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# Biologie# Entwicklungsbiologie

Zellen und ihre einzigartigen Rollen in der Entwicklung

Entdecke, wie Zellen ihre Funktionen durch Genexpression und Epigenetik entscheiden.

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Inhaltsverzeichnis

Jedes lebende Wesen startet als eine einzelne Zelle, die Zygote heisst. Wenn sie wächst, teilt sich diese Zelle viele Male und kreiert mehr Zellen, die schliesslich verschiedene Körperteile bilden, wie Organe und Gewebe. Jede Zelle ist einzigartig und hat eine spezifische Aufgabe, obwohl sie alle von dieser einen ursprünglichen Zelle stammen. Das wirft eine wichtige Frage auf: Wie entscheiden die Zellen, was ihre Aufgabe sein wird?

Die Antwort liegt in einem Prozess, der Genexpression heisst. Jede Zelle entscheidet, welche Gene aus ihrer DNA sie zu einem bestimmten Zeitpunkt und an einem bestimmten Ort nutzen will. Dieser Prozess wird streng kontrolliert. Es gibt viele Faktoren, die beeinflussen, wie Gene aktiviert oder deaktiviert werden, und dazu gehört auch etwas, das Epigenetik genannt wird.

Was ist Epigenetik?

Epigenetik bezieht sich auf Veränderungen in der Genaktivität einer Zelle, die nicht die DNA-Sequenz selbst ändern. Diese Veränderungen können sich darauf auswirken, wie Zellen sich verhalten. Zum Beispiel können zwei Zellen mit derselben DNA ganz anders agieren wegen epigenetischer Faktoren. Das kann durch verschiedene Mechanismen passieren, darunter:

  • DNA-Methylierung: Ein Prozess, bei dem kleine chemische Gruppen an die DNA angehängt werden, was die Genaktivität beeinflusst.
  • Histonmodifikationen: Proteine, die Histone heissen, helfen dabei, DNA zu verpacken. Ihre chemischen Markierungen können beeinflussen, wie fest oder locker die DNA gewickelt ist, was die Genexpression beeinflusst.
  • Histonvarianten: Unterschiedliche Formen von Histonen können zu unterschiedlicher Genaktivität führen.
  • Nicht-codierende RNAs: Das sind RNA-Moleküle, die nicht für Proteine kodieren, aber die Genregulation beeinflussen können.

Bedeutung der Epigenetik in der Entwicklung

Diese epigenetischen Veränderungen sind entscheidend für das, was als "epigenetisches Gedächtnis" bezeichnet wird. Das bedeutet, dass eine Zelle, die eine bestimmte Aufgabe übernommen hat, diese Identität während ihres Lebens beibehalten kann, auch wenn sie sich teilt und mehr Zellen schafft. Epigenetische Veränderungen sind auch wichtig für die Entwicklung, die Aufrechterhaltung der Körperfunktionen und Heilungsprozesse.

Eine gängige Methode, um zu untersuchen, wie Zellen unterschiedliche Wege einschlagen, ist ein Prozess namens Asymmetrische Zellteilung (ACD). Bei ACD teilt sich eine Zelle, um zwei Tochterzellen zu bilden, die nicht identisch sind. Das bedeutet, sie können unterschiedliche Rollen oder Schicksale annehmen, obwohl sie von derselben Mutterzelle stammen.

Die Rolle von DNA-Schäden in der Zellteilung

Interessanterweise haben aktuelle Studien gezeigt, dass DNA-Schäden auch beeinflussen können, wie Zellen sich teilen. Normalerweise teilen sich Zellen symmetrisch, was bedeutet, dass beide Tochterzellen ähnlicher sind. Wenn jedoch DNA-Schäden auftreten, kann das ACD auslösen, was zu unterschiedlichen Schicksalen für die Tochterzellen führt. Das deutet darauf hin, dass Veränderungen an der DNA beeinflussen können, wie Zellen ihre Eigenschaften erben, nicht nur ihre genetischen Informationen.

Erforschung der Histonvererbungsmuster

Um weiter zu untersuchen, wie Zellen spezifische Eigenschaften während ACD erben, haben Forscher Techniken entwickelt, um alte und neue Histone zu markieren. In einer Studie mit der Fruchtfliege Drosophila bemerkten die Wissenschaftler, dass während der ACD in männlichen Keimbahn-Stammzellen ältere Histone eher in der ursprünglichen Stammzelle blieben, während neue Histone in der Tochterzelle gefunden wurden, die sich schliesslich in einen bestimmten Zelltyp differenzieren würde.

Bei symmetrischen Teilungen, wie bei Vorläuferzellen, wurden jedoch sowohl alte als auch neue Histone gleichmässig zwischen den Tochterzellen verteilt. Die Forscher schlugen vor, dass asymmetrische Histonvererbung mehrere Schritte umfasst. Zuerst werden alte und neue Histone unterschiedlich auf den Schwesterchromatiden (den beiden Kopien eines Chromosoms, die entstehen, wenn sich eine Zelle teilt) eingebaut. Das kann aufgrund von Unterschieden in der Art, wie DNA kopiert wird, passieren. Dann werden die unterschiedlichen Chromatiden während der Zellteilung erkannt und getrennt, was dazu führt, dass jede Tochterzelle unterschiedliche Histoninformationen erhält.

Offene Fragen in der Forschung

Trotz dieses Verständnisses gibt es immer noch wichtige Fragen. Zum Beispiel wollen Forscher wissen, welche spezifischen molekularen Mechanismen dafür sorgen, dass alte und neue Histone während der DNA-Replikation unterschiedlich eingebaut werden. Während sich Studien darauf konzentriert haben, wie diese Mechanismen in einzelligen Organismen funktionieren, gibt es viel weniger Informationen darüber, wie sie in mehrzelligen Organismen wie Fruchtfliegen funktionieren.

Eine weitere Frage ist, wie sich diese Prozesse über verschiedene Entwicklungsstufen innerhalb derselben Zelllinie ändern. Warum werden Histone zum Beispiel in Stammzellen anders vererbt als in Vorläuferzellen?

Identifizierung von Schlüsselfaktoren in der asymmetrischen Histonvererbung

Um diese Fragen zu untersuchen, schauten Forscher sich an, welche Proteine an der DNA-Replikation beteiligt sind und wie deren Mengen zwischen Keimbahn-Stammzellen und Vorläuferzellen variieren. Sie fanden heraus, dass spezifische Replikationskomponenten, insbesondere die, die für die Kopie des verzögerten DNA-Strangs verantwortlich sind, in Stammzellen weniger vorhanden waren als in Vorläuferzellen.

Dies führte die Forscher zu der Spekulation, dass niedrigere Mengen dieser Verzögerungsstrang-Polymerasen in Stammzellen zu einer langsameren Replikation auf dieser Seite führen könnten, was mehr Zeit geben würde, alte Histone in den neuen DNA-Strang zu recyceln, während der führende Strang synthetisiert wird.

Untersuchung von alten und neuen Histonmustern in Zellen

Durch die sorgfältige Untersuchung von Zellen mit einem Dual-Farben-Markierungssystem fanden die Forscher heraus, dass in Stammzellen die Trennung zwischen alten und neuen Histonen erheblich war. Im Gegensatz dazu war diese Trennung in Vorläuferzellen nicht so ausgeprägt. Das zeigt ein klares Muster der asymmetrischen Histonvererbung in den Stammzellen und gab Einblicke, wie Zellen sich differenzieren könnten.

Um ihre Hypothesen weiter zu testen, manipulierten Wissenschaftler die Mengen bestimmter DNA-Replikationskomponenten. Eine Reduzierung der Mengen der Verzögerungsstrang-Polymerase führte zu einer Erhöhung der Trennung zwischen alten und neuen Histonen, was zeigte, dass diese Komponenten eine wichtige Rolle bei der Aufrechterhaltung der Asymmetrie in der Histonvererbung spielen.

Die Rolle von RPA in der asymmetrischen Vererbung

Die Forscher betrachteten auch die Rolle von RPA (Replikationsprotein-A), einem Protein, das hilft, einzelsträngige DNA zu stabilisieren. Sie fanden heraus, dass höhere Mengen an RPA in Stammzellen dazu beitragen könnten, alte Histone mit dem führenden Strang zu verbinden, was das beobachtete asymmetrische Muster verstärkt.

Unterschiede in den Chromatin-Kondensationsmustern

In Zellen, die sich teilen, bemerkten die Forscher Unterschiede darin, wie fest oder locker Chromatin (die Struktur, die DNA verpackt) in Stammzellen im Vergleich zu Vorläuferzellen organisiert war. In Stammzellen war das Chromatin, das mit alten Histonen assoziiert war, kompakter als das von neuen Histonen. Bei Vorläuferzellen war diese Kompaktheit jedoch nicht zu erkennen. Als die Forscher die Mengen der Verzögerungsstrang-Polymerasen in Vorläuferzellen reduzierten, beobachteten sie Veränderungen, die den Mustern in Stammzellen ähnelten, was darauf hindeutet, dass dieses Merkmal von den Mengen spezifischer Replikationsproteine beeinflusst werden könnte.

Zeitliche Unterschiede in der DNA-Synthese

Die Forscher wollten auch untersuchen, wie der führende und der verzögerte Strang während der DNA-Replikation synthetisiert wurden. Sie führten Experimente durch, um zu sehen, ob diese Prozesse zeitlich eng verbunden waren. Es stellte sich heraus, dass in bestimmten Fällen der führende Strang schneller synthetisiert wird als der verzögerte Strang. Das bedeutet, dass die alten Histone eine höhere Chance haben, sich mit dem führenden Strang zu verbinden, was zu der beobachteten Asymmetrie führt.

Fazit

Die Studie enthüllt einen wichtigen Mechanismus, wie Zellen während der Entwicklung unterschiedliche Rollen übernehmen können, trotz des Teilens des gleichen genetischen Materials. Durch das Verständnis, wie alte und neue Histone unterschiedlich vererbt werden, können die Forscher Einblicke in die grundlegenden Prozesse der Zelldifferenzierung gewinnen und wie diese Muster das Wachstum und die Heilung von Organismen beeinflussen.

Die Forscher hoffen, diese Mechanismen in verschiedenen Organismen weiter zu erkunden, um zu sehen, wie sie in unterschiedlichen biologischen Kontexten angewendet werden könnten. Dieses Verständnis könnte zu Fortschritten in der Behandlung und regenerativen Medizin führen und dabei helfen, breitere biologische Prinzipien zu entwickeln, die die Entwicklung vieler lebender Kreaturen steuern.

Originalquelle

Titel: Reduced Levels of Lagging Strand Polymerases Shape Stem Cell Chromatin

Zusammenfassung: Stem cells display asymmetric histone inheritance while non-stem progenitor cells exhibit symmetric patterns in the Drosophila male germline lineage. Here, we report that components involved in lagging strand synthesis, such as DNA polymerase and {delta} (Pol and Pol{delta}), have significantly reduced levels in stem cells compared to progenitor cells. Compromising Pol genetically induces the replication-coupled histone incorporation pattern in progenitor cells to be indistinguishable from that in stem cells, which can be recapitulated using a Pol inhibitor in a concentration-dependent manner. Furthermore, stem cell-derived chromatin fibers display a higher degree of old histone recycling by the leading strand compared to progenitor cell-derived chromatin fibers. However, upon reducing Pol levels in progenitor cells, the chromatin fibers now display asymmetric old histone recycling just like GSC-derived fibers. The old versus new histone asymmetry is comparable between stem cells and progenitor cells at both S-phase and M-phase. Together, these results indicate that developmentally programmed expression of key DNA replication components is important to shape stem cell chromatin. Furthermore, manipulating one crucial DNA replication component can induce replication-coupled histone dynamics in non-stem cells in a manner similar to that in stem cells. One Sentence SummaryDelayed lagging strand synthesis regulates asymmetric histone incorporation.

Autoren: Xin Chen, J. Snedeker, B. E. M. Davis, R. Ranjan, M. I. Wooten, J. Blundon

Letzte Aktualisierung: 2024-04-29 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.26.591383

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.26.591383.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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