別によって、その恥ずかしさが強くなることもあるんだ。だから、高齢患者やマイノリティの人たちはケアの結果が悪くなることがあるんだよね。

性の健康に関する不安や不確実さから、多くの男性がインターネットで答えを探すんだけど、オンライン検索は不完全な情報や間違った情報に繋がることがあって、適切な治療を受けるのが遅れて健康状態が悪化することもあるよ。

情報に関する課題

患者が診断されると、多くの臨床情報が生成されるんだ。これには医療提供者のメモや画像や検査のレポートが含まれてる。多くの情報は自由形式のテキストで書かれているから、分析が難しいことがあるんだよ。最近の技術の進展、特に大規模言語モデル(LLM)によって、こういった情報を処理できる可能性が出てきた。これらのモデルは、インタラクティブで控えめに知識を共有するのを助けてくれるんだ。

でも、私たちは一般的なLLMは専門的な医療分野ではうまく機能しないかもしれないと思ってる。こういうモデルは、特定の医療に関する質問に対する正確な答えよりも曖昧な回答を出しがちなんだ。医療に関するテーマでは、間違った情報を生むこともあって、それが危険なこともあるんだよね。

医療分野に特化したLLMを作る研究が進行中なんだけど、こういったモデルは多くの医療や生物学のトピックをカバーするから、かなり大きくて複雑なんだ。医学は異なる専門分野を含んでいて、それぞれに異なる知識があって、たとえば腫瘍学(癌治療)と救急医学は全然違うんだ。

患者記録の重要性

LLMをトレーニングするには、一般的に大量のテキストデータが必要なんだ。たとえば、既存のモデルはインターネットから集めたデータでトレーニングされていて、情報源の信頼性を確認していないことが多いんだ。専門モデルは科学論文や要約を使用してトレーニングされているけど、最も重要な情報源の一つである患者記録はプライバシー法のためにほとんど排除されている。このリアルな臨床データにアクセスできないことは、治療中の意思決定の仕方や患者とコミュニケーションを効果的に行うことを理解するのを妨げているんだ。

臨床メモには、医者と患者がどうやって互いにやり取りし、一緒に決定を下すかに関する重要な情報が含まれてるから、言語モデルのトレーニングに臨床メモを追加するのは、特定の病気を本当に理解するツールを開発するために重要なんだよね。

新しい言語モデルに関する私たちの取り組み

私たちは、敏感な医療情報を扱うときに一般的なモデルの問題を解決するために特に作られた言語モデルを開発したよ。前立腺癌を例にして焦点を当てたんだ。すごく大きなモデルを作る代わりに、1億2400万のパラメータを持つモデルを作ったんだ。前立腺癌の患者から集めたデータ、臨床メモやレポートを使ってモデルをトレーニングしたよ。前立腺癌に関連する重要な詳細を学ばせるために、特別なトレーニング技術も開発したんだ。

モデルがどれだけうまく機能するかを評価するために、一般的なモデルと大きな専門モデルと比較した。主なタスクは臨床情報の予測と質問への回答だったんだ。

モデル開発のステップ

まず、データ収集プロセスから始めて、内部審査委員会の承認を得て、複数のメイヨークリニックの場所での23,665人の前立腺癌患者から臨床メモを集めたよ。このデータには臨床メモだけでなく、画像検査や実験室のレポートも含まれてた。

臨床データはかなり広範で、約180万のメモがあったんだ。これらのメモには重要な情報が含まれてたけど、個人識別情報もあった。だから、トレーニング中に患者と医療提供者の匿名性を確保するための手順を踏んだよ。個人情報はプレースホルダーのトークンで置き換えたし、短すぎる文や長すぎる文もフィルタリングした。モデルの理解が歪まないように、繰り返しのフレーズも取り除くことを目指したんだ。

次に、自由なテキストから前立腺癌に関連する重要な臨床情報をマークする必要があった。医療用語彙システムを使って関連する医療コンセプトを標準化し、見つけることができた。このマーク付けのプロセスで、84%以上の文に重要な医療コンセプトが含まれていることが分かったよ。これが終わった後、医療用語を適切に扱える特別なトークナイザーを作成したんだ。

トレーニングフェーズ

私たちはモデルを2つのフェーズでトレーニングしたよ:

  1. 一般的な言語トレーニング:まずは前立腺癌患者からの自由テキストデータを使って基本的な言語を理解するためのトレーニングをした。

  2. 領域特化型トレーニング:このフェーズでは、前立腺癌に関連する特定の臨床用語を認識するようにモデルを教えることに焦点を当てた。マスクする単語をランダムに選んで、モデルは文脈に基づいてそのマスクされた用語を予測するように学んだ。

この2フェーズのトレーニングによって、モデルは一般的な医療言語と特定の医療言語の両方を理解できるようになったんだ。そして、治療オプション、症状、結果の間の重要なつながりを認識できるようになるんだよ。

モデルの評価

トレーニングが終わった後、モデルのパフォーマンスを2つの重要なタスクで評価したよ:マスクされた臨床情報の予測と質問への回答。

マスク情報の予測タスクでは、モデルが以前に見たことがない文からマスクされた用語を取得する能力をテストした。どれくらい正しい用語を成功裏に識別できたかを測定したよ。

質問応答タスクでは、確立された前立腺癌治療ガイドラインに基づいていくつかの質問を作成した。その後、他のモデルと比べて私たちのモデルがどれだけその質問に答えられたかを評価した。正確さ、完全さ、関連性に焦点を当てたんだ。

評価結果

私たちのモデルは、一般的なモデルよりも一貫して良いパフォーマンスを発揮したし、両方のタスクで大きな専門モデルよりも優れていたよ。特に前立腺癌の特定の語彙を維持するのが得意なんだ。

質問応答の面でも、私たちのモデルは評価したユーザーから関連性のスコアが高かった。他のモデルと比べて、私たちのモデルはより適切で関連する回答を提供していたんだ。

この結果は、敏感な医療分野に特化した言語モデルを開発する明確な利点を示しているよ。一般的なモデルは幅広いタスクに対して印象的な能力を発揮するかもしれないけど、専門的な医療の文脈では正確で関連性のある答えを出すのに苦労しているみたい。

今後の方向性

今後は、患者と医者がもっと効果的にコミュニケーションできるツールを作ることを目指しているよ。目標の一つは、私たちの専門モデルに基づいて前立腺癌治療に関する信頼できる情報を提供するチャットボットを作ることなんだ。これらのチャットボットをトレーニングするためのデータ収集は難しいかもしれないけど、関連する質問と答えのペアを自動生成する方法を探るつもりだよ。

この研究は、医療分野で提供される情報の信頼性と特異性を改善し、患者が正確で適切な情報をタイムリーに受け取るのを確実にするために重要なんだ。

オリジナルソース

タイトル: Domain-specific LLM Development and Evaluation -- A Case-study for Prostate Cancer

概要: In this work, we present our strategy for developing domain-specific large language models which cover the vocabulary of the target domain and train on reliable sources of clinical information. Prostate cancer was chosen as a use-case for this study. We collected more than 1.8 million clinical notes and radiology and pathology reports for 15341 patients treated for prostate cancer in Mayo Clinic across three sites and outpatient clinics. In addition to domain-specific training data, we built domain-specific tokenizers and devised knowledge-guided training strategies for LLM development. During the self-supervised training, LLM was forced to predict domain-specific information by marking clinical terms using UMLS parser. We evaluated the model for downstream tasks of clinical information prediction and question answering using quantitative and user evaluation study to measure the accuracy, reliability and information completeness. We compared the domain-specific model against similarly sized general purpose model GPT-2 and a three-times larger domain specialized model. i.e., BioGPT. Our model outperformed GPT-2 on both tasks by a wide margin. Our model was also able to outperform BioGPT on clinical information prediction tasks and showed some advantages over BioGPT in question-answering tasks.

著者: Amara Tariq, M. Luo, A. Urooj, A. Das, J. Jeong, S. Trivedi, B. Patel, I. Banerjee

最終更新: 2024-03-19 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.03.15.24304362

ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.03.15.24304362.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた medrxiv に感謝します。

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