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Sfide nella Modellazione delle Dinamiche dei Circuiti Neurali

I progressi nelle registrazioni neurali rivelano complessità nella comprensione dell'attività cerebrale.

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Negli ultimi tempi, abbiamo visto grandi miglioramenti nel modo in cui registriamo e studiamo l'attività delle cellule cerebrali, o neuroni. Ora possiamo catturare l'attività di molti neuroni contemporaneamente, anche quando gli animali si comportano in modo naturale o eseguono compiti complessi. Tuttavia, questo crea una sfida: come possiamo capire il funzionamento interno del cervello da tutti questi dati quando sono raccolti in situazioni uniche che non possono essere replicate?

Si pone una domanda urgente: come possiamo usare grandi quantità di dati sull'Attività neurale per ottenere informazioni su come questi circuiti neurali influenzano il comportamento animale? Quando abbiamo solo una singola misurazione dell'attività neurale che non possiamo ripetere, ci chiediamo se possiamo creare un modello informatico che rifletta accuratamente la dinamica del circuito neurale misurato. Poiché questo modello non è limitato da problemi di misurazione nel mondo reale, potrebbe aiutarci a formulare ipotesi sul funzionamento del cervello e simulare come diverse popolazioni neurali potrebbero rispondere a vari input o cambiamenti.

Una strategia comune per costruire questi modelli è usare un tipo di intelligenza artificiale chiamato rete neurale ricorrente (RNN). Recentemente, questa tecnica ha guadagnato popolarità ed è stata applicata a diverse specie e tipi di dati raccolti da registrazioni neurali.

Sfide nei Modelli basati sui dati

Tuttavia, i modelli basati sui dati affrontano diverse sfide. Innanzitutto, quando osserviamo solo un singolo trial di attività, possiamo vedere solo come si comporta il circuito in condizioni specifiche. Questo rende difficile valutare come diversi input o stati interni possano influenzare il circuito. In secondo luogo, di solito non vediamo l'attività di tutti i neuroni nel circuito - registriamo solo un numero ridotto, e non catturiamo tutti gli input che ricevono. In terzo luogo, le registrazioni stesse possono essere rumorose e potrebbero non rappresentare bene l'attività reale. Ad esempio, quando usiamo determinate tecniche di imaging, potremmo perdere il tempo preciso di attivazione dei neuroni, concentrandoci invece su schemi di attività più ampi. Infine, la differenza tra i comportamenti dinamici osservati nei modelli e quelli nella vera biologia crea un divario, poiché i modelli spesso ignorano dettagli cruciali per efficienza.

Anche se riusciamo a catturare l'attività di un gran numero di neuroni, capire come interagiscono basandosi solo su queste misurazioni può essere molto difficile. Un'aspettativa più realistica è che questi modelli dovrebbero essere in grado di catturare alcuni schemi di comportamento più ampi - come cambiamenti lenti nel tempo o oscillazioni - che possono essere osservati nei circuiti reali.

Integrazione Sensoriale come Sfida

L'integrazione sensoriale, o come il cervello combina diversi tipi di informazioni, pone una domanda significativa nelle neuroscienze. Sono stati suggeriti molti modelli su come avviene questo processo, ma due tipi principali si distinguono: il modello dell'attrattore lineare e il modello della catena feedforward. Sebbene entrambi questi modelli possano gestire efficacemente l'integrazione sensoriale, funzionano attraverso meccanismi sottostanti diversi.

Il modello dell'attrattore lineare ha una struttura specifica che aiuta a mantenere una memoria degli input, mentre la catena feedforward elabora gli input in modo sequenziale. Il primo modello può essere molto sensibile a piccole variazioni nei suoi parametri, mentre il secondo tende ad essere più robusto a tali cambiamenti, ma ha limiti su quanto a lungo possa sostenere una memoria.

In uno studio, i ricercatori hanno cercato di vedere se il modeling basato sui dati potesse separare i due tipi di modelli di integrazione sensoriale. Hanno creato un compito che entrambi i modelli potevano risolvere, poi hanno raccolto dati da un numero ridotto di neuroni e hanno cercato di analizzarli con un approccio basato sui dati. Sorprendentemente, entrambi i modelli sono stati interpretati come simili attrattori lineari, portando a confusione su quale modello rappresentasse veramente il comportamento del circuito neurale.

Comprendere le Dinamiche di rete

Per approfondire, i ricercatori hanno spostato la loro attenzione a reti più semplici. Analizzando RNN lineari guidate da rumore casuale, hanno potuto studiare come le reti studente (i modelli) recuperassero i comportamenti dinamici delle reti insegnanti (i veri circuiti neurali).

Nei casi in cui le reti insegnanti avevano connessioni ben strutturate (dinamiche normali), le reti studente potevano identificare accuratamente i loro comportamenti anche con osservazioni incomplete. D'altra parte, quando le reti insegnanti erano organizzate in modo non standard (dinamiche non normali), i modelli studente tendevano a fraintendere i loro comportamenti. Ad esempio, quando esaminavano catene feedforward, i modelli iniziavano a somigliare a attrattori lineari, nonostante fossero fondamentalmente diversi.

Questa confusione accade perché, poiché le reti studente sono costrette a operare con meno neuroni, finiscono per adattare le loro dinamiche in un modo che produce risultati fuorvianti. L'unico modo per loro di rappresentare memorie più lunghe con un numero limitato di neuroni è tarare i loro parametri in modi che imitano gli attrattori lineari.

Problemi simili sono emersi nello studio di reti a basso rango, che si ritiene rappresentino bene le dinamiche cerebrali. Questi modelli dovrebbero teoricamente dimostrare un'attività a bassa dimensione, rendendoli ideali per tecniche basate sui dati. Tuttavia, è stato scoperto che potevano anche creare dinamiche fuorvianti nelle reti studente.

L'Impatto delle Dinamiche Non Lineari

Sebbene i modelli lineari abbiano i loro limiti, i ricercatori hanno iniziato a indagare come le intuizioni delle reti lineari potessero applicarsi a reti non lineari. Introducendo risposte non lineari, hanno esaminato l'effetto delle osservazioni parziali e il loro impatto sulle dinamiche delle reti.

Le reti non lineari possono comportarsi in modo diverso rispetto a quelle lineari, e i ricercatori hanno scoperto che anche se le reti insegnanti non avevano comportamenti problematici, i modelli studente potevano identificare erroneamente risposte caotiche o punti stabili aggiuntivi. Tale malinterpretazione potrebbe complicare ulteriormente la nostra comprensione di come i circuiti neurali operano veramente.

Validazione dei Risultati

Date queste sfide, sorge una domanda critica: come possono i ricercatori convalidare le dinamiche inferite da questi modelli? Un punto chiave di validazione potrebbe includere interventi sperimentali diretti. Studi recenti hanno impiegato metodi come l'optogenetica, una tecnica che consente agli scienziati di controllare l'attività neurale utilizzando la luce. Questi approcci possono fare luce sull'accuratezza delle nostre dinamiche inferite e fornire una comprensione più solida di come funzionano i circuiti neurali.

Conclusione

In sintesi, mentre i progressi nella registrazione dell'attività cerebrale hanno aperto nuove strade per comprendere le dinamiche neurali, presentano anche sfide significative. I modelli basati sui dati possono produrre interpretazioni fuorvianti, specialmente quando si lavora con informazioni incomplete o quando i meccanismi sottostanti dei circuiti neurali differiscono. Sottolinea la necessità di una validazione attenta e di considerare metodi sperimentali nell'interpretare i risultati di questi modelli vincolati dai dati. Comprendere la complessità del cervello richiede non solo tecniche di modellazione sofisticate, ma anche approcci sperimentali rigorosi per testare e confermare le intuizioni sull'attività neurale.

Fonte originale

Titolo: Partial observation can induce mechanistic mismatches in data-constrained models of neural dynamics

Estratto: One of the central goals of neuroscience is to gain a mechanistic understanding of how the dynamics of neural circuits give rise to their observed function. A popular approach towards this end is to train recurrent neural networks (RNNs) to reproduce experimental recordings of neural activity. These trained RNNs are then treated as surrogate models of biological neural circuits, whose properties can be dissected via dynamical systems analysis. How reliable are the mechanistic insights derived from this procedure? While recent advances in population-level recording technologies have allowed simultaneous recording of up to tens of thousands of neurons, this represents only a tiny fraction of most cortical circuits. Here we show that observing only a subset of neurons in a circuit can create mechanistic mismatches between a simulated teacher network and a data-constrained student, even when the two networks have matching single-unit dynamics. In particular, partial observation of models of low-dimensional cortical dynamics based on functionally feedforward or low-rank connectivity can lead to surrogate models with spurious attractor structure. Our results illustrate the challenges inherent in accurately uncovering neural mechanisms from single-trial data, and suggest the need for new methods of validating data-constrained models for neural dynamics.

Autori: Cengiz Pehlevan, W. Qian, J. A. Zavatone-Veth, B. S. Ruben

Ultimo aggiornamento: 2024-05-26 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.24.595741

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.24.595741.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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