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RNAポリメラーゼの変異が健康問題に関連してるって。

研究がPOLR3Bの変異がRNA処理と人間の健康にどんな影響を与えるかを明らかにした。

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RNAの変異が健康に影響をRNAの変異が健康に影響を与えるった。処理を変えて、障害を引き起こすことがわか研究によると、POLR3Bの変異がRNA
目次

生きている細胞では、主に3つのタイプのRNAが生成される。それはリボソームRNA(rRNA)、メッセンジャーRNA(mRNA)、そしてトランスファーRNA(tRNA)だ。それぞれはRNAポリメラーゼと呼ばれる特定の酵素によって作られる。これらのRNAタイプを作るプロセスは、細胞の機能、特にタンパク質の生成にとって重要なんだ。

RNAポリメラーゼの役割

動物、植物、菌類などの真核細胞は、3種類のRNAポリメラーゼを使っている。RNAポリメラーゼI(Pol I)はrRNAの生成に焦点を当てていて、これはリボソームの形成に重要。RNAポリメラーゼII(Pol II)はmRNAや特定の非コーディングRNA(ncRNA)の生成を担当している。RNAポリメラーゼIII(Pol III)は主にtRNAや他の小さなncRNAを作る。この中で、Pol IIIは特に複雑で、転写プロセスを効率良く始めたり終わらせたりするための特別なシステムを持っている。

このシステムで重要なタンパク質はLaタンパク質。これは新しく形成されたRNA転写物と相互作用して、安定化や成熟を助けるんだ。Laタンパク質は特にtRNAに関連するこれらのRNA分子の末端の配列に結合する。

脊椎動物のPol IIIの特異性

脊椎動物では、Pol IIIのシステムは酵母とは異なっていて、酵母はもっとシンプルな生物だから。脊椎動物のtRNA遺伝子は、転写の終わりを示す短い配列を持っていて、終結プロセスを簡素化している。特定の転写因子の存在も異なっていて、酵母には存在しないものもある。

Pol IIIが生成する特定の小さなRNAタイプは、遺伝子の発現に影響を与えることがある。例えば、tRNAの断片(tRF)と呼ばれるものが遺伝子調節に関与していることが示されている。他の非コーディングRNA、例えばボールトRNAやsnaRは、酵母のようなシンプルな生物には存在しない経路を含んでいる。人間には、特定のtRNAや小さなRNAのユニークな形がある。

病原性変異とその影響

POLR3AやPOLR3B遺伝子の変化や変異は、低髄鞘白質ジストロフィー(HLD)として知られる深刻な健康問題を引き起こすことがある。この状態は神経系に影響を及ぼし、神経を覆う保護膜であるミエリンに問題を起こす。こうした変異は、歯やホルモンの調節にも問題を引き起こすことがある。

ある特定のケースでは、診断を受けていなかった患者がPOLR3B遺伝子に特定の変異を持っていることがわかった。さらに調査を進めると、この変異は細胞、特に結合組織を形成する助けをする線維芽細胞におけるRNAの処理に問題を引き起こしていることがわかった。

研究結果

最新の遺伝子編集技術を使って、研究者たちはラボの細胞でその変異を再現することができた。これにより、患者の細胞で見られたのと同様のRNA処理の問題が引き起こされた。研究は、この変異がRNAの特定の部分をスキップさせ、完全で機能的なタンパク質を生成できなくすることを示した。

研究では、患者の細胞が正常な細胞に比べて特定のRNA産物の量が著しく低いことが明らかになった。特に、タンパク質合成に必要な重要な分子であるpre-tRNAがずっと少なかった。

RNA処理への影響

研究では、Laタンパク質が変異によってどのように影響を受けたかも探求された。変異のある細胞では、Laタンパク質の量が必要以上に多いことがわかった。この余分なLaタンパク質は、正常なRNA処理を妨げ、特定のRNA断片の蓄積を引き起こしているようだった。

興味深いことに、研究は、tRNAの断片から派生した特定の小さなRNAタイプが、変異のある細胞でより豊富であることを示した。これは、RNA処理経路が変異に応じて適応した可能性があり、Pol IIIの活動が減少したことによる問題をバランスを取る方法として示唆される。

遺伝子分析と家族歴

患者を調べる中で、研究者たちは家族歴もチェックし、遺伝子検査を行った。POLR3Bの変異はDNA分析によって確認された。患者は、変異によって引き起こされる混乱に一致する、頭のサイズが小さいことや発達の遅れなどの問題を示した。

他の家族メンバーの分析は、変異が遺伝されたかどうかを明らかにするのに役立った。この遺伝子変化を追跡することで、他の親族にこの疾患がどのように現れるかについての洞察が得られた。

変異の影響メカニズムの探求

詳細に、研究では変異がRNAのスプライシングにどのように影響を与えたかを調べた。正常なスプライシングは、機能的なタンパク質の適切な形成を可能にする。しかし、変異はRNAの特定の部分を含めることができず、早期に停止したタンパク質を引き起こした。

この変異の働きをよりよく理解するために、研究者たちは変異を含む修正された細胞と正常な細胞の挙動を比較した。RNA産生の違いは顕著で、特に生成されるtRNAのタイプに関しては明らかだった。

RNA変異の広範な影響の理解

この研究は、見つかったことの広範な影響も強調した。POLR3Bの変異のある細胞でのRNAプロファイルの変化は、他の場所で同様の変異を検出するための指標やバイオマーカーとして役立つ可能性があり、関連する疾患の診断に有用なツールを提供する。

潜在的な治療法と今後の方向性の探求

今後を見据え、研究は潜在的な治療法についての議論を開く。治療は、POLR3Bの変異のある細胞での不具合なRNA処理を修正したり補償したりすることを目指すことができる。これは、RNAポリメラーゼの機能を高めたり、RNA処理に関与するタンパク質の間でバランスを回復することを含むかもしれない。

さらに、tRNA遺伝子が変異に対して異なる反応を示すことを理解することで、必須のtRNAの生成を改善するための標的療法につながる可能性がある。

結論

POLR3Bの変異に関する研究は、RNA処理と人間の健康への影響についての重要な洞察を明らかにした。RNA転写の複雑さと特定のタンパク質の影響は、この研究分野の重要性を強調している。今後は、こうした研究から得た知識が、RNA処理の異常に関連する遺伝的障害の管理に向けたより良い診断法や治療戦略の希望を提供する。

オリジナルソース

タイトル: A POLR3B-variant reveals a Pol III transcriptome response dependent on La protein/SSB

概要: RNA polymerase III (Pol III, POLR3) synthesizes tRNAs and other small non-coding RNAs. Human POLR3 pathogenic variants cause a range of developmental disorders, recapitulated in part by mouse models, yet some aspects of POLR3 deficiency have not been explored. We characterized a human POLR3B:c.1625A>G;p.(Asn542Ser) disease variant that was found to cause mis-splicing of POLR3B. Genome-edited POLR3B1625A>G HEK293 cells acquired the mis-splicing with decreases in multiple POLR3 subunits and TFIIIB, although display auto-upregulation of the Pol III termination-reinitiation subunit POLR3E. La protein was increased relative to its abundant pre-tRNA ligands which bind via their U(n)U-3-termini. Assays for cellular transcription revealed greater deficiencies for tRNA genes bearing terminators comprised of 4Ts than of [≥]5Ts. La-knockdown decreased Pol III ncRNA expression unlinked to RNA stability. Consistent with these effects, small-RNAseq showed that POLR3B1625A>Gand patient fibroblasts express more tRNA fragments (tRFs) derived from pre-tRNA 3-trailers (tRF-1) than from mature-tRFs, and higher levels of multiple miRNAs, relative to control cells. The data indicate that decreased levels of Pol III transcripts can lead to functional excess of La protein which reshapes small ncRNA profiles revealing new depth in the Pol III system. Finally, patient cell RNA analysis uncovered a strategy for tRF-1/tRF-3 as POLR3-deficiency biomarkers.

著者: Richard John Maraia, S. Mattijssen, K. Kerkhofs, J. Stephen, A. Yang, C. G. Han, Y. Tadafumi, J. R. Iben, S. Mishra, R. M. Sakhawala, A. Ranjan, M. Gowda, W. A. Gahl, S. Gu, M. C. Malicdan

最終更新: 2024-02-05 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.05.577363

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.05.577363.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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