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# Scienze della salute# Medicina genetica e genomica

Varianti CHEK2 e Rischio di Cancro: Nuove Scoperte

Uno studio rivela l'impatto delle varianti CHEK2 sul rischio di cancro e sulla sopravvivenza.

Douglas R Stewart, S. Kim, J. Kim, M. Ramos, J. Haley, D. Smelser, H. S. Rao, u. mirshahi, Geisinger-Regeneron DiscovEHR Collaboration, B. I. Graubard, H. A. Katki, D. Carey

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Varianti CHEK2 e CancroVarianti CHEK2 e Cancrorischio di cancro esplorato.Impatto delle varianti genetiche sul
Indice

CHEK2 è un gene che aiuta a proteggere il corpo dal Cancro riparando il DNA danneggiato. I cambiamenti in questo gene, noti come varianti, possono aumentare le possibilità di sviluppare alcuni tipi di cancro. La ricerca ha dimostrato che le persone con varianti dannose in CHEK2 hanno un Rischio maggiore di cancro, specialmente al seno e alla prostata. Ci sono anche affermazioni riguardo a un rischio aumentato per altri tipi di cancro, come quello colorettale, renale e vescicale, ma le prove per queste affermazioni non sono così forti.

Tipi di Varianti in CHEK2

Ci sono due principali tipi di varianti che influenzano il gene CHEK2: le varianti truncanti (PTV) e le varianti missenso (PMV). Le varianti truncanti portano generalmente a un rischio maggiore di cancro. D'altra parte, le varianti missenso possono avere effetti variabili sul rischio di cancro, a seconda di dove avviene il cambiamento nella struttura della proteina. Gli studi indicano che circa il 60% delle rare varianti missenso sono collegate a un rischio inferiore di sviluppare cancro rispetto alle varianti truncanti.

Studio del Rischio di Cancro con Accertamento Genomico

Tradizionalmente, gli studi guardavano alle persone con cancro e alla loro storia familiare per determinare il rischio. Questo metodo è conosciuto come approccio phenotype-first. Al contrario, l'accertamento genomico si concentra prima sull'identificazione delle varianti genetiche e poi sull'analisi delle cartelle cliniche per capire come queste varianti possano influenzare il rischio di cancro. Questo metodo mira a fornire stime più accurate del rischio di cancro e degli effetti delle diverse varianti.

Obiettivo dello Studio

L'obiettivo di questo studio era misurare il rischio di cancro in persone con varianti patologiche di CHEK2 utilizzando l'accertamento genomico. I ricercatori hanno analizzato le cartelle cliniche di due grandi gruppi - il UK Biobank e il Geisinger MyCode - per esaminare quanto siano comuni queste varianti, come influenzano il rischio di cancro e come influenzano i tassi di sopravvivenza rispetto a persone senza queste varianti.

Partecipanti e Raccolta Dati

I ricercatori hanno raccolto dati genetici dai partecipanti nel UK Biobank, che contiene informazioni su molte persone nel Regno Unito, e nel Geisinger Health System in Pennsylvania, che raccoglie dati sulla salute dei suoi pazienti. I partecipanti hanno fornito campioni di sangue per i test genetici e hanno permesso che le loro cartelle cliniche fossero utilizzate per la ricerca.

Per garantire risultati accurati, i ricercatori hanno escluso dalla analisi eventuali individui imparentati per evitare dati distorti.

Valutazione delle Varianti e Stato di Cancro

I ricercatori hanno filtrato le varianti genetiche in base alla loro qualità e le hanno classificate in diverse categorie: patologiche, probabilmente patologiche, di significato incerto, probabilmente benigne e benigne. Lo studio si è concentrato su individui con varianti patologiche o probabilmente patologiche, mentre quelli con varianti di significato incerto sono stati esclusi.

La diagnosi di cancro e i dettagli demografici, come età, sesso e fattori di stile di vita, sono stati raccolti utilizzando codici medici specifici. Questi codici aiutano a identificare i tipi di cancro e le caratteristiche dei pazienti nelle cartelle cliniche.

Analisi Statistica

I ricercatori hanno utilizzato metodi statistici per stimare il rischio di cancro associato alle varianti CHEK2. Hanno considerato fattori come età, sesso, fumo, consumo di alcol e indice di massa corporea (BMI) nella loro analisi. Hanno anche effettuato le necessarie regolazioni per la parentela all'interno dei dati.

Risultati Principali

Prevalenza delle Varianti CHEK2

Lo studio ha trovato che le varianti patologiche di CHEK2 sono relativamente comuni nella popolazione. I tassi di prevalenza variavano tra i due gruppi, con un numero significativo di partecipanti che portavano queste varianti. L'analisi ha rivelato che molte persone con queste varianti avevano anche una maggiore prevalenza di diagnosi di cancro rispetto a coloro che non le avevano.

Aumento del Rischio di Cancro Specifici

Uno dei principali risultati è stato che le persone con varianti patologiche di CHEK2 avevano un rischio significativamente più alto di diversi tipi di cancro, tra cui cancro al seno, cancro alla prostata, cancro renale, cancro alla vescica e leucemia linfocitica. I rischi erano particolarmente notevoli in entrambi i gruppi, confermando l'associazione tra le varianti CHEK2 e il cancro.

Età e Rischio di Cancro

I ricercatori hanno osservato che l'età giocava un ruolo nel rischio di cancro associato alle varianti CHEK2. I giovani con queste varianti mostravano un modello di rischio diverso rispetto agli individui più anziani. In generale, l'analisi ha indicato che il rischio di sviluppare cancro aumentava con l'età per le persone che portavano varianti patologiche di CHEK2.

Tassi di Mortalità

Lo studio ha anche esaminato i tassi di mortalità tra gli individui con varianti CHEK2. Nel UK Biobank, c'era un significativo aumento dei tassi di mortalità generale tra le persone con queste varianti, mentre non è stata notata alcuna differenza significativa nel gruppo Geisinger. Questo suggerisce che, sebbene ci sia un rischio maggiore di cancro, la gravità della malattia potrebbe non essere maggiore rispetto a persone senza varianti CHEK2.

Sopravvivenza al Cancro

L'analisi di sopravvivenza non ha mostrato un significativo aumento dei tassi di mortalità per le persone con cancro che portavano varianti CHEK2 rispetto a quelle senza varianti. Questo indica che la presenza di queste varianti genetiche non porta necessariamente a esiti peggiori nei pazienti con cancro.

Conclusione e Implicazioni

Questo studio fornisce informazioni importanti sulla relazione tra le varianti CHEK2 e il rischio di cancro. Ribadisce il rischio aumentato per i tumori al seno e alla prostata, mentre indica la necessità di ulteriori indagini su altri tipi di cancro, come quelli renali e vescicali.

I risultati enfatizzano l'importanza del test genomico e della comprensione dei fattori genetici nella creazione di strategie efficaci di screening e prevenzione del cancro. I medici potrebbero dover considerare queste varianti quando valutano il rischio di cancro nei pazienti e nelle loro famiglie.

Visto le complessità della genetica del cancro, la ricerca continua è fondamentale per sviluppare linee guida che aiutino a gestire i rischi e migliorare gli esiti per i pazienti in base ai profili genetici individuali. Man mano che più dati diventano disponibili, i fornitori di assistenza sanitaria possono affinare il loro approccio alla sorveglianza e al trattamento del cancro per coloro che portano varianti patologiche di CHEK2.

Fonte originale

Titolo: Genomic ascertainment of CHEK2-related cancer predisposition

Estratto: PurposeThere is clear evidence that deleterious germline variants in CHEK2 increases risk for breast and prostate cancers; there is limited or conflicting evidence for other cancers. Genomic ascertainment was used to quantify cancer risk in CHEK2 germline pathogenic variant heterozygotes. Patients and MethodsGermline CHEK2 variants were extracted from two exome-sequenced biobanks linked to the electronic health record: UK Biobank (n= 469,765) and Geisinger MyCode (n=170,503). Variants were classified as per American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG)/Association for Molecular Pathology (AMP) criteria. Heterozygotes harbored a CHEK2 pathogenic/likely pathogenic (P/LP) variant; controls harbored benign/likely benign CHEK2 variation or wildtype CHEK2. Tumor phenotype and demographic data were retrieved; to adjust for relatedness, association analysis was performed with SAIGE-GENE+ with Bonferroni correction. ResultsIn CHEK2 heterozygotes in both MyCode and UK Biobank, there was a significant excess risk of all cancers tested, including breast cancer (C50; OR=1.54 and 1.84, respectively), male genital organ cancer (C60-C63; OR=1.61 and 1.77 respectively), urinary tract cancer (C64-C68; OR=1.56 and 1.75, respectively) and lymphoid, hematopoietic, and related tissue cancer (C81-C96; OR=1.42 and 2.11, respectively). Compared to controls, age-dependent cancer penetrance in CHEK2 heterozygotes was significantly younger in both cohorts; no significant difference was observed between the penetrance of truncating and missense variants for cancer in either cohort. Overall survival was significantly decreased in CHEK2 heterozygotes in UK Biobank but there was no statistical difference in MyCode. ConclusionUsing genomic ascertainment in two population-scale cohorts, this investigation quantified the prevalence, penetrance, cancer phenotype and survival in CHEK2 heterozygotes. Tailored treatment options and surveillance strategies to manage those risks are warranted.

Autori: Douglas R Stewart, S. Kim, J. Kim, M. Ramos, J. Haley, D. Smelser, H. S. Rao, u. mirshahi, Geisinger-Regeneron DiscovEHR Collaboration, B. I. Graubard, H. A. Katki, D. Carey

Ultimo aggiornamento: 2024-08-08 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.08.07.24311613

Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.08.07.24311613.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia medrxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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