Wie Pflanzen Rezeptor-Kinasen für ihre Immunität nutzen
Pflanzen nutzen Rezeptor-Kinasen, um ihr Wachstum zu steuern und sich gegen Infektionen zu verteidigen.
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Inhaltsverzeichnis
Pflanzen und Tiere reagieren auf Signale von ausserhalb ihrer Zellen auf verschiedene Arten. Bei Tieren spielen eine Gruppe von Proteinen, die G-Protein-gekoppelte Rezeptoren genannt werden, eine grosse Rolle in diesem Prozess. Bei Pflanzen stehen zwei andere Arten von Rezeptoren, bekannt als Rezeptor-Kinasen und Rezeptor-Proteine, im Mittelpunkt. Diese Rezeptoren helfen Pflanzen, verschiedene Signale wahrzunehmen, was ihnen wiederum hilft, zu wachsen, sich zu entwickeln und sich gegen Infektionen zu wehren.
Rezeptor-Kinasen in Pflanzen
Rezeptor-Kinasen in Pflanzen funktionieren oft, indem sie Proteine oder kleine Stücke von Proteinen, die Peptide genannt werden, wahrnehmen. Wenn sie diese Signale erkennen, lösen sie eine Reihe von Aktionen innerhalb der Pflanzenzelle aus. Eine gut erforschte Art von Rezeptor-Kinase in Arabidopsis, einer häufig verwendeten Pflanze in der Forschung, heisst Leucin-reiche Wiederholungs-Rezeptor-Kinase (LRR-RK).
LRR-RKs können verschiedene Signale erkennen, wie zum Beispiel solche, die Wachstum anzeigen oder während Schäden oder Infektionen auftreten. Wenn sie an diese Signale binden, rekrutieren sie andere Proteine, die Co-Rezeptor-Kinasen genannt werden, um einen Komplex zu bilden. Dieser Komplex hilft dabei, das Signal weiterzugeben und verschiedene Reaktionen innerhalb der Pflanze zu aktivieren.
Beispiel: BRI1
Eine der am meisten untersuchten LRR-RKs ist BRI1, die der Pflanze hilft, auf ein Hormon namens Brassinosteroid zu reagieren. Wenn Brassinosteroid vorhanden ist, geht BRI1 eine Partnerschaft mit Co-Rezeptor-Kinasen ein, was zu einer Kettenreaktion führt, die der Pflanze hilft, ihre Reaktion zu signalisieren. Das BRI1-Protein und sein Co-Rezeptor arbeiten zusammen, um sich gegenseitig zu aktivieren, was hilft, das Signal weiter in die Zelle zu verbreiten.
Immunantwort
EFR undEine weitere wichtige LRR-RK ist EFR. EFR ist bekannt für seine Rolle in der Pflanzenimmunität. Es erkennt ein spezifisches Signal (ein Peptid) von Bakterien und löst eine Immunantwort aus. Wenn EFR dieses Signal wahrnimmt, bildet es ebenfalls einen Komplex mit seinem Co-Rezeptor, der wiederum hilft, das Signal zu verstärken, das zur Immunantwort führt.
Diese Immunantwort umfasst mehrere wichtige Aktionen, wie die Erzeugung von reaktiven Sauerstoffspezies, den Einstrom von Calcium-Ionen und verschiedene Veränderungen in der Genexpression. Diese Aktionen helfen der Pflanze, sich gegen potenzielle Infektionen zu verteidigen.
Phosphorylierung in Rezeptor-Kinasen
Phosphorylierung ist ein wichtiger Prozess für diese Rezeptor-Kinasen, bei dem spezifische Teile der Proteine mit Phosphatgruppen modifiziert werden. Diese Modifikation ist entscheidend für ihre Fähigkeit, korrekt zu funktionieren. Für EFR wurden bestimmte Phosphorylierungsstellen identifiziert, die wichtig für seine Funktion im Immunsignal sind.
Forscher haben herausgefunden, dass bestimmte Serin- und Tyrosinreste in EFR phosphoryliert werden müssen, damit es effektiv signalisieren kann. Auch wenn EFR ohne eigene enzymatische Aktivität signalisieren kann (also keine Phosphatgruppen zu sich selbst hinzufügen muss), benötigt es dennoch diese Phosphorylierungen, um seine Immunfunktionen auszuführen.
Die Rolle von EFR in der Signalgebung
Wenn EFR das bakterielle Signal erkennt, bildet es einen Komplex mit seinem Co-Rezeptor BAK1. Diese Interaktion hilft EFR, mehrere nachgeschaltete Proteine zu aktivieren, die wichtig für eine ordnungsgemässe Immunantwort sind.
Zwei Schlüsselproteine, mit denen EFR kommuniziert, heissen BIK1 und PBL1. Sobald sie aktiviert sind, helfen diese Proteine, das Signal von EFR in der Pflanzenzelle zu verbreiten. Diese Ausbreitung des Signals führt zu verschiedenen Immunantworten, wie der Produktion von reaktiven Sauerstoffspezies, um die eindringenden Bakterien anzugreifen.
Experimenteller Ansatz
Um ein tieferes Verständnis dafür zu erlangen, wie EFR funktioniert, haben Wissenschaftler verschiedene Hypothesen durch unterschiedliche experimentelle Methoden getestet. Einer der Schlüsselansätze war es, EFR und BAK1 künstlich im Labor zusammenzubringen. Dies wurde mit einer Technik durchgeführt, die Dimerisierung induziert, also das Zusammenbinden von zwei Proteinen erzwingt.
Als diese Bindung auftrat, beobachteten die Forscher eine gesteigerte Aktivität des Co-Rezeptors BAK1. Die Experimente zeigten, dass selbst EFR, das normalerweise keine katalytische Aktivität hat, trotzdem die Fähigkeit von BAK1 erhöhen konnte, seine Zielproteine zu phosphorylieren.
Untersuchung der Struktur von EFR
Durch weitere Methoden schauten sich Wissenschaftler an, wie bestimmte Mutationen die Struktur von EFR beeinflussten. Mit Hilfe fortschrittlicher Analysetechniken bestätigten sie, dass spezifische Mutationen innerhalb von EFR die Fähigkeit störten, die aktive Struktur anzunehmen, die für die Signalgebung notwendig ist.
Besonders die Änderung im Y836-Rest von EFR schien eine entscheidende Rolle dabei zu spielen, wie sich die Kinase-Domäne verhielt. Mutationen in diesem Bereich beeinflussten, wie EFR die Aktivität von BAK1 regulieren konnte. Die Ergebnisse deuteten darauf hin, dass EFR, um BAK1 effektiv zu aktivieren, eine ordentliche Konformation beibehalten muss.
Aktivierungsmechanismus von BAK1
Die Forschung zeigte, dass EFR eine wichtige Rolle bei der "allosterischen" Aktivierung von BAK1 spielt, was bedeutet, dass EFR hilft, die Form von BAK1 zu ändern, um seine Aktivität zu steigern, ohne es direkt mit einer Phosphatgruppe zu modifizieren.
Selbst wenn bestimmte Teile von EFR mutiert wurden, um seine katalytische Wirkung zu verhindern, konnte es trotzdem die Aktivität von BAK1 steigern. Diese Erkenntnis unterstrich, dass die Hauptaufgabe von EFR nicht nur im Signalisieren besteht, sondern auch darin, die Aktivitätsniveaus von Proteinen auf komplexe Weise zu modifizieren.
Auswirkungen auf die Pflanzenschutz
Die Ergebnisse beleuchten, wie Pflanzen ihre Rezeptor-Kinasen nutzen können, um die Immunität zu regulieren. Da EFR durch einen Mechanismus wirkt, der die Aktivität einer anderen Kinase steigert, deutet das darauf hin, dass auch andere Rezeptor-Kinasen ähnlich funktionieren könnten.
Das Verständnis dieser Prozesse kann Forschern helfen, neue Strategien zur Verbesserung der Pflanzenresistenz gegen Krankheiten zu entwickeln. Wenn bestimmte Wege gestärkt werden können, könnte das zur Entwicklung von Nutzpflanzen führen, die besser gegen Infektionen gewappnet sind.
Ausblick
Die Untersuchung von EFR und seiner Beziehung zu BAK1 ist nur ein Teil eines grösseren Puzzles in der Pflanzenimmunität. Weitere Forschungen werden notwendig sein, um die Komplexität dieser Interaktionen vollständig zu verstehen.
Zukünftige Studien könnten andere pflanzliche Rezeptor-Kinasen untersuchen, um zu sehen, ob sie den gleichen allosterischen Aktivierungsmechanismus teilen. Ausserdem könnten strukturelle Biologie und neue molekulare Techniken neue Möglichkeiten eröffnen, zu verstehen, wie sich diese Proteine während der Signalgebung verändern, was Einblicke in ihre Funktionen in der Pflanzenbiologie liefern könnte.
Fazit
Zusammengefasst sind die Interaktionen zwischen EFR und BAK1 entscheidend für die Pflanzenimmunität. Der allosterische Aktivierungsmechanismus, den EFR verwendet, um die Aktivität von BAK1 zu steigern, hebt ein ausgeklügeltes Mass an regulativer Kontrolle in pflanzlichen Signalwegen hervor. Während die Forschung weiter voranschreitet, verspricht sie, unser Wissen über Pflanzenimmunität zu erweitern und wie wir Nutzpflanzen besser vor Krankheiten schützen können.
Titel: Allosteric activation of the co-receptor BAK1 by the EFR receptor kinase initiates immune signaling
Zusammenfassung: Transmembrane signaling by plant receptor kinases (RKs) has long been thought to involve reciprocal trans-phosphorylation of their intracellular kinase domains. The fact that many of these are pseudokinase domains, however, suggests that additional mechanisms must govern RK signaling activation. Non-catalytic signaling mechanisms of protein kinase domainshave been described in metazoans, but information is scarce for plants. Recently, a non-catalytic function was reported for the leucine-rich repeat (LRR)-RK subfamily XIIa member EFR (ELONGATION FACTOR TU RECEPTOR) and phosphorylation-dependent conformational changes were proposed to regulate signaling of RKs with non-RD kinase domains. Here, using EFR as a model, we describe a non-catalytic activation mechanism for LRR-RKs with non-RD kinase domains. EFR is an active kinase, but a kinase-dead variant retains the ability to enhance catalytic activity of its co-receptor kinase BAK1/SERK3 (BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-ASSOCIATED KINASE 1/SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR KINASE 3). Applying hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry (HDX-MS) analysis and designing homology-based intragenic suppressor mutations, we provide evidence that the EFR kinase domain must adopt its active conformation in order to activate BAK1 allosterically, likely by supporting C-helix positioning in BAK1. Our results suggest a conformational toggle model for signaling, in which BAK1 first phosphorylates EFR in the activation loop to stabilize its active conformation, allowing EFR in turn to allosterically activate BAK1.
Autoren: Cyril Zipfel, H. Mühlenbeck, Y. Tsutsui, M. Lemmon, K. W. Bender
Letzte Aktualisierung: 2024-05-08 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.08.23.554490
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.08.23.554490.full.pdf
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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