Le rôle de la radiomique en neurologie
La radiomique aide à améliorer le diagnostic et le traitement des maladies neurologiques grâce à l'imagerie médicale.
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Table des matières
- C'est quoi la Radiomique ?
- Pourquoi la Radiomique est-elle Importante pour les Maladies Neurologiques ?
- Le Pipeline de la Radiomique
- 1. Curation des Données
- 2. Pré-traitement des Données
- 3. Segmentation d'image
- 4. Extraction de caractéristiques
- 5. Analyse des données
- Applications de la Radiomique en Neurologie
- Maladie d'Alzheimer
- Sclérose en Plaques
- Maladie de Parkinson
- AVC
- Épilepsie
- Troubles de la Santé Mentale
- Défis de la Radiomique
- Disponibilité des Données
- Harmonisation des Données
- Pertinence Clinique
- Conception de l'Étude
- Cohérence du Pipeline
- Interprétation des Résultats
- Directions Futures
- Collaboration Accrue
- Techniques Avancées
- Accent sur les Études Longitudinales
- Éducation et Formation
- Conclusion
- Source originale
- Liens de référence
L'imagerie médicale a beaucoup évolué depuis la découverte des radiographies. Aujourd'hui, grâce aux technologies d'imagerie, les médecins peuvent voir à l'intérieur du corps sans avoir besoin d'opérer. Pourtant, ils examinent toujours les images médicales d'une manière qui peut prendre du temps et être subjective. Ils s'appuient souvent sur leur propre jugement, ce qui peut parfois entraîner des erreurs. Pour rendre ce processus plus précis et efficace, des chercheurs ont développé une méthode appelée Radiomique. La radiomique aide à extraire des informations détaillées des images médicales, ce qui peut soutenir les médecins dans la prise de meilleures décisions.
C'est quoi la Radiomique ?
La radiomique est une méthode utilisée pour extraire des informations quantitatives à partir de données d'imagerie. En gros, ça veut dire obtenir des chiffres et des données à partir d'images qui peuvent donner des indications sur l'état d'un patient. Par exemple, les chercheurs peuvent analyser des images pour trouver des motifs qui pourraient indiquer certaines maladies.
La radiomique se divise en deux types principaux : la radiomique artisanale et la radiomique profonde. La radiomique artisanale implique des caractéristiques définies à l'avance par les chercheurs. D'un autre côté, la radiomique profonde utilise des modèles informatiques avancés qui apprennent à identifier les caractéristiques importantes à partir des données elles-mêmes.
Pourquoi la Radiomique est-elle Importante pour les Maladies Neurologiques ?
Les maladies neurologiques, comme la maladie d'Alzheimer, la sclérose en plaques et la maladie de Parkinson, peuvent être difficiles à diagnostiquer précocement. Souvent, les symptômes n'apparaissent que lorsque la maladie a déjà beaucoup progressé. Un diagnostic précoce est crucial pour un meilleur traitement et des résultats améliorés pour les patients.
La radiomique offre un moyen d'analyser les images du cerveau pour trouver des indices sur ces maladies à un stade plus précoce. Elle examine les caractéristiques détaillées des scans cérébraux, aidant à différencier les tissus sains des tissus malades. Cela pourrait finalement conduire à des diagnostics plus précis et à des traitements sur mesure.
Le Pipeline de la Radiomique
Le processus d'utilisation de la radiomique implique plusieurs étapes, souvent appelées un pipeline. Chaque étape doit être effectuée soigneusement pour s'assurer que l'analyse est précise et utile. Voici un aperçu des principales étapes du pipeline de la radiomique :
1. Curation des Données
Dans les hôpitaux, les images médicales et les informations associées sont stockées dans des systèmes spéciaux. Ces images viennent souvent dans un format spécifique. Pour la recherche, il est préférable d'utiliser des formats de fichiers ouverts car ils sont plus faciles à manipuler.
Avant d'analyser les images, il est essentiel de vérifier et de nettoyer les données. Cela inclut s'assurer qu'il n'y a pas d'informations identifiables dans les scans, ainsi que de confirmer que les images sont complètes et de bonne qualité.
2. Pré-traitement des Données
Une fois les données curées, elles peuvent nécessiter un pré-traitement. Cela inclut les éléments suivants :
- Co-enregistrement : Aligner plusieurs images pour s'assurer qu'elles sont au même endroit spatialement.
- Redimensionnement des images : S'assurer que toutes les images ont la même taille et la même forme.
- Correction de biais : Réparer les irrégularités dans les images qui peuvent résulter du processus de numérisation.
Segmentation d'image
3.Dans cette étape, des zones spécifiques des images cérébrales sont identifiées, souvent appelées régions d'intérêt (ROI). Ce peuvent être des zones suspectées d'avoir une maladie ou des zones importantes pour comprendre l'état général. Différents outils peuvent être utilisés pour cette étape, y compris des techniques de vision par ordinateur et des méthodes d'apprentissage profond plus récentes.
Extraction de caractéristiques
4.Après avoir segmenté les images, les chercheurs extraient des caractéristiques des images. Ces caractéristiques sont des valeurs numériques qui représentent soit la forme, soit l'intensité, soit la texture des régions identifiées. Ces caractéristiques peuvent ensuite être analysées pour rechercher des motifs ou des associations avec certaines maladies.
Analyse des données
5.Avec les caractéristiques extraites, l'étape suivante est l'analyse des données. Cela peut impliquer diverses méthodes statistiques et techniques d'apprentissage automatique pour comprendre la relation entre les caractéristiques et les résultats cliniques.
Au cours de cette étape, les chercheurs peuvent également faire face à des défis comme des données manquantes ou le besoin de séparer les données en ensembles d'entraînement et de test. Cela aide à valider les modèles créés pour s'assurer qu'ils sont fiables.
Applications de la Radiomique en Neurologie
La radiomique est de plus en plus utilisée dans divers troubles neurologiques. Voici quelques façons dont elle fait une différence :
Maladie d'Alzheimer
La maladie d'Alzheimer est une cause majeure de démence, et la recherche dans ce domaine est vaste. Les premières études utilisant la radiomique se sont concentrées sur la différenciation entre les stades de la maladie d'Alzheimer et l'identification des changements dans les scans cérébraux liés à la maladie. Les chercheurs travaillent également à reconnaître les premiers symptômes d'un léger trouble cognitif (MCI), qui peut être un précurseur de la maladie d'Alzheimer.
Sclérose en Plaques
La sclérose en plaques est une maladie qui cause des handicaps et nécessite un diagnostic précoce pour un traitement efficace. La radiomique peut aider à identifier des motifs spécifiques dans les scans cérébraux qui se rapportent à la SEP. Les études actuelles impliquent de comparer les patients atteints de SEP avec des contrôles sains et de distinguer la SEP des conditions similaires.
Maladie de Parkinson
La maladie de Parkinson se développe progressivement et présente des symptômes variés. La radiomique peut être utilisée pour différencier la maladie de Parkinson d'autres troubles similaires. Il y a eu des recherches visant à identifier les premiers symptômes grâce à l'imagerie, ce qui pourrait conduire à différentes approches thérapeutiques.
AVC
L'AVC est une préoccupation majeure pour la santé à l'échelle mondiale. La radiomique peut aider à identifier les zones touchées par des AVC sur les scans cérébraux. De plus, elle peut aider à prédire les résultats et les chemins de récupération des patients, fournissant des informations précieuses pour la planification des traitements.
Épilepsie
Pour l'épilepsie, les chercheurs ont commencé à utiliser la radiomique pour détecter des régions spécifiques du cerveau qui pourraient être impliquées dans les crises. Cette approche peut aider dans la gestion et le traitement du trouble.
Troubles de la Santé Mentale
Diverses conditions de santé mentale, y compris la schizophrénie et le trouble bipolaire, ont été étudiées à l'aide de la radiomique. En analysant les images cérébrales, les chercheurs peuvent créer des modèles qui différencient ces troubles du fonctionnement cérébral normal.
Défis de la Radiomique
Bien que la radiomique montre un bon potentiel, plusieurs défis doivent être abordés :
Disponibilité des Données
De nombreuses études s'appuient sur de petits ensembles de données privés qui ne représentent pas la population générale. Cette limitation peut affecter la fiabilité des modèles développés. Une plus grande diversité de données provenant de différentes démographies et contextes médicaux est essentielle pour créer des modèles robustes.
Harmonisation des Données
La variabilité des données provenant de différents hôpitaux ou machines d'imagerie peut entraîner des incohérences. L'harmonisation des données signifie s'assurer qu'elles sont cohérentes et comparables à travers différentes sources. C'est crucial pour un entraînement efficace des modèles et leur validation.
Pertinence Clinique
Il est important que la radiomique fournisse des informations cliniquement pertinentes. De nombreuses études actuelles se concentrent sur la distinction entre les états malades et sains, mais manquent de spécificité concernant différents types de conditions neurologiques. Plus de travail est nécessaire pour développer des méthodes qui peuvent différencier avec précision parmi diverses maladies.
Conception de l'Étude
La plupart des études sont des conceptions simplifiées de preuve de principe. Elles se concentrent souvent sur des tâches de classification uniques sans explorer les relations complexes entre plusieurs conditions ou stades de la maladie. Il y a un besoin de conceptions d'études plus complètes qui reflètent les réalités du diagnostic et de la gestion des troubles neurologiques.
Cohérence du Pipeline
Différents groupes de recherche peuvent suivre différentes procédures pour exécuter la radiomique, entraînant des résultats incohérents. Standardiser les méthodes et assurer une transparence dans les rapports est crucial pour augmenter la reproductibilité et la confiance dans les résultats de la radiomique.
Interprétation des Résultats
Comprendre comment les caractéristiques de la radiomique se rapportent aux résultats cliniques est clé pour rendre l'approche utile en pratique. Il est nécessaire d'avoir de la clarté sur la manière dont ces caractéristiques impactent les décisions cliniques, surtout à mesure que les modèles deviennent plus complexes.
Directions Futures
Malgré les défis, l'avenir de la radiomique en neurologie semble prometteur. Voici quelques développements potentiels :
Collaboration Accrue
Plus de collaboration entre hôpitaux, institutions de recherche et développeurs de technologies peut conduire à des ensembles de données plus riches et à une meilleure développement des modèles. Partager des données et des ressources peut faciliter la création de modèles validés qui peuvent être appliqués dans divers contextes cliniques.
Techniques Avancées
De nouvelles méthodes computationnelles, comme l'apprentissage profond et l'intelligence artificielle, représentent un potentiel significatif pour améliorer la précision et l'applicabilité de la radiomique. Ces techniques pourraient améliorer l'extraction de caractéristiques et faciliter l'identification de motifs complexes que les méthodes traditionnelles pourraient manquer.
Accent sur les Études Longitudinales
Les études longitudinales qui suivent les changements au fil du temps pourraient fournir des insights plus profonds sur la progression des maladies neurologiques. Cette approche peut aider à identifier les premiers signes de la maladie et à développer des stratégies préventives.
Éducation et Formation
Former les cliniciens sur la valeur et l'utilisation de la radiomique peut améliorer sa mise en œuvre dans la pratique quotidienne. La formation peut aider à s'assurer que les méthodes sont utilisées correctement et que les résultats sont interprétés de manière appropriée.
Conclusion
La radiomique est un domaine excitant et en développement qui a le potentiel de transformer la façon dont les maladies neurologiques sont diagnostiquées et traitées. Malgré les défis actuels, les avancées continues dans la technologie et l'analyse des données montrent un bon potentiel pour améliorer les résultats pour les patients. Alors que les chercheurs et les cliniciens collaborent pour affiner les méthodes et résoudre les limitations, la radiomique pourrait devenir une partie intégrante de la pratique clinique en neurologie, améliorant la précision et la qualité des soins pour les patients.
Titre: A review of handcrafted and deep radiomics in neurological diseases: transitioning from oncology to clinical neuroimaging
Résumé: Medical imaging technologies have undergone extensive development, enabling non-invasive visualization of clinical information. The traditional review of medical images by clinicians remains subjective, time-consuming, and prone to human error. With the recent availability of medical imaging data, quantification have become important goals in the field. Radiomics, a methodology aimed at extracting quantitative information from imaging data, has emerged as a promising approach to uncover hidden biological information and support decision-making in clinical practice. This paper presents a review of the radiomic pipeline from the clinical neuroimaging perspective, providing a detailed overview of each step with practical advice. It discusses the application of handcrafted and deep radiomics in neuroimaging, stratified by neurological diagnosis. Although radiomics shows great potential for increasing diagnostic precision and improving treatment quality in neurology, several limitations hinder its clinical implementation. Addressing these challenges requires collaborative efforts, advancements in image harmonization methods, and the establishment of reproducible and standardized pipelines with transparent reporting. By overcoming these obstacles, radiomics can significantly impact clinical neurology and enhance patient care.
Auteurs: Elizaveta Lavrova, Henry C. Woodruff, Hamza Khan, Eric Salmon, Philippe Lambin, Christophe Phillips
Dernière mise à jour: 2024-07-18 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://arxiv.org/abs/2407.13813
Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2407.13813
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.
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Liens de référence
- https://orcid.org/0000-0003-2751-790X
- https://orcid.org/0000-0001-7911-5123
- https://orcid.org/0000-0002-0398-4848
- https://orcid.org/0000-0003-2520-9241X
- https://orcid.org/0000-0001-7961-0191
- https://orcid.org/0000-0002-4990-425X
- https://nipy.org/nibabel/coordinate_systems.html
- https://topepo.github.io/caret/
- https://www.slicer.org/
- https://www.itksnap.org/
- https://www.radiantviewer.com/
- https://www.microdicom.com/
- https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/spm12/
- https://www.nitrc.org/projects/dcm2nii/
- https://github.com/rordenlab/dcm2niix
- https://github.com/muschellij2/dcm2niir
- https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki
- https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/
- https://github.com/ANTsX/ANTs
- https://brainsuite.org/
- https://www.applied-statistics.de/lst.html
- https://camino.cs.ucl.ac.uk
- https://github.com/ai-med/QuickNATv2
- https://afni.nimh.nih.gov/
- https://neuro-jena.github.io/cat//
- https://pydicom.github.io/
- https://github.com/loli/medpy
- https://nipy.org/nibabel/
- https://github.com/poldracklab/pydeface
- https://github.com/mih/mridefacer
- https://github.com/nipreps/mriqc
- https://github.com/OpenImaging/miqa
- https://github.com/EllenWasbo/ImageQC
- https://github.com/primakov/precision-medicine-toolbox
- https://github.com/bids-standard/pybids
- https://github.com/iitzco/deepbrain
- https://github.com/msharrock/deepbleed
- https://github.com/AIM-Harvard/pyradiomics
- https://github.com/nipy/nipype
- https://torchio.readthedocs.io/
- https://github.com/bthyreau/hippodeep
- https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/term=radiomics+AND+neurology+NOT+oncology
- https://grand-challenge.org/
- https://mirrors.ctan.org/macros/latex/contrib/natbib/natnotes.pdf
- https://www.ctan.org/pkg/booktabs