Une nouvelle méthode pour évaluer les effets des traitements
Découvrez DR-VIDAL, une approche à la pointe pour estimer les résultats des traitements en utilisant l'apprentissage automatique.
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Table des matières
Comprendre comment différents traitements ou interventions affectent les résultats est crucial dans des domaines comme la médecine et la santé publique. Par exemple, on pourrait vouloir savoir si un médicament spécifique peut réduire le risque de maladies cardiaques. Les essais contrôlés randomisés (ECR) sont souvent considérés comme la référence pour évaluer ces effets. Cependant, les ECR ne peuvent parfois pas être réalisés pour des raisons éthiques. Par exemple, ce ne serait pas juste de désigner aléatoirement des ados pour aller à l'université juste pour voir si ça mène à de meilleurs salaires plus tard.
Comme les ECR ne sont pas toujours possibles, les chercheurs s'appuient souvent sur des données d'observation, qui sont des informations collectées sans assignation aléatoire. Ce type de données peut provenir de dossiers de santé, d'enquêtes ou d'autres sources. Malheureusement, les données d'observation peuvent être biaisées. Les facteurs qui influencent les résultats ne sont peut-être pas bien pris en compte, ce qui entraîne des conclusions incorrectes sur les causes.
Un des principaux défis de l'utilisation des données d'observation est la question des contrefactuels. Les contrefactuels renvoient à l'idée de considérer ce qui serait arrivé aux individus s'ils avaient reçu un traitement différent. Comme on ne peut observer qu'un seul résultat pour chaque personne - soit elle a reçu le traitement, soit elle ne l'a pas reçu - il est difficile de voir directement ces contrefactuels. Si les modèles utilisés pour prédire ces résultats sont défectueux, cela peut mener à de mauvaises recommandations, ce qui pourrait être nuisible.
Une façon courante de penser aux effets des traitements est à travers deux mesures : l'effet moyen du traitement (ATE) et l'effet de traitement individualisé (ITE). L'ATE regarde les différences moyennes des résultats entre ceux qui ont reçu le traitement et ceux qui ne l'ont pas reçu. L'ITE, quant à lui, examine la différence pour un individu spécifique avec des caractéristiques de fond similaires. Comme on obtient souvent des résultats mixtes, les chercheurs calculent aussi des ATE stratifiés ou conditionnels pour tenir compte des différents groupes.
Traditionnellement, les chercheurs ont utilisé des méthodes comme l'appariement par score de propension et le poids de probabilité inverse pour ajuster les biais potentiels. Le score de propension est un calcul statistique qui prédit la probabilité de recevoir un traitement en fonction des facteurs observés. Bien que ces méthodes puissent aider à créer un équilibre entre les groupes traités et non traités, elles ont des limites. Elles peuvent ne pas tenir compte de tous les biais présents dans les données, ce qui entraîne une incertitude résiduelle après l'appariement.
Les avancées en apprentissage machine ont introduit de nouvelles techniques pour estimer les effets des traitements, permettant l'utilisation de modèles plus complexes. Parmi les méthodes récentes, on trouve divers types de réseaux de neurones, comme les arbres de régression additive bayésienne et les forêts aléatoires contrefactuelles. Parmi celles-ci, l'apprentissage profond causal a émergé comme une approche puissante. Des exemples notables incluent le Réseau de Représentation Indifférent au Traitement (TARNet), Dragonnet et d'autres.
Nouvelle approche : DR-VIDAL
Ce travail introduit une nouvelle méthode appelée Apprentissage Adversarial Variational Information-théorique Doublement Robuste (DR-VIDAL). Elle vise à relever les défis de l'estimation des Effets de traitement individualisés et de faire des prédictions contrefactuelles en utilisant des données d'observation du monde réel. Cette méthode combine plusieurs techniques avancées en un seul cadre.
Les caractéristiques clés de DR-VIDAL sont :
Structure Causale Sous-jacente : L'approche suppose un graphique causal spécifique qui aide à décomposer les données observées en facteurs indépendants. Cette structure est cruciale pour comprendre les relations entre le traitement, les résultats et les variables de confusion.
Autoencodeur Variationnel (VAE) : Un VAE est utilisé pour identifier les facteurs cachés derrière les variables observées. Il aide à décomposer les données en composants significatifs sans avoir besoin de résultats étiquetés.
Réseau Adversarial Génératif (GAN) : Un GAN est utilisé pour générer des résultats contrefactuels. En entraînant deux réseaux de neurones l'un contre l'autre, le GAN peut produire des données synthétiques réalistes qui imitent les résultats potentiels.
Module Doublement Robuste : Une caractéristique unique de DR-VIDAL est l'inclusion d'un composant doublement robuste, qui combine les prédictions de résultats basées à la fois sur les assignations de traitement et les covariables. Cette couche aide à améliorer l'exactitude des estimations des effets de traitement.
En combinant ces éléments, DR-VIDAL offre un cadre complet pour mieux estimer les effets des traitements et prédire les résultats, même dans des cas où les données peuvent être bruyantes ou incomplètes.
Méthodologie
Dans la construction de DR-VIDAL, le cadre est organisé en trois parties principales :
Inférence de Variables Latentes avec le VAE : Cette partie utilise le VAE pour inférer des variables latentes à partir de données observées. En modélisant comment les facteurs observés pourraient provenir de variables cachées sous-jacentes, le VAE permet une compréhension plus nuancée des données. Le processus d'inférence variationnelle optimise le modèle pour apprendre efficacement ces facteurs cachés.
Génération de Contrefactuels via GAN : Après que le VAE a fourni des aperçus sur la structure latente, le GAN prend le relais. Le réseau générateur au sein du GAN utilise les variables latentes apprises et le bruit aléatoire pour créer à la fois des résultats factuels et contrefactuels. Le réseau discriminateur évalue ensuite ces résultats pour s'assurer qu'ils sont réalistes et valides.
Estimation Doublement Robuste de l'ITE : Enfin, les résultats générés sont transmis au module doublement robuste, qui estime les effets de traitement individualisés. En combinant différentes approches statistiques, ce composant aide à garantir que les estimations sont aussi précises que possible, même en présence de certains biais.
Paramètres Expérimentaux
Pour tester DR-VIDAL, les chercheurs ont réalisé des expériences utilisant à la fois des ensembles de données synthétiques et du monde réel.
Ensembles de Données Synthétiques
Deux types de ensembles de données synthétiques ont été créés pour évaluer la performance de la méthode :
Premier Ensemble de Données : Cet ensemble de données a suivi un processus similaire à des méthodes existantes comme le CEVAE. Il a généré des points de données à partir d'un mélange de distributions gaussiennes, permettant un environnement contrôlé pour évaluer l'efficacité du modèle.
Deuxième Ensemble de Données : Cet ensemble de données visait une structure plus compliquée en combinant des caractéristiques des deux CEVAE et GANITE. En simulant diverses conditions, les chercheurs pouvaient tester en profondeur comment DR-VIDAL performe dans des situations diverses.
Ensembles de Données du Monde Réel
En plus des données synthétiques, DR-VIDAL a été testé sur plusieurs ensembles de données du monde réel établis, comprenant :
Programme de Santé et de Développement des Nourrissons (IHDP) : Cet ensemble de données évalue les interventions précoces pour les nourrissons et inclut une variété de covariables liées aux résultats de santé.
Ensemble de Données des Jumeaux : Cet ensemble de données implique des enregistrements de naissances de jumeaux et examine la mortalité comme un résultat.
Ensemble de Données sur les Emplois : Cet ensemble de données se concentre sur les programmes de formation professionnelle et leurs impacts sur les revenus.
Pour tous les ensembles de données, les chercheurs ont divisé les données en ensembles d'entraînement, de validation et de test. Ils ont effectué de nombreuses itérations pour garantir des résultats fiables.
Résultats et Performance
Les résultats ont indiqué que DR-VIDAL surpassait systématiquement d'autres modèles dans divers contextes :
Ensembles de Données Synthétiques : Dans des expériences utilisant des données synthétiques, DR-VIDAL a montré des erreurs plus faibles dans l'estimation des effets moyens de traitement à travers différentes tailles d'échantillon. Il a également mieux performé dans la mesure de la précision des effets hétérogènes.
Ensembles de Données du Monde Réel : DR-VIDAL a démontré une performance supérieure sur les ensembles de données IHDP, Emplois et Jumeaux. La nature doublement robuste du modèle semblait contribuer significativement à sa précision.
Globalement, le cadre flexible de DR-VIDAL lui a permis de s'adapter à différents types de données, améliorant ses estimations et prédictions.
Discussion
La combinaison de techniques avancées dans DR-VIDAL offre une promesse significative pour améliorer l'inférence causale et l'estimation des effets de traitement. En adoptant une approche structurée qui intègre des hypothèses causales, la modélisation de variables latentes et l'apprentissage adversarial, cette méthode fournit une base solide pour de futures recherches et applications.
Cependant, il existe des limites. Le graphique causal utilisé dans DR-VIDAL pourrait être affiné davantage, et des mécanismes supplémentaires comme l'attention pourraient être mis en œuvre pour mettre en évidence les prédictions les plus importantes. Explorer d'autres techniques, comme intégrer des modèles existants dans le cadre DR-VIDAL, pourrait également conduire à des améliorations.
Conclusion
DR-VIDAL représente une approche novatrice pour estimer les effets de traitement et générer des contrefactuels. En s'appuyant sur les avancées en apprentissage profond et en intégrant des méthodes statistiques robustes, elle offre une solution complète aux complexités des données d'observation du monde réel. Avec sa capacité à s'adapter et à améliorer les estimations, DR-VIDAL peut contribuer de manière significative aux domaines nécessitant des aperçus clairs sur les relations causales et leurs résultats. La flexibilité de son cadre présente des opportunités d'expansion et d'amélioration, ouvrant la voie à de futurs développements dans ce domaine de recherche important.
Titre: DR-VIDAL -- Doubly Robust Variational Information-theoretic Deep Adversarial Learning for Counterfactual Prediction and Treatment Effect Estimation on Real World Data
Résumé: Determining causal effects of interventions onto outcomes from real-world, observational (non-randomized) data, e.g., treatment repurposing using electronic health records, is challenging due to underlying bias. Causal deep learning has improved over traditional techniques for estimating individualized treatment effects (ITE). We present the Doubly Robust Variational Information-theoretic Deep Adversarial Learning (DR-VIDAL), a novel generative framework that combines two joint models of treatment and outcome, ensuring an unbiased ITE estimation even when one of the two is misspecified. DR-VIDAL integrates: (i) a variational autoencoder (VAE) to factorize confounders into latent variables according to causal assumptions; (ii) an information-theoretic generative adversarial network (Info-GAN) to generate counterfactuals; (iii) a doubly robust block incorporating treatment propensities for outcome predictions. On synthetic and real-world datasets (Infant Health and Development Program, Twin Birth Registry, and National Supported Work Program), DR-VIDAL achieves better performance than other non-generative and generative methods. In conclusion, DR-VIDAL uniquely fuses causal assumptions, VAE, Info-GAN, and doubly robustness into a comprehensive, performant framework. Code is available at: https://github.com/Shantanu48114860/DR-VIDAL-AMIA-22 under MIT license.
Auteurs: Shantanu Ghosh, Zheng Feng, Jiang Bian, Kevin Butler, Mattia Prosperi
Dernière mise à jour: 2023-05-07 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://arxiv.org/abs/2303.04201
Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2303.04201
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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