Simple Science

最先端の科学をわかりやすく解説

# 生物学# システム生物学

プラナリアにおけるセロトニンの役割を調査する

研究によると、セロトニンがプラナリアの脳機能や他の細胞にどのように影響を与えるかがわかった。

― 1 分で読む


プラナリアにおけるセロトニプラナリアにおけるセロトニンの影響が明らかにされた細胞に与える影響は広範囲にわたるらしい。研究によると、セロトニン抑制がプラナリア
目次

生物システムってほんと複雑だよね。たった1つの遺伝子を変えるだけで、いろんな影響が生じることがあるんだ。最初は、その遺伝子が活性化されてる特定の細胞や組織に影響が表れるんだけど、それが時間が経つと他の部分にも広がっていくことがあるんだ。特に脳細胞は体の多くの機能を制御するから、これが重要なんだ。

例えば、セロトニンを生産する脳細胞に問題があると、いろんな動物でいろんなトラブルが起きるんだ。セロトニンシステムは、気分や食欲、睡眠、動きなんかにとっても重要だからね。ほとんどのセロトニンに関する研究は脊椎動物に焦点を当ててるけど、最近では無脊椎動物にまで手を広げてるんだ。

プラナリアは脳細胞やその機能を研究するのにめっちゃ良いモデルなんだ。なぜなら、特別な幹細胞を持っていて、さまざまな細胞、特に神経細胞に変わることができるから。全ての頭、つまり脳もすぐに再生できるしね。特定の技術を使うことで、研究者は大人のプラナリアのこれらのプロセスを変えて、その行動にどう影響するかを研究できるんだ。

プラナリアは脳、神経索、いろんな種類の神経細胞を含む神経系を持ってるんだ。研究者たちは、セロトニンやドーパミンといった重要な化学物質を生成する神経細胞など、いくつかの神経細胞の種類を特定しているよ。新しい技術のおかげで、プラナリアの神経細胞の異なるタイプをよりよく理解できるようになってきたんだ。

プラナリアで神経細胞を形成・発展させるプロセスは、転写因子と呼ばれる特定のタンパク質に依存しているんだ。プラナリアでは、pitxとlhx1/5-1という2つの重要な転写因子がセロトニンを生産する神経細胞の小さなグループに見られるんだけど、これをブロックすると生物全体に大きな問題が起こることがあるんだ。例えば、動きが困難になったり、体の形や行動が変わったりすることがあるんだ。これらの問題の正確な理由は完全には理解されていなくて、従来の方法では調べるのが難しいんだ。最近のトランスクリプトーム全体の方法が助けになるかもしれないけど、異なる細胞タイプ間での直接的および間接的な影響を区別するのが難しいんだ。

単一細胞解析は、複雑な生物システムを研究するための重要なツールになってるよ。これにより、研究者はさまざまな細胞タイプやそれらの変化への反応を区別できるようになるんだ。新しい方法を使えば、科学者は1回の実験で複数のサンプルを分析できるから、エラーとコストを削減できるんだ。

この研究では、研究者たちは高度な方法を使って、セロトニン機能をブロックすることがプラナリアにどう影響するかを調べたんだ。pitxとlhx1/5-1遺伝子をノックダウンすると、セロトニンを生産する神経細胞に変化が生じて、期待されていなかった他の細胞タイプにも影響が出たんだ。これらの影響を理解することで、プラナリアにおけるセロトニンのより広い役割をつなげて、新たに特定されたセロトニンの機能に関与する細胞タイプのことも明らかにしていくんだ。

神経細胞の重要性

神経細胞は、体全体で信号を伝達するのに必要不可欠だよ。彼らは単独で働かず、他の神経細胞やさまざまな細胞タイプと相互作用しながら、生物全体の機能に影響を与えているんだ。神経細胞がどう機能するかを理解することは、より広い生物学的プロセスを知る手助けになるんだ。

研究では、セロトニンを生産する神経細胞を変えることが、その神経細胞自身だけでなく、彼らが影響を与える他の組織にも広範な結果をもたらすことがわかってきたんだ。これが生物システムの相互関係を強調してるんだ。

プラナリアは、比較的シンプルな生物であるため、神経の相互作用やそれらの系統的な影響を理解するためのモデルとして役立つんだ。彼らは、神経細胞が全身の機能にどう影響するかを研究するユニークな機会を提供しているよ。

プラナリアモデル

プラナリアは、その優れた再生能力で知られている平らな虫なんだ。彼らは、失った体の部分を再生できるし、脳も再生できるんだ。この能力は、必要なあらゆる種類の細胞に変わることができる豊富な幹細胞やネブラストの供給のおかげでもあるんだ。

プラナリアの神経系はとてもよく整理されていて、脳と2つの主要な神経索、そしてさまざまな種類の神経細胞から成り立っているんだ。研究者たちは、セロトニンを生成する神経細胞など、さまざまな神経細胞のタイプを特定することができたんだ。この再生能力と細胞構造を変える能力が、プラナリアを神経細胞に対する遺伝子ノックダウンの影響を研究する理想的な候補にしているんだ。

特定の転写因子、pitxとlhx1/5-1がセロトニンを生成する神経細胞の機能において重要な役割を果たしていることが示されているんだ。これらの遺伝子がサイレンスされると、動きや体の形に明らかな影響が出るんだ。これらの変化のカスケード効果を理解することで、セロトニンがプラナリアの生物学において果たす役割を明らかにできるんだ。

研究方法

この研究では、科学者たちはACMEとSPLiT-seqという2つの最先端技術を使ったんだ。

ACME技術

ACMEは細胞の解離と固定を組み合わせた方法なんだ。これにより、従来の解離方法で通常生じるストレスを引き起こさずに細胞を研究できるようになるんだ。ACMEを使う目的は、細胞を自然な状態のまま保存して、彼らの機能をより正確に分析できるようにすることなんだ。

SPLiT-seq技術

SPLiT-seqは、単一細胞RNAシーケンシングに使用される組み合わせバーコーディングアプローチなんだ。一つの実験で複数のサンプルとレプリカを組み合わせることができるから、バッチ効果やコストを大幅に最小化できるんだ。この技術を使うことで、研究者は異なる細胞が変化にどう反応するかを分析して、細胞の相互作用や機能について詳細に理解できるんだ。

これらの方法を組み合わせることで、研究者たちは神経細胞に対する遺伝子ノックダウンの直接的な影響や、他の組織タイプへのより広範な影響を理解できるようになるんだ。

結果と発見

ACMEとSPLiT-seqを使った実験の結果、研究者たちはpitxとlhx1/5-1遺伝子がサイレンスされたプラナリアに大きな変化があったことを観察したんだ。

セロトニン神経細胞への影響

これらの遺伝子のノックダウンは、セロトニンを生産する神経細胞に直接影響を与えたんだ。これにより、セロトニンがプラナリアにおいて果たす役割に関する以前の研究結果に沿った形で、動きや体の構造に変化が生じたんだ。

他の細胞タイプへの間接的な影響

面白いことに、これらの遺伝子をノックダウンした影響は、セロトニンを生産する神経細胞を超えて広がったんだ。研究者たちは、転写因子を発現していない細胞タイプにも変化があることを見つけたんだ。例えば、表皮や筋肉の組織などだよ。これらの発見は、セロトニンの影響が神経細胞に限らず、生物全体の機能に重要な他の細胞タイプにも関係していることを示しているんだ。

パレンキマ細胞の役割

プラナリアにおいてあまり理解されていないパレンキマ細胞は、セロトニンのシグナル伝達の変化に対して顕著な反応を示したんだ。これらの細胞は、他のシステムにおけるグリア細胞と似たように、神経伝達物質の代謝を助ける役割を果たしているようなんだ。

研究者たちは、セロトニンの阻害後にこれらのパレンキマ細胞の遺伝子発現に変化が見られたことを発見したんだ。これにより、彼らが神経伝達物質のバランスを維持するためのサポート的な役割を担っている可能性が示唆されるんだ。

結論

この研究は、セロトニンがプラナリアのさまざまな生物学的プロセスにどう影響するかの理解を深めるのに貢献しているんだ。ACMEとSPLiT-seqを組み合わせて使うことで、複雑な相互作用を探求する強力なアプローチが得られているんだ。

神経細胞だけでなく、他の細胞タイプへの影響を研究することで、さまざまな細胞タイプが生物全体の機能において果たす相互関係に光を当てているんだ。これらのダイナミクスをさらに探求することで、細胞の相互作用や生物システムにおける神経伝達物質シグナルの広範な意味をより深く理解できるようになるんだ。

プラナリアはそのユニークな特性のおかげでモデル生物として際立っていて、今後の研究が彼らの生物学の複雑さを解明し、より複雑な生物、例えば人間にまで知識が広がるかもしれないんだ。

オリジナルソース

タイトル: Multiplex single-cell analysis of serotonergic neuron function in planarians reveals widespread effects in diverse cell types

概要: Neurons function by interacting with each other and with other cell types, often exerting organism-wide regulation. Serotonergic neurons play a systemic role in processes such as appetite, sleep and motor control. Functional studies in the planarian Schmidtea mediterranea have shown that impairment of serotonergic neurons results in systemic effects. Studying neurons and the tissues they interact with is challenging using either bulk or single-cell analysis techniques. While bulk methods merge the information from all cell types, single-cell methods show promise in overcoming this limitation. However, current single-cell approaches encounter other challenges including stress of cell dissociation, high cost, multiplexing capacity, batch effects, replication and statistical analysis. Here we used ACME and SPLiT-seq to generate a multiplex single-cell analysis of serotonergic neuron function in planarians by inhibiting pitx and lhx1/5-1, two transcription factors expressed in them. We recovered single-cell transcriptomic profiles of 47,292 cells from knockdown and control animals, including biological and technical replicates. Our results show that epidermal, muscular and the recently described parenchymal cell types are affected the most by serotonergic neuron impairment. By computationally dissecting each cell type, we elucidated gene expression changes in each, including changes in epidermis cilia genes and myofiber genes in muscle. Interestingly, parenchymal cells downregulate genes involved in neurotransmitter recycling, suggesting a glial-like function of these recently described enigmatic cell types. Our results will allow disentangling the complexity of serotonergic neuron inhibition by studying the downstream effectors and the affected tissues, and offer new data on the function of parenchymal cells in planarians. Ultimately, our results pave the way for dissecting complex phenotypes through multiplex single-cell transcriptomics.

著者: Jordi Solana, E. Emili, D. Rodriguez-Fernandez, A. Perez-Posada, H. Garcia-Castro

最終更新: 2024-03-02 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.28.581916

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.28.581916.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

著者たちからもっと読む

類似の記事