Migliorare i modelli di patologia tramite il trasferimento di conoscenze
Migliorare la classificazione WSI trasferendo conoscenze da dataset più grandi.
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Trasferire conoscenza da un'area all'altra può migliorare notevolmente il funzionamento dei modelli in situazioni nuove. In settori come la medicina, dove raccogliere dati a sufficienza può essere difficile, questo metodo può essere particolarmente utile. Ad esempio, le immagini a tutta diapositiva (WSI), che sono grandi immagini utilizzate in patologia, possono a volte scarseggiare. A causa di questo, diventa difficile ottenere una comprensione sufficiente per fare previsioni accurate.
Quando abbiamo dati da una fonte simile a quelli di destinazione, possiamo usare metodi per trasferire quella conoscenza, facendo lavorare meglio i modelli anche quando i dati di destinazione sono limitati. Questo è particolarmente importante nella classificazione delle WSI, dove il numero di immagini potrebbe non essere sufficiente per addestrare un modello in modo efficace da solo.
La sfida arriva dalle differenze tra i domini di origine e di destinazione. In molti casi, i compiti coinvolti possono essere molto diversi. Ad esempio, quando si guarda ai dati sul cancro, diversi set di dati potrebbero concentrarsi su aree come la sottotipizzazione dei tumori o la previsione dei tassi di sopravvivenza. Queste differenze possono creare problemi e rendere difficile applicare ciò che è stato appreso in un'area a un'altra.
Per affrontare questi problemi, è stato proposto un nuovo approccio chiamato Multi-Head Feature Adaptation (MHFA). Questo metodo ci consente di collegare meglio le caratteristiche dell'immagine di origine a quelle nello spazio dell'immagine di destinazione. Facendo ciò, la conoscenza può essere trasferita in modo più efficace. L'MHFA cerca nuovi modelli e combinazioni più allineate a ciò che è necessario nello spazio di destinazione.
Oltre all'adattamento delle caratteristiche, c'è anche un concetto chiamato Distillazione della Conoscenza. Questo avviene quando prendiamo un grande modello che è stato ben addestrato e lo usiamo per aiutare un modello più piccolo a imparare. Questo può essere utile, soprattutto per gli utenti con potenza di calcolo limitata. L'obiettivo qui è assicurarsi che il modello più piccolo possa funzionare bene anche se non è così complesso.
Importanza del trasferimento della conoscenza nella classificazione delle WSI
Le WSI sono strumenti essenziali nell'imaging medico, specialmente per la diagnosi del cancro. Tuttavia, creare un set di dati sufficientemente grande per addestrare modelli può essere un problema. Ad esempio, i patologi impiegano molto tempo ad annotare queste immagini, rendendo costoso e impraticabile raccoglierne grandi quantità. Per questo motivo, molti modelli faticano a funzionare bene quando addestrati su dati limitati.
Il trasferimento dell'apprendimento viene in soccorso permettendo ai modelli di utilizzare la conoscenza appresa in precedenza da un set di dati di origine. In questo modo, anche se il nuovo set di dati è limitato, il modello può comunque funzionare bene. Un metodo comune è il fine-tuning. Questo significa partire da un modello pre-addestrato e aggiornarlo con i nuovi dati. Inoltre, si può applicare il trasferimento delle caratteristiche, che si concentra sul trasferimento degli aspetti utili dei dati in uno spazio nuovo più allineato ai dati di destinazione.
Nonostante le promesse del trasferimento dell'apprendimento, si trova ad affrontare una serie di sfide. I compiti coinvolti nei set di dati di origine e di destinazione potrebbero non essere gli stessi. Ad esempio, un set di dati potrebbe concentrarsi sull'identificazione di tipi specifici di cancro mentre un altro potrebbe riguardare la rilevazione della diffusione del tumore. Inoltre, le immagini reali potrebbero differire nell'aspetto a causa di vari fattori, come la preparazione dei campioni.
Il modulo di Multi-Head Feature Adaptation
Per affrontare queste problematiche, è stato proposto il modulo Multi-Head Feature Adaptation (MHFA). L'idea principale è proiettare le caratteristiche dal modello insegnante (quello addestrato sul set di dati di origine) a un nuovo spazio di caratteristiche. Questo nuovo spazio ha meno differenze rispetto al set di dati di destinazione, il che consente un apprendimento migliore.
Il modulo MHFA utilizza un processo chiamato attenzione multi-testa per analizzare le caratteristiche. In questo approccio, più set di meccanismi di attenzione guardano i dati da diverse prospettive, il che aiuta a comprenderli meglio. Con i meccanismi di attenzione, il modello può determinare quali parti dei dati sono più importanti per fare previsioni.
In sintesi, il modulo MHFA è composto da diversi passaggi. Prima normalizza l'input per renderlo più consistente. Poi applica tecniche di attenzione per identificare schemi che sono più vicini a ciò di cui ha bisogno il modello di destinazione. Infine, un meccanismo di attenzione gated assegna punteggi di importanza alle diverse caratteristiche, assicurandosi che gli aspetti più rilevanti siano enfatizzati durante l'addestramento.
Configurazione sperimentale
Studi hanno dimostrato che l'uso del modulo MHFA migliora significativamente le prestazioni dei modelli nella classificazione delle WSI. Sono stati testati vari set di dati, inclusi quelli che si concentrano su tipi specifici di cancro come i tumori renali e polmonari.
I risultati hanno dimostrato che i modelli che utilizzano il trasferimento della conoscenza hanno costantemente superato quelli addestrati da zero. Questo è vero anche quando i set di dati avevano un numero limitato di campioni. I ricercatori hanno condotto ampi test per convalidare l'efficacia del modulo MHFA nel migliorare le prestazioni di classificazione.
Hanno esaminato metriche di prestazione come l'area sotto la curva (AUC), il punteggio F1 e l'accuratezza. I risultati hanno evidenziato che i modelli che hanno utilizzato metodi di trasferimento della conoscenza hanno fatto meglio nel complesso, dimostrando l'importanza di tali strategie per massimizzare l'efficacia del modello.
Applicazioni in contesti a basse risorse
Una delle applicazioni chiave del trasferimento della conoscenza è in situazioni in cui i dati sono limitati. In questi casi, trasferire conoscenza da un set di dati più grande a uno più piccolo può portare a migliori prestazioni del modello. Gli esperimenti hanno mostrato che il metodo proposto ha raggiunto risultati migliori anche in scenari a basse risorse rispetto ai metodi tradizionali.
I risultati hanno mostrato che man mano che la dimensione del set di dati di addestramento aumentava, le prestazioni dei modelli miglioravano. Tuttavia, i modelli che utilizzavano il modulo MHFA avevano sempre un vantaggio competitivo. Questo è cruciale poiché sottolinea quanto sia efficace il trasferimento della conoscenza nelle applicazioni pratiche, specialmente nel campo medico dove la raccolta di dati può essere davvero un ostacolo.
Confronto con altri metodi
Confrontando diversi metodi di trasferimento della conoscenza, il metodo MHFA proposto ha costantemente mostrato prestazioni superiori. Ha superato altri approcci come il fine-tuning, il trasferimento dell'attenzione e il trasferimento dei logit quando testato su vari set di dati.
Inoltre, i risultati hanno indicato che i metodi derivati dall'attenzione hanno talvolta affrontato sfide a causa di diverse distribuzioni dei dati. Pertanto, la capacità dell'MHFA di adattare le caratteristiche dal modello insegnante e proiettarle in uno spazio di caratteristiche più adatto lo ha reso un metodo più efficace per trasferire conoscenza.
Conclusione
Il trasferimento della conoscenza gioca un ruolo fondamentale nel migliorare le prestazioni del modello, in particolare quando la disponibilità di dati è limitata. Il modulo di Multi-Head Feature Adaptation offre una soluzione pratica per colmare il divario tra diversi compiti e domini.
Trasferendo in modo efficiente la conoscenza da un dominio di origine a un dominio di destinazione, il modulo MHFA aiuta a migliorare significativamente i risultati di classificazione. Questo lavoro getta le basi per sviluppi futuri nella classificazione delle immagini mediche, assicurando che i modelli possano apprendere in modo efficace anche in condizioni di dati non ideali. Complessivamente, questa ricerca illustra il potenziale delle tecniche di trasferimento della conoscenza nel migliorare le applicazioni di machine learning in vari campi.
Titolo: TAKT: Target-Aware Knowledge Transfer for Whole Slide Image Classification
Estratto: Transferring knowledge from a source domain to a target domain can be crucial for whole slide image classification, since the number of samples in a dataset is often limited due to high annotation costs. However, domain shift and task discrepancy between datasets can hinder effective knowledge transfer. In this paper, we propose a Target-Aware Knowledge Transfer framework, employing a teacher-student paradigm. Our framework enables the teacher model to learn common knowledge from the source and target domains by actively incorporating unlabelled target images into the training of the teacher model. The teacher bag features are subsequently adapted to supervise the training of the student model on the target domain. Despite incorporating the target features during training, the teacher model tends to overlook them under the inherent domain shift and task discrepancy. To alleviate this, we introduce a target-aware feature alignment module to establish a transferable latent relationship between the source and target features by solving the optimal transport problem. Experimental results show that models employing knowledge transfer outperform those trained from scratch, and our method achieves state-of-the-art performance among other knowledge transfer methods on various datasets, including TCGA-RCC, TCGA-NSCLC, and Camelyon16.
Autori: Conghao Xiong, Yi Lin, Hao Chen, Hao Zheng, Dong Wei, Yefeng Zheng, Joseph J. Y. Sung, Irwin King
Ultimo aggiornamento: 2024-07-11 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://arxiv.org/abs/2303.05780
Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2303.05780
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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