Die Rolle von Bakterien beim Pflanzenwachstum und der IAA-Verwaltung
Bakterien spielen eine wichtige Rolle beim Abbau des Pflanzenhormons IAA und beeinflussen so das Wachstum.
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Inhaltsverzeichnis
Indol-3-essigsäure, oft IAA genannt, ist eine natürliche Substanz, die von Pflanzen produziert wird und ihnen beim Wachsen hilft. Es ist eine Art Pflanzenhormon, genauer gesagt ein Auxin, und spielt eine wichtige Rolle in vielen pflanzlichen Aktivitäten, wie der Zellteilung und dem Längenzuwachs. IAA findet man hauptsächlich in Pflanzenteilen, die sich entwickeln, besonders an den Wurzeltipps. In diesen Bereichen gibt's viele Zellen, die IAA herstellen können, und es gibt einen Unterschied in der Menge an IAA, was das Wurzelwachstum lenkt.
Obwohl IAA hauptsächlich in den Wurzeln vorkommt, kann es auch in Flüssigkeiten gefunden werden, die Pflanzen in den Boden abgeben, die sogenannten Wurzelexudate. Diese Wurzelexudate können IAA sowie andere Substanzen enthalten.
Die Rolle von Mikroorganismen im Pflanzenwachstum
Pflanzen sind die Heimat vieler Mikroorganismen, und zusammen bilden sie eine Gemeinschaft, das sogenannte pflanzenassoziierte Mikrobiom. Dieses Mikrobiom umfasst verschiedene Bakterien und Pilze, die auf oder in der Pflanze leben. Der Wurzelbereich ist besonders wichtig, weil er beeinflusst, wie diese Mikroorganismen arbeiten.
Forschungen haben gezeigt, dass Wurzelexudate, die Pflanzenhormone wie IAA enthalten, die Gemeinschaft von Mikroorganismen, die in der Nähe der Wurzeln leben, erheblich beeinflussen können. Im Laufe der Zeit haben sich diese Mikroorganismen Wege entwickelt, um mit Pflanzen zu leben, einschliesslich der Fähigkeit, pflanzenspezifische Substanzen wie IAA zu produzieren und abzubauen. Schätzungen deuten darauf hin, dass eine grosse Anzahl von Bakterien im Wurzelbereich IAA produzieren kann.
Allerdings ist nicht viel darüber bekannt, welche Bakterien IAA im Boden abbauen können und welche Rollen sie in der Natur spielen.
Wie Bakterien IAA abbauen
Es gibt zwei Hauptwege, wie Bakterien IAA abbauen können. Die erste Methode beinhaltet eine Gruppe von Genen, die als iac-ähnliches Operon bekannt ist, die es bestimmten Bakterien ermöglicht, IAA in eine andere Substanz namens Catechol umzuwandeln. Zum Beispiel haben einige Bakterien wie Pseudomonas und Acinetobacter diese Fähigkeit.
Die zweite Methode umfasst eine andere Gruppe von Genen, die als iad-ähnliches Operon bezeichnet wird, die es bestimmten Bakterien ermöglicht, IAA in ein anderes Endprodukt namens Anthranilat abzubauen. Beispiele für Bakterien, die das können, sind Variovorax und Achromobacter.
Jüngste Studien haben gezeigt, dass die Gene, die für den Abbau von IAA verantwortlich sind, in vielen Bakterienstämmen vorhanden sind. Allerdings wissen wir immer noch nicht, wie viele dieser Bakterien im Boden IAA abbauen können und was das für die Bodengesundheit bedeutet.
Entdeckung von IAA-abbauenden Bakterien
Um mehr darüber zu erfahren, wie Bakterien IAA abbauen können, untersuchten Wissenschaftler eine grosse Anzahl von Bakterien, die aus den Wurzeln von Arabidopsis (einer kleinen blühenden Pflanze) und Reis gesammelt wurden. Sie überprüften die Gene, die für den IAA-Abbau verantwortlich sind, und führten Experimente durch, um zu bestätigen, welche Bakterien tatsächlich IAA abbauen konnten.
Die Wissenschaftler fanden 21 spezifische Bakterien aus sieben verschiedenen Gruppen, die zeigten, dass sie IAA effektiv abbauen konnten. Interessanterweise wurden zwei dieser Gruppen vorher nicht berichtet. Alle Bakterien, die IAA abbauen konnten, trugen entweder das iac-ähnliche oder das iad-ähnliche Operon. Als diese Bakterien IAA ausgesetzt wurden, erhöhte sich ihre Genaktivität, was zeigte, dass sie auf das Hormon reagieren konnten.
Zusätzlich konnten einige dieser Bakterien IAA nicht nur abbauen, sondern auch als Nahrungsquelle für Energie und Wachstum nutzen. Als diese Bakterien an Pflanzen getestet wurden, zeigten sie eine bemerkenswerte Fähigkeit, die negativen Auswirkungen von überschüssigem IAA auf das Wurzelwachstum zu verringern, was auf ihre potenzielle Rolle bei der Unterstützung der Pflanzenentwicklung hinweist.
Die Suche nach mehr IAA-abbauenden Bakterien
Die Studie wollte mehr Bakterien identifizieren, die in der Lage sind, IAA abzubauen, und verstehen, wie weit verbreitet sie in verschiedenen Umgebungen sind. Wissenschaftler untersuchten Tausende von bakteriellen Genomen, die aus verschiedenen Lebensräumen gesammelt wurden, einschliesslich Gewässern, Böden und sogar den Därmen von Säugetieren.
Die Ergebnisse zeigten, dass IAA-abbauende Fähigkeiten hauptsächlich in pflanzenassoziierten Böden zu finden waren. Konkret konnte eine grosse Anzahl von Bakterien aus Pflanzenwurzeln und -trieben IAA abbauen, während nur wenige in aquatischen oder säugetierischen Umgebungen gefunden wurden.
Wie Bakterien IAA nutzen
Die Wissenschaftler wollten auch wissen, ob diese Bakterien IAA als alleinige Nahrungsquelle nutzen könnten. Viele der identifizierten Stämme waren in der Lage, alles IAA zu konsumieren, das ihnen gegeben wurde, was zeigt, dass sie damit gedeihen konnten. Einige der Stämme wuchsen besonders schnell und verbrauchten das gesamte IAA viel schneller als andere.
Die Bedeutung von IAA-abbauenden Bakterien für das Pflanzenwachstum
Der Abbau von IAA ist entscheidend für das Pflanzenwachstum, da er hilft, die IAA-Spiegel in und um die Wurzeln im Gleichgewicht zu halten. Ein richtiges Gleichgewicht ist notwendig für eine gesunde Wurzelentwicklung. Die Studie identifizierte, dass einige Bakterien in der Lage waren, die Auswirkungen von überschüssigem IAA zu reduzieren, was das Wurzelwachstum hemmen kann.
Als spezifische IAA-abbauende Bakterien zu Pflanzen hinzugefügt wurden, halfen sie, das normale Wurzelwachstum wiederherzustellen, was darauf hindeutet, dass sie eine wichtige Rolle dabei spielen, wie Pflanzen mit IAA-Niveaus umgehen. Diese Wechselwirkungen zeigen, wie wichtig Bakterien in den komplexen Beziehungen zwischen Pflanzen und ihrer Umwelt sind.
Fazit
Diese Forschung wirft Licht auf die wesentlichen Rollen, die Bakterien bei der Verwaltung von IAA-Spiegeln in Pflanzen spielen. Durch die Entdeckung verschiedener IAA-abbauender Bakterien aus unterschiedlichen Pflanzentypen konnten Wissenschaftler die komplexen Verbindungen im pflanzlichen Mikrobiom besser verstehen.
Durch die Identifizierung der Mechanismen, durch die diese Bakterien agieren, können wir Einblicke gewinnen, wie sie Pflanzen beim Wachsen und Entwickeln helfen. Dieses Wissen könnte in Zukunft zu besseren landwirtschaftlichen Praktiken führen, die gesündere Pflanzen und Ökosysteme unterstützen.
Die Interaktionen zwischen IAA-produzierenden Pflanzen und IAA-abbauenden Bakterien sind entscheidend, um ein gesundes Gleichgewicht in den Pflanzenhormonen aufrechtzuerhalten. Während die Forschung fortgesetzt wird, wird es wichtig sein, diese Beziehungen weiter zu erkunden, um unser Verständnis und die Förderung des Pflanzenwachstums durch Wissenschaft zu verbessern.
Titel: Degradation of indole-3-acetic acid by plant-associated microbes
Zusammenfassung: Plant-associated microbiota affect pant growth and development by regulating plant hormones homeostasis. Indole-3-acetic acid (IAA), a well-known plant hormone, can be produced by various plant-associated bacteria. However, the prevalence of microbes with the capacity to degrade IAA in the rhizosphere has not been systematically studied. In this study, we analyzed the IAA degradation capabilities of bacterial isolates from the roots of Arabidopsis and rice. Using genomics analysis and in vitro assays, we found that 21 out of 189 taxonomically diverse bacterial isolates possess the ability to degrade IAA. Through comparative genomics and transcriptomic assays, we identified iac-like or iad-like operon in the genomes of these IAA degraders. Additionally, the regulator of the operon was found to be highly conserved among these strains through protein structure similarity analysis. Some of the IAA degraders could utilize IAA as their sole carbon and energy source. In planta, most of the IAA degrading strains mitigated Arabidopsis seedling root growth inhibition (RGI) triggered by exogenous IAA. Importantly, we observed increased colonization preference of IAA degraders from soil to root according to the frequency of the biomarker genes in metagenome-assembled genomes (MAGs) collected from different habitats, suggesting that there is a close association between IAA degraders and IAA-producers. In summary, our findings further the understanding of the functional diversity and roles of plant-associated microbes.
Autoren: Lei Dai, L. WANG, Y. Liu, H. Ni, W. Zuo, H. Shi, W. Liao, H. Liu, Y. Bai, H. Yue, A. Huang, J. Friedman, T. Si, M. Chen
Letzte Aktualisierung: 2024-02-08 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.08.579438
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.08.579438.full.pdf
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