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Nuove scoperte sulla struttura e funzione dell'ossibutirina

La ricerca rivela la struttura cristallina dell'ossibutirina, aiutando nello sviluppo futuro di farmaci per la vescica.

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L'ossibutirina, venduta col nome "Ditropan", è un medicinale usato per trattare l'iperattività della vescica. È in uso da quasi 50 anni, avendo ricevuto per la prima volta l'approvazione negli Stati Uniti nel 1975. Questo farmaco funziona in modo diverso rispetto a un altro medicinale, il mirabegron, che rilassa la vescica. Invece, l'ossibutirina blocca recettori specifici che controllano le contrazioni della vescica. Bloccando una sostanza chimica chiamata acetilcolina dall'attaccarsi a questi recettori, l'ossibutirina riduce lo stimolo di urinare frequentemente.

L'ossibutirina si presenta in due varianti, conosciute come Enantiomeri, che sono immagini speculari l'una dell'altra. La struttura del medicinale include diversi componenti importanti: un anello fenilico, un anello cicloesilico, un gruppo idrossile e una catena alifatica collegata da un atomo di carbonio chirale. Questa struttura è complessa e capire come funziona è stata una sfida.

Sfide nello Studio della Struttura dell'Ossibutirina

Per capire la struttura dettagliata dell'ossibutirina e come interagisce con il suo bersaglio, gli scienziati solitamente si affidano a un metodo chiamato diffrazione a raggi X. Questa tecnica ha funzionato con altri farmaci simili, ma non ha dato buoni risultati per l'ossibutirina. Questo principalmente perché l'ossibutirina forma spesso cristalli molto piccoli che sono difficili da studiare con i metodi standard a raggi X.

Metodi alternativi, come la diffrazione a raggi X da polvere, hanno anche avuto problemi nell'analizzare l'ossibutirina. Studi passati con questa tecnica hanno fornito dati inconsistenti e ci sono state complicazioni legate all'esposizione del farmaco alla luce e alla radiazione, che potrebbero danneggiare la struttura. A causa di questi problemi, la precisa struttura cristallina dell'ossibutirina è rimasta poco chiara per decenni nonostante il suo ampio uso medico.

MicroED: Un Nuovo Approccio per Scoprire la Struttura

Recentemente, i ricercatori hanno adottato una nuova tecnica chiamata diffrazione elettronica di microcristalli, o MicroED. Questo metodo consente agli scienziati di studiare cristalli molto piccoli che sono troppo minuscoli per le tecniche tradizionali di diffrazione a raggi X. Usando questo nuovo approccio, i ricercatori possono potenzialmente superare alcune delle limitazioni che hanno affrontato con l'ossibutirina.

MicroED raccoglie dati a dosi di radiazione molto basse e a temperature estremamente fredde. Questo aiuta a prevenire danni alla struttura cristallina, che è fondamentale per un'analisi accurata. L'introduzione del MicroED ha aperto la porta alla scoperta delle strutture cristalline di molti farmaci che erano precedentemente difficili da analizzare.

Scoprendo la Struttura Cristallina dell'Ossibutirina

In questo studio, i ricercatori sono riusciti a utilizzare il MicroED per determinare la struttura cristallina dell'ossibutirina cloridrato dopo anni di tentativi senza successo. Hanno raccolto dati da cristalli molto piccoli usando dosi di radiazione basse, senza mostrare segni di danno nella struttura.

I ricercatori hanno scoperto che l'ossibutirina forma un pattern specifico all'interno dei suoi cristalli. Erano presenti due enantiomeri, (R)-ossibutirina e (S)-ossibutirina, che si accalcavano strettamente in strati. Questi strati sono tenuti insieme da varie interazioni, comprese le legami idrogeno, che sono critiche per la stabilità della struttura.

Come L'Ossibutirina Si Lega al Suo Bersaglio

L'ossibutirina agisce interagendo con recettori specifici nel corpo noti come recettori muscarinici M3 (M3R). La comprensione precedente di come l'ossibutirina si leghi a questi recettori era limitata. Per colmare questa lacuna, i ricercatori hanno usato simulazioni al computer per prevedere come l'ossibutirina interagisce con M3R.

Le simulazioni hanno rivelato che l'enantiomero (R) dell'ossibutirina è cruciale per legarsi efficacemente al recettore. L'enantiomero (R) ha mostrato interazioni specifiche con il recettore che contribuiscono alla sua efficacia nel bloccare i segnali che provocano contrazioni della vescica. Le interazioni coinvolgono legami idrofobici (che respingono l'acqua) e legami idrogeno, che aiutano a mantenere il farmaco in posizione.

Implicazioni per lo Sviluppo Futuro di Farmaci

I risultati di questo studio non solo migliorano la nostra conoscenza dell'ossibutirina, ma pongono anche le basi per lo sviluppo futuro di nuovi medicinali mirati ai M3R. La comprensione dettagliata di come l'ossibutirina interagisce col suo recettore può guidare gli scienziati nella creazione di farmaci più efficaci e con meno effetti collaterali.

Sapendo come diversi enantiomeri si legano e influenzano il recettore, i ricercatori possono progettare nuovi composti che potrebbero migliorare la gestione della vescica iperattiva e potenzialmente di altre condizioni correlate.

Conclusione

L'ossibutirina è stata un trattamento fondamentale per l'iperattività della vescica per molti anni, eppure la sua precisa struttura cristallina è stata sfuggente fino ad ora. L'avanzamento della tecnica MicroED ha permesso ai ricercatori di superare ostacoli precedenti e fare luce sulla struttura di questo importante farmaco. Questo successo potrebbe aprire la strada a una migliore comprensione e sviluppo di medicinali per il controllo della vescica, migliorando le opzioni di trattamento per i pazienti in futuro.

Fonte originale

Titolo: An Updated Structure of Oxybutynin Hydrochloride

Estratto: Oxybutynin (Ditropan), a widely distributed muscarinic antagonist for treating the overactive bladder, has been awaiting a definitive crystal structure for nearly 50 years due to the sample and technique limitations. Past reports used powder X-ray diffraction (PCRD) to shed light on the possible packing of the molecule however a 3D structure remained elusive. Here we used Microcrystal Electron Diffraction (MicroED) to successfully unveil the 3D structure of oxybutynin hydrochloride. We identify several inconsistencies between the reported PXRD analyses and the experimental structure. Using the improved model, molecular docking was applied to investigate the binding mechanism between M3 muscarinic receptor (M3R) and (R)-oxybutynin, revealing essential contacts/residues and conformational changes within the protein pocket. A possible universal conformation was proposed for M3R antagonists, which is valuable for future drug development and optimization. This study underscores the immense potential of MicroED as a complementary technique for elucidating the unknown pharmaceutical crystal structures, as well as for the protein-drug interactions.

Autori: Tamir Gonen, J. Lin, G. Bu, J. Unge

Ultimo aggiornamento: 2024-06-06 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.05.597682

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.05.597682.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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