ESBL産生クレブシエラ・ニューモニエの脅威が高まってるよ。

クレブシエラ・ニューモニエは、病院でいろんな感染症を引き起こすバクテリアの一種だよ。この感染は肺や尿路、血液、脳、軟部組織に影響を及ぼすことがある。全体の病院関連の細菌感染の3～7%を占めてるんだ。

#治療の課題

昔は、クレブシエラ・ニューモニエによる感染症の治療は簡単だったんだけど、拡張スペクトラムβ-ラクタマーゼ（ESBL）っていう酵素が出てきてから、特定の抗生物質が効きにくくなってしまったんだ。この酵素は抗生物質を分解しちゃうからね。クレブシエラ・ニューモニエが抵抗性を持つ一般的な抗生物質には、セフェム系やモノバクタムがあるよ。

#ESBL産生K.ニューモニエの普及状況

最近の報告によると、ESBLを産生するクレブシエラ・ニューモニエが高頻度で見つかってる。スーダンでは、尿サンプルから53%の株がESBL陽性だったんだ。ザンビアでも同じような結果が出て、52%の株がESBL陽性だったよ。この抵抗性を引き起こす酵素は主にTEMとSHVという2つの遺伝子に由来していて、プラスミドと呼ばれるDNAの断片に見つかることが多いんだ。TEM遺伝子はE.コリの株で最初に見つかったし、SHV遺伝子は変化する特定の位置を指してる。

#研究の概要

いろんな研究で、世界中のクレブシエラ・ニューモニエにこれらの遺伝子がどれくらい多いかが示されてる。例えば、いくつかのヨーロッパの国では、SHV遺伝子が67.1%のサンプルに存在して、一方でTEM遺伝子は16.4%だったんだ。イランやインドなど他の国でも、株に応じてこれらの遺伝子の割合が変わってるという報告がある。

スーダンの研究では、SHVが17.6%のサンプルに現れ、TEM遺伝子は16.2%に見つかったよ。でも、スーダンにおけるESBL産生K.ニューモニエやその関連遺伝子の普及状況についてはまだ限られた情報しかないんだ。

#研究の目的

今回の研究の目的は、スーダンのハルツーム州からのサンプルの中で、ESBL産生クレブシエラ・ニューモニエがどれくらい存在するのかを調べて、TEMとSHV遺伝子の存在を確認することだったよ。

#研究の方法

#サンプルの収集

この研究では、2018年の初めにハルツーム州のいろんな病院から100のユニークなK.ニューモニエのサンプルを4ヶ月にわたって集めたんだ。病院にはファダイル病院、ロイヤル・ケア病院、アルブラハ病院、シャルグ・エルネイル病院、医療軍病院が含まれてたよ。サンプルは尿、痰、傷、血液、髄液（CSF）、便など、いろんな臨床ソースから採取された。

#バクテリアの同定

バクテリアを同定するために、いろんなラボテストを使ったよ。これらのテストでは、バクテリアの成長する様子や、特定の染色に対する反応、特定の物質の利用方法なんかを見てた。

#ESBLの検査

ESBLを産生するバクテリアをチェックするために、キルビー・バウアーディスク拡散試験っていう方法を使ったんだ。この方法では、バクテリアを含むプレートに抗生物質のディスクを置いて、その周りのバクテリアの成長を観察するんだ。バクテリアがディスクの近くで成長できなかったら、その抗生物質に対して感受性があるってことだよ。

#DNA抽出とPCR検査

研究者たちは、K.ニューモニエのサンプルから標準的な方法でDNAを抽出したんだ。それから、TEMとSHV遺伝子を探すために特定のプライマーを使ったよ。抽出したDNAをプライマーや他の物質と混ぜて、DNAを増幅するためのサーマルサイクリングマシンに入れるっていう感じ。

#研究の結果

全部で100株のK.ニューモニエが分離されて、ほとんどは尿（49）、次に痰（23）、傷（14）、血液（6）、CSF（4）、便（4）から来てたよ。

#抵抗パターン

この研究では、これらのバクテリアが多くの抗生物質に対して高い抵抗性を示すことが分かった。特にコリスチン（88%）、セフタジジム（85%）、セフォタキシム（80%）、セフトリアキソン（74%）、アズトレオナム（73%）に対する抵抗率が高かった。一方でメロペネムに対する抵抗率は33%だったよ。

#ESBLの存在

テストした株の中で、85%がESBLを産生すると判明した。ESBLの割合は血液と便のサンプルで100%見つかって、一番高かったんだ。痰や傷のサンプルでも高レベルのESBLが見られたけど、尿サンプルは少し低い割合だったよ。CSFサンプルは一番低かった。

#検出遺伝子

85のESBL陽性サンプルの中で、TEM遺伝子は9.4%に、SHV遺伝子はESBL陽性株の中で1.2%にしか見つからなかったんだ。興味深いことに、SHV遺伝子はESBL産生者と見なされないバクテリアでも検出されたよ。

#考察

この研究の結果は、臨床サンプルにおけるESBL産生クレブシエラ・ニューモニエの高い普及率を示している。これらのバクテリアにおけるTEMとSHV遺伝子の存在は、抗生物質抵抗性についての認識の必要性を示唆してるね。他の国の研究と比べると、ESBLの普及状況はかなり変わることが示されてる。

抵抗率の違いを説明する要因はいくつかあって、試験されたサンプルの種類や、異なる医療設定でのバクテリアの取り扱い方なんかが関係してる。この研究はまた、メロペネムへの著しい抵抗を指摘していて、治療の効果に対して懸念すべき傾向を示してるよ。

#結論

この研究は、ハルツーム州のいろんな臨床サンプルにESBLを産生するクレブシエラ・ニューモニエが広がっていることを示してる。これらのバクテリアの中でのTEMとSHV遺伝子の検出は、抗生物質抵抗性の問題が続いてることを示してるね。これらのバクテリアが抗生物質に対して抵抗性をどのように発展させるか、その全体的な公衆衛生への影響を深く分析するためには、もっと研究が必要だよ。これらのパターンを理解することで、より良い治療戦略を形成し、抗生物質抵抗に効果的に対抗する手助けができるんだ。