ケニアでの土壌由来の線虫に関する調査方法の改善
新しいモデルは、STH感染の追跡と制御を強化することを目指している。
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目次
土壌を媒介とした腸内寄生虫(STHs)は、人間の腸に感染するワームの一種で、卵で汚染された土を通じて広がるんだ。最も一般的なSTHsには、回虫(Ascaris lumbricoides)、鞭虫(Trichuris trichiura)、いくつかのフックワーム(たとえば、アンキロストマ・デュオデナレやネカトル・アメリカヌス)がある。これらのワームは、広がり方や診断方法、感染の制御と予防法が似ているから一緒にまとめられることが多い。特に貧しい地域の子供たちなんかは、同時に複数のタイプのSTHに感染することがあるんだ。世界中で10億人以上がこれらのワームに感染していて、これが最も一般的な無視されてる熱帯病の一つになってる。感染は主に衛生状態が悪い地域、特にサハラ以南のアフリカや東南アジアで多くて、公共の健康上の大きな問題を引き起こしてるよ。
世界保健機関の推奨事項
世界保健機関(WHO)は、STHsによる健康問題を減らすための複合的なアプローチを提案してる。これには、衛生へのアクセスの改善、衛生についての教育の提供、学校プログラムを通じて学校年齢の子供たちに予防的な治療を提供することが含まれている。目標は、2030年までにこれらの子供たちの中等度および重度の感染を2%未満に減らすこと。進捗を追跡するために、治療サイクルの前後で感染している学生の数を推定するために学校で調査が行われているんだ。
より良い調査デザインの必要性
STHsが一般的な地域では、健康プログラムの資金が限られていることが多い。感染率をチェックするための定期的な調査は高くつくことがあるから、こうした調査は慎重にデザインすることが重要だよ。目的は、コストを低く抑えながら感染率を正確に測定すること。過去の研究では、統計モデルを使うと従来の方法に比べてこれらの調査の精度が向上することが示されている。この研究では、これらのモデルを他のモデルと組み合わせることで、将来の感染率をより良く予測でき、より効果的な調査のデザインに役立つかどうかを調べてるんだ。
ケニアでのデータ収集
STHの感染率と治療のカバレッジに関するデータが、ケニアの16の地区から集められた。この情報は、2012年から2017年の間に行われた年次学校去虫プログラムによる感染率の変化を監視するために集められたんだ。各地区の治療カバレッジ率は、治療の各ラウンドの前に行われた調査に基づいていて、地域ごとに記録されている。このデータは、腸内寄生虫感染に特化したオンラインプラットフォームを通じて公開されているよ。
研究分析のステップ
この研究には主に3つのステップが含まれている:
調査データのモデル化:最初のステップは、治療前に収集した調査データに基づいてSTHの感染率を推定するための統計モデルを作成することだった。植物や土壌の湿度などの環境要因を含めることで、モデルの精度を向上させたよ。
将来の有病率の予測:第二のステップでは、基準となる感染率を取り、2つの異なる方法(マルコフモデルとメカニスティックモデル)を使って将来の有病率を予測した。マルコフモデルは既存の調査データを使用し、メカニスティックモデルは初期データと治療のカバレッジ率に基づいて予測を行ったんだ。
シミュレーション研究:最後に、異なる調査デザインがどれだけ感染レベルの異なる地域を正確に特定できるかを試すためのシミュレーション研究が行われた。調査で異なる数の学校と子供をサンプルする場合にどうなるかを探ったよ。
調査データのモデル化
最初のステップでは、各タイプのSTHに対して調査データに統計モデルが当てはめられた。これらのモデルは、異なる地域の感染率の詳細なイメージを作成するのに役立った。研究者たちは、ワームの感染を影響することが知られている環境要因を見て、モデルの精度を向上させた。結果は感染率の基準的理解を提供するものとなったんだ。
将来の感染率の予測
第二のステップでは、将来の感染率を予測することに焦点を当てた。これには2つの方法が使われた:
マルコフモデル:この方法は、調査間での感染率の変化を推定し、治療の履歴を使って将来の感染の分類を予測する。研究者たちは基準となる調査と中間調査の率を使ってこれらの予測を行ったよ。
メカニスティックモデル(WORMSIM):このモデルは、ワームが時間とともに人間を感染させる様子をシミュレートし、治療の効果を組み込んでいる。中間データは必要ないから、そういったデータがない地域でも使いやすいんだ。
予測モデルの結果
両方のモデルは感染率を正確に予測しようとしたけど、限界があった。マルコフモデルは一般的に感染率が低い地域でよく機能したけど、メカニスティックモデルは高い有病率の地域では問題を抱えていた。どちらのモデルも、治療後に感染が減少しなかった一部のホットスポットを見逃していたよ。
STHの種についての発見
- Ascaris lumbricoides:マルコフモデルは、感染率が高い地域でしばしば感染率を過小評価しちゃった。
- Trichuris trichiura:両方のモデルは特定の地域での有病率を正確に予測するのが難しかったけど、メカニスティックモデルの方が若干良かった。
- フックワーム種:両方のモデルはフックワームの有病率を予測するのが得意で、治療後に率が一貫して減少したからね。
調査デザインシミュレーション研究
シミュレーション研究は、異なる調査デザインが感染レベルに基づいて地域を分類できるかどうかを評価した。主な発見には以下が含まれる:
- 学校ごとにサンプルを取る子供の数が多いほど、分類の精度が良くなった。
- 最も良い情報(地理統計モデルの予測)に基づいた調査が総じて最も良い結果を出した。
- マルコフモデルとメカニスティックモデルを使った調査のパフォーマンスは一般的に低く、特にマルコフモデルに関してはそうだったよ。
結論
この研究は、ケニアでのSTHの感染率を予測するための2つの異なる方法を比較して、調査デザインをどれだけ導けるかに注目している。メカニスティックモデルがより良い予測を提供することが分かって、より効果的な調査デザインにつながる可能性があるんだ。これらの発見は、他の無視されている熱帯病にも広い意味を持っていて、公共の健康に関する決定を導くために信頼できるモデルやデータを使用することの重要性を強調している。
要するに、より良いモデリングを通じて調査デザインを改善することで、特にリソースが限られている地域でのSTH感染の制御と予防の能力を高めることができるよ。この研究は、STHsがもたらす公衆衛生の課題に取り組むために、正確な予測と効率的なリソースの使用が必要であることを強調してるんだ。
タイトル: A comparison of Markov and mechanistic models for soil-transmitted helminth (STH) prevalence projections in the context of survey design
概要: Globally, there are over one billion people infected with soil-transmitted helminths (STHs), mostly living in marginalised settings with inadequate sanitation in sub-Saharan Africa and Southeast Asia. The WHO recommends an integrated approach to STH morbidity control through improved access to sanitation and hygiene education, and the delivery of preventive chemotherapy (PC) to school age children delivered through schools. Progress of STH control programmes is currently estimated using a baseline (pre-PC) school-based prevalence survey and then monitored using periodical school-based prevalence surveys, known as Impact Assessment Surveys (IAS). We investigated whether integrating geostatistical methods with a Markov model or a mechanistic transmission model for projecting prevalence forward in time from baseline can improve IAS design strategies. To do this, we applied these two methods to prevalence data collected in Kenya, before evaluating and comparing their performance in accurately informing optimal survey design for a range of IAS sampling designs. We found that although both approaches performed well, the mechanistic method more accurately projected prevalence over time and provided more accurate information for guiding survey design. Both methods performed less well in areas with persistent STH hotspots where prevalence did not reduce despite multiple rounds of PC. Our findings show that these methods can be useful tools for more efficient and accurate targeting of PC. The general framework built in this paper can also be used for projecting prevalence and informing survey design for other NTDs.
著者: Claudio Fronterre, M. T. Eyre, C. A. Bulstra, O. Johnson, S. J. de Vlas, P. J. Diggle, L. E. Coffeng
最終更新: 2023-10-03 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.02.23296429
ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.02.23296429.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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