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# Biologie# Biochemie

Zielgerichtete USP1: Ein neuer Hoffnungsträger in der Krebsbehandlung

Forschung hebt USP1-Hemmer als potenzielle Krebsbehandlungen hervor.

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Ubiquitin-spezifische Protease 1 (USP1) ist ein wichtiger Protein, das hilft, die DNA in unseren Zellen zu erhalten, indem es ein kleines Tag namens Ubiquitin von bestimmten Proteinen entfernt, die an der DNA-Reparatur beteiligt sind. Es arbeitet mit einem anderen Protein namens USP1-assoziierten Faktor 1 (UAF1) zusammen, das seine Aktivität verbessert und sicherstellt, dass es effektiv mit seinen Zielproteinen interagieren kann. Zu den von USP1 angezielten Proteinen gehören die, die während des Reparaturprozesses als Klammern fungieren. Diese Klammern, bekannt als PCNA und FANCI-FANCD2, spielen eine essentielle Rolle bei der Handhabung von DNA-Schäden und sorgen dafür, dass das genetische Material in unseren Zellen intakt bleibt.

Die Aktivität von USP1 ist entscheidend. Wenn zum Beispiel PCNA mit Ubiquitin markiert ist, zieht es Reparaturenzyme an, die mit beschädigter DNA umgehen können. Ähnlich bleibt der FANCI-FANCD2-Komplex, wenn er markiert ist, an der DNA haften, was für eine effektive Reparatur notwendig sein kann. Allerdings kann USP1 diese Tags entfernen, wodurch die Prozesse, die eine DNA-Reparatur ermöglichen, potenziell rückgängig gemacht werden. Diese Fähigkeit von USP1 macht es zu einem Schlüsselspieler im Krebs, da seine Überaktivität oder Regulierung zu Problemen bei der DNA-Reparatur führen kann, was oft bei verschiedenen Krebsarten zu sehen ist.

USP1 als Ziel für die Krebsbehandlung

In letzter Zeit haben Wissenschaftler USP1 als potenzielles Ziel für Krebsbehandlungen ins Auge gefasst. Eine der Strategien, die erkundet wird, ist bekannt als Synthetische Letalität. Dieses Konzept bezieht sich auf die Idee, dass, wenn zwei Proteine oder Gene für das normale Überleben der Zelle nicht entscheidend sind, eine gleichzeitige Störung beider zum Tod der Krebszellen führen kann. Einfach gesagt, wenn ein Weg fehlschlägt, kann das Anvisieren eines anderen, der auch kritisch ist, dazu führen, dass Krebszellen nicht überleben können.

Ein Beispiel für synthetische Letalität in der Krebsbehandlung ist die Verwendung von PARP-Inhibitoren für Patienten mit Mutationen in den BRCA1- oder BRCA2-Genen. Diese Mutationen führen zu Problemen mit der DNA-Reparatur, und wenn PARP-Inhibitoren verwendet werden, nehmen sie den Krebszellen die Fähigkeit, ihre DNA zu reparieren, was zu Zelltod führt. Einige Tumore entwickeln jedoch Resistenzen gegen diese Behandlungen durch verschiedene Mechanismen.

Studien haben gezeigt, dass die Aktivität des USP1-Gens oft höher in vielen Krebserkrankungen ist, was mit einer schlechteren Prognose für die Patienten einhergeht. Besonders einige dieser Tumore haben auch BRCA1-Mutationen. Forschung hat gezeigt, dass das Anvisieren sowohl von USP1 als auch von BRCA1/2 möglicherweise zu einer höheren Wirksamkeit bei der Behandlung bestimmter Tumore führt, insbesondere bei solchen, die resistent gegen Standardtherapien sind.

Aktuell gibt es mehrere Medikamente, die USP1 hemmen, die in klinischen Studien getestet werden, um ihre Wirksamkeit bei der Krebsbehandlung zu bewerten. Diese Medikamente könnten möglicherweise besser wirken, wenn sie zusammen mit PARP-Inhibitoren verwendet werden, besonders bei Tumoren mit Mutationen in BRCA1 oder BRCA2. Dieser kombinierte Ansatz könnte die Resistenzen überwinden, die einige Tumoren gegen PARP-Inhibitoren allein entwickelt haben.

Wirkungsmechanismus der USP1-Inhibitoren

Der erste selektive Inhibitor von USP1, bekannt als ML323, wurde in einem Labor entwickelt. Forscher konnten visualisieren, wie dieser Inhibitor mit USP1, UAF1 und dem FANCI-FANCD2-Protein unter Verwendung fortschrittlicher Bildgebungstechniken interagiert. ML323 bindet an einen spezifischen Bereich von USP1, der nicht sichtbar ist, wenn der Inhibitor nicht vorhanden ist, was bedeutet, dass er das Enzym stabilisiert auf eine Weise, die es daran hindert, richtig zu funktionieren.

Kürzlich wurde ein weiterer Inhibitor namens KSQ-4279 identifiziert. Forscher haben untersucht, wie KSQ-4279 an USP1 bindet und es mit ML323 verglichen. Beide Inhibitoren scheinen die Struktur von USP1 erheblich zu stabilisieren, aber es gibt subtile Unterschiede in der Interaktion mit dem Enzym. Diese Unterschiede könnten die Wirksamkeit und Selektivität beim Anvisieren von USP1 im Vergleich zu anderen verwandten Enzymen beeinflussen.

Testen der Inhibitoren

Um zu bewerten, wie gut ML323 und KSQ-4279 gegen USP1 wirken, haben Wissenschaftler Tests durchgeführt. Sie haben herausgefunden, dass beide Inhibitoren selbst in sehr niedrigen Konzentrationen speziell gegen USP1 wirksam sind im Vergleich zu anderen ähnlichen Enzymen. KSQ-4279 zeigt eine besonders starke Selektivität für USP1, was bedeutet, dass es USP1 viel effektiver anvisiert als andere Enzyme.

In Labor-Assays wurde gezeigt, dass beide Inhibitoren die Aktivität von USP1 fast vollständig blockieren, wenn sie mit relevanten Substraten getestet werden. Dies wurde durch verschiedene Experimente beobachtet, die die Fähigkeit von USP1 massen, an seinen Zielen zu wirken, wenn die Inhibitoren vorhanden waren.

Verständnis der Bindung und strukturellen Veränderungen

Als Forscher untersuchten, wie KSQ-4279 an USP1 bindet, fanden sie heraus, dass es eine strategische Tasche in der Struktur des Proteins besetzt, ähnlich wie ML323. In beiden Fällen verändert die Bindung der Inhibitoren die Position einiger wichtiger Teile des Proteins auf eine Weise, die seine Aktivität verringert. Dies beinhaltet wahrscheinlich eine Verschiebung in der Proteinstruktur, die seine Fähigkeit beeinträchtigt, effektiv mit seinen natürlichen Zielen zu interagieren.

Die Bindung der Inhibitoren beeinflusst auch einen spezifischen Bereich von USP1, der als Mobilized by Inhibitor Region (MIR) bekannt ist. In Anwesenheit der Inhibitoren werden bestimmte Bereiche weniger geordnet, was anzeigt, dass die Inhibitoren die Gesamtform und Stabilität des Proteins beeinflussen. Diese Veränderung kann dazu beitragen, wie gut die Inhibitoren USP1s Funktion blockieren können.

Durch verschiedene Techniken haben Wissenschaftler festgestellt, dass, wenn diese Inhibitoren an USP1 binden, sie wichtige Wechselwirkungen innerhalb des Proteins blockieren, die für seine Aktivität notwendig sind. Dies zeigt, wie sowohl ML323 als auch KSQ-4279 verhindern, dass USP1 normal funktioniert, was entscheidend für ihre potenzielle Verwendung als Krebsbehandlungen ist.

Auswirkungen auf die Selektivität der Inhibitoren

Die unterschiedlichen Weisen, wie ML323 und KSQ-4279 die Struktur von USP1 beeinflussen, geben Aufschluss darüber, warum einer selektiver als der andere sein könnte. KSQ-4279 scheint besser darin zu sein, USP1 spezifisch anzusprechen im Vergleich zu ähnlichen Enzymen wie USP12 und USP46. Diese Selektivität ist wichtig, da sie bedeutet, dass KSQ-4279 weniger wahrscheinlich die Funktionen anderer Proteine stört, was es zu einer potenziell sichereren Wahl für Krebsbehandlungen macht.

Forscher vermuten, dass bestimmte strukturelle Merkmale und Interaktionen von KSQ-4279 es ermöglichen, besser in USP1 zu passen, während sie grössere Störungen in seiner Struktur verursachen. Diese Feinjustierung der Bindungsinteraktionen ist der Schlüssel zur Entwicklung wirksamerer Behandlungen, die Nebenwirkungen minimieren.

Auswirkungen auf die USP1-Funktion und Katalyse

Wichtig ist, dass die Bindung von USP1-Inhibitoren nicht nur die Funktion des Proteins behindert, sondern auch seine aktive Stelle verändert, die für seine Rolle in der DNA-Reparatur entscheidend ist. Wenn USP1 gehemmt wird, kann es seine Aufgabe, Ubiquitin-Tags effektiv zu entfernen, nicht mehr erfüllen, was zu einem Anstieg von Proteinen führen kann, die entfernt werden sollten, was letztendlich zum Zelltod in Krebszellen beiträgt.

Forschungen haben gezeigt, dass, wenn USP1 aufgrund der Inhibitorbindung nicht funktioniert, die Reaktion mit einem Substrat namens Ub-Prg erheblich verlangsamt wird. Dies deutet darauf hin, dass die Inhibitoren wirksam sind, um die enzymatische Aktivität von USP1 zu verhindern, was eines der Hauptziele bei der Verwendung dieser Medikamente zur Bekämpfung von Krebs ist.

Zukünftige Richtungen und Fazit

Zusammenfassend bieten die Daten aus den Studien zu USP1-Inhibitoren wie ML323 und KSQ-4279 ein tieferes Verständnis dafür, wie diese Medikamente mit USP1 interagieren. Sie zeigen wichtige Einblicke in die strukturellen Veränderungen, die diese Inhibitoren verursachen, und heben das Potenzial hervor, USP1 in der Krebsbehandlung anzugreifen.

In Zukunft wird die laufende Forschung weiterhin klären, wie diese Inhibitoren in klinischen Umgebungen genutzt werden können, insbesondere in Anbetracht ihrer Auswirkungen auf ähnliche Enzyme. Die Informationen, die aus diesen Studien gewonnen wurden, könnten den Weg für die Entwicklung wirksamerer Krebstherapien ebnen, die spezifische Proteine besser anvisieren, wodurch die Behandlungsergebnisse für Patienten mit verschiedenen Krebsarten verbessert werden.

Originalquelle

Titel: Structural and biochemical insights on the mechanism of action of the clinical USP1 inhibitor, KSQ-4279

Zusammenfassung: DNA damage triggers cell signalling cascades that mediate repair. This signalling is frequently dysregulated in cancers. The proteins that mediate this signalling are potential targets for therapeutic intervention. Ubiquitin-specific protease 1 (USP1) is one such target, with small molecule inhibitors already in clinical trials. Here we use biochemical assays and cryo-electron microscopy (cryo-EM) to study the clinical USP1 inhibitor, KSQ-4279 (RO7623066), and compare this to the well-established, tool compound, ML323. We find that KSQ-4279 binds to the same cryptic site of USP1 as ML323 but disrupts the protein structure in subtly different ways. Inhibitor binding drives a substantial increase in thermal stability of USP1, which may be mediated through the inhibitors filling a hydrophobic tunnel in USP1. Our results contribute to the understanding of the mechanism of action of USP1 inhibitors at the molecular level.

Autoren: Martin L Rennie, M. Gundogdu, C. Arkinson, S. Liness, S. Frame, H. Walden

Letzte Aktualisierung: 2024-05-16 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.16.594330

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.16.594330.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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