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臨床データの非識別化におけるバイアス

研究によると、臨床名の非特定化手法には大きなバイアスがあることが明らかになった。

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非特定化バイアスが明らかに非特定化バイアスが明らかにされたるバイアスを浮き彫りにした。研究が臨床データのプライバシー慣行におけ
目次

データ共有は研究や医療にとって重要なんだけど、臨床データを共有する際には、電子健康記録から保護された健康情報(PHI)を取り除く必要がある。このプロセスをデアイデンティフィケーションって呼ぶんだ。多くのシステムは、この作業を達成するために機械学習アルゴリズムを使ってるけど、これらのアルゴリズムは平均的にはよく機能するけど、すべてのデモグラフィックグループに対して同じようにはうまくいかないかもしれない。

この研究では、臨床ノートの名前に関連するデアイデンティフィケーションシステムのバイアスを詳しく分析していくんだ。僕たちは、性別、人種、名前の人気、名前が人気だった年代の4つのデモグラフィック特性に基づいて、16セットの名前を作ったんだ。これらの名前を100の臨床テンプレートに追加して、9つの異なるデアイデンティフィケーション手法のパフォーマンスを評価したよ。

結果は、これらの手法がさまざまなデモグラフィックグループの名前をどれだけよく認識するかに重要な違いがあることを示してる。デアイデンティフィケーションの質に影響を与える要因には、名前の意味、名前が使われる文脈、臨床ノート自体の特性がある。僕たちは、特定のデモグラフィックグループに対するバイアスを解消するために、デアイデンティフィケーション手法を調整して、臨床コンテキストや多様な名前を含めるシンプルな解決策を提案してるよ。これらのバイアスに取り組むことは、すべてのデモグラフィックグループにサービスを提供する公正で効果的なシステムを作るために不可欠なんだ。

はじめに

臨床データセットの利用可能性は、医療システムの機械学習(ML)の進歩に大きな影響を与えてる。でも、臨床試験データを合法的に共有するには、関係者が18種類のPHIを保護するHealth Insurance Portability and Accountability Act(HIPAA)のガイドラインに従う必要がある。正しく行えば、臨床データを共有することは、患者のプライバシーを危険にさらすことなく科学的再現性を高めることができるんだ。

多くの会社やオープンソースプラットフォームが電子健康記録のデアイデンティフィケーションサービスを提供してる。自然言語処理(NLP)ライブラリの名前付きエンティティ認識(NER)ツールは、この目的で頻繁に使われてる。でも、一部の機械学習モデルがマイノリティグループに対してうまく機能しない証拠があるから、それが現実の危害につながることもあるんだ。

例えば、腎臓損傷の早期警告システムは、主に男性データで訓練されていたため、女性患者を保護できなかった。デアイデンティフィケーション手法が特定のグループのアイデンティティを十分に保護できていないと、HIPAA規則の違反につながる可能性があり、そういう集団のアイデンティティ盗難のリスクが高まるんだ。

研究概要

私たちの研究では、臨床ノートにおける名前のデアイデンティフィケーションに特に焦点を当ててるんだ。名前はデモグラフィック特性と関連してるから選んだんだけど、他のPHIカテゴリーの中で人のアイデンティティを簡単に明らかにすることができるからなんだ。

これまでの研究は、実際の臨床ノートの複雑さを反映しない単純なテンプレートを使って限られた数の手法を比較してきたけど、私たちの研究は、実際の臨床記録から導き出した複雑なテンプレートに基づいて、16の名前セットと9つの異なるデアイデンティフィケーション手法を分析してるよ。

名前を4つのデモグラフィック次元に沿って分類してるんだ:性別、人種、名前の人気、人気があった年代。バイナリーの性別分類や標準化された人種カテゴリーを使うことには限界があるって認識してるけど、私たちの研究は、電子健康記録(EHR)における名前に関するデアイデンティフィケーション手法のパフォーマンスとそれに伴うリスクの初期探求としての役割を果たしてるんだ。

実験の設定

臨床記録から名前をデアイデンティフィケーションする際のバイアスを評価することに焦点を当ててるよ。名前は特定のデモグラフィック特性と関連があるから、簡単に識別できるんだ。そのために、先ほど述べた4つのデモグラフィック次元を基に16の名前セットを準備したんだ。各名前セットには20の名前(ファーストネームとラastネーム)が含まれていて、合計400のフルネームになってる。

さらに、病院の退院記録から100の臨床テンプレートを作成して、テンプレートが通常のベンチマークデータセットよりも複雑になるようにしたんだ。この複雑さが、私たちの分析を現実のシナリオにより関連性のあるものにしてるから、あまり効果的でないデアイデンティフィケーション手法の欠点を見つけやすくなってる。

また、各デモグラフィック次元に沿ったモデルのパフォーマンスを評価し、他の要因を制御しながら実験をデザインしたよ。性別、人種、名前の人気、人気があった年代がパフォーマンスにどう影響するかを探ったんだ。

デモグラフィック次元の定義

私たちの分析で使う4つのデモグラフィック次元を次のように定義してるよ:

  1. 性別:与えられた名前に付与された性別を指し、男性または女性として分類される。

  2. 人種:名前に関連付けられた人種や民族のアイデンティティを示し、ホワイト、ブラック、アジア系、ラテン系の4つのグループを含む。

  3. 名前の人気:特定の性別において、ある年代にどれだけ一般的な名前かを測定し、トップ、中くらい、ボトムの人気に分類される。

  4. 人気の年代:名前がアメリカで赤ちゃんに頻繁に付けられた年代を特定し、2000年代、1970年代、1940年代の3つのグループで評価される。

標準的な人種や性別のカテゴリーを使うことには限界があるって認めてるけど、私たちの研究では、定期的に収集されたデータに対するデアイデンティフィケーション手法のパフォーマンスを評価するためにこれらの分類に依存してるんだ。

名前セットの構築

私たちの研究では、アメリカのソーシャルセキュリティのデータに基づいてファーストネームの人気を計算したよ。異なる人種グループに主に関連する名前を選んで、各名前セットが多様なデモグラフィックバックグラウンドを代表するようにしたんだ。

ホワイト、ブラック、アジア系、ラテン系グループのために個別の名前セットを作成し、特定の年代に人気だった名前に焦点を当てた。名前セットごとに20の名前に制限して、一貫性を保ち、異なるセット間にオーバーラップがないようにしたよ。

ラストネームも同様に準備し、2000年の国勢調査データを使用したんだ。年代ごとにラストネームの人気を固定することで、分析のための安定した参照を確立したんだ。

臨床デアイデンティフィケーションにおけるバイアス

医療におけるデアイデンティフィケーションの重要な役割を考えると、デアイデンティフィケーションシステムに存在するバイアスを調査することは不可欠だよ。以前の研究では、単純なテンプレートを使って限られた数の手法を比較するだけだったから、パフォーマンスが劣る要因の包括的な評価が欠けてたんだ。

私たちの研究は、このギャップを埋めるために、さまざまな名前セットと実際の臨床ノートテンプレート全体にわたる9つのデアイデンティフィケーション手法の広範な実証評価を行ってる。

研究結果

私たちは、名前のデアイデンティフィケーションにおけるバイアスを評価することに焦点を当ててる。調査した手法はパフォーマンスが異なり、ほとんどの手法が調査したデモグラフィック次元に対して顕著なパフォーマンスギャップを示してる。

全体のパフォーマンスのばらつき

9つのデアイデンティフィケーション手法のパフォーマンスは異なっていて、いくつかは他よりも高いリコール率を達成したよ。例えば、1つの手法であるflairはリコールや他の指標で特に良いパフォーマンスを示したけど、別の手法であるspaCyはリコール率が低く、PHIを保護できていないリスクがあることを示唆してる。

面白いことに、Googleのような商業サービスは、名前の認識においてAmazonやMicrosoftよりも劣ってたんだ。Philterのようなルールベースの手法は、臨床ノートに適用したときに非常に不正確な結果をもたらしたよ。

顕著なデモグラフィックギャップ

ほとんどの手法は、デモグラフィック次元において統計的に有意なパフォーマンスの違いを示した。例えば、手法は特定の人種グループのために人気が低い名前をよりよく認識する傾向があったため、これらのバイアスに対処する必要があることが示されてる。

さまざまなグループ間の違いは、名前の人気や人種的関連性に基づいて手法が名前を認識する能力を評価する際に特に顕著だったよ。

パフォーマンスの低下を引き起こす要因

私たちの研究では、なぜ一部のデアイデンティフィケーション手法が劣ったのかについても深堀りしてるんだ。パフォーマンスに影響を与える重要な要因を明らかにする重要な発見をしたよ。

多義語の名前が難しい

多義語の名前は、手法にとって認識が難しいことが多かった。例えば、「An」のような名前は一般的な英単語にもなるし、個人名としても使われるから、認識が難しくなるんだ。

文脈が重要

文脈の手がかりを考慮する手法は、名前に暗示された性別が一致する場合にパフォーマンスが良い傾向にあった。これが、ローカルな文脈がデアイデンティフィケーションのパフォーマンスを向上させる重要な役割を果たしてることを示唆してるよ。

テンプレートの特性が結果に影響

臨床ノートの長さやその中に含まれるユニークな名前の数もパフォーマンスに影響を与えた。長いノートや多くのユニークな名前が含まれるノートは、一般的に認識率が低くなる傾向があったよ。

デアイデンティフィケーション手法におけるバイアスの軽減

私たちの研究で特定したバイアスに対処するために、シンプルで実践的なアプローチを提案してる。私たちは、臨床コンテキストと多様な名前を利用してデアイデンティフィケーション手法を微調整することで、全体的なパフォーマンスを向上させ、バイアスを軽減することを提案してるんだ。

微調整プロセス

微調整プロセスでは、実際のノートからの臨床コンテキストを取り入れ、さまざまな名前を組み込むことが求められる。こうすることで、モデルがすべてのデモグラフィックグループで名前を認識できる能力が向上するんだ。

微調整の後、spaCyとNeuroNERの両方の全体的なパフォーマンスが大きく改善され、重要な次元でのバイアスが減少したことを観察したよ。

結果についての考察

私たちの結果は、名前に関連するデモグラフィックの関連性を認識し、対処する重要性を強調してる。名前は特定の人種や性別の特徴に関連付けられることが多くて、デアイデンティフィケーション手法で適切に扱われないとバイアスが蓄積されてしまうんだ。

医療システムのバイアスは系統的で潜在的なもので、異なるデモグラフィックグループに対して不平等な治療や結果をもたらすことがあるから、デアイデンティフィケーション手法がすべての集団に対して公正で平等な結果を出すことを確実にすることが重要なんだ。

高品質のデアイデンティフィケーションデータの重要性

デアイデンティフィケーションされたデータは、プライバシーを維持しつつ医療における研究や開発を可能にする上で重要なんだ。データを規制に従って共有することで、研究者は個人のプライバシーを保護し、モデルを訓練するために多様なデータセットの使用を促進できるんだ。

多様な集団の包括

特定のデモグラフィックグループをデータ共有から除外すると、それらの集団に対してパフォーマンスが悪いモデルが生まれることになるんだ。これが誤診や不適切な治療を引き起こし、既存の健康格差を強化することがあるから、過小評価されたコミュニティからのデータを収集し含めることが不可欠なんだ。

マイノリティグループの信頼とプライバシー

デアイデンティフィケーションのパフォーマンスの不均一性は、マイノリティコミュニティのプライバシーに関する懸念を引き起こし、アイデンティティ盗難のリスクが高まることにつながる。多様な集団の間で信頼を促進する実践を導入することが重要で、臨床データの共有に参加することを奨励するためなんだ。

監査の必要性

定期的な監査は、改善が必要な分野を特定し、法律や基準への準拠を保証する助けになるんだ。さまざまな分野での過去の監査は、意味のある変化を促進し、導入されたシステムのバイアスを減少させる能力を示してる。

私たちは、医療の実践者にデアイデンティフィケーション手法を巡る監査に取り組むことを提案して、すべてのグループに公正で平等なサービスを保証するように呼びかけてるよ。

結論

この研究では、臨床記録のデアイデンティフィケーションにおけるバイアスを詳細に分析してる。結果は、特定のデモグラフィックグループにとってプライバシーリスクを引き起こす系統的なバイアスがあることを示してる。医療や機械学習分野の関係者は、これらのバイアスにすぐに取り組む必要があるんだ。

私たちの提案を実施することで、デアイデンティフィケーション手法の公正性と効果を向上させ、最終的にはすべてのデモグラフィックグループが平等に扱われることを保証できるようになるよ。この研究は、これらのバイアスを理解する上で重要なステップだけど、さまざまなPHIクラスやより詳細なデモグラフィックカテゴリーにわたるデアイデンティフィケーション手法の調査にはまだ多くの作業が必要なんだ。

オリジナルソース

タイトル: In the Name of Fairness: Assessing the Bias in Clinical Record De-identification

概要: Data sharing is crucial for open science and reproducible research, but the legal sharing of clinical data requires the removal of protected health information from electronic health records. This process, known as de-identification, is often achieved through the use of machine learning algorithms by many commercial and open-source systems. While these systems have shown compelling results on average, the variation in their performance across different demographic groups has not been thoroughly examined. In this work, we investigate the bias of de-identification systems on names in clinical notes via a large-scale empirical analysis. To achieve this, we create 16 name sets that vary along four demographic dimensions: gender, race, name popularity, and the decade of popularity. We insert these names into 100 manually curated clinical templates and evaluate the performance of nine public and private de-identification methods. Our findings reveal that there are statistically significant performance gaps along a majority of the demographic dimensions in most methods. We further illustrate that de-identification quality is affected by polysemy in names, gender context, and clinical note characteristics. To mitigate the identified gaps, we propose a simple and method-agnostic solution by fine-tuning de-identification methods with clinical context and diverse names. Overall, it is imperative to address the bias in existing methods immediately so that downstream stakeholders can build high-quality systems to serve all demographic parties fairly.

著者: Yuxin Xiao, Shulammite Lim, Tom Joseph Pollard, Marzyeh Ghassemi

最終更新: 2024-01-02 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://arxiv.org/abs/2305.11348

ソースPDF: https://arxiv.org/pdf/2305.11348

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた arxiv に感謝します。

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