Umgang mit fehlenden Daten in klinischen Studien
In diesem Artikel geht's um die Auswirkungen von fehlenden Daten auf die Ergebnisse klinischer Forschung.
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Inhaltsverzeichnis
Klinische Studien basieren oft auf Daten, die von Patienten gesammelt werden, um herauszufinden, wie effektiv Behandlungen sind. Allerdings können dabei einige Herausforderungen auftreten, insbesondere wenn Daten fehlen. Fehlende Daten können die Ergebnisse verzerren und es schwer machen, die echten Effekte von Behandlungen zu erkennen. Dieser Artikel beleuchtet, wie fehlende Daten klinische Studien beeinflussen, besonders in einer multizentrischen Studie zu Endometriumkarzinom.
Was sind fehlende Daten?
Fehlende Daten treten auf, wenn bestimmte Informationen nicht verfügbar sind. In klinischen Studien kann das aus verschiedenen Gründen passieren. Zum Beispiel könnte ein Patient einen Test auslassen oder einige Daten könnten verloren gehen. Es gibt drei Haupttypen von fehlenden Daten:
Vollständig zufällig fehlend (MCAR): Das Fehlen hat keine Beziehung zu den Daten oder den Ergebnissen. Diese Form ist am wenigsten besorgniserregend.
Zufällig fehlend (MAR): Das Fehlen ist mit anderen beobachteten Daten, aber nicht mit den fehlenden Daten selbst verbunden. Zum Beispiel könnten ältere Patienten bestimmte Tests häufiger auslassen als jüngere, was allerdings die Ergebnisse dieser Tests nicht beeinflusst.
Nicht zufällig fehlend (MNAR): Das Fehlen steht in Beziehung zu den fehlenden Daten selbst. Beispielsweise könnten Patienten mit schwereren Symptomen weniger wahrscheinlich bestimmten Tests unterzogen werden.
In der klinischen Forschung ist MNAR recht häufig und kann die Ergebnisse erheblich beeinflussen.
Warum sind fehlende Daten ein Problem?
Wenn Daten fehlen, kann das zu Verzerrungen in den Ergebnissen führen. Wenn die Analyse die fehlenden Daten nicht genau berücksichtigt, können die Ergebnisse zu falschen Schlussfolgerungen über Behandlungen führen. Wenn zum Beispiel eine Studie zu dem Schluss kommt, dass eine bestimmte Behandlung sehr effektiv ist, basierend auf unvollständigen Daten, könnte das Ärzte und Patienten in die Irre führen.
Aktuelle Methoden zum Umgang mit fehlenden Daten
Forscher nutzen typischerweise verschiedene Methoden, um mit fehlenden Daten umzugehen, wobei sie oft Annahmen darüber treffen, warum die Daten fehlen. Diese Methoden umfassen:
Einfache Imputation: Fehlende Werte werden mit einer einzigen Schätzung ausgefüllt. Das kann zu übermässigem Vertrauen in die Ergebnisse führen, da die Unsicherheit der imputierten Werte nicht berücksichtigt wird.
Multiple Imputation: Hierbei werden mehrere plausible Datensätze erzeugt, indem die fehlenden Werte mehrfach ausgefüllt und dann die Ergebnisse gemittelt werden. Diese Methode ist besser als die einfache Imputation, basiert aber immer noch auf Annahmen, die möglicherweise nicht zutreffen.
Die meisten Methoden gehen davon aus, dass die Daten entweder MCAR oder MAR sind. Wenn diese Annahmen jedoch falsch sind, können die aus der Studie gezogenen Schlussfolgerungen verzerrt sein.
Kausale Entdeckung: Ein neuer Ansatz
Kausale Entdeckung ist eine Methode, die darauf abzielt, die Beziehungen zwischen verschiedenen Variablen zu ermitteln, ohne zu viele Annahmen über die fehlenden Daten zu treffen. Sie hilft, ein kausales Diagramm zu erstellen, das zeigt, wie verschiedene Faktoren miteinander in Beziehung stehen.
In der Studie zum Endometriumkarzinom wollten die Forscher beispielsweise verstehen, wie verschiedene Faktoren wie Tumorgrad und Behandlungsart die Ergebnisse der Patienten, wie Überlebensraten und das Vorhandensein von Lymphknotenmetastasen (LNM), beeinflussen.
Was sind kausale Diagramme?
Ein kausales Diagramm ist eine visuelle Darstellung, wie verschiedene Faktoren einander beeinflussen. Im Kontext einer Krebsstudie könnten diese Faktoren die Art der erhaltenen Behandlung, die Eigenschaften des Tumors und ob der Krebs auf Lymphknoten übergegriffen hat, umfassen.
Das Diagramm hat typischerweise zwei Arten von Variablen:
Vollständig beobachtete Variablen: Das sind Faktoren, für die vollständige Daten vorliegen.
Latente Variablen: Das sind Faktoren, die nicht direkt beobachtet werden, aber die beobachteten Faktoren beeinflussen können.
Fehlendenheitsdiagramme
Zusätzlich zu kausalen Diagrammen können Forscher Fehlendenheitsdiagramme erstellen. Diese Diagramme zeigen, wie die fehlenden Daten mit den beobachteten Daten zusammenhängen und können helfen, die durch fehlende Daten eingeführten Verzerrungen zu klären.
Verständnis der d-Trennung
D-Trennung ist ein Konzept, das hilft zu erkennen, ob eine Gruppe von Variablen den Informationsfluss zwischen zwei anderen Variablen im Diagramm blockiert oder erlaubt. Wenn eine Variable alle Wege zwischen zwei anderen blockiert, deutet das darauf hin, dass das Wissen über die blockierte Variable keine zusätzlichen Informationen über die Beziehung zwischen den anderen beiden liefert.
Praktische Anwendung: Eine Studie zum Endometriumkarzinom
In einer aktuellen Studie mit 763 Patienten mit Endometriumkarzinom aus verschiedenen Kliniken in Europa wählten Experten wichtige Variablen zur Analyse aus. Dazu gehörten Tumoreigenschaften, Behandlungsarten und verschiedene Biomarker, die mit dem Verhalten des Krebses und den Ergebnissen der Patienten in Verbindung stehen.
Die Forscher verwendeten sowohl einfache als auch multiple Imputationsmethoden basierend auf MAR-Annahmen und führten einen neuen Ansatz ein, der MNAR-Annahmen ermöglicht. Diese neue Methode zielt darauf ab, Verzerrungen zu korrigieren, die aufgrund fehlender Daten auftreten können.
Vergleich verschiedener Methoden
Um zu bewerten, wie gut diese Methoden funktionierten, verglichen die Forscher die kausalen Diagramme, die unter verschiedenen Annahmen erstellt wurden. Sie schauten sich an, wie genau die Diagramme die Beziehungen zwischen den Variablen darstellten und wie gut sie zu den tatsächlichen Daten passten.
Die Studie ergab, dass die Annahme von MNAR ein besseres Ergebnis für die Daten lieferte im Vergleich zu MAR-Methoden. Das deutet darauf hin, dass die fehlenden Daten in diesem Fall wahrscheinlich mit den fehlenden Beobachtungen in Zusammenhang standen, was zu genaueren Schlussfolgerungen über die Beziehungen zwischen den Variablen führte.
Klinische Implikationen der Ergebnisse
Die Ergebnisse der Studie haben erhebliche Auswirkungen auf die klinische Praxis. Zu verstehen, welche Faktoren wirklich relevant für die Ergebnisse der Patienten sind, kann die Behandlungsentscheidungen leiten. Wenn zum Beispiel bestimmte Biomarker gefunden werden, die eng mit LNM verbunden sind, kann diese Information zu gezielteren Test- und Behandlungsstrategien führen.
Herausforderungen in der Zukunft
Trotz der Fortschritte im Umgang mit fehlenden Daten bleiben Herausforderungen bestehen. Künftige Forschungen müssen weiterhin untersuchen, wie verschiedene Arten von Fehlenden Auswirkungen auf klinische Ergebnisse und Entscheidungen haben. Dazu gehört auch die Untersuchung, wie durch fehlende Daten eingeführte Verzerrungen mit versteckten und Auswahlvariablen überlappen.
Fazit
Fehlende Daten sind ein häufiges Problem in klinischen Studien und können zu irreführenden Schlussfolgerungen führen, wenn sie nicht richtig behandelt werden. Durch den Einsatz von Methoden zur kausalen Entdeckung und die Erstellung von Fehlendenheitsdiagrammen können Forscher die Beziehungen zwischen Variablen und die Auswirkungen fehlender Daten besser verstehen. Dieser Ansatz ist entscheidend für informierte klinische Entscheidungen und die Verbesserung der Patientenversorgung.
Die fortlaufende Verfeinerung dieser Methoden wird helfen, die Herausforderungen, die durch fehlende Daten entstehen, anzugehen und die Qualität klinischer Forschung zu verbessern.
Titel: The Impact of Missing Data on Causal Discovery: A Multicentric Clinical Study
Zusammenfassung: Causal inference for testing clinical hypotheses from observational data presents many difficulties because the underlying data-generating model and the associated causal graph are not usually available. Furthermore, observational data may contain missing values, which impact the recovery of the causal graph by causal discovery algorithms: a crucial issue often ignored in clinical studies. In this work, we use data from a multi-centric study on endometrial cancer to analyze the impact of different missingness mechanisms on the recovered causal graph. This is achieved by extending state-of-the-art causal discovery algorithms to exploit expert knowledge without sacrificing theoretical soundness. We validate the recovered graph with expert physicians, showing that our approach finds clinically-relevant solutions. Finally, we discuss the goodness of fit of our graph and its consistency from a clinical decision-making perspective using graphical separation to validate causal pathways.
Autoren: Alessio Zanga, Alice Bernasconi, Peter J. F. Lucas, Hanny Pijnenborg, Casper Reijnen, Marco Scutari, Fabio Stella
Letzte Aktualisierung: 2023-11-03 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://arxiv.org/abs/2305.10050
Quell-PDF: https://arxiv.org/pdf/2305.10050
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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