レア病に対するアンチセンスオリゴヌクレオチド療法の進展
新しいガイドラインと治療法が希少疾患の患者に希望を与えている。
Marlen Lauffer, D. Cheerie, M. Meserve, D. Beijer, C. Kaiwar, L. Newton, A. L. T. Tavares, A. S. Verran, E. Sherrill, S. Leonard, S. J. Sanders, E. Blake, N. Elkhateeb, A. Gandhi, N. S. Y. Liang, J. T. Morgan, A. Verwillow, J. Verheijen, A. Giles, S. Williams, M. Chopra, L. Croft, H. S. Dafsari, A. E. Davidson, J. Friedman, A. Gregor, B. Haque, R. Lechner, K.-A. Montgomery, M. Ryten, E. Schober, G. Siegel, P. Sullivan, B. Zardetto, T. W. Yu, M. Synofzik, A. Aartsma-Rus, G. Costain, N=1 Collaborative
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目次
今日、約7,000の希少疾患が知られてるけど、そのうち治療法が病気の進行を変えられるのは約5%だけなんだ。希少疾患ってのは、アメリカでは20万人未満、ヨーロッパとカナダでは2,000人に1人未満に影響を与える疾患のこと。世界の約6%の人口が希少疾患で苦しんでると推定されてる。これらの疾患のほとんどは遺伝的だと考えられてて、家族を通じて遺伝子の変化から発生するんだ。遺伝子検査の進展のおかげで、約50%の希少疾患の原因遺伝子を特定できるようになったけど、特定の遺伝的診断を持つ人が増えるにつれて、そういった特定の状態にターゲットを絞った治療法の開発がますます必要になってきてるんだ。多くの希少疾患はごく少数の人にしか影響を与えないから、従来の薬の開発プロセスは実用的でないことが多い。そのため、より個別化された治療法が必要とされてるんだ。
アンチセンスオリゴヌクレオチド:新しい治療選択肢
新しい治療法の開発でワクワクする選択肢が、アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)っていうやつ。これまでに、世界中の規制機関で20以上のASO治療法がさまざまな用途で承認されてるんだ。これらの治療法は何千人もの患者に使われて、効果があることが証明されてる。ASOは皮下注射や静脈注射など、いろんな方法で投与できるし、脳や目など特定の臓器にターゲットを絞ることもできるから、少量でも効果があるんだ。ASOは体内に長く残らないから、患者は数ヶ月ごとに治療を受ける必要があるけど、これにより治療計画を個別化して、各患者を助けることができるんだ。
2018年以降、さまざまなグループが患者の特定の遺伝子変化をターゲットにしたASO治療を開発してきた。この進展は希少疾患コミュニティに、より個別化された治療法が近く利用できるかもしれないという希望をもたらした。すでに10人以上が個別化されたASO治療を受けていて、さらに多くの治療法が開発中なんだ。
ASOの働き
ASOは使い方がいろいろあって、いくつかのことをするように設計できるんだ:
- 特定の遺伝子変異が生産する有害なタンパク質のレベルを下げる。
- タンパク質の生産が disruptedされた場合に修正する。
- 遺伝子の読み方の間違いを正す。
- 遺伝子のコピーが一つだけ正常に働くときに、機能的なタンパク質の量を増やす。
でも、すべての遺伝子変化がASOで治療できるわけじゃないし、治療できるものでもASOの候補としての良さはそれぞれ違うんだ。だから、どの症例がASO治療で最も利益を得られるかを慎重に評価することが重要なんだ。
N=1コラボラティブ
N=1コラボラティブ(N1C)は、超希少疾患の治療法開発プロセスを標準化することを目的としたグローバルプロジェクトだ。このプロジェクト内のグループの一つは、3つの主要な分野に焦点を当ててる:
- ASOでターゲットにできる遺伝子変化を見つけること。
- 遺伝子治療の候補となる疾患を特定すること。
- 個別化された治療に適した患者を選ぶこと。
このグループは、医者や研究者、患者団体が治療法について良い決定を下せるように必要な情報を理解する手助けをしたいんだ。彼らはASO治療に適した遺伝子変化を評価するためのガイドラインを開発した。このガイドラインは既存のフレームワークに基づいていて、単一遺伝子疾患を引き起こすさまざまな遺伝子問題も含むように拡張されたんだ。
ガイドラインの開発プロセス
これらのガイドラインを作成するには、いろんな場所からのチームワークと、研究者や医療提供者の意見が必要だった。プロジェクトは異なるサイトでいくつかの遺伝子変異を評価することから始まった。それぞれのサイトが30の選ばれた変異を独立に評価して、その結果をもとにガイドラインのドラフトが作成されたんだ。
最初のドラフトは特定の遺伝子変化とASO治療の種類にだけ焦点を当ててた。フィードバックを集めた後、そのドラフトは改訂され、より大きな外部評価者グループと共有された。彼らのフィードバックによってガイドラインがさらに改善されて、最終版が確定したんだ。
最新のバージョンでは、ガイドラインがさらに多くの遺伝子問題とASO治療のアプローチをカバーするように拡大された。この最終版は、リリース前に追加のフィードバックを求めるために、関係者全員と共有されたんだ。
評価者へのトレーニングとサポート
評価者がガイドラインをナビゲートできるように、例の評価や教育用の動画を含むトレーニング資料が作成された。この動画は遺伝子変異を評価する方法を示していて、評価に役立つ重要なリソースなんだ。動画は、興味のある人がオンラインでアクセスできるようになってる。
加えて、N1Cバリアント適格性計算機っていうインタラクティブツールが作られた。このツールは、重要な質問に答えながらガイドラインを一歩一歩進めていく助けをするんだ。遺伝子変化の種類を考慮して、ユーザーをガイドラインの正しいセクションに導いてくれるんだ。
ガイドラインの目的
これらのガイドラインの主な目標は、ASO治療から最も利益を得られそうな遺伝子変化を特定する助けをすることなんだ。病気を引き起こす変異とASO治療への適性を評価するためのフレームワークを提供して、評価者がどの変異が適格かを特定できるようにするのが目的なんだ。
評価者は、変異が次のようなことに適しているかどうかを判断できる:
- ASOを介したスプライシングエラーの修正。
- ASOを介した問題のあるエクソンのスキップ。
- ASOまたは小さな干渉RNA(siRNA)を使った有害な転写物のノックダウン。
評価の最後には、変異をこれらのASOアプローチの適性に基づいてカテゴリーに分類できるんだ。
分類の理解
ガイドラインでは、変異を分類するための5つのカテゴリーを提案してる:
- 適格:この変異にASOアプローチが効果があることが明確に示されている。
- おそらく適格:この変異はターゲットにできる可能性があるけど、直接的な証拠はまだない。
- おそらく非適格:ASOが効果的である可能性が低いという証拠があるけど、完全には排除できない。
- 非適格:この変異にASOアプローチが効果的でないことが明確。
- 評価不能:評価するための十分な情報がない。
これらの分類は、評価者が特定のASO戦略に対する変異の適性を分類するのに役立つんだ。
前進するために
ガイドラインは、ASO治療に対する遺伝子変化の適格性を評価する上で重要なステップを表してるけど、その開発は続いていて、新しい情報が入るたびに定期的に更新される予定なんだ。これらのガイドラインが医療従事者がどの患者がこれらの治療法から利益を得られるかをより理解する手助けになることを期待してる。
さらに、適切な変異を特定することが重要だけど、治療の決定には患者の全体的な状態や特定のニーズなど、他の要因も考慮されるんだ。この評価が臨床実践の一部となって、希少疾患に苦しむ人たちに貴重な洞察を提供できるようになることが望まれてる。
明確なガイドライン、トレーニング資料、評価ツールを提供することで、希少疾患コミュニティを支援して、将来の治療選択肢の希望をもたらすことを目指してるんだ。
タイトル: Consensus guidelines for eligibility assessment of pathogenic variants to antisense oligonucleotide treatments
概要: Of the around 7,000 known rare diseases worldwide, disease-modifying treatments are available for fewer than 5%, leaving millions of individuals without specialized therapeutic strategies. In recent years, antisense oligonucleotides (ASOs) have shown promise as individualized genetic interventions for rare genetic diseases. However, there is currently no consensus on which disease-causing DNA variants are suitable candidates for this type of genetic therapy. The Patient Identification Working Group of the N=1 Collaborative (N1C), alongside an international group of volunteer assessors, has developed and piloted consensus guidelines for assessing the eligibility of pathogenic variants towards ASO treatments. We herein present the N1C VARIANT (Variant Assessments towards Eligibility for Antisense Oligonucleotide Treatment) guidelines, including the guiding scientific principles and our approach to consensus building. Pathogenic, disease-causing variants can be assessed for the three currently best-established ASO treatment approaches: splice correction, exon skipping, and downregulation of RNA transcripts. A genetic variant is classified as either "eligible", "likely eligible", "unlikely eligible", or "not eligible" in relation to the different approaches, or "unable to assess". We also review key considerations for assessment for upregulation of transcripts from the wildtype allele, an emerging ASO therapeutic strategy. We provide additional tools and training material to enable clinicians and researchers to use these guidelines for their eligibility assessments. With this initial edition of our N1C VARIANT guidelines, we provide the rare genetic disease community with guidance on how to identify suitable candidates for variant-specific ASO-based therapies and the possibility of integrating such assessments into routine clinical practice.
著者: Marlen Lauffer, D. Cheerie, M. Meserve, D. Beijer, C. Kaiwar, L. Newton, A. L. T. Tavares, A. S. Verran, E. Sherrill, S. Leonard, S. J. Sanders, E. Blake, N. Elkhateeb, A. Gandhi, N. S. Y. Liang, J. T. Morgan, A. Verwillow, J. Verheijen, A. Giles, S. Williams, M. Chopra, L. Croft, H. S. Dafsari, A. E. Davidson, J. Friedman, A. Gregor, B. Haque, R. Lechner, K.-A. Montgomery, M. Ryten, E. Schober, G. Siegel, P. Sullivan, B. Zardetto, T. W. Yu, M. Synofzik, A. Aartsma-Rus, G. Costain, N=1 Collaborative
最終更新: 2024-09-28 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.09.27.24314122
ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.09.27.24314122.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた medrxiv に感謝します。
参照リンク
- https://www.n1collaborative.org/
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/
- https://www.youtube.com/playlist?list=PL1FIwS0tbJHj0-aDMmZ5fUy5d40eiwa8B
- https://www.n1collaborative.org/post/n1c-variant-guidelines
- https://eligibilitycalculator.n1collaborative.org/
- https://github.com/N1Collaborative/Variant-Eligibility-Calculator
- https://rnainformatics.org.cn/RiboUORF/
- https://gnomad.broadinstitute.org/downloads
- https://search.clinicalgenome.org/kb/downloads
- https://mutalyzer.nl/
- https://n1collaborative.github.io/Variant-Eligibility-Calculator/