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# Gesundheitswissenschaften# Genetische und genomische Medizin

Die Rolle von RNA und Splicing in der psychischen Gesundheit

Neue Erkenntnisse über RNA-Spleissung und ihre Auswirkungen auf psychische Erkrankungen.

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Inhaltsverzeichnis

RNA, oder Ribonukleinsäure, spielt eine wichtige Rolle in unseren Zellen. Sie hilft, die Anweisungen von unserer DNA in Proteine zu übersetzen, die für den Körper wichtig sind. Bei Menschen können viele Gene verschiedene Versionen von RNA durch einen Prozess namens Spleissen produzieren.

Spleissen ist wie das Bearbeiten eines Videos. Stell dir vor, du hast einen langen Film, und du kannst Szenen rausschneiden oder umsortieren, um eine andere Version zu erstellen. Ähnlich können bei der Umwandlung von Genen in RNA bestimmte Teile, die Exons heissen (die den Code für die Herstellung von Proteinen tragen), behalten oder übersprungen werden, während andere Teile, die Introns heissen (die keine codierenden Informationen tragen), entfernt werden können. So kann ein einziges Gen viele verschiedene RNA-Varianten produzieren, was zu unterschiedlichen Proteinen führen kann.

Bedeutung des alternativen Spleissens

Mehr als 90 % unserer Gene, die aus mehreren Code-Teilen bestehen, unterliegen alternativem Spleissen. Das bedeutet, dass sie verschiedene Versionen von RNA erzeugen können. Einige häufige Formen des alternativen Spleissens sind das Überspringen bestimmter Abschnitte, das Behalten von Teilen, die normalerweise entfernt werden, und das Verwenden unterschiedlicher Start- und Endpunkte in der RNA. Diese Flexibilität erhöht die Vielfalt der Proteine, die unser Körper produzieren kann, was für verschiedene Funktionen und Prozesse entscheidend ist.

Im Gehirn ist alternatives Spleissen besonders wichtig. Das Gehirn hat eine einzigartige Art des Spleissens von Genen, die für seine Entwicklung und Funktion unerlässlich ist. Viele Studien haben gezeigt, dass Probleme beim Spleissen zu verschiedenen psychischen Gesundheitsproblemen wie Schizophrenie, Depressionen und Autismus führen können.

Psychische Gesundheitsstörungen

Psychische Gesundheitsstörungen, wie Schizophrenie, Major Depression, Autismusspektrumstörung und bipolare Störung, können das Leben von betroffenen Personen und deren Familien stark beeinträchtigen. Die Diagnose dieser Erkrankungen kann schwierig sein, da die Symptome sich überschneiden und es gesellschaftliche Stigmatisierung gibt. Die Behandlungen sind oft begrenzt und nicht immer für jeden wirksam, und die Ursachen dieser Störungen sind noch nicht vollständig verstanden.

Jüngste Forschungen, insbesondere gross angelegte Studien, die unser genetisches Erbgut untersuchen, haben zahlreiche genetische Varianten entdeckt, die mit diesen psychischen Gesundheitsstörungen in Verbindung stehen. Viele dieser Varianten befinden sich in Bereichen der DNA, die nicht direkt für Proteine kodieren, sondern wahrscheinlich beeinflussen, wie Gene exprimiert werden und wie die RNA gespleisst wird.

Untersuchung der Rolle des Spleissens bei psychischen Gesundheitsstörungen

Angesichts der Bedeutung des alternativen Spleissens ist es entscheidend zu verstehen, wie genetische Varianten das Spleissen und somit die Arten von produzierter RNA beeinflussen könnten. Viele der genetischen Risikofaktoren für psychische Störungen befinden sich in nicht-codierenden Bereichen, sodass sie voraussichtlich die Genexpression und das Spleissen von RNA regulieren, anstatt direkt für Proteine zu kodieren.

Einige genetische Varianten können beispielsweise beeinflussen, wie „Spleissfaktoren“, die Proteine, die beim Spleissen helfen, an RNA binden. Wenn diese Bindung verändert wird, kann das dazu führen, dass sich ändert, welche RNA-Versionen produziert werden, was potenziell zu psychischen Gesundheitsproblemen führen kann. Das bedeutet, dass es wichtig ist, zu untersuchen, wie diese Varianten das RNA-Spleissen beeinflussen, um den Zusammenhang zwischen Genetik und den biologischen Prozessen, die psychische Störungen zugrunde liegen, zu verstehen.

Einschränkungen der aktuellen Sequenzierungstechnologien

Um RNA und Spleissen zu studieren, verwenden Wissenschaftler oft Sequenzierungstechnologien, die die RNA lesen. Aktuelle beliebte Methoden, wie die Illumina-Kurzzeit-Sequenzierung, sind effizient, haben aber Einschränkungen. Sie bieten oft nicht vollständige Informationen darüber, wie Exons miteinander verbunden sind, insbesondere in grossen und komplexen Genen.

Auf der anderen Seite können Langzeit-Sequenzierungstechnologien, wie die von Oxford Nanopore Technologies und Pacific Biosciences, ganze RNA-Moleküle auf einmal lesen. Diese Fähigkeit ermöglicht eine bessere Identifizierung der verschiedenen RNA-Versionen und ein genaueres Verständnis von Spleissmustern.

Neuer Forschungsansatz

In einer aktuellen Studie wollten Forscher die Lücken in unserem Verständnis von RNA-Isoformen in Bezug auf psychische Gesundheitsstörungen schliessen. Sie entwickelten ein neues Tool namens IsoLamp, das speziell dafür ausgelegt ist, RNA-Isoformen mithilfe von Daten aus der Langzeit-Sequenzierung zu identifizieren und zu analysieren.

Indem sie diese Technologie auf postmortale Gehirnproben von Personen ohne psychische Störungen anwendeten, untersuchten sie die RNA-Profile von 31 Genen, die mit Gesundheitsrisiken verbunden sind. Diese Forschung entdeckte 363 neue RNA-Isoformen und 28 neuartige Exons, die eine komplexe Schicht der Genexpression aufdeckten, die zuvor nicht berücksichtigt worden war.

Wichtige Ergebnisse

Die Forscher fanden heraus, dass einige Gene hauptsächlich neue Isoformen und nicht die bekannten exprimierten. Zum Beispiel hatten ATG13 und GATAD2A einen hohen Anteil ihrer Expression, der mit neuartigen RNA-Versionen verbunden war. Das deutet darauf hin, dass das aktuelle Verständnis dieser Gene unvollständig sein könnte und zeigt, wie wichtig bessere Annotationen und Forschung zu ihren funktionalen Rollen sind.

Ausserdem variierte die Vielfalt der erkannten Isoformen erheblich je nach Gen, wobei einige Gene zeigten, dass der Grossteil ihrer Expression von neuen Versionen stammt. Diese Komplexität bedeutet, dass Forscher mehr als nur die kanonischen Formen von Genen berücksichtigen müssen, wenn sie deren Funktion und mögliche Zusammenhänge mit psychischen Gesundheitsstörungen untersuchen.

Ausdrucksunterschiede im Gehirn

Die Forschung untersuchte auch, wie verschiedene Gehirnregionen diese neuartigen Isoformen ausdrücken. Es wurde festgestellt, dass das Kleinhirn mehr Variation im Vergleich zu kortikalen Regionen aufwies. Zum Beispiel wurde eine spezifische RNA-Version des DCC-Gens im Kleinhirn viel häufiger gefunden als in anderen Bereichen.

Ausserdem wurden signifikante Unterschiede in der Expression spezifischer RNA-Versionen im DOC2A-Gen beobachtet, was auf potenzielle regionsspezifische Rollen dieser neuartigen RNAS hindeutet. Das Verständnis dieser Unterschiede könnte helfen, wie bestimmte Gene zu spezifischen Aspekten der Gehirnfunktion oder der Entwicklung psychischer Störungen beitragen.

Validierung neuartiger Exons

Von den identifizierten neuen Exons wurden viele durch zusätzliche Experimente validiert. Die Forscher bestätigten, dass diese neuartigen Exons tatsächlich existieren könnten, was die Idee untermauert, dass bestehende Genannotationen nicht umfassend sind.

Besonders viele dieser neuartigen Exons enthielten vorzeitige Stopcodons, was zur Abbau von mRNA führen kann und dadurch die Proteinproduktion beeinflusst. Das deutet darauf hin, dass diese Variationen eine Rolle bei der Regulierung der Genexpressionslevel im Gehirn spielen könnten.

Die Zukunft der RNA-Studien in der psychischen Gesundheit

Die Ergebnisse dieser Forschung eröffnen neue Wege, um die komplexe Biologie hinter psychischen Gesundheitsstörungen zu verstehen. Die identifizierten RNA-Isoformen und Exons könnten neue Einblicke darin geben, wie genetische Risikofaktoren über Veränderungen in RNA- und Proteinfunktionen wirken.

Mit Fortschritten in den Sequenzierungstechnologien und bioinformatischen Tools wie IsoLamp können Forscher die Komplexität des RNA-Spleissens im Gehirn effektiver aufdecken. Dieses Wissen könnte zu besseren Diagnosen führen und möglicherweise zukünftige Therapien informieren, die darauf abzielen, Spleiss-Anomalien durch gezielte Ansätze, wie das Modifizieren von RNA mit neuen Technologien, zu korrigieren.

Fazit

Das Verständnis von RNA und ihren vielfältigen Formen ist entscheidend, um die biologischen Komplexitäten psychischer Gesundheitsstörungen zu begreifen. Die hohe Anzahl neu identifizierter RNA-Isoformen und Exons veranschaulicht die komplexe Natur der Genexpression im Gehirn.

Während die Forschung weiterhin fortschreitet, wird es wichtig sein, Erkenntnisse aus Genetik, RNA-Studien und funktionalen Analysen zu integrieren, um ein umfassendes Verständnis der psychischen Gesundheit zu schaffen. Dieses Wissen könnte möglicherweise zu besseren Behandlungen und Interventionen führen, die auf individuelle genetische Profile zugeschnitten sind und Hoffnung für Betroffene von psychischen Gesundheitsstörungen bieten.

Originalquelle

Titel: Long-read sequencing reveals the RNA isoform repertoire of neuropsychiatric risk genes in human brain

Zusammenfassung: Neuropsychiatric disorders are highly complex conditions and the risk of developing a disorder has been tied to hundreds of genomic variants that alter the expression and/or products (isoforms) made by risk genes. However, how these genes contribute to disease risk and onset through altered expression and RNA splicing is not well understood. Combining our new bioinformatic pipeline IsoLamp with nanopore long-read amplicon sequencing, we deeply profiled the RNA isoform repertoire of 31 high-confidence neuropsychiatric disorder risk genes in human brain. We show most risk genes are more complex than previously reported, identifying 363 novel isoforms and 28 novel exons, including isoforms which alter protein domains, and genes such as ATG13 and GATAD2A where most expression was from previously undiscovered isoforms. The greatest isoform diversity was present in the schizophrenia risk gene ITIH4. Mass spectrometry of brain protein isolates confirmed translation of a novel exon skipping event in ITIH4, suggesting a new regulatory mechanism for this gene in brain. Our results emphasize the widespread presence of previously undetected RNA and protein isoforms in brain and provide an effective approach to address this knowledge gap. Uncovering the isoform repertoire of neuropsychiatric risk genes will underpin future analyses of the functional impact these isoforms have on neuropsychiatric disorders, enabling the translation of genomic findings into a pathophysiological understanding of disease.

Autoren: Michael B Clark, R. De Paoli-Iseppi, S. S. Joshi, J. Gleeson, Y. D. Prawer, Y. You, R. Agarwal, A. Li, A. Hull, E. M. Whitehead, Y. Seo, R. Kujawa, R. Chang, M. Dutt, C. McLean, B. L. Parker

Letzte Aktualisierung: 2024-04-03 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.02.22.24303189

Quell-PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.02.22.24303189.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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