植民地動物の魅力的な世界
ハイドラクティニアみたいなコロニー生物の生物学やユニークさを探ってみよう。
― 1 分で読む
目次
コロニア動物は、単独の動物とは全然違う成長の仕方をするユニークな生物群だよ。彼らは一人で生きるんじゃなくて、遺伝的に同じ小さな個体、ザウオイドから成り立ってるんだ。これらのザウオイドは生きた組織でつながってて、血液と神経信号のためのシステムを共有してる。コロニア動物の面白いところは、再生する能力があることだね。この能力は、多様な細胞に変わることができる多能性幹細胞から来てるんだ。
コロニア動物には、クラゲやチュニケート、ブリオゾアなどのいろんなグループがある。それぞれのコロニーはひとつの生物のように協力して働いていて、リソースや機能を共有してる。コロニーの中で、ザウオイドは異なる役割を果たすことができるんだ。例えば、あるザウオイドは食物の摂取に集中するかもしれないし、別のは繁殖や防御に集中するかもしれない。
アロレコグニションの重要性
遺伝的な均一性を保つために、コロニア動物はアロレコグニションって呼ばれるシステムを持ってることが多い。このシステムは、どの個体が自分たちのコロニーの一部か、それとも違うかを見分けるのに役立つんだ。アロレコグニションは、ある生物が他の生物のリソースを利用するような寄生の問題を避けるために発達した可能性がある。いろんなグループでこのシステムは見つかってるけど、責任を持つ遺伝子は種によって違うことが多い。
ハイドラクティニアを詳しく見てみる
ハイドラクティニアは、ヤドカリの殻に成長する特定のコロニア動物の属なんだ。一つの幼虫が殻に定着して成長し、新しい個体であるポリプを生み出すプロセスを経て、遺伝的に一致した特化したザウオイドのネットワークを作ることができるんだ。それぞれのコロニーは、捕食や繁殖のようなタスクに特化した異なるタイプのポリプを含むことがあるよ。
ハイドラクティニアのコロニー内のすべての細胞は、i-細胞って呼ばれる同じ多能性幹細胞から来てるけど、異なるタイプの動物が同じ細胞からできてるのか、特定の役割ごとに異なる細胞があるのかは、まだ完全には理解されてないんだ。
単細胞解析で細胞タイプを理解する
最近の技術の進歩、特に単細胞トランスクリプトミクスは、研究者が個々の細胞を分析して、遺伝子発現に基づいて分類することを可能にしてるんだ。いろんな生物の細胞タイプを研究することで、異なる生物部位の細胞構成を明らかにできるんだ。ただし、過去の研究は主に混合細胞ライブラリに焦点を当てていて、コロニーの特定の部分がどう機能するのかにはあまり光を当ててこなかった。
ここでの目標は、ハイドラクティニアのさまざまな細胞タイプの詳細なマップを作ること、コロニーの異なる機能的な部分からサンプリングを含めることだよ。研究者たちは、異なるサンプルから大量の細胞プロファイルを収集し、さまざまな細胞タイプと、それらの細胞に関連する遺伝子や因子を特定できたんだ。分析の結果、コロニーの異なる部分に多くの細胞タイプが見られることが分かったけど、量は異なっていて、特定の部分に特有のタイプもあることが分かったよ。
ハイドラクティニアの結果
研究は、ハイドラクティニアコロニーの細胞構成に大きな違いがあることを明らかにしたんだ。例えば、食用ポリプや性ポリプのように、異なるタイプのポリプにはさまざまな細胞タイプがあった。食用ポリプは消化に関与する細胞が多い傾向があり、性ポリプは生殖細胞が多いんだ。
統計分析を通じて、研究者たちはこれらの観察結果を確認し、特定のポリプのタイプに特に一般的な細胞があることを示したよ。例えば、食用ポリプには豊富な腺細胞や刺胞(刺すのに関与する細胞)があって、性ポリプには生殖細胞が豊富だったんだ。
これらのよく知られた細胞タイプに加えて、研究者たちは特化した細胞、特にストロンに主に見られるシマトリン様細胞も発見したんだ。これらの細胞は、コロニーの構造的誠実さに寄与するキチンや鉱物の生成に関与しているよ、貝類の殻形成のようにね。
遺伝子ネットワークと機能の分析
異なる細胞タイプがどうやって発展し機能するかを理解するために、研究者たちは一緒に発現する遺伝子のグループを分析したんだ。これらの遺伝子ネットワークを調べることで、特定の細胞タイプに関連するさまざまなモジュールを特定し、各々の重要な機能が明らかになったよ。
さまざまな細胞タイプで活動している遺伝子モジュールが見つかったんだ、上皮細胞も含まれていて、これはバリアを形成して組織を保護するのに関わってるんだ。他のモジュールは筋肉細胞や消化細胞にリンクしていて、コロニーの生存におけるこれらの細胞タイプの重要な役割を示してるよ。
主要な転写因子の特定
転写因子(TF)は遺伝子の発現を調整するんだ。彼らは細胞が特定のタイプに分化するかどうかを決定する上で重要な役割を果たすんだ。研究者たちは、ハイドラクティニアで800以上のTFを特定し、特定の細胞タイプで特有の発現パターンを示す69個に焦点を当てたんだ。これらの転写因子のつながりを分析することで、細胞タイプの発展における重要なプレーヤーを特定できたんだ。
研究者たちは、特定の細胞タイプの発展に関連する幾つかの重要なTFを見つけたよ。例えば、特定のTFは刺胞細胞や上皮細胞と関連付けられていて、これらの細胞の独特な特徴に関与していることを示唆してるんだ。
シマトリン様細胞のユニークな役割
いろんな細胞タイプの中で、シマトリン様細胞は特に興味深いね。これらの細胞は、貝類の殻形成に関与してることで知られる遺伝子を発現してるんだ。この研究は、シマトリン様細胞がハイドラクティニアコロニーでの鉱物生成プロセスに寄与してる可能性があることを示唆していて、ヤドカリの殻にしっかりと付着できるようにしてるかもしれないんだ。
シマトリン様細胞には、特定のゲノム位置に組織された遺伝子のクラスターが見つかっていて、他の生物の類似の遺伝子との進化的関係の可能性を示しているよ。分析の結果、これらの遺伝子はキチン生成と密接に関連してることが分かったんだ。
他の刺胞動物との比較
研究者たちは、コーラルやクラゲのような他の刺胞動物にも似たシマトリン様遺伝子が存在するか調べたよ。いくつかの関連種にはこれらの遺伝子が存在することが分かったけど、機能は異なることがあるんだ。これらの遺伝子を探す中で、同様の生体鉱化経路がハイドラクティニアに特有のものではなく、他の刺胞動物でも見られることを確認したんだ。
進化的洞察
この研究は、異なる細胞タイプがどう進化したのかについての洞察を提供するものだよ。結果は、多くの細胞タイプがコロニーの異なる部分で共有されている一方で、細胞の特化がこれらの動物が環境に適応する上で重要な要素だった可能性があることを示唆している。
ハイドラクティニアと他の生物との間でいくつかの遺伝子や機能が似ていることは、共通の祖先の起源を暗示しているけど、シマトリン様細胞の独特な役割は、ハイドラクティニア系統内で生まれたユニークな革新があるかもしれないことを示してるんだ。
結論
ハイドラクティニアの研究は、コロニア動物の複雑さと多様性について多くのことを明らかにしているよ。個々の細胞タイプとその機能を掘り下げることで、科学者たちはこれらの生物がどのように相互に関連したユニットとして機能するのかをよりよく理解できるんだ。この研究は、コロニア生物についての知識に貢献するだけでなく、彼らの生物学や進化のさまざまな側面を探求するための将来の研究の舞台を整えるものだよ。
技術が進化するにつれて、研究者たちはこれらの魅力的な生物についてさらに多くのことを発見するだろうし、私たちの海の中に見られる生物多様性への理解が深まるだろう。この研究は、生命の相互関連性が共有された特性と独自の適応を伴っていることを示していて、動物界における進化のダイナミックな性質を強調しているよ。
これらの小さくて複雑な生物を調べることで、私たちは地球上の生命がどのように進化し、環境の変化に直面してどのように適応し続けているのかについてのより広い洞察を得る道を開いているんだ。生物学の微視的な領域への冒険は、まだ始まったばかりだよ。
タイトル: The Hydractinia cell atlas reveals cellular and molecular principles of cnidarian coloniality
概要: Coloniality is a widespread growth form in cnidarians, tunicates, and bryozoans, among others. Despite being modular, composed of multiple zooids and supporting tissues, colonies function as a single physiological unit. A major question in the biology of colonies is the cellular mechanism of generating structurally and functionally distinct colony parts. The cnidarian Hydractinia establishes colonies with different types of zooids (polyps), interconnected by a gastrovascular system that is attached to the substrate and known as stolons. We obtained single cell transcriptomic profiles of [~]200K Hydractinia cells, including isolated stolons and two polyp types. We characterised the major Hydractinia cell types and quantified their abundance across colony parts. Overall, we find that distinct colony parts are characterised primarily by distinct combinations of shared cell types and to a lesser extent by part-specific cell types. Therefore, we propose that both cell type combinations, as well as rarer cell type innovations, have been the main mechanism in the evolution of coloniality in cnidarians. We identified cell type-specific transcription factors (TFs) and gene networks expressed within these cell types. Notably, we discovered a previously unidentified, stolon-specific cell type, which expresses enzymes related to biomineralization and chitin synthesis, reminiscent of molluscan shell matrix proteins that may represent a crucial adaptation to the animals habitat. In summary, the Hydractinia cell atlas elucidates the fundamental cellular and molecular mechanisms underlying coloniality.
著者: Jordi Solana, D. A. Salamanca-Diaz, H. R. Horkan, H. Garcia-Castro, E. Emili, M. Salinas-Saavedra, M. E. Rossi, M. Alvarez-Presas, R. M. Gabhann, F. Febrimarsa, A. Perez-Posada, N. J. Kenny, J. Paps, U. Frank
最終更新: 2024-06-20 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.18.599157
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.18.599157.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。