Prevedere la diffusione dei linfonodi nelle pazienti con cancro uterino
Utilizzare le reti bayesiane per valutare il coinvolgimento dei linfonodi nel cancro uterino.
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Indice
Valutare il rischio di diffusione nei linfonodi nei pazienti con cancro uterino prima dell'intervento è complicato. Questo è in parte dovuto al fatto che i dati disponibili possono essere disordinati, con informazioni mancanti, campioni piccoli e troppe variabili da seguire. Questo rende difficile creare modelli di machine learning affidabili su cui i medici possano contare. Invece, possiamo usare un modello di rete bayesiana causale che ci aiuta a evitare alcuni di questi problemi e a utilizzare le conoscenze che i medici già hanno sul cancro uterino.
Il processo implica un nuovo modo di scoprire relazioni, utilizzando metodi basati su campionamenti ripetuti. Consideriamo anche come i pregiudizi derivanti dalla scelta di specifici gruppi di pazienti possano influenzare ciò che troviamo. In molte situazioni reali, i dati mancanti possono essere un grosso problema e possono portare a conclusioni errate.
Intelligenza Artificiale in Medicina
L'intelligenza artificiale (AI) ha molti usi in medicina, specialmente nella ricerca sul cancro. Viene spesso utilizzata per prevedere diagnosi, possibilità di sopravvivenza e opzioni di trattamento. Il machine learning (ML), una parte dell'AI, ha mostrato buoni risultati, specialmente nell'analisi delle immagini. Tuttavia, questi modelli di ML possono essere difficili da spiegare. I medici potrebbero non fidarsi di modelli che non mostrano chiaramente come vengono prese le decisioni. Recenti sforzi sono stati fatti per migliorare la comprensione dell'AI, ma molti modelli mancano ancora di trasparenza.
I modelli grafici probabilistici (PGMs) mostrano esplicitamente come diverse variabili siano collegate. Un tipo di PGM, le Reti Bayesiane (BNs), può essere utile come strumenti di supporto decisionale. Le BNs possono aiutare a evitare problemi riscontrati nelle previsioni tipiche fatte da altri modelli di ML, rendendole più adatte per applicazioni cliniche.
Diffusione nei Linfonodi nei Pazienti con Cancro Uterino
Questo articolo si concentra sulla creazione di un modello di rete bayesiana per prevedere la diffusione nei linfonodi nel cancro uterino. Il cancro uterino si verifica nella mucosa dell'utero e colpisce molte donne in tutto il mondo. La maggior parte delle donne viene diagnosticata precocemente e ha buone possibilità di sopravvivenza, ma circa 90.000 muoiono ogni anno a causa di questo cancro.
Il trattamento spesso inizia con un intervento chirurgico per rimuovere l'utero e, in alcuni casi, le ovaie. La scelta dei trattamenti dati prima o dopo l'intervento dipende spesso da quanto è probabile che il cancro si diffonda. Scoprire se ci sia coinvolgimento dei linfonodi è cruciale per pianificare ulteriori trattamenti e migliorare i risultati per i pazienti.
Attualmente, non c'è accordo su quale sia il modo migliore per capire quali pazienti trarrebbero beneficio dall'intervento per rimuovere i linfonodi circostanti. Infatti, nei casi in fase iniziale, è stato riscontrato che rimuovere i linfonodi ha avuto poco effetto sui risultati, e può portare a problemi di salute a lungo termine. L'accuratezza diagnostica per la diffusione nei linfonodi è anche limitata; circa la metà dei casi viene trovata in pazienti che si pensano a basso o medio rischio.
Questo lavoro si basa su modelli di rete bayesiana esistenti, concentrandosi su due miglioramenti principali:
- Aggiungere informazioni ospedaliere per identificare meglio i pregiudizi nella selezione dei pazienti.
- Affrontare i pregiudizi creati dai dati mancanti, che possono portare ad associazioni fuorvianti.
L'obiettivo è creare un modello causale che combini le conoscenze degli esperti con i dati osservazionali per identificare i pazienti con cancro uterino a basso o medio rischio di diffusione nei linfonodi. Questo mira ad aiutare i medici a prendere decisioni informate.
Lavori Correlati
I trattamenti personalizzati mirano a ridurre gli effetti collaterali non necessari dalle terapie, garantendo una gestione appropriata in base ai livelli di rischio. Nel contesto del cancro uterino, prevedere il rischio di coinvolgimento dei linfonodi prima dell'intervento non è stato esplorato a fondo nella letteratura. Uno studio ha esaminato i modelli bayesiani e ha trovato che solo un modello ha funzionato bene.
Altri studi hanno evidenziato alcuni biomarcatori come potenziali predittori degli esiti, insieme a caratteristiche del paziente come condizioni di salute preesistenti e caratteristiche del tumore. Più recentemente, è stato sviluppato un modello chiamato ENDORISK, che utilizza marker clinici, istopatologici e molecolari valutati prima dell'intervento. Questo modello ha funzionato bene e ha aiutato nelle discussioni con i pazienti prima delle decisioni chirurgiche.
Reti Bayesiane Causali
Per capire come funzionano le reti bayesiane, possiamo guardare alcune definizioni chiave. Un grafo consiste in nodi e archi che esprimono relazioni. Ci concentriamo su grafi diretti, dove un nodo è connesso a un altro, mostrando una relazione genitore-figlio.
Un grafo causale delinea le relazioni di causa-effetto in un sistema. Le variabili in questo grafo aiutano a spiegare il comportamento del sistema. A differenza delle reti bayesiane standard, le reti causali mostrano esplicitamente questi collegamenti di causa-effetto, rendendoli più chiari per l'interpretazione.
Quando il grafo causale non è già noto, può essere ricostruito da un mix di conoscenze pregresse e metodi basati sui dati. Questo processo si chiama Scoperta Causale. Un algoritmo di scoperta causale utilizza sia i dati che le conoscenze esistenti per costruire un modello causale accurato.
Gli algoritmi di scoperta causale sono tipicamente divisi in due tipi: basati su vincoli e basati su punteggi. Anche se gli algoritmi tradizionali potrebbero non gestire bene i dati mancanti, combinarli con metodi di imputazione può creare un dataset completo per l'analisi.
Un approccio comune è il metodo Greedy Search, dove l'algoritmo esamina grafi possibili e seleziona il migliore in base a un sistema di punteggio. Questo spazio di ricerca può essere modificato includendo conoscenze pregresse, permettendo un processo di scoperta più diretto ed efficace.
Risultati Sperimentali
Le tecniche di scoperta causale possono offrire risultati affidabili quando ci sono abbastanza campioni di dati. Tuttavia, nelle situazioni reali, specialmente in sanità, le dimensioni del campione tendono a essere piccole, portando a rumore nei dati che può alterare i risultati. Pertanto, è fondamentale valutare la fiducia nelle relazioni mostrate nella rete causale.
Per valutare la forza delle relazioni, possiamo usare una tecnica nota come bootstrapping, in cui un dataset viene campionato ripetutamente per vedere quanto siano coerenti le relazioni. Questo aiuta a identificare l'affidabilità delle connessioni trovate nei dati.
I modelli sviluppati sono stati testati su un coorte di pazienti con cancro uterino. I dati sono stati suddivisi in set di addestramento e di test. Ogni modello è stato valutato prevedendo il coinvolgimento dei linfonodi nel set di test. I risultati sono stati analizzati utilizzando metriche come sensibilità, specificità e l'area sotto la curva (AUC).
I dati mostrano che i modelli hanno raggiunto punteggi AUC elevati, indicando forti capacità predittive.
Forza delle Relazioni
Gli archi nelle reti bayesiane mostrano le connessioni tra le variabili. La forza di queste connessioni aiuta a interpretare il modello complessivo. I grafi risultanti dopo l'analisi possono illustrare come diversi fattori siano collegati alla diffusione nei linfonodi.
L'inclusione di dati ospedalieri nei modelli consente di identificare come diverse istituzioni possano influenzare i risultati, possibilmente a causa di fattori non osservabili. Mentre alcune relazioni si allineano con la conoscenza degli esperti, altre rivelano connessioni inaspettate, suggerendo che siano necessarie ulteriori indagini.
Conclusioni e Lavoro Futuro
I metodi di scoperta causale sono stati utili per scoprire e affrontare associazioni inaccurate nei dati osservazionali. Questo approccio migliora il modo in cui valutiamo il rischio di coinvolgimento dei linfonodi nei pazienti con cancro uterino.
I risultati mostrano che integrare la conoscenza degli esperti può migliorare i modelli predittivi, raggiungendo una maggiore accuratezza rispetto ai lavori passati.
Procedendo, rimangono alcune sfide.
- L'impatto dei dati mancanti deve essere considerato, specialmente dove ci sono pregiudizi coinvolti.
- L'influenza causale di vari trattamenti sulla diffusione nei linfonodi necessita di esame.
- Comprendere come i pregiudizi derivanti dai dati ospedalieri influenzino i risultati è fondamentale.
Affrontando queste questioni, possiamo migliorare il processo decisionale nel trattamento dei pazienti con cancro uterino e, in ultima analisi, migliorare la cura dei pazienti.
Titolo: Risk Assessment of Lymph Node Metastases in Endometrial Cancer Patients: A Causal Approach
Estratto: Assessing the pre-operative risk of lymph node metastases in endometrial cancer patients is a complex and challenging task. In principle, machine learning and deep learning models are flexible and expressive enough to capture the dynamics of clinical risk assessment. However, in this setting we are limited to observational data with quality issues, missing values, small sample size and high dimensionality: we cannot reliably learn such models from limited observational data with these sources of bias. Instead, we choose to learn a causal Bayesian network to mitigate the issues above and to leverage the prior knowledge on endometrial cancer available from clinicians and physicians. We introduce a causal discovery algorithm for causal Bayesian networks based on bootstrap resampling, as opposed to the single imputation used in related works. Moreover, we include a context variable to evaluate whether selection bias results in learning spurious associations. Finally, we discuss the strengths and limitations of our findings in light of the presence of missing data that may be missing-not-at-random, which is common in real-world clinical settings.
Autori: Alessio Zanga, Alice Bernasconi, Peter J. F. Lucas, Hanny Pijnenborg, Casper Reijnen, Marco Scutari, Fabio Stella
Ultimo aggiornamento: 2023-05-17 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://arxiv.org/abs/2305.10041
Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2305.10041
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.
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