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# Gesundheitswissenschaften# Infektionskrankheiten (außer HIV/AIDS)

Neue Methode zur Schätzung der Krankheitsausbreitung

Ein simulationsbasierter Ansatz bietet verbesserte Schätzungen der Übertragbarkeit von Krankheiten.

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Inhaltsverzeichnis

Während Ausbrüche von Infektionskrankheiten ist es echt wichtig, dass Gesundheitsbehörden Massnahmen umsetzen, die die Ausbreitung der Krankheit stoppen, ohne das tägliche Leben der Leute zu sehr einzuschränken. Ein zentraler Punkt bei diesen Entscheidungen ist die Fähigkeit, die Verbreitungsgeschwindigkeit einer Krankheit in Echtzeit zu verfolgen. Das hilft zu bestimmen, ob die aktuellen Strategien funktionieren oder ob mehr Aktionen nötig sind.

Eine gängige Methode zur Messung, wie ansteckend eine Krankheit ist, basiert auf einer Zahl, die Reproduktionszahl oder RT genannt wird. Diese Zahl zeigt, wie viele neue Infektionen ein infizierter Mensch über die gesamte Zeit, in der er ansteckend ist, verursachen könnte. Wenn Rt konstant unter eins liegt, nimmt der Ausbruch ab. Im Gegenteil, wenn es über eins bleibt, wird der Ausbruch wahrscheinlich zunehmen.

Es gibt zwei Haupttypen von Rt. Der erste ist die momentane Reproduktionszahl, die die erwartete Anzahl von Infektionen zu einem bestimmten Zeitpunkt widerspiegelt, falls sich nichts ändert. Der zweite ist die Fallreproduktionszahl, die berücksichtigt, wie sich die Bedingungen nach diesem Moment ändern könnten. Für die Verfolgung von Ausbrüchen in Echtzeit ist die momentane Reproduktionszahl praktischer, und darauf werden wir uns konzentrieren.

Um Rt zu schätzen, wurde von einer Gruppe von Forschern eine beliebte Methode entwickelt. Diese Methode analysiert tägliche Fallzahlen der Krankheit und wie lange Menschen ansteckend sind. Ein Problem entsteht jedoch, wenn Daten so gesammelt werden, dass tägliche Zahlen in wöchentliche Summen kombiniert werden. Zum Beispiel haben während der COVID-19-Pandemie viele Gesundheitsbehörden auf wöchentliche Berichte über Fälle umgestellt. Das schafft Probleme bei der genauen Messung von Rt, da die Dynamik der Krankheitsausbreitung innerhalb weniger Tage geschehen könnte. Ein gängiger Workaround war es, den Zeitpunkt der Datenanalyse an die wöchentlichen Daten anzupassen, aber diese Methode kann wichtige Details übersehen, weil sie annimmt, dass alle neuen Fälle in einer Woche durch Infektionen der vorherigen Woche verursacht wurden.

In diesem Artikel stellen wir eine neue Methode zur Schätzung von Rt vor, die Daten verwendet, die über längere Zeiträume, wie Wochen, gemeldet werden. Unser Ansatz verwendet Simulationen, wie sich die Krankheit mit feineren Zeitintervallen verbreitet. So können wir unsere Simulationen effektiv an die aggregierten Daten anpassen, was zu einer genaueren Schätzung von Rt führt.

Schätzung der Übertragbarkeit

Die Verfolgung der Anzahl neuer Fälle ist wichtig, weil sie ein Gefühl dafür gibt, wie schnell sich eine Krankheit verbreitet. Ein Schlüsselkonzept ist hier das Verständnis von Rt. Wenn wir bestimmen können, ob Rt steigt oder fällt, informiert das Gesundheitsentscheidungen. Zum Beispiel, wenn Rt hoch ist, könnte das darauf hindeuten, dass mehr Einschränkungen nötig sind.

In der Praxis wird Rt geschätzt, indem die gemeldeten Fallzahlen und das Wissen darüber, wie lange es dauert, bis eine Person krank wird und eine andere sich bei ihr ansteckt, verwendet werden. Dieses Intervall wird als Serienintervall bezeichnet. Wenn Daten wöchentlich präsentiert werden, spiegeln sie möglicherweise nicht die schnellen Veränderungen in der Übertragung wider, die innerhalb einer Woche stattfinden.

Die ursprüngliche Methode zur Schätzung von Rt basiert auf täglichen Daten, aber die sind oft nicht verfügbar. Wenn Daten wöchentlich gemeldet werden, geht etwas Detail darüber verloren, wann Infektionen passiert sind. Das kann zu ungenauen Schätzungen führen, wenn es nicht richtig gehandhabt wird. Die Cori-Methode ist zum Beispiel nicht immer für wöchentliche Daten geeignet und kann irreführende Ergebnisse liefern.

Um dieses Problem zu beheben, schlagen wir eine neue Methode vor, die Simulationen verwendet. Durch die Simulation der Krankheitsausbreitung mit einer feineren Zeitskala (wie täglich statt wöchentlich) können wir die Simulationsergebnisse besser an die wöchentlichen Daten anpassen. Das kann helfen, eine genauere Schätzung von Rt abzuleiten.

Übersicht über die Cori-Methode

Die Cori-Methode ist eine Standardtechnik zur Schätzung von Rt, basierend auf der Anzahl neuer Fälle über die Zeit. Sie geht davon aus, dass die erwartete Anzahl von Fällen in jeder Woche aus der Anzahl der Fälle in den vorherigen Wochen abgeleitet werden kann, unter Berücksichtigung des Serienintervalls. Diese Methode funktioniert gut, wenn detaillierte tägliche Daten verfügbar sind.

Aber wenn wöchentliche Daten verwendet werden, können die Annahmen der Cori-Methode zu Fehlern führen. Wenn die Daten einer Woche aggregiert werden, können mehrere Infektionsereignisse, die innerhalb dieser Woche stattfinden, mit einbezogen werden, was die Cori-Methode nicht berücksichtigt. Diese Einschränkung kann zu irreführenden Schlussfolgerungen über den Fortschritt des Ausbruchs führen.

Methode auf Basis von Simulationen

Unser neuer simulativer Ansatz zielt darauf ab, die Grenzen der Cori-Methode bei der Arbeit mit aggregierten Daten zu überwinden. Diese Methode besteht darin, ein Simulationsmodell zu erstellen, das auf einer kürzeren Zeitskala läuft und Fallzahlen erzeugt, die mit den wöchentlichen aggregierten Daten übereinstimmen können.

So funktioniert's

  1. Kürzere Zeitintervalle: Statt anzunehmen, dass alle Fälle in einer Woche von Infektionen der vorherigen Woche stammen, erlaubt unser Ansatz die Möglichkeit, dass einige Infektionen innerhalb derselben Woche auftreten.

  2. Wiederholte Simulationen: Wir führen das Modell mehrfach aus und passen die Reproduktionszahl jedes Mal an, um Simulationen zu finden, die genau mit den gemeldeten Fallzahlen übereinstimmen.

  3. Iterativer Prozess: Durch wiederholte Simulationen können wir unsere Schätzungen von Rt für jede Woche verfeinern, basierend darauf, wie gut sie mit den tatsächlichen Falldaten übereinstimmen.

Dieser Ansatz ermöglicht es uns, die schnelle Übertragung der Krankheit zu berücksichtigen, die möglicherweise in den aggregierten Daten nicht erfasst wird. Indem wir dem Modell erlauben, mehrere Schritte innerhalb einer Woche zu simulieren, können wir Rt genauer schätzen.

Anwendung auf Influenza-Daten

Um unsere Methode zu zeigen, haben wir sie auf echte Daten zu Influenza-Fällen in Wales aus zwei verschiedenen Ausbruchssaisons angewendet. Durch den Vergleich unserer schätzungsbasierten Ergebnisse von Rt mit den Ergebnissen der Cori-Methode konnten wir bewerten, wie gut unser Ansatz funktioniert hat.

Ergebnisse

Unsere Ergebnisse zeigten, dass die neue Methode oft zuverlässigere Schätzungen von Rt im Vergleich zur Cori-Methode lieferte. Die schätzungsbasierten Werte gaben ein klareres Bild der Ausbruchs­dynamik, insbesondere in Zeiten schnellen Wandels.

In unserer Analyse der Influenza-Daten von 2019-2020 und 2022-2023 identifizierte die schätzungsbasierte Methode Trends in Rt, die mit der Cori-Methode nicht so gut zu erkennen waren. Zum Beispiel deutete die Cori-Methode in einigen Wochen darauf hin, dass Rt sehr hoch war, während unsere Methode niedrigere Werte anzeigte, was besser mit den tatsächlichen übertragenen Dynamiken in diesen Wochen übereinstimmte.

Bedeutung genauer Schätzungen

Eine genaue Schätzung von Rt ist entscheidend für die öffentliche Gesundheit. Zu verstehen, ob Rt konstant unter oder über eins liegt, kann den Gesundheitsbehörden über den aktuellen Stand eines Ausbruchs informieren. Wenn Rt über eins liegt, deutet das darauf hin, dass der Ausbruch sich verschlechtern könnte und strengere öffentliche Gesundheitsmassnahmen nötig sein könnten. Umgekehrt, wenn die Zahl unter eins liegt, deutet das darauf hin, dass der Ausbruch abnimmt, was möglicherweise eine Lockerung der Massnahmen erlaubt.

Fazit

Zusammengefasst bietet unsere neuartige Methode auf Basis von Simulationen eine vielversprechende Alternative zur Schätzung von Rt aus zeitlich aggregierten Krankheitsinzidenzdaten. Die Ergebnisse deuten darauf hin, dass traditionelle Methoden wie die Cori-Methode zwar ihren Platz haben, aber nicht immer für Szenarien geeignet sind, in denen Daten über längere Zeiträume aggregiert wurden.

Während wir weiterhin mit Ausbrüchen von Infektionskrankheiten konfrontiert sind, ist die Fähigkeit, die Übertragbarkeit genau zu schätzen, entscheidend. Unser Ansatz bietet einen Weg, um besser informierte öffentliche Gesundheitsentscheidungen zu treffen, basierend auf realistischen Einschätzungen, wie sich Krankheiten in der Gemeinschaft verbreiten. Diese Methode kann weiter verfeinert und auf verschiedene Infektionskrankheiten angewendet werden, was ihr Potenzial zur Verbesserung des Ausbruchsmanagements in Echtzeit unterstreicht.

Durch die kontinuierliche Entwicklung von Methoden, die sich an die verfügbaren Daten anpassen, können Gesundheitsbehörden bessere Entscheidungen treffen, die letztendlich Leben retten und Ausbrüche effektiver verwalten können.

Originalquelle

Titel: A simulation-based approach for estimating the time-dependent reproduction number from temporally aggregated disease incidence time series data

Zusammenfassung: Tracking pathogen transmissibility during infectious disease outbreaks is essential for assessing the effectiveness of public health measures and planning future control strategies. A key measure of transmissibility is the time-dependent reproduction number, which has been estimated in real-time during outbreaks of a range of pathogens from disease incidence time series data. While commonly used approaches for estimating the time-dependent reproduction number can be reliable when disease incidence is recorded frequently, such incidence data are often aggregated temporally (for example, numbers of cases may be reported weekly rather than daily). As we show, commonly used methods for estimating transmissibility can be unreliable when the timescale of transmission is shorter than the timescale of data recording. To address this, here we develop a simulation-based approach involving Approximate Bayesian Computation for estimating the time-dependent reproduction number from temporally aggregated disease incidence time series data. We first use a simulated dataset representative of a situation in which daily disease incidence data are unavailable and only weekly summary values are reported, demonstrating that our method provides accurate estimates of the time-dependent reproduction number under those circumstances. We then apply our method to two previous outbreak datasets consisting of weekly influenza case numbers from 2019-20 and 2022-23 in Wales (in the United Kingdom). Our simple-to-use approach allows more accurate estimates of time-dependent reproduction numbers to be obtained during future infectious disease outbreaks.

Autoren: Robin N Thompson, I. Ogi-Gittins, W. Hart, J. Song, R. Nash, J. Polonsky, A. Cori, E. M. Hill

Letzte Aktualisierung: 2023-09-14 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.09.13.23295471

Quell-PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.09.13.23295471.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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