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便の分析による食事追跡の新しい方法

便のサンプルからDNAを使って食事を分析する革新的なアプローチ。

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stoolstoolDNA分析によるダイエットトラッキング化する。革命的な方法が便の分析を通じて食事を定量
目次

食事は人間の成長、発達、全体的な健康にめっちゃ重要だよ。代謝の健康とも関係があって、心臓病、糖尿病、アルツハイマー病、がんみたいな慢性疾患のリスクにも影響するんだ。さらに、食べるものによって腸内に住むバクテリアの種類も変わるから、体がいろんな食事にどう反応するかにも関わってくるんだよね。

何を食べてるかを追跡するのは、さまざまな人の健康結果の違いを理解するために大事なんだ。正確な食事摂取データがあれば、研究者は食事と健康の関係を分析できる。でも、この情報を集めるのは結構大変なんだ。たいてい、研究者は参加者に食事習慣について聞くアンケートを使うんだけど、使いやすくて詳しい情報を提供する必要があるんだよね。

食事評価の一般的な方法には、よく食べる食品についての一般的なデータを集める食事頻度アンケート(FFQs)がある。より正確なデータは、参加者が特定の期間に何を食べたかをメモする食事回想調査から得られることもある。これだと栄養摂取の詳細がわかるけど、参加者の正直さと記憶に頼らざるを得ないんだ。

多くの標準的なアンケートや食品データベースは、すべての人口を正確に反映していないことがある。これが特定のグループ、特にマイノリティの食事が正しく表現されないギャップにつながることもあるし。さらに、自己報告データは信頼性が低いことが多くて、人はしばしば食事を誤って記憶したり報告したりするから、新しい方法で食事習慣を評価する必要が強く求められている。

食事評価の新技術

食事の質を測る一つの方法は、血中のグルコースやコレステロールみたいな物質を測定することだ。これは医療現場で使われるけど、食事のすべての側面を捉えられるわけじゃない。代謝物を血液、唾液、便で分析するメタボロミクスみたいな高度な技術は、食事習慣についての深い洞察を提供できるんだ。

もう一つの革新的なアプローチは、スマホで撮った食べ物の画像を利用すること。これらの画像を機械学習で分析して、食事摂取を推定できるんだ。ただし、この方法には、大規模なトレーニングデータセットと参加者の協力が必要な課題がある。

便のDNAを分析する分子技術は、食事の摂取をより詳細に見ることができる。たとえば、科学者は便サンプルに含まれる食品由来のDNAの痕跡を探すことができる。これをすることで、研究者は従来の方法よりも人々が食べたものをより正確に特定できると期待しているんだ。

食品ゲノムデータベースの構築

食事追跡の精度を向上させるために、研究者たちは食品ゲノムデータベースを開発した。このデータベースは食品項目をその遺伝情報や栄養プロフィールにリンクしている。植物や動物のさまざまな食品を含む包括的なデータベースを作ることで、科学者たちは異なる食事の栄養成分をよりよく理解できるんだ。

研究者たちは、食品項目をゲノム情報や栄養プロフィールにマッチさせることでデータベースを構築した。これは、食品データベースからデータを抽出し、食品項目を遺伝的な対応物にマッピングすることを含んだ。多くの食品項目が成功裏に特定され、食事分析のための強力なリソースが作成されたんだ。

このデータベースには、主要な食品群をカバーする広範な食品項目とその栄養成分が含まれている。マクロ栄養素の構成(タンパク質、脂肪、炭水化物)、エネルギー含量、特定の代謝物などのさまざまな要素を分析できるから、食事の栄養価を特定するのに役立つんだ。

どうやって動くのか:MEDIアプローチ

研究者たちは、食事摂取のメタゲノム推定(MEDI)という方法を導入した。このシステムは、食品ゲノムデータベースを使って便サンプル中の食品由来のDNAを特定し、定量化するんだ。便からDNAを分析することで、参加者に食事摂取を覚えてもらう必要なしに、食事習慣を推測できるんだ。

MEDI技術は、大量の配列データを分析するために迅速かつ効率的なマッピング戦略を利用している。バクテリアやヒトゲノムからの背景遺伝物質を考慮して、非食品DNAを食品源として誤って特定しないようにしている。これは、ほとんどのDNAが腸内のバクテリアや人間の細胞から来ているから、めっちゃ重要なんだ。

この方法を適用することで、研究者は代謝健康指標とよく相関する食事摂取データを得ることができる。新しいデータ収集の努力を必要とせずに、既存の便サンプルを分析できるから非常に効率的なんだ。

年齢グループ別の食事追跡

MEDIがどう機能するかを示すために、研究者たちは乳児と大人の便中の食事関連DNAを調べた。乳児は大人よりも食品由来のDNAが少ないことがわかったんだけど、これは乳児の食事が主に母乳かフォーミュラだから納得できるよね。乳児が固形食を食べ始めると、検出可能な食品DNAの量が増えたんだ。

一方、大人のサンプルにはほとんどすべてに食品DNAが含まれていた。食品由来のDNAの量は個人によって大きく異なり、食事習慣にかなりの違いがあることがわかった。研究者たちはこのデータを使って、個々人が摂取しているエネルギー量やマクロ栄養素の組成を計算したんだ。

結果は、食事習慣が乳児から大人へと変化し、既知の成長パターンや栄養的要件と一致していることを確認した。研究は、MEDIアプローチが時間とともに食事の変化を効果的に捉えられることを強調したんだ。

食事と代謝健康を見つめて

MEDIの効果をさらに評価するために、研究者たちは代謝症候群のある人とない人の研究にこれを適用した。533人の多様な参加者を含むグループで、健康な人と代謝問題の兆候を示す人が含まれていたんだ。

分析の結果、代謝健康に関連する特徴的な食事パターンが明らかになった。たとえば、代謝症候群の人は、より健康な人に比べて豚肉などの特定の食品を多く摂取していた。これらの結果は、高い動物製品の消費が代謝問題に関連しているという以前の研究を反映している。

さらに、研究者たちは2つのグループ間で異なる特定の栄養素を特定した。たとえば、代謝症候群の人は、コレステロール値やオメガ脂肪酸が高い食事をしていた。一方、より健康な人は、主に果物のような自然な源からの糖分が多かったんだ。

MEDIメソッドの利点

MEDIは食事追跡において重要な進展をもたらす。既存のメタゲノムデータを分析できるこの方法は、研究者が新たなデータ収集の努力なしに食事評価を行うことを可能にするんだ。食品由来のDNAを食事習慣にリンクさせることで、MEDIは人々の食事についての貴重な洞察を提供できるんだ。

MEDIの最大の強みの一つは、参加者の記憶に頼ることなく食事摂取を正確に評価できることなんだ。これにより、食事と健康結果との相関を見つける研究で集められる食事データの質が大幅に向上するんだよ。

この方法は、食事と腸内細菌の組成との関係を理解するのに役立つ可能性もある。食事習慣は腸内に存在するバクテリアの種類に大きく影響し、それが健康に影響を与えるからね。

課題と制限

可能性があるにもかかわらず、MEDIには挑戦がある。特に加工食品のような一般的に消費される食品は、便中に検出可能なDNAを残さないかもしれない。これにより、特定の食事成分の過小評価につながる可能性がある。

さらに、既存の食品データベースは、特に非西洋文化の多様な食事を完全には反映していないかもしれない。この表現の欠如は結果を歪める可能性があり、さまざまな人口に対してMEDIの適用可能性を低下させることがある。

もう一つの制限は、現在の栄養マッピングが加工食品のすべての成分を考慮していない可能性があること。たとえば、加工中に追加される糖分は、便DNAから得られる食事評価に正確に反映されないかもしれない。

結論

要するに、MEDIの開発は便分析を通じて食事習慣を分析する新しい方法を提供している。この革新的な方法は、従来のアンケート方法に依存せずに食事摂取を評価できるから、栄養研究の進め方を変える可能性があるんだ。

食品DNAを栄養成分にリンクさせることで、MEDIは食事パターンや悪い食事に関連する健康リスク、そして食事と腸の健康との関係についての深い洞察を提供できるんだ。もっとデータが集まり、方法論が向上すれば、MEDIは異なる人口での栄養と健康への影響を研究するための貴重なツールになるかもしれない。

結局、信頼性が高くスケーラブルな方法で食事摂取を定量化できる能力は、栄養、疫学、公衆衛生の分野などさまざまな分野に利益をもたらし、食事と健康の相互作用をよりよく理解する新しい扉を開くことになるんだ。

オリジナルソース

タイトル: Metagenomic estimation of dietary intake from human stool

概要: Dietary intake is tightly coupled to gut microbiota composition, human metabolism, and to the incidence of virtually all major chronic diseases. Dietary and nutrient intake are usually quantified using dietary questionnaires, which tend to focus on broad food categories, suffer from self-reporting biases, and require strong compliance from study participants. Here, we present MEDI (Metagenomic Estimation of Dietary Intake): a method for quantifying dietary intake using food-derived DNA in stool metagenomes. We show that food items can be accurately detected in metagenomic shotgun sequencing data, even when present at low abundances (>10 reads). Furthermore, we show how dietary intake, in terms of DNA abundance from specific organisms, can be converted into a detailed metabolic representation of nutrient intake. MEDI could identify the onset of solid food consumption in infants and it accurately predicted food questionnaire responses in an adult population. Additionally, we were able to identify specific dietary features associated with metabolic syndrome in a large clinical cohort, providing a proof-of-concept for detailed quantification of individual-specific dietary patterns without the need for questionnaires.

著者: Sean M Gibbons, C. Diener

最終更新: 2024-02-06 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.02.578701

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.02.578701.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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