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# 健康科学# 医療情報学

より良い患者ケアのための健康データ分析

研究では、複数の病状を持つ患者の健康結果予測を向上させるためにEHRを活用してるよ。

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目次

人々が年を取るにつれて、長期的な健康問題をうまく管理できるようになると、より多くの人が複数の長期的条件(MLTC)を抱えるようになるんだ。つまり、同時に2つ以上の健康問題を持っているってこと。これらの条件間のつながりを無視すると、健康に悪い影響が出る可能性がある。研究者たちは、これらの健康問題がどのように相互作用するかに焦点を当て始めているんだ。

これらの相互作用を研究するために、医者たちは主にプライマリケアからの電子健康記録(EHR)を使っている。この記録は、ある人の健康履歴を追跡し、時間と共に発生した病気を含んでいる。研究者たちは、こうした大量の健康データを分析するために、先進的なコンピュータ手法を使い始めている。自然言語処理NLP)の技術は、テキストを理解するためによく使われるが、EHRデータにも応用できるんだ。

EHRの重要性

EHRは、患者の病気についての詳細な情報を保存している。診断された病状の順序を文中の単語の順序と同じように扱うことで、研究者たちは健康履歴に基づいて患者を表すモデルを作ることができる。このモデルを使って、どの患者が新たに健康問題を抱えるかを予測できるんだ。

この分野の研究の主な目標は、さまざまな臨床結果にうまく対応できる単一の患者表現を作ることだ。たとえば、患者を病歴に基づいてうまくグループ化できれば、健康リスクを予測する複雑さを減らせるかもしれない。

でも、NLPを使ってこれらの患者表現を作成する方法の比較研究はあまり進んでいない。EHRデータを効果的に使うための最良の戦略についても不確実な部分がある。

研究概要

私たちの研究では、Latent Dirichlet Allocation(LDA)、doc2vec、2つのトランスフォーマーモデルアプローチなど、一般的に使われているNLP技術を使って患者表現を作成するさまざまな方法を比較した。また、人口統計情報を含む新しいモデルEHR-BERTも導入した。このモデルが、入院や新しい診断などのさまざまな健康結果を予測する際にどのように機能するかを調べた。

私たちは、一般開業医に登録されている600万人以上の患者の大きなデータセットで作業した。患者たちは2つ以上の長期的健康問題を抱えていた。この大きく多様なデータセットは、時間と共に健康データを分析する良い機会を提供した。

患者表現の作成方法

患者の病気の表現を作成する異なる方法を比較するために、いくつかのアプローチを評価した。たとえば、LDAを使う際には、データを表すのに最適なトピック数を決定した。doc2vecメソッドでは、特定のアルゴリズムが病歴に基づいて類似の患者を認識するのにより優れていることがわかった。

また、データのより複雑な関係をキャッチできるトランスフォーマーモデルの性能もテストした。トランスフォーマーモデルの最も関連性の高い部分からデータを平均することで、各患者の医療履歴の詳細な表現を作成できた。

詳細なパフォーマンス分析

私たちが作成した各モデルの性能をテストし、関連する健康結果を予測するのに使用した。特定の病気を持っているかどうかを見るシンプルな方法と比較した。

私たちの結果は、EHR-BERTモデルが結果を予測する際に最も優れていることを示した。一方、シンプルなバイナリ指標は特定の予測に対しては十分な結果を出したが、一般的にはより複雑な方法に比べて劣っていた。

様々な健康結果の予測

私たちの評価には、患者の死亡、救急外来の訪問、入院などのイベントの予測が含まれていた。EHR-BERTが生み出した埋め込みは、ほとんどの場合で他のモデルを上回った。これは、詳細な患者表現を使用する効果を示している。

しかし、救急外来の訪問を予測するのは特に難しいことがわかった。この難しさは、患者の行動に影響を与える外部要因、たとえば病院からの距離やケアへのアクセスのしやすさに起因しているかもしれない。

新しい診断の予測も全てのモデルで難しいことがわかった。私たちのモデルは、既存の病気に関連する患者がどのくらい通院するかを予測するのには良かったが、新しい病気を予測するのにはあまり効果的ではなかった。

研究の強み

私たちの研究の強みの一つは、幅広い患者を代表する大きなデータセットを使用したことだ。これにより、患者の病気パターンと健康結果との関係をより包括的に分析できた。病院データだけを使用する研究とは異なり、私たちのアプローチはプライマリケアデータを取り入れているので、患者の健康履歴の全体像を提供している。

さまざまな方法を並べて比較することで、それぞれのアプローチの強みと弱みを特定できた。この比較は、特定の臨床応用にどの方法が最適かを明確にするのに役立つ。

研究の限界

私たちの研究には強みがあった一方で、限界もあった。たとえば、モデルの最適な設定を選択する方法がパフォーマンスの変動を引き起こす可能性がある。いくつかのアルゴリズムの最良の構成を決定するために、既存の指標に依存せざるを得なかった。

また、全体の人口に対する平均的なパフォーマンスに焦点を当てることで、異なる患者グループに対するモデルの効果の違いが隠れることもある。今後の研究では、民族や社会経済的地位などの人口統計的要因がモデルのパフォーマンスに与える影響を調べることができるだろう。

実務への影響

私たちの研究の結果は、医療において現実的な影響を持つ。予測モデルに関しては、バイナリの病気指標のようなシンプルな方法でも満足のいく結果を得られることがある。しかし、より複雑な病気表現を利用する方法は、特に患者の健康履歴の順次情報を考慮する際に、より深い洞察を提供することができる。

トランスフォーマーアーキテクチャのようなより先進的なモデルを使うことで、健康結果の予測を大幅に改善できるかもしれない。さらに、より大きな語彙を使用することが同じレベルの予測精度を提供するのに対し、より小さな病気カテゴリーを使うことには大きな利点がないことを示唆している。

今後の方向性

私たちの研究はさらなる探求の道を開く。たとえば、アルゴリズムを強化して予測能力を向上させることが価値のある次のステップかもしれない。患者表現に行動健康情報などの他の要素を追加することで、患者の行動に対するより良い洞察が得られるかもしれない。

さらに、異なる医療環境や多様な患者集団でこれらのモデルがどのように機能するかを調べることで、より特化したソリューションが得られるかもしれない。

結論

より多くの人が複数の長期的条件を抱えて生きている中で、彼らの健康相互作用を理解することが重要になる。電子健康記録と先進的なNLP手法の使用は、患者ケアを向上させる大きな可能性を秘めている。これらのモデルを継続的に洗練し、その応用を探ることで、健康結果を予測する能力を高め、患者のニーズにより適切に応えることができる。

オリジナルソース

タイトル: Comparing natural language processing representations of disease sequences for prediction in the electronic healthcare record

概要: Natural language processing (NLP) is increasingly being applied to obtain unsupervised representations of electronic healthcare record (EHR) data, but their performance for the prediction of clinical endpoints remains unclear. Here we use primary care EHRs from 6,286,233 people with Multiple Long-Term Conditions in England to generate vector representations of sequences of disease development using two input strategies (212 disease categories versus 9,462 diagnostic codes) and different NLP algorithms (Latent Dirichlet Allocation, doc2vec and two transformer models designed for EHRs). We also develop a new transformer architecture, named EHR-BERT, which incorporates socio-demographic information. We then compare use of each of these representations to predict mortality, healthcare use and new disease diagnosis. We find that representations generated using disease categories perform similarly to those using diagnostic codes, suggesting models can equally manage smaller or larger vocabularies. Sequence-based algorithms perform consistently better than bag-of-words methods, with the highest performance for EHR-BERT.

著者: Thomas Beaney, S. Jha, A. Alaa, A. Smith, J. Clarke, T. Woodcock, A. Majeed, P. Aylin, M. Barahona

最終更新: 2023-11-17 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.11.16.23298640

ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.11.16.23298640.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた medrxiv に感謝します。

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