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# Scienze della salute# Medicina genetica e genomica

Auto-Riferimento del Paziente: Un Passo Verso Diagnosi Migliori

Nuovi approcci nella segnalazione dei sintomi da parte dei pazienti potrebbero migliorare l'accuratezza nella diagnosi.

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I pazienti con malattie non diagnosticate spesso girano da un dottore all'altro e passano un sacco di tempo online a cercare supporto. Descrivono i loro Sintomi in dettaglio, ma di solito non usano un linguaggio che i computer possono capire. Questo rende difficile per i medici usare queste informazioni nel loro lavoro. Inoltre, quando i pazienti vedono specialisti, spesso la comunicazione tra di loro è scarsa. Capire bene i sintomi di un paziente è fondamentale per fare una Diagnosi corretta. Questa comprensione può anche guidare i test genetici che potrebbero aiutare a arrivare a una diagnosi. Mentre gli strumenti per analizzare i dati genetici sono migliorati nel tempo, raccogliere dati dettagliati sui sintomi non è diventato più facile o più economico. Una strategia che si sta usando è portare i pazienti in cliniche specializzate dove possono far valutare i loro sintomi da diversi dottori in un solo posto.

L'Ontologia del Fenotipo Umano (HPO)

L'Ontologia del Fenotipo Umano è una raccolta dettagliata di termini che descrivono sintomi associati a diverse malattie. È stata creata per catturare informazioni dettagliate sui sintomi di un paziente. Usando queste informazioni, i medici possono lavorare per identificare la malattia più probabile che un paziente può avere e possono collegare i pazienti con altri che hanno sintomi simili. Negli ultimi anni, c'è stata una crescita nell'uso di modelli che confrontano i sintomi tra pazienti per migliorare la diagnosi. Questo ha portato allo sviluppo di vari algoritmi che calcolano quanto i sintomi di un paziente corrispondano a quelli di malattie conosciute.

Nel processo abituale di valutazione di un paziente con una condizione non diagnosticata, un team medico fa una valutazione dettagliata dei sintomi e crea un elenco di termini dall'HPO che caratterizzano questi sintomi. Tuttavia, questo processo approfondito potrebbe comunque perdere dettagli importanti. I pazienti spesso hanno conoscenze approfondite sui loro sintomi che potrebbero non essere catturate durante le valutazioni mediche. Alcuni sintomi potrebbero non essere immediatamente visibili, non essere chiesti o non essere comunicati efficacemente tra diversi fornitori di assistenza sanitaria. Pertanto, permettere ai pazienti di descrivere i loro sintomi potrebbe essere un'integrazione importante alla storia medica, alla valutazione e ai test usati per identificare un disturbo genetico. Questa auto-descrizione potrebbe essere particolarmente cruciale per i pazienti che non possono accedere a valutazioni specializzate da parte di dottori. Usare l'auto-descrizione dei pazienti potrebbe risparmiare tempo e denaro, riducendo i colli di bottiglia nel processo di test. Ma soprattutto, permetterebbe ai pazienti di avere un ruolo più attivo nella propria salute.

Approcci di Auto-Fenotipizzazione

Data la potenziale utilità di far descrivere ai pazienti i propri sintomi, sono stati sviluppati diversi metodi. Un metodo comune è quello di far rispondere ai pazienti a domande in sondaggi che chiedono informazioni sui loro sintomi, con le risposte poi abbinate ai termini dell'HPO. Un esempio è GenomeConnect, un registro pazienti che mira a collegare pazienti e fornire informazioni sulle loro condizioni genetiche. Il sondaggio di GenomeConnect include termini comuni sui sintomi basati su vari sistemi del corpo e consente descrizioni aggiuntive in testo libero. I pazienti che forniscono certe risposte possono ricevere sondaggi di follow-up che approfondiscono sintomi specifici. Ad esempio, se un paziente menziona di avere crisi, potrebbe ricevere un sondaggio specifico sulle crisi per avere informazioni più dettagliate.

Anche se GenomeConnect raccoglie informazioni preziose, il suo sondaggio non è stato originariamente progettato per la diagnosi, quindi non è stato testato per confermare che i termini derivati da esso riflettano accuratamente i sintomi di un paziente. La convalida dei metodi di auto-descrizione è importante perché dimostra che i pazienti possono fornire informazioni strutturate che potrebbero essere utili nella diagnosi. Un altro metodo di auto-descrizione permette ai pazienti di selezionare direttamente i termini dell'HPO che si riferiscono ai loro sintomi. Tuttavia, poiché molti di questi termini sono gergo medico, potrebbero non essere familiari ai pazienti. Pertanto, è necessario tradurre questi termini in un linguaggio più semplice. L'Iniziativa Monarch ha preso in carico questo compito creando versioni per la gente comune dei termini dell'HPO, rendendoli più accessibili ai pazienti.

Valutazione dei Metodi

L'obiettivo di uno studio recente era confrontare i due metodi di auto-fenotipizzazione: il sondaggio GenomeConnect e la versione per la gente comune dell'HPO, per vedere quale fosse più efficace per i pazienti. Lo studio mirava a determinare se l'uso di questi metodi portasse a profili utili e accurati che corrispondano a malattie note. Per ogni malattia rara, ci sono profili sintomatici standard curati dalla letteratura medica. Non tutti questi termini medici possono essere facilmente tradotti in linguaggio comune, e molti termini di GenomeConnect non possono essere mappati direttamente all'HPO. Quindi, capire quanto possa essere ricco ogni profilo sintomatico può influenzare la diagnosi.

Per valutare il potenziale di questi metodi di auto-reporting, i ricercatori hanno creato profili massimi immaginari (TMax) per entrambi gli strumenti basati sul numero più alto di termini che potevano essere utilizzati per il confronto. Hanno anche generato profili "realistici" (Sim) aggiungendo variazioni e omissioni per mimare come i pazienti potrebbero descrivere i loro sintomi. Questo è stato fatto per capire quanto bene i profili riportati dai pazienti si allineano con i profili reali per varie malattie.

I due strumenti di auto-fenotipizzazione sono stati poi presentati ai pazienti. I partecipanti erano o quelli che frequentavano un centro medico o quelli già iscritti a un registro pazienti. Tutti i partecipanti avevano diagnosi verificate di malattie rare. Sono stati invitati a completare uno o entrambi gli strumenti. I pazienti che hanno completato solo uno strumento hanno ricevuto un compenso, mentre quelli che hanno completato entrambi hanno ricevuto un importo maggiore per incoraggiare la partecipazione.

Confronto degli Strumenti

I ricercatori hanno confrontato i profili generati dal sondaggio GenomeConnect e dalla versione per la gente comune dell'HPO con profili simulati di pazienti. Hanno analizzato quanto bene questi profili auto-riportati si comportassero nell'identificare le malattie corrette. Hanno anche valutato quanto fossero specifici e accurati i profili rispetto ai profili standard utilizzati dai medici.

Attraverso questo confronto, è emerso che il sondaggio GenomeConnect ha prodotto profili generalmente più vicini alla simulazione di malattie note rispetto a quelli dello strumento Phenotypr. Tuttavia, lo strumento Phenotypr ha mostrato meno variabilità nei suoi risultati, indicando un certo grado di precisione che lo rendeva utile in determinati contesti. Anche se si è scoperto che l'approccio GenomeConnect era generalmente più accurato, la mancanza di differenze significative rispetto ai profili clinici standard suggeriva che le prestazioni di entrambi gli strumenti potrebbero variare in base al contesto.

Un altro aspetto importante dello studio sono state le interviste condotte con i partecipanti dopo l'uso di entrambi gli strumenti. I pazienti hanno preferito l'approccio strutturato a risposta multipla del sondaggio GenomeConnect, che ha reso più facile per loro fornire risposte. Tuttavia, hanno anche apprezzato le risposte dettagliate consentite da Phenotypr. Alcuni utenti hanno trovato difficile digitare per Phenotypr e hanno preferito un formato a lista da cui scegliere.

Risultati Chiave

Lo studio ha messo in evidenza diversi punti importanti. In primo luogo, permettere ai pazienti di auto-descrivere i propri sintomi potrebbe essere un'aggiunta preziosa alle valutazioni mediche. Entrambi gli strumenti di auto-fenotipizzazione possono consentire ai pazienti di fornire informazioni essenziali che potrebbero aiutare nella diagnosi. Anche se GenomeConnect si è rivelato più accurato, Phenotypr ha offerto uno sguardo più completo ai sintomi e potrebbe aiutare a identificare condizioni con maggiori livelli di dettaglio.

Inoltre, la ricerca ha indicato la necessità di lavori futuri per trovare un equilibrio tra facilità d'uso e ricchezza dei dati sui sintomi. Un approccio ibrido che unisca la semplicità delle domande a scelta multipla con la profondità delle risposte aperte potrebbe essere il modo migliore per sviluppare strumenti di auto-fenotipizzazione efficaci.

Direzioni Future

Lo studio ha anche sottolineato la necessità di testare questi strumenti di auto-fenotipizzazione con una popolazione più diversificata e non diagnosticata. Questo aiuterebbe a capire le loro vere prestazioni in un contesto clinico. Dovrebbero esserci anche sforzi per coinvolgere più gruppi sotto-rappresentati per garantire una gamma più ampia di esperienze e prospettive nella segnalazione dei sintomi.

Alcune limitazioni dello studio sono state riconosciute, come la mancanza di diversità nel campione dei partecipanti. La maggior parte dei rispondenti era bianca e femmina, spesso madri di figli con condizioni. Questo squilibrio demografico mostra la necessità di raggiungere comunità più variegate quando si conducono ricerche di questo tipo.

Conclusione

In conclusione, sia il sondaggio GenomeConnect che Phenotypr hanno dimostrato potenzialità nell'aiutare i pazienti a condividere le loro informazioni sui sintomi. Anche se GenomeConnect si è rivelato generalmente più accurato, la precisione di Phenotypr merita ulteriori esplorazioni, suggerendo che un approccio combinato potrebbe essere più efficace. L'obiettivo finale è migliorare il processo diagnostico aumentando la partecipazione dei pazienti e la comunicazione con i clinici. Andando avanti, i ricercatori dovrebbero concentrarsi su come perfezionare questi strumenti per assicurarsi che siano sia efficaci che facili da usare, permettendo ai pazienti di contribuire in modo significativo ai loro percorsi di assistenza sanitaria.

Fonte originale

Titolo: Development of self-phenotyping tools to empower patients and improve diagnostics

Estratto: Deep phenotyping is important for improving diagnostics and rare diseases research and is especially effective when standardized using Human Phenotype Ontology (HPO). Patients are an under-utilized source of information, so to facilitate self-phenotyping we previously "translated" HPO into plain language ("layperson HPO"). Another self-phenotyping survey, GenomeConnect, asks patient-friendly questions that map to HPO. However, self-reported data has not been assessed. Since not all HPO terms are translated to layperson HPO or in the GenomeConnect survey, we created theoretical maximum-accuracy phenotype profiles for each disease for each instrument, representing the theoretical maximum performance. Both instruments performed well in analyses of semantic similarity (area under the curve 0.991 and 0.954, respectively). To explore the real-world implications, we randomized participants with diagnosed genetic diseases to complete the GenomeConnect, Phenotypr, or both instruments. For each diagnosed disease, we compared the derived disease profile to the patient-completed profile for each instrument. Profiles resulting from participant responses to the GenomeConnect survey were more accurate than to the Phenotypr instrument. The Phenotypr instrument had a tighter distribution of scores for respondents who did both instruments and was therefore more precise. We evaluated the ability of each known Mendelian disease HPO phenotype profile to retrieve the corresponding disease. We conducted interviews and generally participants preferred the GenomeConnect multiple choice format over the autocomplete Phenotypr format. Our results demonstrate that individuals can provide rich HPO phenotype data. These results suggest that self-phenotyping source of information could be used to support diagnostics or supplement profiles created by clinicians.

Autori: Melissa A Haendel, K. Shefchek, S. Ziniel, J. A. McMurry, C. A. Brownstein, J. S. Brownstein, E. R. Riggs, M. Might, D. Smedley, A. Clugston, A. H. Beggs, H. Paterson, P. N. Robinson, N. A. Vasilevsky, I. A. Holm

Ultimo aggiornamento: 2024-06-14 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.06.13.24308791

Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.06.13.24308791.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia medrxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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