MFSトランスポーターの細胞機能における役割
MFSトランスポーターについて学んで、それらが細胞プロセスでどれだけ重要かを理解しよう。
― 1 分で読む
輸送タンパク質は、物質の細胞の内外への移動に重要なんだ。大きく分けて2つのグループに分類できる:受動的輸送と能動的輸送。能動的輸送は機能するのにエネルギーが必要で、細胞が物質を濃度勾配に逆らって移動させることができるんだ。特に「二次能動輸送体」という特殊な能動輸送体は、他のイオンが勾配に従って移動するエネルギーを利用して、別の分子を輸送するのを助ける。
輸送体の種類
二次能動輸送体は、主に「シンポータ」と「アンチポータ」の2つのカテゴリーに分けられる。シンポータは細胞膜を越えて2つ以上の物質を同じ方向に移動させ、アンチポータは逆方向に移動させる。この記事ではシンポータに焦点を当てていて、特に「メジャーファシリテーター超ファミリー(MFS)」というグループについて話すよ。
MFS輸送体は、陽イオン(H+やNa+など)と結びついていることが多く、他の分子を移動させるのに役立ってる。特に「サルモネラ・エンテリカ」のメリビオース透過酵素(MelBSt)は、メリビオースとH+、リチウム(LI+)、またはNa+を輸送する。
MFS輸送体の重要性
MFS輸送体はさまざまな生理的過程で重要な役割を果たしていて、特定の病気にも関与してる。例えば、NA+結合リピッド輸送体(MFSD2A)は、脳や網膜に必要なリピッドを輸送するのに役立っている。これらの輸送体がどのように機能するかを理解することは、健康や病気におけるその役割についての手がかりを提供してくれるんだ。
MelBStの構造
研究はMelBStの構造に貴重な洞察をもたらしている。科学者たちは異なる形のMelBStの結晶構造を取得していて、結合した糖のアナログを持つ変異体の構造も含まれている。これらの構造は、輸送体が基質とどのように相互作用するかを決定する重要な特徴を特定するのに役立った。
重要な発見の一つは、糖結合ポケットが陽イオン結合部位とは異なるけど、近くにあること。これにより相互作用の可能性が示唆されているけど、糖と陽イオンの結合の正確な関係はまだ完全には理解されていない。
研究からの主な発見
最近の研究では、MelBStに対するメリビオース、Na+、Li+の結合親和性が特定された。この研究は、これらの物質の結合が協調的であることを示していて、ある物質の結合が別の物質の結合に影響を与える。例えば、Na+やLi+が存在すると、メリビオースの結合はそれらのイオンがないときよりもかなり強い。
MelBSt輸送体の異なる変異は、その機能に影響を与えることがある。たとえば、Na+やLi+を輸送できない変異は、メリビオースの輸送は可能だけど、濃度勾配を通じて行われる。これは、輸送体内の特定の残基が結合と輸送活動において重要な役割を果たしていることを示している。
実験的方法
MelBStがどのように機能するかを理解するために、科学者たちは結合親和性を測定したり、変異の影響を観察したり、pHなどの外的条件が輸送活動に与える影響を評価したりするさまざまな実験を行っている。
輸送アッセイ
輸送アッセイでは、科学者たちは異なる条件下でMelBStがメリビオースをどれだけ効率よく輸送するかを測定している。結果は、特定の濃度と特定のイオンが存在する場合、MelBStが効率的にメリビオースを輸送できることを示した。しかし、これらのイオンがないと、輸送活動は減少した。
結合親和性測定
等温滴定熱量測定などの技術を使用して、研究者たちは異なる物質がMelBStにどれだけしっかり結合するかを測定している。これにより、メリビオース、Na+、H+間の相互作用に関する重要な情報が明らかになった。
変異体分析
科学者たちはまた、特定の変化がMelBStの機能にどのように影響するかを調べるために、変異体の研究も行っている。例えば、Na+を結合できない変異体はメリビオースを輸送できるけど、異なる方法で行っていて、輸送体のメカニズムの複雑さを示している。
pHの役割
MelBStの周囲のpHは、その機能に大きな影響を与える可能性がある。実験では、低いpH(より酸性の条件)では輸送活動が減少することが示されている。pHが上昇すると、輸送活動が改善され、この輸送体は特定のpHレベルを好むことが示唆されている。
結論
MelBStのような輸送タンパク質は、栄養の吸収や廃棄物の除去など、多くの生物学的機能に必要不可欠なんだ。これらのタンパク質がどのように機能するか、構造はどうか、物質とどのように結合し、変異が与える影響を理解することは、健康と病気におけるその役割についての貴重な洞察を提供してくれる。今後もこの分野の研究が、さまざまな医療条件においてこうした輸送体をターゲットにする戦略を開発するために重要なんだ。
タイトル: Distinct roles of the major binding residues in the cation-binding pocket of MelB
概要: Salmonella enterica serovar Typhimurium melibiose permease (MelBSt) is a prototype of the major facilitator superfamily (MFS) transporters, which play important roles in human health and diseases. MelBSt catalyzed the symport of galactosides with either H+, Li+, or Na+, but prefers the coupling with Na+. Previously, we determined the structures of the inward- and outward-facing conformation of MelBSt, as well as the molecular recognition for galactoside and Na+. However, the molecular mechanisms for H+- and Na+-coupled symport still remain poorly understood. We have solved two x-ray crystal structures of MelBSt cation-binding site mutants D59C at an unliganded apo-state and D55C at a ligand-bound state, and both structures display the outward-facing conformations virtually identical as published previously. We determined the energetic contributions of three major Na+-binding residues in cation selectivity for Na+ and H+ by the free energy simulations. The D55C mutant converted MelBSt to a solely H+-coupled symporter, and together with the free-energy perturbation calculation, Asp59 is affirmed to be the sole protonation site of MelBSt. Unexpectedly, the H+-coupled melibiose transport with poor activities at higher {Delta}pH and better activities at reversal {Delta}pH was observed, supporting that the membrane potential is the primary driving force for the H+-coupled symport mediated by MelBSt. This integrated study of crystal structure, bioenergetics, and free energy simulations, demonstrated the distinct roles of the major binding residues in the cation-binding pocket.
著者: Lan Guan, P. Hariharan, A. Bakhtiiari, R. Liang
最終更新: 2024-03-02 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.27.582382
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.27.582382.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。