S'attaquer à la menace des organismes multi-résistants dans les hôpitaux
Un aperçu de la propagation des MDRO et des mesures de contrôle des infections dans le secteur de la santé.
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Table des matières
Dans les hôpitaux, il y a de plus en plus d'inquiétudes concernant les infections causées par des organismes multi-résistants aux antibiotiques, appelés MDROs. Ces organismes peuvent représenter des risques sérieux, surtout pour les groupes vulnérables comme les personnes âgées ou celles avec un système immunitaire affaibli. Beaucoup de ces infections, connues sous le nom d'Infections associées aux soins de santé (HCAIs), peuvent être évitées grâce à de meilleures mesures de contrôle et de prévention des infections.
Une des dernières options pour traiter les infections causées par les MDROs est un groupe d'antibiotiques appelés carbapénèmes. Cependant, certaines bactéries sont devenues résistantes à ces antibiotiques, en particulier un groupe connu sous le nom d'Enterobacterales résistants aux carbapénèmes (CRE). Les infections à CRE sont liées à des taux plus élevés de maladies et de décès chez les patients. Ces organismes sont difficiles à traiter car ils produisent des enzymes qui dégradent presque tous les antibiotiques d'un certain type.
Comment la résistance des CRE se propage
Les enzymes carbapénémases, comme OXA-48 et NDM, sont des moyens courants par lesquels les CRE résistent au traitement. Ces mécanismes de résistance se retrouvent dans le monde entier et se déplacent facilement entre différents types de bactéries. Les infections causées par les CRE peuvent être transférées par des éléments génétiques mobiles, comme les plasmides, qui sont de petites molécules d'ADN pouvant transporter des Gènes de résistance. Les CRE portent souvent des gènes de résistance supplémentaires, ce qui les rend encore plus difficiles à détecter et à traiter.
Les recherches montrent que les CRE peuvent être trouvés à la fois dans la communauté et dans les hôpitaux. Alors que les patients qui ne sont que porteurs de CRE n'ont peut-être pas besoin d'antibiotiques, ils peuvent quand même transmettre les bactéries à d'autres. Cela rend essentiel de considérer à la fois la colonisation et l'infection lors de la mise en œuvre des stratégies de prévention des infections. Des CRE ont été trouvés sur des surfaces que beaucoup de gens touchent, comme les poignées de porte et le matériel médical, ainsi que dans des endroits comme la blanchisserie de l'hôpital et les eaux usées. Lorsque des eaux usées non traitées contenant ces bactéries pénètrent dans les systèmes publics, elles peuvent ramener ces germes dans l'environnement, surtout dans des zones où le traitement des eaux usées peut ne pas être suffisant.
L'importance de la surveillance
La surveillance est essentielle pour contrôler les épidémies de pathogènes et la résistance aux antibiotiques. Dans les hôpitaux avec des patients vulnérables, il est crucial de suivre ces infections. La méthode standard pour tester les CRE est la culture et les tests de sensibilité aux antibiotiques, mais de nouvelles méthodes comme la PCR et les tests rapides sont également utilisées.
La pandémie de COVID-19 a montré la nécessité d'un suivi en temps réel des infections. L'analyse génomique peut offrir des aperçus précieux sur la façon dont ces organismes se propagent. Les tests traditionnels ne peuvent pas toujours identifier les relations génétiques entre les différentes souches, ce qui est crucial pour suivre les épidémies potentielles. Le séquençage complet du génome (WGS) peut révéler des liens entre les CRE, leurs gènes de résistance et les plasmides qu'ils portent.
Étude sur la transmission des CRE
Dans une étude récente, des chercheurs se sont concentrés sur des patients dans un hôpital du Nord de Londres qui étaient infectés ou colonisés par des CRE pendant un an. Ils ont collecté des échantillons de patients et de l'environnement hospitalier pour examiner comment ces organismes circulaient.
Ils ont recueilli des données sur les mouvements et traitements des patients grâce aux dossiers hospitaliers. Une variété de tests a été utilisée pour identifier les bactéries et déterminer leurs profils de résistance. Des échantillons environnementaux ont été collectés dans les chambres des patients, les zones partagées et même les eaux usées, assurant une vue d'ensemble complète sur les endroits où les CRE pouvaient se cacher.
Résultats de l'étude
Grâce à l'échantillonnage environnemental, les chercheurs ont trouvé différents types de bactéries dans diverses zones de l'hôpital. Ils ont découvert que certaines bactéries étaient plus couramment trouvées dans les eaux usées que dans les échantillons prélevés sur des surfaces ou des écouvillons. Cela a soulevé des préoccupations concernant les eaux usées servant de réservoir pour ces organismes.
L'étude a révélé que 28 isolats cliniques avaient été obtenus à partir de patients ayant des tests positifs pour des gènes de résistance spécifiques. La majorité de ces isolats cliniques portaient des gènes de résistance, y compris ceux de type OXA et NDM. Pour les isolats environnementaux, les chercheurs ont également identifié des gènes de résistance, mais à des taux plus faibles que dans les échantillons cliniques.
Fait intéressant, certains isolats avaient des plasmides uniques, qui sont des morceaux d'ADN pouvant porter des traits de résistance. Comprendre ces plasmides est essentiel car ils peuvent aider à la propagation de la résistance parmi différentes bactéries.
Implications pour le contrôle des infections
Les résultats suggèrent une connexion entre les patients et l'environnement, indiquant que les infections pourraient se propager entre les individus et de l'environnement aux patients. La présence de bactéries résistantes dans des zones à fort contact et dans les eaux usées montre que les mesures de prévention des infections doivent être renforcées.
Avec les connaissances acquises grâce à l'analyse génomique, les hôpitaux peuvent mieux comprendre comment ces organismes se propagent et comment concentrer leurs efforts de contrôle des infections. Cela pourrait mener à des protocoles mis à jour pour le nettoyage et la surveillance des zones à haut risque.
De plus, les hôpitaux pourraient vouloir augmenter le dépistage des CRE parmi les patients pour détecter plus tôt les infections potentielles. En identifiant ces cas, les travailleurs de la santé peuvent prendre des mesures pour réduire les risques associés à la fois aux réservoirs humains et environnementaux.
Conclusion
L'étude a éclairé les défis posés par les organismes multi-résistants dans les hôpitaux. Avec la bonne surveillance et les bonnes interventions, la propagation de ces organismes peut être mieux contrôlée. Un dépistage amélioré, associé à des pratiques de nettoyage efficaces, pourrait aider à protéger les patients vulnérables.
La recherche sur ce sujet est vitale alors que les hôpitaux continuent de faire face à des défis liés à de nouvelles infections résistantes. Les résultats soulignent l'importance de maintenir des mesures strictes de contrôle des infections pour protéger la santé des patients et prévenir les épidémies.
Titre: Tracing the transmission of carbapenem-resistant Enterobacteriales at the patient:ward environmental nexus
Résumé: Structured summaryO_ST_ABSIntroductionC_ST_ABSColonisation and infection with Carbapenem-resistant Enterobacterales (CRE) in healthcare settings poses significant risks, especially for vulnerable patients. Genomic analysis can be used to trace transmission routes, supporting antimicrobial stewardship and informing infection control strategies. Here we used genomic analysis to track the movement and transmission of CREs within clinical and environmental samples. Methods25 isolates were cultured from clinical patient samples or swabs, that tested positive for OXA-48-like variants using the NG-Test(R) CARBA-5 test and whole genome sequenced (WGS) using Oxford Nanopore Technologies (ONT). 158 swabs and 52 wastewater samples were collected from the ward environment. 60 isolates (matching clinical isolate genera; Klebsiella, Enterobacter, Citrobacter and Escherichia) were isolated from the environmental samples. Metagenomic sequencing was undertaken on 36 environmental wastewater and swab samples. Results21/25 (84%) clinical isolates had >1 blaOXA gene and 19/25 (76%) harboured >1 blaNDM gene. Enterobacterales were most commonly isolated from environmental wastewater samples 27/52 (51.9%), then stick swabs 5/43 (11.6%) and sponge swabs 5/115 (4.3%). 11/60 (18%) environmental isolates harboured at >1 blaOXA gene and 1.9% (1/60) harboured blaNDM-1. blaOXA genes were found in 2/36 (5.5%) metagenomic environmental samples. DiscussionPotential for putative patient-patient and patient-ward transmission was shown. ONT sequencing can expedite clinical decisions whilst awaiting reference laboratory results, providing economic and patient care benefits. Metagenomic sampling needs optimization to improve sensitivity.
Auteurs: Linzy Elton Sr., L. Elton, A. Williams, S. Ali, J. Heaphy, V. Pang, L. Commins, C. O'Brien, O. Yetis, E. Caine, I. Ward, M. Muzslay, S. Yui, K. Karia, E. Shore, S. Rofael, D. Mack, T. D. McHugh, E. Q. Wey
Dernière mise à jour: 2024-07-05 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.07.03.24309291
Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.07.03.24309291.full.pdf
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