Simple Science

Hochmoderne Wissenschaft einfach erklärt

# Biologie# Evolutionsbiologie

Der letzte eukaryotische gemeinsame Vorfahren: Einblicke ins frühe Leben

Lern, wie die Studie von LECA Geheimnisse über die frühe genetische Entwicklung enthüllt.

― 6 min Lesedauer


LECA: Der Beginn desLECA: Der Beginn deskomplexen Lebensoffenlegen.Krankheiten und der EvolutionDie Rolle von LECA in menschlichen
Inhaltsverzeichnis

Der letzte eukaryotische gemeinsame Vorfahr, oder LECA, wird auf vor etwa 1,5 bis 1,8 Milliarden Jahren datiert. Dieses einzellige Organismus ist der Vorfahren aller Eukaryoten, zu denen Pflanzen, Tiere, Pilze und viele Mikroorganismen gehören. Durch das Studium von LECA hoffen Wissenschaftler, mehr über die frühen genetischen Entwicklungen zu erfahren, die zu den komplexen Zellen geführt haben, die wir heute bei verschiedenen Lebewesen sehen.

Forscher glauben, dass LECA sehr komplex war und wahrscheinlich viele Merkmale aufwies, die typisch für eukaryotische Zellen sind. Man nimmt an, dass es mindestens einen Zellkern hatte, der DNA in linearen Chromosomen organisiert. Ausserdem hatte LECA wahrscheinlich ein verbundenes System von Membranen, einschliesslich Strukturen wie das endoplasmatische Retikulum und das Golgi-Apparat, die bei der Verarbeitung und dem Transport von Proteinen und anderen Molekülen innerhalb der Zelle helfen. Es gibt auch Hinweise darauf, dass LECA ein System von Proteinen hatte, das Zytoskelett genannt wird, das der Zelle ihre Form gibt und ihr bei der Bewegung hilft.

Ein weiteres wichtiges Merkmal von LECA war seine Fähigkeit, Abfall abzubauen und Energie zu produzieren. Es hatte wahrscheinlich Mitochondrien, die Teile der Zellen sind, die für die Energieerzeugung verantwortlich sind, und andere Strukturen für verschiedene Stoffwechselprozesse. Angesichts all dieser Komponenten wird LECA als ein bedeutender Schritt in der Evolution komplexer Lebensformen angesehen.

Genetische Zusammensetzung von LECA

Wissenschaftler versuchen, die Gene zu identifizieren, die LECA ausgemacht haben. Die meisten Studien konzentrierten sich auf einige Gruppen von Eukaryoten, wie Tiere und Pilze. Es gab jedoch nur begrenzte systematische Bemühungen, den vollständigen genetischen Inhalt von LECA zu kartieren. Forscher arbeiten hart daran, ein umfassenderes Bild von LECA's Proteinen und deren Wechselwirkungen zu erstellen.

Die Interaktionen zwischen Proteinen sind entscheidend für zahlreiche Zellfunktionen. Ein besseres Verständnis dieser Interaktionen kann Einblicke darin geben, wie Zellen zusammenarbeiten, wie sie Informationen verarbeiten und wie sie zur allgemeinen Gesundheit des Organismus beitragen. Daher würde die Erstellung eines Netzwerkes von Proteininteraktionen für LECA eine detailliertere Sicht auf seine Biologie bieten, als nur die Gene allein zu betrachten.

Rekonstruktion des Genom von LECA

Ein aktueller Versuch bestand darin, den Geninhalt von LECA zu rekonstruieren. Forscher identifizierten über 10.000 Gen-Gruppen, die auf LECA zurückverfolgt werden können, indem sie die Proteine von vielen verschiedenen Arten analysierten. Diese Gen-Gruppen entsprechen verschiedenen Funktionen, wie DNA-Replikation, Energieproduktion und Zellstruktur.

Überraschenderweise sind viele der Gene in LECA mit wichtigen Prozessen verbunden, wie der Herstellung und Reparatur von DNA, der Produktion von Proteinen und der Handhabung von Energie innerhalb der Zelle. Zum Beispiel ist eine grosse Gruppe von Genen an DNA-Prozessen beteiligt, die entscheidend für Zellwachstum und -vermehrung sind. Eine weitere bedeutende Gruppe von Genen konzentriert sich auf die Erzeugung und Nutzung von Energie, was die komplexen Methoden zeigt, die LECA möglicherweise zur Selbstversorgung genutzt hat.

Protein-Interaktionsnetzwerke

Um mehr darüber zu erfahren, wie die Proteine von LECA zusammenarbeiteten, verwendeten Forscher eine Methode namens Co-Fraktionierung-Massenspektrometrie (CFMS). Diese Technik erlaubt es Wissenschaftlern, zu messen, wie Proteine innerhalb einer Zelle interagieren, ohne sie mit zusätzlichen Markern zu kennzeichnen. Durch die Analyse von Proben aus über 30 verschiedenen Eukaryoten konnten sie viele der Proteininteraktionen identifizieren, die wahrscheinlich in LECA vorhanden waren.

Diese Proteininteraktionen sind entscheidend für das Verständnis der Zellfunktionen. Sie helfen dabei, grössere Komplexe zu bilden, die zusammenarbeiten, um verschiedene Aufgaben in der Zelle zu erledigen. Indem sie diese Beobachtungen über verschiedene Arten hinweg integrieren, können Wissenschaftler besser verstehen, welche Interaktionen während der Evolution erhalten blieben und welche sich möglicherweise in spezifischen Linien entwickelt haben.

Bedeutung moderner Studien

Durch die Analyse der Proteine von LECA und ihrer Interaktionen können Forscher Einblicke in die Evolution von Krankheiten bei modernen Arten gewinnen. Viele menschliche Krankheiten können auf Gene zurückgeführt werden, die bereits in LECA existierten. Das bedeutet, dass das Verständnis der genetischen Struktur von LECA helfen könnte, neue Gene zu identifizieren, die mit Krankheiten verbunden sind. Zum Beispiel fanden Forscher starke Verbindungen zwischen LECA-Genen und Erkrankungen wie chronischer Nierenerkrankung und verschiedenen genetischen Störungen.

Ein spezieller Fall betraf das Gen EFHC2, das bei einem Kind mit Nierenerkrankung identifiziert wurde. Durch das Studium der mit LECA assoziierten Proteine konnten die Forscher verstehen, wie Veränderungen in diesem Gen zu Problemen bei der Nierenentwicklung und -funktion führten. In einem anderen Beispiel verknüpften Forscher das V-ATPase-Protein mit einer Erkrankung namens Osteopetrose, die dazu führt, dass die Knochen zu dicht werden. Durch die Untersuchung der alten Verbindungen in LECA identifizierten Wissenschaftler, wie bestimmte moderne genetische Störungen möglicherweise ihre Wurzeln bis zu den Anfängen komplexer zellulärer Lebensformen zurückverfolgen können.

Untersuchung von Zilien und Zellbewegung

Zilien sind winzige haarähnliche Strukturen, die aus Zellen herausragen und ihnen helfen, sich zu bewegen oder ihre Umgebung wahrzunehmen. Viele menschliche Krankheiten gehen mit Problemen der Zilien einher, die zusammenfassend als Ziliopathien bezeichnet werden. Forscher haben festgestellt, dass es ein umfangreiches Netzwerk von Proteinen gibt, die mit Zilien in LECA in Verbindung stehen. Das Vorhandensein dieser Proteine deutet darauf hin, dass LECA nicht nur beweglich war, sondern möglicherweise ähnliche Mechanismen verwendet hat, die man bei modernen Zilien sieht.

Zum Beispiel wurden Proteine, die für den Aufbau und die Erhaltung der Zilienstruktur verantwortlich sind, im LECA-Interaktom gefunden. Als die Forscher diese Proteine in modernen Organismen untersuchten, stellten sie fest, dass sie eine Rolle bei Prozessen wie Zellteilung und sensorischen Funktionen spielen. Die Erkenntnisse über LECA zeigen, dass diese Schlüsselkomponenten seit Milliarden von Jahren für zelluläre Prozesse von entscheidender Bedeutung sind.

Beziehungen zwischen Genen und Krankheiten

Um die Krankheitsmechanismen besser zu verstehen, haben Forscher eine Methode namens "Guilt-by-Association" eingesetzt. Dieser Ansatz nutzt die aus LECA etablierten Protein-Interaktionsnetzwerke, um potenzielle Gene-Krankheit-Beziehungen zu bewerten. Durch die Analyse der Verbindungen zwischen verschiedenen Proteinen können Forscher vorhersagen, welche Gene möglicherweise an bestimmten Krankheiten beteiligt sind.

Zum Beispiel identifizierten Wissenschaftler durch Netzwerkanalysen neuartige Assoziationen zwischen Genen und Krankheiten, einschliesslich Verbindungen zu Osteopetrose und Short-Rib-Thorax-Dysplasie. Im Fall von Osteopetrose machten Forscher Vorhersagen basierend auf Interaktionen, die das Protein ATP6V1A betrafen. Weitere Studien bestätigten, dass Störungen in diesem Gen zu der Erkrankung führten, was die Kraft zeigt, alte Proteininteraktionen mit modernen Gesundheitsproblemen zu verbinden.

Implikationen für zukünftige Forschungen

Die Erkenntnisse aus dem Studium von LECA und seinen Proteininteraktionen bieten eine Grundlage für weitere Erkundungen der Krankheitsmechanismen beim Menschen. Indem sie weiterhin den genetischen Inhalt von LECA analysieren, können Forscher bedeutendere Assoziationen zwischen alten Proteinen und Krankheiten heute aufdecken. Das kann zu Entwicklungen in Diagnostik, Behandlungen und einem besseren Verständnis dafür führen, wie sich genetische Merkmale entwickeln.

Zusammenfassend ist das Studium des letzten eukaryotischen gemeinsamen Vorfahren ein entscheidender Schritt, um das komplexe Geflecht der Genetik zu entwirren, das sowohl die biologische Vielfalt als auch die Mechanismen menschlicher Krankheiten zugrunde liegt. Während Wissenschaftler weiterhin das Rätsel der alten Biologie von LECA zusammensetzen, ebnen sie den Weg für eine verbesserte Gesundheitsversorgung und eine tiefere Wertschätzung unseres biologischen Erbes.

Originalquelle

Titel: Ancient eukaryotic protein interactions illuminate modern genetic traits and disorders

Zusammenfassung: All eukaryotes share a common ancestor from roughly 1.5 - 1.8 billion years ago, a single-celled, swimming microbe known as LECA, the Last Eukaryotic Common Ancestor. Nearly half of the genes in modern eukaryotes were present in LECA, and many current genetic diseases and traits stem from these ancient molecular systems. To better understand these systems, we compared genes across modern organisms and identified a core set of 10,092 shared protein-coding gene families likely present in LECA, a quarter of which are uncharacterized. We then integrated >26,000 mass spectrometry proteomics analyses from 31 species to infer how these proteins interact in higher-order complexes. The resulting interactome describes the biochemical organization of LECA, revealing both known and new assemblies. We analyzed these ancient protein interactions to find new human gene-disease relationships for bone density and congenital birth defects, demonstrating the value of ancestral protein interactions for guiding functional genetics today.

Autoren: Edward M. Marcotte, R. M. Cox, O. Papoulas, S. Shril, C. Lee, T. Gardner, A. M. Battenhouse, M. Lee, K. Drew, C. D. McWhite, D. Yang, J. C. Leggere, D. Durand, F. Hildebrandt, J. B. Wallingford

Letzte Aktualisierung: 2024-05-29 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.26.595818

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.26.595818.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

Vielen Dank an biorxiv für die Nutzung seiner Open-Access-Interoperabilität.

Mehr von den Autoren

Ähnliche Artikel