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精子の円形DNAに関する新たな洞察

研究によると、eccDNAが男性の生殖能力や健康において重要な役割を果たす可能性があることがわかった。

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精子のDNAと健康の関係精子のDNAと健康の関係連を示している。研究が精子中のeccDNAと慢性疾患の関
目次

最近の研究によると、外因性DNA(ecDNA)と呼ばれる特定のDNA鎖が、細胞内の通常の染色体構造の外に存在できることがわかったんだ。特にがん細胞で見つかることが多いんだけど、これらの鎖は自己環状化できる、つまり円形の形を作れるんだ。通常は大きなサイズで、ゲノムのいろんな部分から来ていることがあるんだって。一部の研究では、これらのecDNAが腫瘍の成長を助ける遺伝子を運んだり、薬剤耐性を助ける細胞のバリエーションを作ったり、さらには線状DNAに再統合されて、さらなる変異を引き起こすこともあるみたい。

面白いことに、円形DNAは健康な細胞にも見つかっていて、その場合は中がん細胞に見られるecDNAと区別するために外因性円形DNA(EccDNA)と呼ばれるんだ。でも、特に人間の生殖細胞におけるeccDNAについてはあんまり知られていないんだ。

eccDNAを研究するための新しい方法

eccDNAについてもっと知るために、研究者たちはPEAR-seqと呼ばれる新しい方法を開発したんだ。これを使うと、同じ細胞からeccDNAとRNAを同時に配列することができるんだ。彼らはこの方法を人間の精子サンプルを使って試したんだ。精子DNAは特定の精製技術を使ってRNAから分離された。その後、線状DNAを酵素で消化して円形DNAが孤立されたんだ。これが研究者たちに円形の形に焦点を当てさせる助けになったんだ。

サンプルを準備した後、彼らはeccDNAのサイズや分布を調べる特別な技術を使った。結果は、eccDNAが人間のゲノムのあらゆる場所から来ていて、サイズもいろいろだってことを示した。一部の典型的なパターンもDNAに見られたんだ。

精子のeccDNAの転写活性

研究者たちは、これらのeccDNAがRNAを生成できるかどうか、つまり転写と呼ばれるプロセスについて調べたんだ。彼らは、精子のeccDNAの約19%が少なくとも遺伝子の一部を含んでいて、ほぼ5%が全体の遺伝子を持っていることを発見したんだ。がん細胞ではecDNAががんの成長を助けるRNAを生成することがあるから、同じことが精子にも当てはまるかと考えたんだ。

彼らは、精子のeccDNAがユニークなRNA産物を生成するかどうかを調べるために二つのアプローチを考えたんだ。最初のアプローチでは、eccDNAでつながれた二つの異なる遺伝子領域からハイブリッド遺伝子を作成することにした。彼らは精子サンプルの中にこれらのハイブリッド遺伝子の転写例を見つけて、精子のeccDNAが確かにユニークなRNA産物を生成できることを確認したんだ。

二つ目のアプローチでは、二つの精子サンプルからのRNAを系統的に調べた。結果は、複数の転写イベントが示されて、いくつかの精子eccDNAが実際にRNAを生成できることを示唆したんだ。

精子のeccDNAの臨床的関連性

この研究では、精子のeccDNAの存在が健康状態に関連しているかどうかも見たんだ。彼らは、高血圧や糖尿病のような慢性疾患を持つ個人が、健康な個人に比べて精子中にもっとeccDNAを持っていることを発見したんだ。年齢がデータに影響を与えていないことを確認するために、30歳から55歳の男性のサンプルだけを比較したんだ。

よく見てみると、アポトーシスと呼ばれる細胞死の形態を経ている精子が、健康な精子よりも多くのeccDNAを持っていることがわかった。これは、アポトーシスのシグナルが増えることが、慢性疾患を持つ男性にeccDNAの増加をもたらす可能性があることを示唆しているんだ。

精子のeccDNA形成のメカニズム

慢性疾患がなぜ精子のeccDNAの増加につながるのかを理解するために、研究者たちはさまざまな要因を調べたんだ。彼らは、アポトーシスが糖尿病患者の精子の質に大きく影響していることを見つけた。精巣サンプルを調べると、糖尿病患者の精子でアポトーシスのシグナル経路がもっと活発であることがわかったんだ。

分析を通じて、DNA修復に関与する特定のタンパク質が糖尿病患者で変化していることを観察したんだ。この不均衡は、DNA損傷の増加がeccDNAの形成に寄与するかもしれないんだ。

精子におけるeccDNAの水平移動

研究者たちは、健康な精子がアポトーシスの過程以外でeccDNAを獲得する方法についても疑問を持ったんだ。最初に、健康な精子にも少しeccDNAが含まれていることを見つけたけど、アポトーシスを経た精子よりも少なかったんだ。

彼らは、精子生成に必要な細胞分裂の一種である減数分裂が、この獲得に寄与するメカニズムの一つかもしれないと考えたんだ。これをさらに探るために、減数前の精子細胞を孤立させて調べたところ、成熟した精子と同じくらいのeccDNAを持っていることがわかったんだ。

この発見は、健康な精子がこれらの円形DNAを取得する別の方法があるかもしれないことを示唆したんだ。具体的には、アポトーシスを経た精子がeccDNAを環境に放出し、健康な精子がそれを取り込む可能性があると仮定したんだ。それを確かめるために、共同培養実験を行ったんだ。生きた精子が蛍光ラベリングされた円形DNAを取り込むことができたけど、正常な温度の時だけだったから、エネルギー依存のプロセスであることを示唆しているんだ。

結論と今後の方向性

要するに、この研究は人間の精子におけるeccDNAの機能と形成についての理解を深めているんだ。これらのeccDNAがRNAを生成できる能力は、精子の発達やおそらく受精後の胚の発達に役立つ可能性があることを示しているんだ。さらに、精子eccDNAの増加と慢性健康問題との関連が、男性の生殖健康の指標として機能する可能性があるんだ。

今後の研究では、精子に存在するeccDNAが未来の世代に移る可能性について探求することができるかもしれない。精子の健康維持におけるeccDNAの役割や、それが不妊に及ぼす影響についてもさらに調査が必要なんだ。健康状態や遺伝的背景の幅広い範囲を含めた研究を拡大することで、人間の生殖におけるeccDNAの重要性についての理解が深まるだろう。

オリジナルソース

タイトル: Functional and Clinical Implications of Extrachromosomal Circular DNA in the Human Germline

概要: Extrachromosomal circular DNA (eccDNA) originates from linear chromosomal DNA and can be found in various human cell types including the male germline. However, the functional effects and biogenesis mechanisms of the eccDNA in the human male germline are not well understood. Here, we developed a sequencing approach to extract eccDNA sequence information and the paired transcriptome information from the same cells. By applying this approach to human samples, we found evidence of transcriptional activities of germline eccDNAs. We also showed that patients with chronic diseases such as hypertension and diabetes had a significantly higher number of eccDNAs in the sperm than their healthy counterparts. This was, at least partly, due to an increased apoptosis signaling in the germline. Analysis of single cell RNA sequencing data of spermatogenic cells from diabetic patients vs. healthy individuals suggested that a dysregulation in the expression levels of multiple poly (ADP-ribose) polymerases may contribute to the increased amount of germline eccDNAs in diseased patients. In addition, we identified a potential horizontal transfer mechanism through which healthy sperm can take up eccDNAs from their surrounding microenvironment. Together, our results suggest that eccDNA may have functional effects on the germline, and it may serve as a non-invasive clinical biomarker for human health.

著者: Haiqi Chen, M. Evans, S. Rajachandran, X. Zhang, Y. Zhang, K. Saner, L. Xu, K. E. Orwig, O. Bukulmez

最終更新: 2024-06-03 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.02.597028

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.02.597028.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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