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Genetische Einblicke in pädiatrische Hirntumoren

Aktuelle Forschung zeigt genetische Veränderungen, die pädiatrische Hirntumore und Behandlungsresultate beeinflussen.

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Gehirntumoren sind die häufigsten festen Tumoren bei Kindern unter 19 Jahren. Sie sind auch die Hauptursache für krebsbedingte Todesfälle in dieser Altersgruppe. Es gibt über 100 Arten von Gehirntumoren bei Kindern, und diese Tumoren unterscheiden sich ziemlich von denen bei Erwachsenen. Obwohl die Überlebensrate für pädiatrische Gehirntumoren über fünf Jahre bei 75 % liegt, stehen viele Überlebende weiterhin vor den Herausforderungen, die sowohl vom Tumor als auch von den Behandlungen stammen, die sie erhalten haben. Diese Situation zeigt, dass wir dringend mehr über die Funktionsweise dieser Tumoren lernen müssen und neue Behandlungsoptionen brauchen, um die Überlebensraten und die Lebensqualität für die Patienten und ihre Familien zu verbessern.

Genetische Veränderungen bei pädiatrischen Gehirntumoren

Krebs geht oft mit Veränderungen in den Genen einher. Diese Veränderungen können sehr klein sein, wie einzelne Nukleotidvarianten (SNVs), oder grösser, wie Kopienzahlvarianten (CNVs) und Strukturelle Variationen (SVs). Pädiatrische Gehirntumoren haben im Vergleich zu anderen Kinderkrebserkrankungen tendenziell weniger kleine genetische Änderungen (SNVs), dafür aber mehr grössere strukturelle Veränderungen (SVs). Zu den strukturellen Variationen gehören Dinge wie DNA-Deletionen, Duplikationen und DNA-Umordnungen. Eine spezielle Form der strukturellen Variation, die als Chromothripsis bekannt ist, tritt auf, wenn ein katastrophales Ereignis viele Veränderungen während eines Zellzyklus verursacht.

Durch das Lernen über diese genetischen Veränderungen hoffen Forscher, Einblicke in die Ursachen dieser Tumoren und wirksame Behandlungsmöglichkeiten zu gewinnen. Zum Beispiel wurden Translokationen (eine andere Art von struktureller Veränderung) mit bestimmten Arten von Blutkrebs in Verbindung gebracht und können krebserregende Gene aktivieren. Ähnlich zeigen spezifische Mutationen in Genen wie BRCA1 und BRCA2 bei Brust- und Eierstockkrebs, wie bestimmte Tumoren mit gezielten Therapien behandelt werden können.

Wichtige Erkenntnisse aus Studien zu pädiatrischen Gehirntumoren

Neuere Studien haben einen genaueren Blick auf die Struktur pädiatrischer Gehirntumoren geworfen. Eine grosse Datenbank namens Pediatric Brain Tumor Atlas hat über 1.000 Tumoren aus mehr als 30 verschiedenen Typen gesammelt. Nach dem Herausfiltern irrelevanter Proben haben die Forscher 744 Tumoren genau untersucht, wobei sie sich auf die mit mindestens zehn Proben konzentrierten.

Die Analyse dieser Tumoren zeigte eine signifikante Vielfalt in der Anzahl und den Arten struktureller Veränderungen, die in verschiedenen Tumorkategorien vorhanden sind. Hochgradige Gliome hatten die meisten strukturellen Veränderungen, während einige Tumoren, wie z. B. Choroidplexus-Papillome, überhaupt keine zeigten. Es wurde klar, dass bestimmte Tumortypen eine höhere Neigung hatten, Veränderungen in ihrer DNA-Struktur zu durchlaufen als andere.

Komplexe strukturelle Variationen

Komplexe strukturelle Variationen sind solche mit mehreren Veränderungspunkten und können gruppierte oder weniger gruppierte Veränderungen beinhalten. Forscher fanden verschiedene Signaturen dieser komplexen Variationen. Einige Typen, wie hochgradige Gliome, hatten spezifische Muster komplexer struktureller Veränderungen. Andere Tumortypen hatten viel weniger komplexe Veränderungen.

Gruppierte komplexe Variationen wurden mit bestimmten Mechanismen genetischer Veränderungen in Verbindung gebracht, wie solchen, die zirkuläre DNA oder strukturelle Veränderungen in spezifischen Regionen des Genoms betreffen. Das Vorhandensein bestimmter Signaturen dieser Variationen könnte helfen, das Tumorverhalten vorherzusagen und gezielte Behandlungsansätze zu unterstützen.

Einfache strukturelle Variationen

Neben komplexen Veränderungen konzentrierte sich die Studie auch auf einfachere strukturelle Variationen. Dazu gehörten Deletionen, Duplikationen und Umordnungen kleinerer DNA-Abschnitte. Die Forscher identifizierten neun unterschiedliche Typen einfacher struktureller Variationen, die jeweils mit ihrer Häufigkeit und Verteilung über verschiedene Tumortypen einhergingen.

Bestimmte Tumoren, wie niedriggradige astrozytäre Tumoren, wiesen spezifische Muster einfacher Variationen auf. Ein bemerkenswerter Fingerabdruck, bekannt als "BRAF-Fusion", wurde überwiegend in niedriggradigen astrozytären Tumoren gefunden, was auf ein mögliches Ziel für die Therapie hinweist.

Genomische Merkmale und ihre Verbindung zu strukturellen Variationen

Strukturelle Variationen treten nicht zufällig im Genom auf. Stattdessen können bestimmte genomische Eigenschaften, wie der Zeitpunkt der DNA-Replikation und das Vorhandensein bestimmter DNA-Sequenzen, beeinflussen, wo diese Änderungen stattfinden. Die Forscher untersuchten 31 verschiedene genomische Merkmale, um zu verstehen, wie sie mit strukturellen Variationen bei pädiatrischen Gehirntumoren zusammenhängen.

Die Studie ergab, dass spezifische Signaturen struktureller Variationen häufig mit spät replizierenden Regionen des Genoms verknüpft waren. Auf der anderen Seite wurden einzigartige Assoziationen für einige Variationen beobachtet, die bei Erwachsenen nicht gesehen werden, was auf unterschiedliche zugrunde liegende Mechanismen für pädiatrische Tumoren hindeutet.

Patientenüberleben und strukturelle Variationen

Es ist auch wichtig zu sehen, wie diese strukturellen Variationen die Ergebnisse für die Patienten beeinflussen. Während Chromothripsis und andere komplexe Variationen zuvor mit schlechtem Überleben bei Erwachsenen in Verbindung gebracht wurden, fand die aktuelle Forschung kein ähnliches Muster bei pädiatrischen Gehirntumoren. Stattdessen waren bestimmte einfache strukturelle Variationen mit schlechteren Ergebnissen bei hochgradigen Gliomen verknüpft, was darauf hindeutet, dass die Mechanismen struktureller Variationen bei bestimmten Tumortypen aktiver sein könnten.

Fazit

Die Ergebnisse dieser umfassenden Studie zu pädiatrischen Gehirntumoren heben die Komplexität und Vielfalt genetischer Veränderungen in diesen Tumoren hervor. Das Verständnis der verschiedenen Arten struktureller Variationen, sowohl komplex als auch einfach, kann wertvolle Einblicke in die Biologie pädiatrischer Gehirntumoren bieten. Dieses Wissen kann letztendlich zu besseren Behandlungsstrategien und verbesserten Ergebnissen für junge Patienten führen, die mit diesen herausfordernden Bedingungen konfrontiert sind.

Die Zukunft der Forschung zu pädiatrischen Gehirntumoren liegt darin, diese genetischen Veränderungen weiter zu erkunden und herauszufinden, wie sie das Tumorverhalten und das Überleben der Patienten beeinflussen. Eine verstärkte Zusammenarbeit und der Austausch von Daten zwischen den Forschern werden entscheidend sein, um neue Erkenntnisse zu gewinnen, die klinische Entscheidungen leiten und letztendlich das Leben von Kindern verbessern können, die mit diesen Tumoren diagnostiziert werden.

Originalquelle

Titel: Somatic structural variation signatures in pediatric brain tumors

Zusammenfassung: Brain cancer is the leading cause of cancer-related death in children. Somatic structural variations (SVs), large scale alterations in DNA, remain poorly understood in pediatric brain tumors. Here, we detect a total of 13,199 high confidence somatic SVs in 744 whole-genome-sequenced pediatric brain tumors from Pediatric Brain Tumor Atlas. The somatic SV occurrences have tremendous diversity among the cohort and across different tumor types. We decompose mutational signatures of clustered complex SVs, non-clustered complex SVs, and simple SVs separately to infer the mutational mechanisms of SV formation. Our finding of many tumor types carrying unique sets of SV signatures suggests that distinct molecular mechanisms are active in different tumor types to shape genome instability. The patterns of somatic SV signatures in pediatric brain tumors are substantially different from those in adult cancers. The convergence of multiple signatures to alter several major cancer driver genes suggesting the functional importance of somatic SVs in disease progression.

Autoren: Lixing Yang

Letzte Aktualisierung: 2023-05-26 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.05.18.23290139

Quell-PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.05.18.23290139.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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