脳の活動をモデル化して行動の変動予測する
研究者たちが脳信号と行動の変動を結びつけるモデルを開発した。
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目次
研究者たちは、脳の活動が行動にどう影響するかを理解したいと思ってるんだ。だから、動物の多くのニューロンから電気信号を記録しながら、その行動を追跡することが多い。このプロセスは貴重なデータを提供するけど、いくつかの課題もある。主な目標の一つは、神経活動と行動のつながりを説明できるモデルを作ることだよ。
この記事は、感覚と動きに関与する特定の脳経路をモデル化する方法に焦点を当ててる。研究では、行動の変動性とスパイキング活動が異なる試行でどのように一致するかを見てる。研究者たちは、実際のニューロンの振る舞いを模倣する大きな人工ニューラルネットワークを使ってる。このネットワークを記録されたデータに基づいて調整することで、神経と行動の変動を正確に反映するモデルを作ることを目指してるんだ。
背景
ここ数年で、技術の進歩により、科学者たちは多くのニューロンの活動を高精度で記録できるようになった。この記録は行動測定と組み合わせることで、脳の働きについてのより明確な情報を得られる。でも、訓練された動物が同じ刺激に対して異なる反応を示すことはよくあることだ。たとえば、マウスは色々な理由でシンプルなタスクで報酬を逃すことがあるんだ。
この記事の目標は、脳の活動と行動の変動性に寄与する脳回路のシミュレーションを作ることだ。研究者たちは、シミュレーションされたスパイクが観察された神経活動と一致することを確実にするために、実際の生物学的プロセスを反映するモデルを開発してる。
新しいアプローチ
研究者たちは、複数の録音セッションにわたる神経記録と行動の相互作用をモデル化する方法を導入してる。以前のモデルは通常、単一セッションのデータしか考慮してなかった。この提案されたモデルは、複数のセッションからのデータを扱えるようになり、神経回路についてのより包括的な理解を可能にしてる。
このモデルは、再帰スパイキングニューラルネットワーク(RSNN)というタイプのニューラルネットワークを使用してる。このモデルのユニークな点は、記録された行動と神経活動の変動性を試行ごとに一致させることに重点を置いていることだ。研究者たちは、数学の手法である最適輸送を使って、記録された試行と生成された試行の間のスパイキング活動と動きの分布を比較する最良の方法を見つけようとしてる。
モデルの仕組み
RSNNは、実際のニューロンの振る舞いを模倣するように設計されてる。各ニューロンは興奮性か抑制性に分類され、ネットワークは正確なタイミングで動作する。研究者たちは、触覚から刺激に対する動きへの感覚運動経路を再現することを目指してる。
モデルをトレーニングするために、研究者たちはさまざまな脳の領域を含む複数のセッションからデータを収集する。モデルが記録されたデータに直接結びつくようにすることで、脳がどう機能しているかのより正確な表現を作ることができるんだ。
このプロセスの重要な部分は、モデルを記録された活動にフィットさせることだ。研究者たちはロス関数を使って、モデルをデータにより良く一致させる調整を行う。この関数は、実際のデータとシミュレーションされたデータの違いを測定し、モデルの継続的な改善を可能にするよ。
変動性を一致させる際の課題
この研究の主な課題の一つは、データに見られる変動性をキャプチャすることだ。研究者たちは、よく訓練された動物でも予測できない方法で反応することがあるため、すべての可能なシナリオを正確に反映するモデルを作るのが難しいと指摘してる。
新しい方法は、神経活動のリアルな分布を生成することでこの問題に対処してる。モデルを記録された活動と行動にフィットさせることで、研究者たちは試行ごとの変動性を効果的に捉えることができる。このアプローチにより、神経活動が成功した試行や失敗した試行など特定の行動に対応する時期を特定できるようになるんだ。
関連研究
過去には、多くの方法が神経データをフィットさせるために使われてきたが、通常は単一のニューロンや小さなネットワークに焦点を当ててた。これらの方法は、大きなネットワークの複雑さを捉えることには限界があった。いくつかの研究者は、複数のセッションにモデルを拡張しようとしたが、そのアプローチには制限があった。
著者たちは、他のモデルが変動性を説明するために潜在変数に依存していたのに対し、彼らの目標は神経活動を駆動する基礎的なメカニズムに対してより明確な視点を提供するモデルを開発することだと述べてる。ニューロンの相互作用についての構造的な仮定を避けることで、データに適応できるより柔軟なモデルを作りたいと思ってるんだ。
モデルの構築
研究者たちは、皮質神経ネットワークの働きを明示的にシミュレートするモデルを構築してる。彼らは、研究している行動に関連する感覚運動経路の重要な側面を取り入れたRSNNの作成に注力してる。
モデルの各ニューロンは、実際の録音から得られたデータに基づいて接続されてる。目標は、刺激が提示された時のニューロンの発火パターンを再現することだ。これを達成するために、モデルにはランダム性やノイズが組み込まれていて、実際のデータに見られる変動性を模倣するために重要なんだ。
モデルのトレーニング
モデルのトレーニングは、記録されたデータと生成されたデータの違いを最小限に抑えるために勾配降下法を使うことを含んでる。研究者たちは複数の試行をシミュレートし、試行平均と単一試行の統計を分析する。このプロセスがモデルがデータに学び、適応するのを助けるんだ。
最適化プロセスは数日間続き、その間にモデルは多くの反復を経る。モデルの性能を各ステップで評価することが重要で、データの正確な表現に向かって進んでいることを確信するために必要だよ。
主な発見
トレーニング後、研究者たちはモデルが記録されたデータと密接に一致するリアルな神経活動を生み出すことを観察する。ニューロンの発火率は実際の実験で観察されるものと比較可能だ。生成されたデータと記録されたデータの間の試行平均の相関は、モデルが神経活動の主要な傾向を効果的に捉えていることを示してる。
この研究での驚くべき成果の一つは、これまで特定されていなかったデータの追加の変動性の発見だ。この変動性は、タスクに直接関連しない動きにリンクしているように見えるんだ。
試行マッチングロス関数
この研究の中心的な革新は、試行マッチングロス関数で、観察されたデータとシミュレーションされたデータの分布の違いを定量化する。これにより、生成された神経活動にリアルな試行ごとの変動性を強制できるんだ。
最適輸送法を利用することで、研究者たちは生成された試行と記録された試行をより効果的に比較することができる。このアプローチによって、二つの間の違いが最小限に抑えられ、より正確なモデルにつながるんだ。
人工データによる検証
彼らの方法を検証するために、研究者たちは実データに似た特性を持つ人工的なデータセットを作成する。試行マッチングを使用したモデルは、神経活動の微妙な振る舞いを効果的に捉えることができると観察される。
結果を比較すると、試行マッチングを使わないモデルは人工データセットに見られる活動の分布を再現するのに苦労していることがわかる。これにより、彼らの提案した方法が試行ごとの変動性を正確にモデル化するうえで重要であることがさらに強調されるんだ。
実データへの応用
研究者たちは、自分たちのモデルアプローチを実際の電気生理学的録音に適用する。最適化プロセスの後、彼らはモデルが記録された神経活動と一致する結果を生み出し続けることを発見する。ニューロンの発火率や単一ニューロンの活動パターンの多様性は、観察されたデータに密接に似てるんだ。
試行ごとの変動性を評価する中で、研究者たちは彼らのモデルが神経活動の分布とそれに対応する動きをうまく捉えていることを認識する。これにより、行動が神経の発火パターンによってどのように影響を受けるかについての理解が深まるんだ。
変動性に関する洞察
分析中に、研究者たちは行動の変動性に寄与する重要な要因を特定する。彼らは、刺激に対する反応が動物の状態や気を散らすものなど、さまざまな外的および内的要因によって影響を受けることに注意する。これらのダイナミクスを考慮することは、正確なモデルを作るうえで重要だよ。
予想外にも、このモデルは意図したタスクに直接関連しない行動に光を当てる新しい変動性のモードを発見する。この発見は、モデルが神経回路内の複雑な相互作用を特定できることを示しているんだ。
結論
研究者たちは、神経活動と行動の相互作用を理解するための頑丈なモデルアプローチを導入した。データに基づいたRSNNと試行マッチングロス関数を使用することで、彼らは実際の神経データに存在する変動性を正確に反映するモデルを作ることに成功したんだ。
この研究は、脳が情報を処理し、行動に影響を与える方法についての理解を深める。発見は、生物学的に解釈可能なモデルを開発するための継続的な努力に貢献し、最終的には神経メカニズムや行動を支配するプロセスについてのより深い洞察に繋がるかもしれない。
今後の方向性
研究者たちは、神経のダイナミクスの追加の側面を調査することで、自分たちの発見を基に向上させていくことを目指してる。動物の異なる状態が神経の変動性や行動にどう影響するかを探求し、さらに包括的なモデルを作ることを望んでいるんだ。
さらに、研究者たちは、彼らの方法が他の神経科学研究の分野にも適用できると見込んでる。試行ごとの変動性をモデル化するための技術を洗練させることで、多様な神経システムやそれらの相互作用の理解を深めたいと思っているんだ。
要するに、この研究は脳の機能と行動の複雑さを理解するための重要な一歩を示している。研究とモデルアプローチの洗練を続けることで、研究者たちは脳の働きとそれが行動に与える影響についての新しい洞察を解き明かすことが期待されているんだ。
タイトル: Trial matching: capturing variability with data-constrained spiking neural networks
概要: Simultaneous behavioral and electrophysiological recordings call for new methods to reveal the interactions between neural activity and behavior. A milestone would be an interpretable model of the co-variability of spiking activity and behavior across trials. Here, we model a mouse cortical sensory-motor pathway in a tactile detection task reported by licking with a large recurrent spiking neural network (RSNN), fitted to the recordings via gradient-based optimization. We focus specifically on the difficulty to match the trial-to-trial variability in the data. Our solution relies on optimal transport to define a distance between the distributions of generated and recorded trials. The technique is applied to artificial data and neural recordings covering six cortical areas. We find that the resulting RSNN can generate realistic cortical activity and predict jaw movements across the main modes of trial-to-trial variability. Our analysis also identifies an unexpected mode of variability in the data corresponding to task-irrelevant movements of the mouse.
著者: Christos Sourmpis, Carl Petersen, Wulfram Gerstner, Guillaume Bellec
最終更新: 2023-12-01 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://arxiv.org/abs/2306.03603
ソースPDF: https://arxiv.org/pdf/2306.03603
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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