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# Biologie# Neurowissenschaften

Fortschritte in der Verhaltensvorhersage durch neuronale Daten

Innovative Methoden verbessern die Vorhersagen über Hirnaktivität und Verhalten mit komplexen Daten.

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Inhaltsverzeichnis

Neueste Fortschritte bei Forschungsmethoden ermöglichen es Wissenschaftlern, das Verhalten von Tieren in Echtzeit zu verfolgen und die Aktivität vieler Gehirnzellen gleichzeitig aufzuzeichnen. Das hat zu grossen und komplexen Datensätzen in der Neurowissenschaft geführt, die oft verschiedene Arten von Informationen zusammenbringen, wie Gehirnaktivität und Verhalten. Zu verstehen, wie die Aktivität des Gehirns mit komplexen Verhaltensweisen zusammenhängt, ist ein zentrales Anliegen der Systemneurowissenschaften.

Um die neuronalen und Verhaltensdaten zu verstehen, haben Forscher verschiedene Modelle erstellt. Diese Modelle helfen dabei, die Gehirnaktivität basierend auf beobachtetem Verhalten zu erklären oder umgekehrt. Es ist wichtig, dass diese Modelle die natürliche Variabilität bei der Datenerhebung berücksichtigen. Je komplexer und unbeschränkter die gesammelten Daten sind, desto kritischer wird dieser Aspekt.

Sowohl die Aufgabe, die Gehirnaktivität basierend auf Verhalten zu verstehen, als auch umgekehrt, kommen darauf an, bestimmte Beziehungen zu berechnen. Zum Beispiel wird bei einer Studienart untersucht, wie die Gehirnaktivität durch Verhalten vorhergesagt werden kann. Eine gegenteilige Studie würde betrachten, wie Verhalten aus der Gehirnaktivität vorhergesagt werden kann. Eine wichtige Herausforderung besteht darin, nützliche Vorhersagen aus diesen komplexen Datensätzen zu machen.

Modelle wie latente Variablenmodelle wurden entwickelt, um mit den vielen Dimensionen der Daten umzugehen, die aus dem Studium von Gehirn und Verhalten stammen. Diese Modelle können die Komplexität der Daten reduzieren, indem sie wichtige Muster finden. Die Herausforderung besteht darin, Modelle zu schaffen, die keine zu vereinfachten Annahmen erfordern, da dies die Realität der Daten verfehlen könnte. Jüngste Fortschritte in der Deep-Learning-Technik haben es Forschern ermöglicht, einige dieser Annahmen zu lockern und komplexe Beziehungen in den Daten zu erfassen.

Variational Autoencoders

Eine Methode, die heraussticht, sind die Variational Autoencoders (VAE). VAEs können dabei helfen, versteckte Muster in den Daten aufzudecken, indem sie beobachtete Informationen verarbeiten, um Vorhersagen über nicht beobachtete Informationen zu treffen. Insbesondere sequentielle VAEs können auf Zeitreihendaten angewendet werden, was sie geeignet macht, um Verhaltens- und Gehirnaktivitäten über die Zeit zu untersuchen.

Obwohl VAEs leistungsstark sind, stehen sie vor Herausforderungen, wenn es darum geht, grosse Datenmengen zu berechnen. Sie benötigen in der Regel vollständig beobachtete Eingabedaten, um effektiv zu arbeiten, was in experimentellen Umgebungen einschränkend sein kann. Viele Analysen müssen mit Daten umgehen, die möglicherweise unvollständig sind oder bestimmte Teile fehlen.

Um diese Herausforderungen zu bewältigen, haben Forscher eine Methode vorgeschlagen, die VAEs verbessert, indem sie es ihnen ermöglicht, mit teilweise beobachteten Daten zu arbeiten. Dies beinhaltet einen neuen Trainingsansatz, bei dem während des Trainings Teile der Daten maskiert werden.

Maskierte Trainingsmethode

Der maskierte Trainingsansatz wurde entwickelt, um VAEs zu helfen, nicht beobachtete Daten aus beobachteten Daten vorherzusagen. Während dieses Trainings werden bestimmte Teile der Eingabedaten maskiert, was bedeutet, dass sie nicht in die Berechnungen einbezogen werden. Das Modell wird dann trainiert, um sich nur auf die unmaskierten Daten zu konzentrieren.

Diese Methode fördert ein besseres Lernen von Mustern und Beziehungen in den Daten, was zu genaueren Vorhersagen führt. Die Ergebnisse zeigen, dass dieser Ansatz in verschiedenen Situationen angewendet werden kann, etwa beim Studium von Verhaltensweisen bei Tieren wie der Fruchtfliege oder bei der Analyse von Gehirndaten von Affen.

In einer Studie verwendeten Forscher dieses maskierte Training, um zu untersuchen, wie Fruchtfliegen sich bewegen. Sie sammelten Daten, indem sie die Bewegungen bestimmter Körperteile verfolgten, während die Fliegen liefen. Durch das Maskieren der Daten zu bestimmten Gliedmassen während des Trainings konnte das Modell die Bewegungen genauer vorhersagen. Es stellte sich heraus, dass es besser darin war, realistische Bewegungsmuster zu generieren als Modelle, die nicht den maskierten Ansatz verwendeten.

In einem anderen Experiment analysierten Forscher die Reichbewegungen von Affen. Die Studie zeichnete die neuronale Aktivität auf, während die Affen nach Zielen griffen. Durch die Anwendung der maskierten Trainingsmethode konnte das Modell die aufgezeichneten neuronalen Daten genau mit den Bewegungen der Affen verbinden, was zu verbesserten Vorhersagen für sowohl Verhalten als auch Gehirnaktivität führte.

Bedeutung von Genauigkeit und Unsicherheit

Wenn es um Vorhersagen geht, ist es wichtig, nicht nur die Genauigkeit, sondern auch das Niveau der Unsicherheit rund um diese Vorhersagen zu verstehen. Genauigkeit sagt uns, wie nah die Ergebnisse an der Realität sind, während Unsicherheit uns Einblicke gibt, wie zuverlässig diese Vorhersagen basierend auf den verfügbaren Daten sind.

Viele traditionelle Modelle treffen oft selbstbewusste Vorhersagen, sind aber nicht immer genau. Die Betonung der Unsicherheit kann die Zuverlässigkeit von Vorhersagen in Anwendungen wie Gehirn-Computer-Schnittstellen verbessern, wo falsche Vorhersagen ernste Folgen haben können.

Der maskierte Trainingsansatz hilft, die Unsicherheit zu verbessern, indem er es dem Modell ermöglicht, zu wissen, wann es unsicher über seine Vorhersagen ist. Dieser Aspekt ist in wissenschaftlichen Anwendungen entscheidend, da das Verständnis des Vertrauens in die Vorhersagen die Entscheidungsfindung beeinflussen kann.

Anwendungen über die Neurowissenschaft hinaus

Die maskierte Trainingsmethode ist nicht auf die Neurowissenschaft beschränkt. Ihre Fähigkeit, Vorhersagen aus nicht beobachteten Daten zu modellieren und zu generieren, kann auf verschiedene Bereiche ausgeweitet werden, in denen Daten möglicherweise unvollständig oder verloren sind. Zum Beispiel in Situationen, in denen einige Messungen aufgrund von Geräteschäden verloren gehen, könnte dieser Ansatz die Lücken füllen, indem er die fehlenden Werte basierend auf verfügbaren Daten vorhersagt.

Darüber hinaus kann das Rauschen, das in vielen Datensätzen vorhanden ist, durch diese Methode angegangen werden, was die Qualität der Vorhersagen selbst in herausfordernden Situationen verbessert. Das eröffnet Möglichkeiten, die maskierte Trainingsmethode in Bereichen wie der klinischen Forschung zu nutzen, wo die Datenqualität ein erhebliches Anliegen sein kann.

Indem sie die Unsicherheiten neben den Daten untersuchen und vorhersagen, können Forscher auch Fehler in den gemessenen Werten korrigieren, was besonders nützlich ist in Bereichen, die eine hohe Zuverlässigkeit von ihren Daten erfordern.

Fazit

Zusammenfassend ermöglichen Fortschritte beim Verfolgen von Tierverhalten und der Aufzeichnung von Gehirnaktivität den Wissenschaftlern, zunehmend komplexe Datensätze zu sammeln. Durch die Nutzung innovativer Modelle wie VAEs und deren Verfeinerung mit maskiertem Training können Forscher diese Datensätze effektiv analysieren, um bedeutungsvolle Einblicke zu gewinnen.

Die Fähigkeit, Unsicherheiten zu modellieren, ist ebenso wichtig, da sie die Vertrauenswürdigkeit der Ergebnisse erhöht. Mit Anwendungen, die über die Neurowissenschaft hinausgehen, birgt diese Methodik vielversprechendes Potenzial für zukünftige Forschungen in verschiedenen wissenschaftlichen Disziplinen.

Beim Navigieren durch die Herausforderungen, die hochdimensionale Daten mit sich bringen, sticht der maskierte Trainingsansatz als wertvolles Werkzeug hervor, um die Lücke zwischen komplexer Datensammlung und bedeutungsvoller wissenschaftlicher Analyse zu überbrücken. Seine Anwendungen in der Vorhersage von Verhalten und Gehirnaktivität zeigen seine Vielseitigkeit und Relevanz in der heutigen sich entwickelnden wissenschaftlichen Landschaft und ebnen den Weg für zukünftige Studien, die auf diesen grundlegenden Erkenntnissen aufbauen.

Originalquelle

Titel: Modeling conditional distributions of neural and behavioral data with masked variational autoencoders

Zusammenfassung: Extracting the relationship between high-dimensional recordings of neural activity and complex behav- ior is a ubiquitous problem in systems neuroscience. Toward this goal, encoding and decoding models attempt to infer the conditional distribution of neural activity given behavior and vice versa, while dimensionality reduc- tion techniques aim to extract interpretable low-dimensional representations. Variational autoencoders (VAEs) are flexible deep-learning models commonly used to infer low-dimensional embeddings of neural or behavioral data. However, it is challenging for VAEs to accurately model arbitrary conditional distributions, such as those encountered in neural encoding and decoding, and even more so simultaneously. Here, we present a VAE-based approach for accurately calculating such conditional distributions. We validate our approach on a task with known ground truth and demonstrate the applicability to high-dimensional behavioral time series by retrieving the condi- tional distributions over masked body parts of walking flies. Finally, we probabilistically decode motor trajectories from neural population activity in a monkey reach task and query the same VAE for the encoding distribution of neural activity given behavior. Our approach provides a unifying perspective on joint dimensionality reduction and learning conditional distributions of neural and behavioral data, which will allow for scaling common analyses in neuroscience to todays high-dimensional multi-modal datasets.

Autoren: Auguste Schulz, J. Vetter, R. Gao, D. Morales, V. Lobato-Rios, P. Ramdya, P. J. Goncalves, J. H. Macke

Letzte Aktualisierung: 2024-04-25 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.19.590082

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.19.590082.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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