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慢性炎症の測定に関する新しい洞察

研究者たちは、DNAメチル化を炎症の安定した指標として探求している。

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炎症測定の革命炎症測定の革命かもしれない。新しいマーカーが慢性炎症の検出を改善する
目次

慢性的な低度の炎症は年齢とともに一般的な問題だよ。この持続的な炎症は、心臓病や脳卒中、2型糖尿病などのいくつかの健康問題と関連しているんだ。炎症を測る方法の一つがC反応性タンパク質(CRP)という物質を使うことなんだけど、CRPを一度だけ測るのは難しいこともあるんだ。というのも、感染症やけがの影響でレベルが大きく変わることがあるからね。つまり、単一のCRP測定では、長期的な炎症の状態を完全に把握できないかもしれないってわけ。

慢性的な炎症をよりよく理解するために、科学者たちはもっと安定した指標を探しているんだ。その中で期待されているのがDNAメチル化(DNAm)なんだ。これは、小さな化学グループがDNAに結合するプロセスで、主にCpGサイトという特定の場所に付着するんだ。DNAメチル化は遺伝や環境によって影響を受け、遺伝子の発現にも関与しているよ。

研究者たちは、血液中のCRPレベルに関連する1,000以上のCpGサイトを見つけたんだ。これらのサイトを使って、DNAメチル化に基づいたCRPレベルの予測因子を作成したんだ。この予測因子は、通常のCRP測定よりも時間を通じて安定していて、認知や代謝の健康結果ともより強い関連を示しているんだ。これから、DNAメチル化が慢性的な炎症の信頼できるマーカーになり得ることが示唆されているよ。

測定技術の改善の必要性

DNAメチル化がCRPにどのように関連しているかを深く理解するためには、全ゲノムにわたってCRPの変動がDNAメチル化によってどれだけ説明できるかを推定することが重要なんだ。この推定が、DNAメチル化に基づく予測因子の効果を評価するのに役立つんだ。現在の予測因子を開発する方法では、個々の線形回帰の結果を重みづけするだけで、異なるCpGサイト同士の関係や他の要因を考慮していないんだ。

いろんな統計的方法を使って、ベイズ的アプローチや特徴選択技術を取り入れて、研究者たちはこれらの予測因子の開発を改善しようとしているよ。加えて、DNAメチル化とCRPに関するほとんどの研究は、主にヨーロッパ系の成人に焦点を当てているんだ。これで、これらの発見が他のバックグラウンドの人々や、子供や高齢者などの異なるライフステージにも適用できるかどうかの疑問が生まれているんだ。

研究目標

今回の研究で、科学者たちは6つの多様なグループからの血液サンプルを使って、4つの主要な目標を達成しようとしているよ。

  1. 大規模な研究を実施: 最初のステップは、DNAメチル化とCRPの関係を理解するために、約17,936人の「Generation Scotland」というグループを対象に大規模な研究を行うことなんだ。研究者たちは、CRPの変動のどれだけがDNAメチル化によるものかを見極めるために、さまざまな統計技術を適用するよ。

  2. 新しい予測因子を開発: 2つ目の目標は、弾性ネット回帰、ベイズ的ペナルティ回帰、主成分分析(PCA)の3つの一般的な方法を使ってCRPレベルの新しい予測因子を作成することだよ。

  3. 予測性能を比較: これらの予測因子を開発した後、研究者たちはお互いや他の研究で使われている既存の予測因子と比較して、どれが一番性能がいいかを見るよ。

  4. 健康結果をテスト: 最後に、新しいDNAメチル化のCRP予測因子が26種類の心血管代謝リスク因子を含むさまざまな健康指標にどれだけ関連するかを調べるんだ。

コホート研究の説明

この研究は、DNAメチル化とCRPレベルの両方が測定された複数のグループ(コホート)からの血液サンプルを使っているんだ。「Generation Scotland」が主なトレーニングコホートで、他のコホートには母親と子供、異なる民族背景の成人、高齢者などさまざまな集団が含まれているよ。

トレーニングコホート: Generation Scotland

「Generation Scotland」は、スコットランドの24,000人以上を対象にした大規模な研究なんだ。2006年から2011年の間に血液サンプルが集められ、参加者の健康やライフスタイルに関する詳細な情報も収集されたよ。合計で17,936人が分析に使えるデータを持っていたんだ。

他のテストコホート

他のコホートには次のようなものがあるよ:

  • Avon Longitudinal Study of Parents and Children: この研究では、UKの母親とその子供たちが長年にわたって追跡されているんだ。いろんなライフステージの子供たちのサンプルが含まれているよ。

  • Health for Life in Singapore: このコホートは、シンガポールに住む異なる民族背景の約10,000人の成人から構成されているんだ。

  • Southall and Brent REvisited: この研究は、UKに住む第一世代の南アジア系移民とヨーロッパ系の人々が対象なんだ。

  • Lothian Birth Cohorts: スコットランドの健康的な老化を研究する2つのコホートで、さまざまな年齢で繰り返し測定が行われているよ。

DNAメチル化とCRPレベルの分析

この研究では、DNAメチル化データとCRPレベルを分析するんだ。信頼性を確保するために2段階のアプローチを使っているよ。

  1. 線形回帰: 研究者たちは、さまざまなサイトでのDNAメチル化とCRPレベルの関係を分析するために統計モデルを適用するんだ。これによって、どのDNAメチル化パターンがCRPと有意に関連しているかを特定するんだ。

  2. ベイズ的ペナルティ回帰: この方法は、異なるDNAメチル化サイトのつながりを考慮して、これらのサイトがCRPレベルにどのように貢献しているかをより詳細に見ることができるんだ。

関連性の発見

分析が終わったら、研究者たちはDNAメチル化とさまざまな健康結果との関連を探すんだ。新しい予測因子が既知の健康リスクにどれだけ関連しているかを考慮するよ。

予測因子の比較

一番効果的な予測因子を決めるために、研究者たちは新しいDNAメチル化の予測因子と既存のものの性能を比較するんだ。それぞれの予測因子が異なるコホートでの実際のCRPレベルとどれだけ相関しているかを評価するよ。

健康結果の予測

研究者たちは、その最も性能の良いDNAメチル化の予測因子を使って、さまざまな健康結果との関連を調べるんだ。具体的には:

  • 心血管代謝の健康: 予測因子が心臓病、糖尿病、脳卒中のリスクにどれだけ関連するかを評価するよ。

  • 死亡リスク: さらに、この予測因子がどれだけ死因に関するリスクを示すかも調べるんだ。

結果と解釈

この研究は、DNAメチル化が慢性的な低度の炎症の役立つ指標になり得ることを示すことを目指しているよ。信頼できる予測因子があれば、研究者たちは慢性的な炎症に関連する健康問題のリスクがある人をより効果的に特定できるようになるんだ。

一般性

この研究の結果は、さまざまな集団において一般的に適用できるかどうかも評価されるよ。これが、異なるグループで予測因子が信頼性を持って使えるかどうかを判断するのに重要なんだ。

結論

慢性的な低度の炎症は特に年齢とともに重要な健康問題なんだ。これを正確に測定できれば、病気を予防して健康結果を改善する手助けになるよ。この研究は、炎症をより信頼性高く測定する方法としてDNAメチル化に焦点を当てているんだ。新しい予測因子を開発・検証することで、炎症とその健康への影響を理解するためのより良いツールを提供したいと思っているんだ。

この取り組みを通じて、科学者たちは慢性的な炎症に関する知識を深め、さまざまな集団でリスクをよりよく評価する手段を提供し、最終的には加齢に伴う病気の負担を減らすための公衆衛生イニシアティブを支援したいと考えているよ。

オリジナルソース

タイトル: Blood-based epigenome-wide analyses of chronic low-grade inflammation across diverse population cohorts

概要: Chronic inflammation is a hallmark of ageing and age-related disease states. The effectiveness of inflammatory proteins such as C-reactive protein (CRP) in assessing long-term inflammation is hindered by their phasic nature. DNA methylation (DNAm) signatures of CRP may act as more reliable markers of chronic inflammation. We show that inter-individual differences in DNAm capture 50% of the variance in circulating CRP (N=17,936, Generation Scotland). We develop a series of DNAm predictors of CRP using state-of-the-art algorithms. An elastic net regression-based predictor outperformed competing methods and explained 18% of phenotypic variance in the LBC1936 cohort, doubling that of existing DNAm predictors. DNAm predictors performed comparably in four additional test cohorts (ALSPAC, HELIOS, SABRE, LBC1921), including individuals of diverse genetic ancestry and from different age groups. The newly-described predictor surpassed assay-measured CRP and a genetic score in its associations with 26 health outcomes. Our findings forge new avenues for assessing chronic low-grade inflammation in diverse populations.

著者: Robert F. Hillary, H. K. Ng, D. L. McCartney, H. R. Elliott, R. M. Walker, A. Campbell, F. Huang, K. Direk, P. Welsh, N. Sattar, J. Corley, C. Hayward, A. M. McIntosh, C. Sudlow, K. L. Evans, S. R. Cox, J. C. Chambers, M. Loh, C. L. Relton, R. E. Marioni, P. D. Yousefi, M. Suderman

最終更新: 2023-11-03 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.11.02.23298000

ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.11.02.23298000.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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