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Modello di Self-Attention Consapevole della Distanza nell'Imaging Medicale

Un nuovo modello migliora l'analisi delle immagini concentrandosi sulle relazioni spaziali tra i pezzi.

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In tante situazioni, specialmente nel campo medico, non abbiamo un'etichetta per ogni singolo pezzo di informazione. Invece, abbiamo etichette per gruppi di dati, conosciuti come bag. Questo può essere complicato quando cerchiamo di insegnare ai computer a riconoscere schemi o fare previsioni, soprattutto con le immagini. Un'area chiave su cui concentrarsi è come possiamo imparare riguardo a questi gruppi in un modo che ci permetta comunque di capire i singoli pezzi.

Apprendimento a più istanze (MIL)

L'apprendimento a più istanze è una tecnica dove ci occupiamo di bag invece di singoli oggetti. L'idea di base è semplice: se un bag è etichettato come positivo, significa che almeno un oggetto in quel bag soddisfa una certa condizione, mentre per un bag negativo, nessuno degli oggetti soddisfa quella condizione. Questo approccio è utile in molte aree, inclusa la classificazione delle immagini, dove potremmo guardare a una collezione di patch di immagini che insieme formano un'immagine più grande.

Nell'imaging medico, ad esempio, abbiamo spesso immagini ad alta risoluzione di tessuti. Queste immagini sono troppo grandi per essere analizzate tutte in una volta, quindi le suddividiamo in parti più piccole o patch. Tuttavia, le etichette che usiamo si applicano all'intera immagine piuttosto che a ciascuna patch separatamente.

Sfide nell’Imaging Medico

Una sfida nell'uso di MIL nell'imaging medico è che le relazioni tra le patch possono essere importanti. Le patch non esistono in un vuoto; interagiscono tra loro. Ad esempio, la prossimità di una patch che contiene tessuto tumorale a un'altra patch può aiutare a determinare la classificazione complessiva dell'immagine più grande. Quindi, è importante tenere in considerazione le Relazioni spaziali tra le patch quando facciamo previsioni.

I modelli MIL esistenti hanno mostrato successo nel catturare le relazioni tra le patch attraverso tecniche come l'auto-attivazione. Questo metodo consente ai modelli di pesare l'importanza di ciascuna patch in base a tutte le altre patch nel bag. Tuttavia, le tecniche tradizionali di auto-attivazione spesso non considerano le relazioni spaziali tra le patch.

Introduzione di un Nuovo Modello

Per affrontare questi problemi, introduciamo un nuovo modello chiamato Self-Attention Consapevole della Distanza per l'Apprendimento a Più Istanze (DAS-MIL). Questo modello tiene specificamente conto delle distanze tra le patch quando calcola le loro interazioni. Invece di guardare solo alle posizioni assolute, DAS-MIL incorpora informazioni continue sulla distanza, permettendo di pesare le patch in modo più accurato in base a quanto siano distanti tra loro.

Includendo questo approccio consapevole della distanza, speriamo di migliorare le prestazioni in scenari in cui le relazioni spaziali sono critiche, come nell'imaging medico.

L'Importanza delle Relazioni Spaziali

Comprendere le relazioni spaziali tra le patch può essere cruciale per fare previsioni accurate in contesti medici. Ad esempio, nella rilevazione del cancro, l'interazione tra le cellule tumorali e le cellule immunitarie può variare notevolmente a seconda del loro assetto spaziale. Queste interazioni possono influenzare come un paziente potrebbe rispondere al trattamento.

Nei modelli tradizionali che non considerano le informazioni spaziali, dettagli chiave possono andare persi. Il nostro approccio mira a mantenere e utilizzare queste informazioni importanti per migliorare le previsioni.

Costruzione del Modello

Nel nostro modello, partiamo da patch di immagini estratte da immagini più grandi. Ogni patch è elaborata per produrre un vettore di caratteristiche che rappresenta le caratteristiche importanti dell'immagine. Successivamente, applichiamo il nostro meccanismo di auto-attivazione consapevole della distanza a questi vettori di caratteristiche. Questo meccanismo si concentra su come le patch si relazionano tra loro in base alle loro distanze.

Dopo aver calcolato i pesi dell'attenzione, aggregiamo le caratteristiche in una singola rappresentazione per l'intero bag. Questo passaggio finale è cruciale, poiché ci consente di fare una previsione sul bag basata sulle informazioni combinate delle sue patch.

Valutazione del Modello

Abbiamo testato il nostro modello su due tipi di set di dati: uno che si concentra su distanze relative e un altro che coinvolge compiti reali di rilevazione del cancro da immagini mediche. Nel nostro set di dati personalizzato, abbiamo creato bag costituiti da cifre disposte in un collage, e abbiamo etichettato i bag in base alla prossimità spaziale di cifre specifiche.

Nel secondo set di dati, che contiene immagini reali di tessuto tumorale, abbiamo formato bag utilizzando patch estratte da grandi diapositive. Volevamo vedere quanto bene il nostro modello potesse distinguere tra immagini cancerose e non cancerose, dato che l'organizzazione delle patch potrebbe influenzare significativamente la classificazione.

Risultati e Scoperte

Le nostre valutazioni mostrano che DAS-MIL si comporta meglio di altri modelli esistenti, in particolare nel riconoscere relazioni importanti basate sulla prossimità spaziale. Abbiamo scoperto che il nostro modello ha raggiunto alta accuratezza in entrambi i set di dati, catturando le sfumature che i modelli tradizionali spesso mancano.

Nei nostri test con il set di dati personalizzato basato su MNIST, DAS-MIL ha superato i classificatori standard che si concentrano su istanze individuali piuttosto che sulle relazioni tra di esse. Questo evidenzia quanto possa essere cruciale il contesto spaziale per fare previsioni.

Nel set di dati CAMELYON16, comunemente usato per la rilevazione del cancro, il nostro modello ha brillato. Abbiamo osservato punteggi elevati in termini di prestazioni, indicando che il nostro metodo consapevole della distanza migliora la capacità di classificare le immagini con precisione.

Confronto con Metodi Esistenti

Quando abbiamo confrontato DAS-MIL con altri modelli, abbiamo notato che mentre i metodi tradizionali spesso si basano su codifiche posizionali assolute, faticano a considerare efficacemente le posizioni relative delle patch. Il nostro approccio, che introduce una rappresentazione appresa delle distanze, consente una gestione migliore delle informazioni spaziali.

I modelli di auto-attivazione che impiegano codifiche assolute non si sono comportati altrettanto bene nel riconoscere schemi chiave nei dati. Al contrario, l'enfasi del nostro modello sulle relazioni di distanza gli ha permesso di catturare caratteristiche più rilevanti, portando a risultati migliori.

Importanza della Formazione e delle Impostazioni degli Iperparametri

Le prestazioni del nostro modello dipendono anche da quanto bene è stato addestrato. Abbiamo selezionato con attenzione vari iperparametri per ottimizzare il processo di apprendimento. Attraverso esperimenti, abbiamo trovato le migliori impostazioni per cose come tassi di apprendimento e decadimento del peso, che alla fine hanno contribuito al successo del modello.

Abbiamo anche esaminato come diversi componenti del nostro modello abbiano contribuito alle sue prestazioni complessive. Ad esempio, abbiamo testato l'impatto di vari termini di incorporamento, scoprendo che alcune configurazioni hanno prodotto risultati migliori di altre.

Approfondimenti dai Mappe di Attenzione

Visualizzando i pesi di attenzione, abbiamo guadagnato ulteriori approfondimenti sul comportamento del nostro modello. Queste mappe mostrano quali patch hanno ricevuto maggiore attenzione quando si fanno previsioni, aiutandoci a capire il processo decisionale. Ad esempio, le patch che erano spazialmente vicine hanno ricevuto un'attenzione maggiore, rinforzando l'importanza di considerare le relazioni nella nostra analisi.

Questo livello di interpretabilità è utile non solo per comprendere le previsioni del modello, ma anche per affinare ulteriormente il nostro approccio per garantire efficacia in diverse applicazioni.

Sfide e Direzioni Future

Sebbene il nostro modello abbia mostrato promesse, ci sono ancora sfide da considerare. Una limitazione è che l'interpretabilità del modello può variare in base a come è configurato. Migliorare l'interpretabilità sarà un'importante attenzione nel lavoro futuro.

Speriamo anche di esplorare modi migliori per incorporare vari bias induttivi nel nostro modello. Questo potrebbe comportare un affinamento di come rappresentiamo distanze e relazioni per migliorare ulteriormente le prestazioni.

Impatto più Ampio

La nostra ricerca apre la strada per ulteriori esplorazioni di tecniche consapevoli della distanza nella patologia computazionale e in altri campi in cui le informazioni spaziali giocano un ruolo significativo. Sottolineando l'importanza delle distanze relative, miriamo a contribuire a strumenti diagnostici e metodologie migliori.

Conclusione

In sintesi, il modello DAS-MIL rappresenta un significativo progresso nel modo in cui ci approcciamo all'apprendimento a più istanze, specialmente nell'imaging medico. Affrontando esplicitamente le relazioni spaziali attraverso un meccanismo consapevole della distanza, miglioriamo la capacità del modello di riconoscere schemi complessi che sono vitali per previsioni accurate. Sviluppi futuri in quest'area potrebbero portare a applicazioni ancora più robuste, aiutando a migliorare i risultati in situazioni mediche critiche.

Fonte originale

Titolo: Deep Multiple Instance Learning with Distance-Aware Self-Attention

Estratto: Traditional supervised learning tasks require a label for every instance in the training set, but in many real-world applications, labels are only available for collections (bags) of instances. This problem setting, known as multiple instance learning (MIL), is particularly relevant in the medical domain, where high-resolution images are split into smaller patches, but labels apply to the image as a whole. Recent MIL models are able to capture correspondences between patches by employing self-attention, allowing them to weigh each patch differently based on all other patches in the bag. However, these approaches still do not consider the relative spatial relationships between patches within the larger image, which is especially important in computational pathology. To this end, we introduce a novel MIL model with distance-aware self-attention (DAS-MIL), which explicitly takes into account relative spatial information when modelling the interactions between patches. Unlike existing relative position representations for self-attention which are discrete, our approach introduces continuous distance-dependent terms into the computation of the attention weights, and is the first to apply relative position representations in the context of MIL. We evaluate our model on a custom MNIST-based MIL dataset that requires the consideration of relative spatial information, as well as on CAMELYON16, a publicly available cancer metastasis detection dataset, where we achieve a test AUROC score of 0.91. On both datasets, our model outperforms existing MIL approaches that employ absolute positional encodings, as well as existing relative position representation schemes applied to MIL. Our code is available at https://anonymous.4open.science/r/das-mil.

Autori: Georg Wölflein, Lucie Charlotte Magister, Pietro Liò, David J. Harrison, Ognjen Arandjelović

Ultimo aggiornamento: 2023-05-20 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://arxiv.org/abs/2305.10552

Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2305.10552

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia arxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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