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# 生物学# 癌生物学

肺腺癌における血管侵犯の評価

血管侵襲に関する新たな洞察が、肺癌治療の決定を改善する。

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肺癌における血管侵襲肺癌における血管侵襲果が改善されるかもしれない。血管浸潤を特定することで、肺腺癌の治療結
目次

肺腺癌(LUAD)は、肺癌の中で最も一般的なタイプで、手術治療を受けるケースの大部分を占めてるんだ。LUADを早く正確に見つけることがめっちゃ大事で、そうすることで患者が早めに治療を受けられるし、それが良い結果につながることが多いんだ。CT(コンピュータ断層撮影)っていう方法があって、これを使うとLUADを早期に見つけるのに役立つんだよね。特に大切なのが血管の微小侵入、つまり血管侵入(VI)で、これが癌の攻撃性を示す指標になるんだ。この侵入は、治療後の癌の再発リスクが高くなることと結びついていることが多いんだ。

現在、世界保健機関(WHO)は肺癌のグレーディングシステムにVIを含めてないんだけど、それが再発の予測には既存のグレードシステムよりもよっぽど良いかもしれないって言われてる。このことから、VIを含んだLUADの分類を特別なカテゴリーに変更するアイデアが出てきてるんだ。

I期のLUADでVIが見られる患者は、手術後に追加の治療を受けることがあるんだけど、組織サンプルでVIを特定するのが難しいんだ。侵入した血管を見やすくするための技術を使っても、小さい侵入部分は見逃されがちで、手術前に見つけるのが難しいんだ。この検出の不足は、医者が治療の決定をする際にVIの存在を利用できないことを意味してる。

最近の臨床研究では、I期のLUADを持つ一部の患者において、部分切除(サブロバー切除)というあまり広範囲でない手術が、広範囲の手術である肺葉切除と同じくらい効果的かもしれないってわかったんだ。でも、VIがある患者がこの部分切除を受けると再発率が高いみたいで、どの患者が特別な手術戦略の恩恵を受けるかを見極める必要があるってことを示唆してるんだ。

分子プロファイリングの方法は臨床病理で一般的になりつつあるけど、過去のLUADに関する研究は結果に関連するパターンの特定に重点を置いてきたんだ。病理医はしばしばVIをリンパ管侵入(LI)とまとめて扱うことが多くて、それがVIの独自の重要性を隠してしまって、理解が難しくなっちゃうんだ。新しい技術革新である空間トランスクリプトミクスは、遺伝子発現が腫瘍とその周囲の生物学的構成にどのように関連するかを詳しく見ることができるんだ。

I期のLUADを持つ多くの患者を調べることで、VIに関連する遺伝子発現パターンをマッピングして、これらのケースをより効果的に検出するための新しいツールを構築するのが目標なんだ。

LUADの血管侵入

私たちは、2つの病院で治療を受けたI期LUAD腫瘍のグループから情報を集めたんだ。新しいグレーディングシステムを使って、腫瘍の特徴に基づいて分類して、従来のグレーディングシステムと比較したんだ。結果、VIを示す腫瘍は悪い結果に関連していることがわかった。これにより、患者におけるVIの特定の重要性がさらに強調されたんだ。

研究した腫瘍の約30%にVIが見つかったよ。これらの腫瘍のほとんどは、複数の侵入タイプを示してた。分析で他の要素を考慮しても、VIは依然として癌再発の重要な指標だったんだ。特に、固形腫瘍で見られる成長タイプと関連してる一方、別の成長タイプ(微小乳頭性)は異なる拡がりのパターンに関連してたんだ。

遺伝子発現の変化とVI

VIがLUADの遺伝子発現にどう影響するかをもっと知るために、私たちは腫瘍のサブセットを分析したんだ。VIがある腫瘍と悪性潜在性の低いと分類された腫瘍で、異なる活動レベルを示す遺伝子のいろんな範囲を特定したよ。経路分析により、これらの遺伝子が細胞周期、組織の成長、低酸素状態への応答など、さまざまな生物学的プロセスに関与していることがわかったんだ。

VIに関連する遺伝子の大部分は、VI+腫瘍で活動が増加してた。逆に、これらの腫瘍では別のセットの遺伝子が活動が低下していて、通常腫瘍成長を制御するのに役立つプロセスが減少していることを示唆してるんだ。全体として、VIの存在に基づいて腫瘍がどれだけ攻撃的になるかを示す遺伝子セットを特定したんだ。

VIとLIはよく一緒に報告されるから、両方に関連する遺伝子発現パターンを比較したんだ。結果、VIからのシグナルはLIよりもずっと強くて明確で、異なる生物学的プロセスを代表していることが示されたんだ。

研究デザインと方法論

この研究では、腫瘍を慎重にレビューして詳細な遺伝子発現プロファイリングを行ったんだ。stRNA-seq技術を使って、個々の組織領域での遺伝子発現について高解像度データを集めたよ。これは、VIのある腫瘍とない腫瘍を見て、遺伝子パターンがどう違うか、腫瘍の物理的特徴にどう対応しているかを調べることを含んでるんだ。

分析には15の腫瘍が含まれていて、いくつかの特徴は病理を通じて文書化されたんだ。私たちはさまざまな遺伝子発現パターンが異なる腫瘍の特徴にどのように関連しているかをテストした結果、VIと特定の組織病理学的特徴との間に明確な関連があることがわかったんだ。

空間トランスクリプトミクスの発見

分析したサンプルでVIに関連する遺伝子の発現は、さまざまな腫瘍の特徴と関連していることがわかった。VIのある腫瘍では、いくつかのパターンがより一般的で、他のパターンは活動が減少してた。これは、特定の腫瘍成長タイプや全体の組織環境が血管侵入の存在と強く結びついていることを示してるんだ。

今、私たちは腫瘍の異なる領域内で遺伝子発現がどう変わるかについての洞察を得たよ。たとえば、腫瘍環境の細胞構成も遺伝子発現パターンに影響を与えることが分かったんだ。

VI予測因子の開発

遺伝子発現のパターンから、LUAD腫瘍のVIを特定するための予測因子を開発したんだ。この予測因子は、特定の遺伝子の活動を使ってVIのある腫瘍とない腫瘍を区別するんだ。テスト中にケースを区別するのに強力なパフォーマンスを示して、独立した腫瘍セットでも検証されたんだ。

このモデルは、他の腫瘍の特徴が含まれるサンプルでもVIの可能性を予測するのにうまく機能したよ。これにより、腫瘍の特定の成長パターンに関係なく、有用な情報を提供できる可能性があるんだ。

腫瘍内の異質性

私たちの研究からのもう一つの重要な発見は、この予測因子が腫瘍自体の固有の変動があっても堅牢であることだったんだ。これは、サンプルを腫瘍の小さな部分からだけ取っても、予測因子が信頼できる可能性があることを示唆してるんだ。

予測因子が実際の侵入部位から離れた腫瘍領域をどれだけうまく区別できるかを評価したよ。結果、距離から測定してもVIの兆候を特定できることが示されたんだ。これにより、小さなサンプルでも使える可能性があるんだ。

患者の結果への影響

この研究の結果は、LUADにおけるVIの理解がいかに重要かを強調してるよ。VIに関連する独特な遺伝子発現パターンを認識することで、腫瘍がどれだけ攻撃的になるかを予測する能力が向上して、治療の決定を改善できるんだ。

私たちが開発した予測因子は、臨床医にとって重要なツールになる可能性があって、追加治療の必要性を評価したり、手術の決定を導くのに役立つんだ。また、バイオプシーサンプルにも適用できるように変更できれば、より早く正確な介入が可能になるかもしれないんだ。

結論

要するに、私たちの研究は肺腺癌の進行や治療における血管侵入の重要な役割を明らかにしたんだ。腫瘍の行動についての洞察を提供する独特な遺伝子発現パターンを明らかにし、VI+ケースを特定するための信頼できる予測因子を確立したんだ。

この侵入タイプの分子的側面を進めることで、治療のターゲットをより良く絞り込んで、患者の結果を改善できる方向に進みたいと思ってるんだ。さらに検証が進めば、この発見が肺癌管理における臨床実践に影響を与える変化につながることを期待してるよ。

オリジナルソース

タイトル: Identification of a gene expression signature of vascular invasion and recurrence in stage I lung adenocarcinoma via bulk and spatial transcriptomics

概要: Microscopic vascular invasion (VI) is predictive of recurrence and benefit from lobectomy in stage I lung adenocarcinoma (LUAD) but is difficult to assess in resection specimens and cannot be accurately predicted prior to surgery. Thus, new biomarkers are needed to identify this aggressive subset of stage I LUAD tumors. To assess molecular and microenvironment features associated with angioinvasive LUAD we profiled 162 resected stage I tumors with and without VI by RNA-seq and explored spatial patterns of gene expression in a subset of 15 samples by high-resolution spatial transcriptomics (stRNA-seq). Despite the small size of invaded blood vessels, we identified a gene expression signature of VI from the bulk RNA-seq discovery cohort (n=103) and found that it was associated with VI foci, desmoplastic stroma, and high-grade patterns in our stRNA-seq data. We observed a stronger association with high-grade patterns from VI+ compared with VI- tumors. Using the discovery cohort, we developed a transcriptomic predictor of VI, that in an independent validation cohort (n=60) was associated with VI (AUROC=0.86; p=5.42x10-6) and predictive of recurrence-free survival (HR=1.98; p=0.024), even in VI- LUAD (HR=2.76; p=0.003). To determine our VI predictors robustness to intra-tumor heterogeneity we used RNA-seq data from multi-region sampling of stage I LUAD cases in TRACERx, where the predictor scores showed high correlation (R=0.87, p

著者: Marc E. Lenburg, D. Steiner, L. Sultan, T. Sullivan, H. Liu, S. Zhang, A. LeClerc, Y. O. Alekseyev, G. Liu, S. A. Mazzilli, J. Zhang, K. Rieger-Christ, E. J. Burks, J. Beane

最終更新: 2024-06-10 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.07.597993

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.07.597993.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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