ペットのX線分析の新しい方法
ペットのX線で胸の対称性をチェックする方法。診断をより良くするために。
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目次
犬や猫の胸部X線は健康問題をチェックするのによく使われるけど、ペットがじっとしてくれないから画像を撮るのが大変なんだよね。人間みたいに協力してくれないし、体の形やサイズもバラバラだしさ。X線を撮るときにペットの位置が正しくないと、健康について間違った結論を出しちゃうことがある。一つのサインは胸の左右側がすごく違って見えること。そこで、その違いを自動的にチェックする方法を提案するよ。
アプローチ
まず、胸の左右の半分を特定する方法を設計したんだ。これは畳み込みニューラルネットワーク(CNN)というコンピュータープログラムを使ってる。具体的には、U-Netというモデルを使ってX線画像の肋骨と脊椎を見つけたよ。それから、アクティブコンター技術を使って胸の左右を見つけたんだ。そのエリアからデータを集めて、サポートベクターマシン(SVM)、勾配ブースティング、マルチレイヤーパーセプトロン(MLP)みたいな分類器を教えた。信頼性を確保するために、何度もテストして、いろんな方法で結果を測定したよ。
結果
900枚のX線画像を見たところ、胸の左右が対称かどうかを判断する精度が良かったよ。理想的じゃない条件下でも動作するか確認するために、意図的に画像を暗くしたり明るくしたりした。テストの結果、完璧じゃない画像でもそれなりにうまく機能した。
結論
我々の発見は、我々の方法がX線画像を効果的に分析できることを示唆している。しかも、ほんの少しの変更で人間のX線にも対応できるかも。
ペットケアにおけるX線の重要性
X線はペットの健康をチェックするのに重要な役割を果たしている。心臓や肺の問題を診断したり、犬や猫の腫瘍をステージングしたりするのに一般的に使われる。だけど、これらの画像の質は撮影する人の経験や動物の協力に大きく依存しているんだ。ペットがまっすぐ立ってないと位置エラーがよく起こる。研究によると、普通の実践で撮られたX線の約30%が正しく位置づけられてないらしい。これらのエラーを修正すれば画像の質が向上して、正しく解釈するのが楽になる。でも、日常の実践で目で一つ一つの画像の質を確認するのは難しい。この位置エラーを自動的に認識できるシステムがあれば、獣医にとってとても便利だよ。
一般的なX線ビュー
腹背(VD)ビューと背腹(DV)ビューは、ペットの胸を調べるときに使われる標準的なX線角度だ。ペットを正しく位置づけて、目標の臓器が見えるようにするのが目的。動物が正しく位置づけられてれば、胸の左右はほぼ同じに見える。大きな違いがあれば、X線中にペットが動いた可能性があることを示してる。視覚的な例で対称と非対称の画像がどう見えるかもはっきりわかるよ。
ペットのX線における深層学習の最近の進展
最近、深層学習技術が犬のX線を分析するのに多く使われているんだ。例えば、ある研究者たちはCNNを使って、正常な胸画像と異常な胸画像を区別して、心臓のサイズを問題のサインとして見てる。別の研究者たちは、異なるビューや領域に基づいて犬のX線を分類する方法を開発して、時間やメモリの制約も考慮してる。最近は、横向きの犬の胸画像から様々な所見を分類するために高度なモデルを使った研究もあった。
人間のX線で肺の対称性を検出する研究はあったけど、ペットに対して同じような注目はあまりされてない。いくつかの研究者たちは人間の胸で対称性を探して肺の問題を見つけようとしたけど、胸を最初にセグメント分けすることはなかったんだ。代わりに、胸のセグメントがすでに与えられていると仮定してたんだ。彼らの研究も、X線画像でよく起こる異なる露出による問題を細かく見てなかった。
我々が提案する方法
我々は、X線画像の肋骨と脊椎を見つけることで胸の左右の半分を見つける新しい方法を提案したんだ。それが終わったら、セグメント化された肋骨をガイドにして全体の胸エリアを見つけた。脊椎を使って胸を左右に分けたんだ。それぞれの半分から分類のために異なる特徴を集めたよ。
我々の知る限り、この研究は犬と猫の胸画像の対称性に焦点を当てた方法を提案しているユニークなものなんだ。900枚のX線画像でこの方法を専門の獣医放射線科医の指導の下でテストしたし、露出設定が結果にどんな影響を与えるかも調べたよ。
重要な貢献
- 肋骨と脊椎をまず見つけて胸エリアを分ける新しい方法で、これは人間のX線にも役立つかも。
- 胸の左右が対称かどうかを判断する方法を提供して、画像取得の質をチェックするのに役立つかも。
- 異なる露出条件下での我々の方法のパフォーマンスを包括的に見て、そういった課題に対処する能力を明らかにした。
詳細なプロセス
まず、U-Netモデルを使って肋骨と脊椎を見つけた。このモデルは、重要な特徴を抽出するためにX線画像を層ごとに処理するんだ。画像サイズを徐々に減らしてボトルネックに達し、そこから元のサイズに戻しながら抽出した情報を保持する。
肋骨と脊椎を見つけた後、アクティブコンターアプローチを使って胸の境界を確立した。胸の形が決まったら、脊椎を分割線として使って胸を左右に分けた。
次に、胸のそれぞれの半分からいろんな特徴を抽出したよ。これらの特徴には、面積(それぞれの半分にどれだけピクセルが塗りつぶされているか)、周囲(境界の長さ)、胸の質量中心から脊椎までの距離が含まれる。この特徴を使って、対称性を評価するための分類モデルを訓練したんだ。
分類プロセス
両側からデータを集めた後、SVM、MLP、勾配ブースティングの3つの分類器を組み合わせた。各方法はデータの見方が異なるから、より包括的な分析に貢献しているんだ。それぞれの結果を合併することで、対称性の結果の精度と信頼性を高めたよ。
特定のタスクに対応するデータセットがなかったから、900枚のX線画像を獣医大学から集めて、分析のために整理した。これらの画像の中には非対称な状態を示すものもあれば、対称に見えるものもあった。意図的に質に問題のある画像も含めて、我々の方法が堅牢であることを確認したんだ。
実装の詳細
我々の方法はPythonを使って構築したし、Deep Learningモデルは特定のライブラリで開発した。迅速な処理とトレーニング時間を確保するために、強力なハードウェアを使用した。テスト中は、信頼性を確保するために確立された指標を使ってパフォーマンスを追跡したよ。
実験設計
我々の方法の有効性を評価するために、異なる露出背景下でテストを行った。これには、画像を暗くしたり明るくしたり、サンプル画像の胸の一部を遮ったりすることが含まれた。
パフォーマンス評価
我々の方法を、いくつかの制限があった直接セグメンテーションアプローチと比較した。画像の一部が隠れていたり、露出が悪かったりしても、対称性評価を維持する能力が我々の方法が優れていることが明らかになったよ。
議論
要するに、我々はペットのX線で胸のエリアをセグメント化し、対称性を分類する新しい方法を提案したんだ。結果は、この方法が困難な条件下でもよく機能することを支持している。
今後の方向性
将来的には、この対称性の発見を利用して、ペットのX線の質を自動的にチェックするシステムを構築するつもりだ。それによって、獣医の診断精度を向上させるのに役立つはずだよ。
タイトル: Automatic Classification of Symmetry of Hemithoraces in Canine and Feline Radiographs
概要: Purpose: Thoracic radiographs are commonly used to evaluate patients with confirmed or suspected thoracic pathology. Proper patient positioning is more challenging in canine and feline radiography than in humans due to less patient cooperation and body shape variation. Improper patient positioning during radiograph acquisition has the potential to lead to a misdiagnosis. Asymmetrical hemithoraces are one of the indications of obliquity for which we propose an automatic classification method. Approach: We propose a hemithoraces segmentation method based on Convolutional Neural Networks (CNNs) and active contours. We utilized the U-Net model to segment the ribs and spine and then utilized active contours to find left and right hemithoraces. We then extracted features from the left and right hemithoraces to train an ensemble classifier which includes Support Vector Machine, Gradient Boosting and Multi-Layer Perceptron. Five-fold cross-validation was used, thorax segmentation was evaluated by Intersection over Union (IoU), and symmetry classification was evaluated using Precision, Recall, Area under Curve and F1 score. Results: Classification of symmetry for 900 radiographs reported an F1 score of 82.8% . To test the robustness of the proposed thorax segmentation method to underexposure and overexposure, we synthetically corrupted properly exposed radiographs and evaluated results using IoU. The results showed that the models IoU for underexposure and overexposure dropped by 2.1% and 1.2%, respectively. Conclusions: Our results indicate that the proposed thorax segmentation method is robust to poor exposure radiographs. The proposed thorax segmentation method can be applied to human radiography with minimal changes.
著者: Peyman Tahghighi, Nicole Norena, Eran Ukwatta, Ryan B Appleby, Amin Komeili
最終更新: 2023-02-24 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://arxiv.org/abs/2302.12923
ソースPDF: https://arxiv.org/pdf/2302.12923
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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