Verfolgung der lysosomalen Proteinbewegung in Neuronen
Neue Techniken zeigen, wie lysosomale Proteine in Neuronen funktionieren.
― 7 min Lesedauer
Inhaltsverzeichnis
Zellen in unserem Körper müssen im Gleichgewicht und gesund bleiben, damit sie richtig funktionieren. Ein wichtiger Teil dieses Gleichgewichts sind winzige Strukturen, die Lysosomen genannt werden. Diese Lysosomen helfen dabei, unerwünschte Materialien abzubauen und wiederzuverwerten, wie beschädigte Proteine und alte Zellteile. Dieser Prozess ist besonders wichtig für Zellen, die sich nicht oft teilen, wie Neuronen in unserem Gehirn. Forscher interessieren sich dafür, wie diese Lysosomen ihre Funktionen aufrechterhalten, insbesondere in Neuronen, die viele Jahre leben können, ohne sich zu teilen.
Die Proteine, aus denen Lysosomen bestehen, kommen von einer anderen Zellstruktur, dem endoplasmatischen Retikulum (ER). Nachdem sie im ER hergestellt wurden, werden sie zum Golgi-Apparat geschickt, wo sie verpackt und an die Lysosomen geliefert werden. Das Studium, wie diese Proteine durch die Zelle wandern, ist tricky, denn wenn sie erst einmal in den Lysosomen sind, ist es schwer zu sehen, woher sie kamen und wie sie dorthin gelangt sind.
Unter den Proteinen, die an diesem Prozess beteiligt sind, sind LAMP1 und LAMP2 wichtige Akteure. Sie sitzen auf der Oberfläche der Lysosomen und helfen, sie stabil zu halten. Forscher haben herausgefunden, dass das Entfernen dieser Proteine bei Mäusen ernste Probleme und sogar den Tod verursachen kann. Während Wissenschaftler ein wenig darüber verstehen, wie LAMP-Proteine in verschiedenen Zelltypen sortiert werden, gibt es immer noch viel zu lernen, wie sie in Neuronen funktionieren, wo die Zellen einzigartige Strukturen und lange Ausläufer wie Axone und Dendriten haben.
Die Herausforderung, Neuronen zu studieren
In Neuronen ist es besonders kompliziert, lysosomale Proteine zu ihren endgültigen Zielen zu transportieren, weil Lysosomen nicht nur im Zellkörper, sondern auch entlang des langen Axons und in den Dendriten zu finden sind. Dieser Ferntransport stellt eine logistische Herausforderung dar. Wenn der Prozess der Herstellung und Bewegung von lysosomalen Proteinen schiefgeht, kann das zu verschiedenen Gehirnerkrankungen beitragen. Daher ist es entscheidend, zu verstehen, wie Lysosomen in Neuronen funktionieren.
Kürzlich haben Wissenschaftler neue Techniken entwickelt, um Proteine zu verfolgen, während sie sich durch die Zelle bewegen. Eine Methode heisst RUSH-System, mit der Forscher Proteine visualisieren können, während sie hergestellt werden und wie sie sich innerhalb der Zellen bewegen. Diese Technik benötigt jedoch spezielle Marker, um die Proteine sichtbar zu machen, was die Fähigkeit einschränkt, alle Proteine in einer Zelle gleichzeitig zu studieren.
Um dieses Problem anzugehen, haben Forscher eine neue Methode namens Protein Origin, Trafficking And Targeting to Organelle Mapping (POTATOMap) entwickelt. Diese fortschrittliche Technik ermöglicht es Wissenschaftlern, lysosomale Proteine von ihrer Entstehung im ER bis zu ihren endgültigen Zielen zu verfolgen, was ihnen ein klareres Bild davon gibt, wie diese Proteine über die Zeit interagieren und funktionieren.
Die POTATOMap-Methode
Mit POTATOMap können Forscher detaillierte Informationen darüber sammeln, wie lysosomale Proteine, insbesondere LAMP-Proteine, innerhalb von Neuronen reisen und interagieren. Die Methode verfolgt die Proteine vom Moment ihrer Abreise aus dem ER, durch verschiedene zelluläre Kompartimente, bis sie die Lysosomen erreichen. Indem sie zu verschiedenen Zeitpunkten während dieses Prozesses Schnappschüsse machen, können die Forscher ein umfassendes Bild vom Lebenszyklus dieser Proteine erstellen.
In dieser Studie haben die Forscher die POTATOMap-Methode angewandt, um LAMP-Proteine in kultivierten Neuronen zu verfolgen. Sie konnten die Maschinen identifizieren, die helfen, diese Proteine vom ER zum Golgi und schliesslich zu den Lysosomen zu bewegen. Überraschenderweise entdeckten sie, dass die Mechanismen, die den Transport der LAMP-Proteine in das Axon unterstützen, sich von denen unterscheiden, die sie zu den Lysosomen im Zellkörper bringen.
Erkenntnisse zum Transport von LAMP-Proteinen
Im Axon fanden die Forscher heraus, dass der Transport der LAMP-Proteine von speziellen Proteinen unterstützt wurde, die wie kleine Fahrzeuge agieren. Diese Proteine umfassten Kinesine, die Motorproteine sind, die entlang des Gerüstes der Zelle bewegen, um andere Proteine zu ihren Zielen zu transportieren. Die Studie zeigte, dass verschiedene Kinesine am Transport der LAMP-Proteine in das Axon beteiligt waren, was die Komplexität des Proteintransports in Neuronen verdeutlicht.
Interessanterweise entdeckte die Forschung auch, dass diese LAMP-Proteine nicht nur dafür verantwortlich sind, Lysosomen aufrechtzuerhalten, sondern auch eine Rolle beim Transport anderer wichtiger Proteine spielen, die für die Synapsen im Axon benötigt werden, das sind die Verbindungen zwischen Neuronen. Diese Entdeckung legt nahe, dass der Transport von LAMP-Proteinen und synaptischen Proteinen gleichzeitig stattfinden könnte, was darauf hindeutet, dass die lysosomale Wartung und die synaptische Funktion miteinander verbundene Prozesse sind.
Die Rolle von Kinesinen und Adapterproteinen
Die Studie hob die wesentliche Rolle der Kinesinmotoren hervor, die beim Transport von LAMP-Proteinen entlang des Axons helfen. Verschiedene Kinesine wurden für den Transport dieser Proteine rekrutiert, was darauf hinweist, dass der Transportmechanismus fein abgestimmt ist, um den Anforderungen des Neurons gerecht zu werden. Die Anwesenheit von Adapterproteinen, wie ARL8B, spielt ebenfalls eine bedeutende Rolle bei der Verbindung von Lysosomen mit diesen Kinesinen, was andeutet, dass mehrere Proteine zusammenarbeiten, um den erfolgreichen Transport der lysosomalen Proteine sicherzustellen.
Interaktion mit synaptischen Proteinen
Eine wichtige Entdeckung dieser Forschung war, dass LAMP-Proteine gemeinsam mit Proteinen, die an synaptischen Funktionen beteiligt sind, transportiert wurden. Mehrere Proteine, die mit der Synapse assoziiert sind, wurden in denselben Kompartimenten wie LAMP-Proteine kurz nach ihrer Freisetzung aus dem ER identifiziert. Dies deutet darauf hin, dass diese lysosomalen Proteine und synaptischen Proteine während ihres Transports zum Axon zusammen sortiert werden könnten.
Die Forscher stellten fest, dass nach einiger Zeit die LAMP-Proteine und synaptischen Proteine begannen, sich in unterschiedliche Kompartimente zu segregieren, was auf einen Sortierungsmechanismus hinweist, der es dem Neuron ermöglicht, diese Proteine dorthin zu verteilen, wo sie benötigt werden. Diese Segregation ist entscheidend, um sicherzustellen, dass synaptische Proteine nicht in Lysosomen landen, wo sie abgebaut werden könnten.
Die Bedeutung von SNARE-Proteinen
SNARE-Proteine sind entscheidend für die Verschmelzung von Vesikeln mit ihren Zielkompartimenten. Die Studie fand heraus, dass spezifische SNARE-Proteine während des Transports von LAMP-Proteinen und synaptischen Proteinen dynamisch angereichert waren. Besonders VAMP4 wurde als entscheidender Akteur hervorgehoben, um sicherzustellen, dass beide Arten von Proteinen ihre Ziele im Axon erreichen. Wenn VAMP4 gestört wurde, war die Lieferung dieser Proteine an das Axon beeinträchtigt, was seine Schlüsselrolle in diesem Prozess verdeutlicht.
RNA-Granula und ihre Verbindungen
Neben Proteinen fanden die Forscher auch RNA-bindende Proteine in denselben Kompartimenten wie LAMP-Proteine. Diese Funde deuteten auf eine mögliche Beziehung zwischen lysosomalen Kompartimenten und dem Transport von mRNA hin, die für die lokale Proteinsynthese im Axon wichtig ist. Die Anwesenheit von RNA-Granula in der Nähe lysosomaler Kompartimente legt nahe, dass sie auf den LAMP-Kompartimenten mitfahren könnten, was einen Mechanismus für den Transport von mRNA zu Bereichen im Neuron bietet, wo sie benötigt wird.
Diese Interaktion wirft die interessante Möglichkeit auf, dass LAMP-Kompartimente zusätzliche Rollen über das Recycling und den Abbau von Proteinen hinaus haben könnten. Die Zusammenarbeit zwischen RNA-Transport und lysosomaler Wartung könnte wichtig für neuronale Funktionen sein, um sicherzustellen, dass die richtigen Proteine und Botschaften zur richtigen Zeit an den richtigen Orten ankommen.
Fazit
Die Entwicklung von POTATOMap hat den Forschern ein leistungsstarkes Werkzeug an die Hand gegeben, um besser zu verstehen, wie lysosomale Proteine in Neuronen funktionieren und transportiert werden. Diese Studie hat wichtige Details über die Dynamik der LAMP-Proteine, ihre Interaktionen mit anderen wichtigen Proteinen und die komplexen Systeme, die ihren Transport unterstützen, offenbart.
Diese Mechanismen zu verstehen, ist nicht nur für die Grundlagenforschung in der Zellbiologie wichtig, sondern auch um Einblicke in neurologische Störungen zu erhalten, die entstehen, wenn diese Systeme nicht richtig funktionieren. Indem Wissenschaftler weiterhin die komplexen Beziehungen zwischen Lysosomen, synaptischen Proteinen und RNA-Granula erkunden, können sie die Geheimnisse der neuronalen Gesundheit und Krankheit weiter entschlüsseln.
Die Ergebnisse dieser Forschung eröffnen viele neue Wege, die im Bereich der Neurowissenschaften erkundet werden können, insbesondere in Bezug darauf, wie Zellen ihre wesentlichen Funktionen über die Zeit aufrechterhalten. Während wir unser Wissen über diese Prozesse vertiefen, könnten wir neue Strategien zur Prävention oder Behandlung neurologischer Erkrankungen entdecken, die aus gestörter lysosomaler Funktion und Proteintransport entstehen. Insgesamt stellt diese Arbeit einen bedeutenden Fortschritt im Verständnis der zellulären Dynamik im Gehirn dar und hebt die Bedeutung solcher Studien für den Fortschritt der medizinischen Wissenschaft hervor.
Titel: Spatiotemporal proteomics reveals the biosynthetic lysosomal membrane protein interactome in neurons
Zusammenfassung: Lysosomes are membrane-bound organelles critical for maintaining cellular homeostasis. Delivery of biosynthetic lysosomal proteins to lysosomes is crucial to orchestrate proper lysosomal function. However, it remains unknown how the delivery of biosynthetic lysosomal proteins to lysosomes is ensured in neurons, which are highly polarized cells. Here, we developed Protein Origin, Trafficking And Targeting to Organelle Mapping (POTATOMap), by combining trafficking synchronization and proximity-labelling based proteomics, to unravel the trafficking routes and interactome of the biosynthetic lysosomal membrane protein LAMP1 at specified time points. This approach, combined with advanced microscopy, enabled us to identify the neuronal domain-specific trafficking machineries of biosynthetic LAMP1. We revealed a role in replenishing axonal lysosomes, in delivery of newly synthesized axonal synaptic proteins, and interactions with RNA granules to facilitate hitchhiking in the axon. POTATOMap offers a robust approach to map out dynamic biosynthetic protein trafficking and interactome from their origin to destination.
Autoren: Ginny G Farias, C. H. Li, N. Kersten, N. Ozkan, M. Koppers, H. Post, M. Altelaar
Letzte Aktualisierung: 2024-05-16 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.16.594502
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.16.594502.full.pdf
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.
Vielen Dank an biorxiv für die Nutzung seiner Open-Access-Interoperabilität.