Avancées dans l'apprentissage par un petit nombre d'exemples pour l'imagerie médicale
Améliorer la classification d'images médicales avec des données limitées en utilisant des méthodes d'apprentissage innovantes.
― 9 min lire
Table des matières
Dans le monde de la médecine, l'apprentissage profond change notre façon de voir les images médicales. Mais il y a des défis, surtout quand on a pas beaucoup de données pour entraîner ces modèles. En travaillant avec des images médicales, obtenir suffisamment de données est souvent un gros souci à cause de la complexité et du coût pour capturer ces images, et de la nécessité de garder les infos des patients privées.
Pour résoudre le problème des données limitées, les chercheurs se penchent sur une méthode appelée apprentissage avec peu d’exemples (FSL). Cette façon d'apprendre permet à un modèle d'apprendre à partir d'un petit nombre d'exemples. Un domaine où le FSL peut être super utile, c'est dans la Classification d'images médicales, où les ensembles de données sont petits pour les raisons évoquées plus tôt.
Ces dernières années, une nouvelle méthode appelée méta-apprentissage a vu le jour. C'est un concept où les modèles apprennent comment apprendre. Au lieu de s'entraîner juste sur des données brutes, ces modèles sont formés sur différentes tâches. Cette structure peut aider les modèles à mieux généraliser face à de nouvelles tâches ou données.
Une manière d'améliorer la performance des modèles conçus dans le cadre du FSL est d'utiliser l'Apprentissage auto-supervisé (SSL). Grâce au SSL, les modèles peuvent apprendre des caractéristiques utiles à partir de données non étiquetées supplémentaires avant d’être entraînés sur des exemples étiquetés. Un obstacle courant avec le SSL est que les caractéristiques apprises peuvent être liées à la façon dont les images sont modifiées, plutôt qu'aux classes réelles d'images. Cela peut poser des problèmes lors des prédictions sur de nouvelles données.
Pour améliorer le SSL, les chercheurs ont introduit une méthode appelée Minimisation de Risque Invariant Basée sur Partition Itérative (IP-IRM). Cette stratégie trie les données en groupes basés sur des caractéristiques spécifiques, permettant au modèle de se concentrer sur les bons détails lors de l'apprentissage.
L'objectif principal de ce travail est de combiner les avantages du SSL désencombré et du méta-apprentissage pour créer un modèle robuste qui peut mieux performer dans la classification d'images médicales, même avec seulement de petites quantités de données disponibles.
Contexte
L'utilisation de l'apprentissage profond dans l'imagerie médicale est en plein essor. Cependant, à cause du manque de données étiquetées, entraîner ces modèles de manière efficace représente un défi significatif. L'apprentissage avec peu d'exemples entre en jeu ici, permettant d'apprendre avec des exemples limités. C'est crucial dans le secteur de la santé, car obtenir suffisamment de données étiquetées est non seulement difficile mais aussi coûteux et chronophage.
Le méta-apprentissage aide les modèles à apprendre comment améliorer leur propre processus d'apprentissage. Quand les modèles sont formés sur des tâches plutôt que sur des ensembles de données individuelles, ils sont mieux préparés à gérer de nouvelles données non vues à l'avenir.
L'apprentissage auto-supervisé est un autre composant important de cette stratégie. Il permet aux modèles d'apprendre des représentations à partir de grandes quantités de données non étiquetées avant d'être affinés sur des ensembles de données plus petits et étiquetés. En faisant cela, on peut améliorer la performance du modèle sans avoir besoin immédiatement de vastes quantités de données étiquetées.
Apprentissage avec Peu d'Exemples dans la Classification d'Images Médicales
L'apprentissage avec peu d'exemples prend de l'ampleur dans l'imagerie médicale parce que l'apprentissage supervisé traditionnel ne fonctionne pas toujours bien quand les données étiquetées sont limitées. Avec l'apprentissage avec peu d'exemples, les modèles peuvent être entraînés en utilisant juste quelques exemples par classe, ce qui est particulièrement bénéfique quand les ensembles de données sont petits et coûteux à collecter.
Des recherches ont montré que tirer parti du méta-apprentissage peut améliorer l'efficacité de l'apprentissage avec peu d'exemples dans le domaine médical. Cela permet aux modèles de mieux s'adapter à de nouvelles tâches, améliorant leur capacité à classifier des images avec un minimum d'exemples.
Apprentissage Auto-Supervisé comme Étape de Pré-Formation
L'apprentissage auto-supervisé devient de plus en plus populaire comme étape de pré-formation dans l'apprentissage avec peu d'exemples pour booster la performance des modèles. En s'entraînant sur des données non étiquetées supplémentaires, les modèles peuvent apprendre des caractéristiques précieuses avant d’être affinés sur un nombre plus restreint d'exemples étiquetés.
Des études antérieures indiquent qu'ajouter du SSL au processus d'entraînement peut considérablement améliorer les représentations apprises par le modèle, menant à de meilleures performances en classification. Cependant, si la méthode utilisée en SSL se concentre seulement sur les augmentations appliquées aux images plutôt que sur les classes spécifiques, cela peut entraîner de moins bonnes performances sur les tâches réelles.
Avec l'IP-IRM, une approche plus efficace est adoptée pour séparer les caractéristiques qui sont importantes pour la tâche en cours de celles qui sont liées à la façon dont les images ont été modifiées. Cela garantit que le modèle apprend des caractéristiques robustes qui aideront lors de la classification d'images issues de jeux de données plus petits.
Méthode Proposée
Ce travail propose une méthode combinée utilisant l'apprentissage auto-supervisé désencombré et le méta-apprentissage pour améliorer l'apprentissage avec peu d'exemples dans l'imagerie médicale.
L'objectif global est de pré-entrainer un modèle en utilisant l'apprentissage auto-supervisé pour obtenir de fortes représentations de caractéristiques avant de l'affiner via un processus de méta-apprentissage.
La première étape est une phase de pré-formation, où les caractéristiques sont extraites en utilisant des techniques d'apprentissage auto-supervisé. Le but est de désencombrer les caractéristiques associées à la tâche plutôt qu'à celles liées aux augmentations. Après cela, une phase de méta-apprentissage affine le modèle sur des données étiquetées, lui permettant d'apprendre à partir de tâches qui aident à mieux généraliser.
Un aspect innovant de cette approche est l'utilisation de classes liées à différents niveaux de granularité durant la méta-formation et les tests. En s'entraînant sur des classes plus fines, le modèle est alors testé sur des catégories plus larges qui sont toujours pertinentes dans le contexte clinique. C'est important car cela permet au modèle d'apprendre des distinctions complexes durant l'entraînement, qui peuvent ensuite se traduire par de bonnes performances dans des scénarios de test plus simples, mais cliniquement importants.
Applications en Imagerie Médicale
Pour démontrer l'efficacité de cette méthode, l'approche proposée a été testée sur deux tâches d'imagerie médicale : classifier l'agressivité du cancer de la prostate à l'aide de données IRM et classifier la malignité du cancer du sein à partir d'images microscopiques.
Dans la première tâche, des images IRM de la prostate ont été utilisées pour prédire la gravité de la tumeur en fonction des valeurs pronostiques. Un modèle de prédiction fiable est nécessaire ici pour réduire les procédures inutiles pour les patients et améliorer la précision diagnostique grâce à des méthodes automatisées.
La deuxième tâche a examiné des cellules de cancer du sein à partir d'images microscopiques pour identifier correctement les lésions bénignes et malignes. Cela peut vraiment aider les pathologistes dans leur charge de travail, permettant des diagnostics plus rapides et plus précis.
Résultats
Les résultats montrent que la méthode proposée surpasse constamment les méthodes traditionnelles, même face à des défis comme les changements de distribution des données entre les phases d'entraînement et d'évaluation.
Dans l'ensemble, l'utilisation de l'apprentissage auto-supervisé désencombré peut considérablement améliorer la façon dont les modèles apprennent à partir de données limitées, renforçant leur performance dans les tâches de classification d'images médicales.
Les expériences ont montré des résultats prometteurs, indiquant que l'utilisation de l'IP-IRM durant la phase de pré-formation a conduit à des représentations plus robustes qui ont amélioré les performances du modèle lors de l'affinage avec le méta-apprentissage.
Conclusion
En conclusion, ce travail présente une nouvelle approche pour améliorer la performance de l'apprentissage avec peu d'exemples dans l'imagerie médicale en combinant des méthodes d'apprentissage auto-supervisé désencombré et de méta-apprentissage. En employant un processus de formation structuré qui tire parti à la fois des forces de l'apprentissage auto-supervisé pour l'extraction de caractéristiques et du méta-apprentissage pour améliorer les capacités de généralisation, la méthode proposée répond efficacement aux défis associés à des données d'entraînement limitées dans les tâches d'imagerie médicale.
Les résultats démontrent que l'utilisation de cette méthodologie combinée améliore les tâches de classification, facilitant le diagnostic des conditions médicales à partir d'images, tout en soutenant les praticiens dans la réduction de leur charge de travail et l'amélioration des soins aux patients.
À mesure que la recherche progresse, il y a plusieurs domaines à explorer davantage. Les travaux futurs pourraient chercher à optimiser encore plus les algorithmes d'apprentissage, y compris d'éventuelles améliorations des représentations de caractéristiques et le développement d'approches plus sophistiquées pouvant gérer des types de données et des modalités d'images encore plus divers.
En continuant à améliorer ces techniques, l'objectif est de fournir une solution robuste aux défis de l'imagerie médicale qui bénéficiera finalement aux fournisseurs de soins de santé et aux patients.
Titre: Boosting Few-Shot Learning with Disentangled Self-Supervised Learning and Meta-Learning for Medical Image Classification
Résumé: Background and objective: Employing deep learning models in critical domains such as medical imaging poses challenges associated with the limited availability of training data. We present a strategy for improving the performance and generalization capabilities of models trained in low-data regimes. Methods: The proposed method starts with a pre-training phase, where features learned in a self-supervised learning setting are disentangled to improve the robustness of the representations for downstream tasks. We then introduce a meta-fine-tuning step, leveraging related classes between meta-training and meta-testing phases but varying the granularity level. This approach aims to enhance the model's generalization capabilities by exposing it to more challenging classification tasks during meta-training and evaluating it on easier tasks but holding greater clinical relevance during meta-testing. We demonstrate the effectiveness of the proposed approach through a series of experiments exploring several backbones, as well as diverse pre-training and fine-tuning schemes, on two distinct medical tasks, i.e., classification of prostate cancer aggressiveness from MRI data and classification of breast cancer malignity from microscopic images. Results: Our results indicate that the proposed approach consistently yields superior performance w.r.t. ablation experiments, maintaining competitiveness even when a distribution shift between training and evaluation data occurs. Conclusion: Extensive experiments demonstrate the effectiveness and wide applicability of the proposed approach. We hope that this work will add another solution to the arsenal of addressing learning issues in data-scarce imaging domains.
Auteurs: Eva Pachetti, Sotirios A. Tsaftaris, Sara Colantonio
Dernière mise à jour: 2024-03-26 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://arxiv.org/abs/2403.17530
Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2403.17530
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.
Merci à arxiv pour l'utilisation de son interopérabilité en libre accès.