Die Rolle von Man-PTS in der bakteriellen Funktion
Untersuchung des Mannose-Phosphotransferase-Systems und seine Auswirkungen auf Bakterien.
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Inhaltsverzeichnis
- Die Funktion von Man-PTS
- Bakteriocine und Man-PTS
- Klasse II Bakteriocine
- Empfindlichkeit von Bakterien gegenüber Bakteriocinen
- Rolle spezifischer Regionen in der Empfindlichkeit
- Neue Entdeckungen in der Bakteriocin-Forschung
- Identifizierung neuer Bakteriocine
- Implikationen für die medizinische Nutzung
- Potenzielle Anwendungen
- Die Komplexität von Bakteriocin-Bindungsmustern
- Die Rolle von Aminosäuremotiven
- Zukünftige Forschungsrichtungen
- Fortschritte in der Technologie
- Fazit
- Originalquelle
- Referenz Links
Bakterien haben wichtige Systeme, die ihnen helfen, Nährstoffe aufzunehmen. Eines dieser Systeme ist das Mannose-Phosphotransferasesystem (Man-PTS), das Bakterien wie Bacillota und Gammaproteobacteria hilft, ZUCKER wie Glukose und Mannose in ihre Zellen zu transportieren. Dieses System kann auch andere Zucker wie Fruktose und einige Aminozucker transportieren. Man-PTS spielt eine grosse Rolle, nicht nur beim Zuckereinlass, sondern auch beim Management, wie die Bakterien wachsen und auf ihre Umgebung reagieren.
Die Funktion von Man-PTS
Man-PTS transportiert Zucker mithilfe eines speziellen Verfahrens, das ein Molekül namens Phosphoenolpyruvat (PEP) einsetzt. Wenn ein Zucker in die Bakterien gelangt, wird ihm eine Phosphatgruppe angehängt, die den Zucker für die weitere Verwendung durch die Bakterien aktiviert. Man-PTS besteht aus verschiedenen Komponenten, von denen einige im Inneren der Zelle und andere in der Membran liegen. Die inneren Komponenten verarbeiten zuerst den Zucker, während die Membranteile einen Weg für den Zucker schaffen, um in die Zelle einzutreten.
Neben dem Zuckerverkehr kann Man-PTS viele zelluläre Prozesse beeinflussen. Dazu gehört die Kontrolle, wie Gene exprimiert werden, wie Energie genutzt wird, die Bildung von Biofilmen und wie die Bakterien Krankheiten verursachen. Ausserdem kann das Man-PTS-System als Rezeptor für bestimmte Viren und antimikrobielle Peptide fungieren.
Bakteriocine und Man-PTS
Bakteriocine sind kleine Proteine, die von Bakterien produziert werden und andere Bakterien töten oder deren Wachstum hemmen können. Einige Bakteriocine zielen auf das Man-PTS-System ab. Viele dieser Bakteriocine stammen von grampositiven Bakterien und benötigen keine zusätzlichen Modifikationen, um zu wirken. Sie können in Subklassen basierend auf ihrer Struktur und Funktionsweise eingeteilt werden.
Klasse II Bakteriocine
Klasse II Bakteriocine werden weiter in vier Gruppen basierend auf ihrer Struktur unterteilt:
- IIa Pediocine - Dazu gehören Bakteriocine mit einem spezifischen Aminosäuremuster.
- IIb Zwei-Peptid Bakteriocine - Diese bestehen aus zwei verwandten Proteinen.
- IIc Führerlose Bakteriocine - Diese haben keine Signalpeptide.
- IId Nicht-Pediocin-ähnliche Bakteriocine - Diese unterscheiden sich in Struktur und Natur von den anderen.
Man-PTS fungiert als Ziel für viele dieser Bakteriocine. Zum Beispiel binden mehrere Pediocine und andere Bakteriocine an Man-PTS, um ihre Wirkung zu entfalten. Jedes dieser Bakteriocine hat einzigartige Merkmale, die bestimmen, wie gut sie gegen verschiedene bakterielle Stämme wirken können.
Empfindlichkeit von Bakterien gegenüber Bakteriocinen
Die Empfindlichkeit von Bakterien gegenüber diesen Bakteriocinen kann stark variieren und wird oft durch bestimmte Bereiche im Man-PTS-System beeinflusst. Diese Bereiche haben spezifische Aminosäuremotive, die wichtig dafür sind, wie die Bakteriocine an den Rezeptor binden. Einige Bakteriocine können effektiv Bakterien angreifen, die bestimmte Regionen in ihrem Man-PTS haben, während andere nur auf Bakterien wirken können, denen diese Regionen fehlen.
Rolle spezifischer Regionen in der Empfindlichkeit
Verschiedene Regionen im Man-PTS-System können bestimmte Bakterien empfindlich oder resistent gegenüber spezifischen Bakteriocinen machen. Zum Beispiel sind die α- und γ-Regionen von Man-PTS entscheidend für die Aktivität bestimmter Bakteriocine. Bakterien mit diesen Regionen können von Bakteriocinen angegriffen werden, die diese Teile erkennen. Im Gegensatz dazu könnten Bakterien ohne diese Regionen resistent oder nur schwach betroffen sein.
Der Mechanismus der Interaktion
Wenn Bakteriocine an Man-PTS binden, können sie die Membranen der Bakterien stören und deren Zellen schwächen. Einige Bakteriocine haben den Verdacht erregt, Poren in bakteriellen Membranen zu bilden, was zum Zelltod führt. Diese Aktion kann komplex sein, da verschiedene Bakteriocine möglicherweise leicht unterschiedliche Mechanismen verwenden, um ähnliche Effekte zu erzielen.
Neue Entdeckungen in der Bakteriocin-Forschung
Kürzliche Studien haben viele bisher unbekannte Bakteriocine identifiziert, die mit dem Man-PTS-System interagieren. Einige dieser neuen Bakteriocine zeigen Potenzial bei der Behandlung von Infektionen, die durch antibiotikaresistente Bakterien verursacht werden. Diese Forschung hat die grosse Vielfalt an Bakteriocinen hervorgehoben, die Man-PTS anvisieren können, was zu einem besseren Verständnis führt, wie diese Proteine in medizinischen Anwendungen genutzt werden können.
Identifizierung neuer Bakteriocine
Forscher haben verschiedene Techniken verwendet, um neue Bakteriocine zu entdecken, die an das Man-PTS-System binden können. Durch die Untersuchung der Aminosäuresequenzen bekannter Bakteriocine identifizierten sie neue Gruppen von Bakteriocinen mit ähnlicher Struktur und Funktion. Diese neuen Bakteriocine wurden ebenfalls getestet, um zu bestimmen, welche bakteriellen Stämme sie effektiv angreifen können, was zur Schaffung einer breiteren Familie von Man-PTS-bindenden Bakteriocinen führte.
Implikationen für die medizinische Nutzung
Die Entdeckung neuer Bakteriocine, die gezielt auf Man-PTS abzielen, eröffnet neue Wege zur Behandlung bakterieller Infektionen. Bakteriocine könnten als Alternativen zu traditionellen Antibiotika dienen, besonders in Fällen, in denen Bakterien Resistenzen gegen bestehende Behandlungen entwickelt haben. Dies ist besonders wichtig für Infektionen, die durch schwer behandelbare Bakterien verursacht werden, wo neue Lösungen dringend benötigt werden.
Potenzielle Anwendungen
Einige neu entdeckte Bakteriocine haben vielversprechende Ergebnisse gegen spezifische Bakterienstämme gezeigt, die Krankheiten bei Menschen und Tieren verursachen. Zum Beispiel könnten bestimmte Bakteriocine helfen, Infektionen durch vancomycinresistente Enterokokken zu behandeln, die eine erhebliche Herausforderung im Gesundheitswesen darstellen. Andere Bakteriocine könnten die Lebensmittelsäuberung durch schädliche Bakterien verhindern und so der Lebensmittelsicherheit zugutekommen.
Die Komplexität von Bakteriocin-Bindungsmustern
Die Art und Weise, wie Bakteriocine mit Man-PTS interagieren, ist komplex und variiert zwischen verschiedenen Gruppen. Jede Gruppe von Bakteriocinen scheint ihre eigenen Bindungspräferenzen und Mechanismen zu haben. Einige könnten an spezifische Regionen in der Man-PTS-Struktur binden, während andere allgemeiner wirken könnten. Diese Komplexität deutet auf eine Ko-Evolution zwischen Bakteriocinen und ihren bakteriellen Zielen hin, die es ihnen ermöglicht, in verschiedenen Umgebungen effektiv zu konkurrieren.
Die Rolle von Aminosäuremotiven
Spezifische Aminosäuresequenzen in Bakteriocinen sind entscheidend für ihre Fähigkeit, an Man-PTS zu binden. Zum Beispiel sind bestimmte Motive, die in den GarQ-ähnlichen Bakteriocinen gefunden werden, entscheidend für ihre Aktivität. Forscher haben festgestellt, dass die Wirksamkeit von Bakteriocinen drastisch vermindert werden kann, wenn diese Motive verändert werden, was die Bedeutung dieser Sequenzen für ihre Funktion verdeutlicht.
Zukünftige Forschungsrichtungen
Es gibt immer noch viel zu lernen, wie diese Interaktionen stattfinden und wie wir Bakteriocine in praktischen Anwendungen nutzen können. Zukünftige Forschungen könnten sich auf das Verständnis der dreidimensionalen Strukturen dieser Proteine und darauf konzentrieren, wie deren Formen ihre Funktionen beeinflussen. Wissenschaftler könnten auch untersuchen, wie diese Proteine modifiziert werden können, um ihre Wirksamkeit zu erhöhen oder ihr Wirkungsspektrum zu erweitern.
Fortschritte in der Technologie
Der Einsatz von fortschrittlichen Techniken wie struktureller Biologie und Bioinformatik wird voraussichtlich eine Schlüsselrolle in zukünftigen Studien spielen. Diese Technologien könnten helfen, zu visualisieren, wie Bakteriocine auf molekularer Ebene mit ihren Zielen interagieren, was zu einem besseren Design und der Optimierung neuer antimikrobieller Mittel führen könnte.
Fazit
Das Mannose-Phosphotransferasesystem (Man-PTS) ist eine entscheidende Komponente in Bakterien, die nicht nur bei der Nährstoffaufnahme hilft, sondern auch als Rezeptor für verschiedene Bakteriocine dient. Die laufende Forschung zu diesem System und seinen Wechselwirkungen mit Bakteriocinen ist ein vielversprechendes Feld, das darauf abzielt, Herausforderungen im Zusammenhang mit Antibiotikaresistenz anzugehen. Während wir weiterhin die Komplexität dieser Interaktionen aufdecken, sind neue Strategien zur Nutzung von Bakteriocinen in der Gesundheitsversorgung und Lebensmittelsicherheit zu erwarten, die den Weg für innovative Behandlungen und Konservierungsmethoden ebnen.
Titel: Subclass IId bacteriocins targeting Man-PTS--structural diversity and implications for receptor interaction and antimicrobial activity
Zusammenfassung: The bacterial mannose phosphotransferase system (Man-PTS) mediates uptake of selected monosaccharides. Simultaneously, it is a receptor for diverse bacteriocins such as subclass IIa pediocin-like bacteriocins and some subclass IId ones (garvicins ABCQ, lactococcins ABZ, BacSJ, ubericin K, and angicin). So far, no attempt has been made to categorize this ever-expanding group of bacteriocins. Here, we identified Man-PTS as a receptor for a number of novel bacteriocins and demonstrated that they all belong to a large family of Man-PTS-binding non-pediocin-like peptides. Based on amino acid sequence similarities between members of this family, we propose their classification into five groups. This classification conveniently distinguishes bacteriocins with specific structures and properties regarding their spectrum of antimicrobial activity and pattern of interaction with Man-PTS. With respect to the latter, we indicate individual amino acid residues or regions of Man-PTS and the bacteriocin responsible for their interaction. In Man-PTS these residues localize to the exterior of the transport complex, specifically the extracellular loop of the so-called Vmotif domain containing regions {gamma} and/or {gamma}+, and to the interior of the transport complex, specifically the interface between the Core and Vmotif domains. Finally, we propose that while the bacteriocins from separate groups display specific binding patterns to Man-PTS, the general mechanism of their interaction with the receptor is universal despite significant differences in their predicted structures, i.e., after initial docking on the bacterial cell through an interaction with the Man-PTS regions {gamma} and/or {gamma}+, they pull away its Core and Vmotif from one another to form a pore across the membrane. Significance statementBacteriocins show potential as natural and safe food preservatives and next-generation antibiotics. However, ensuring their safe future use requires primarily the identification of bacteriocin receptors and a detailed understanding of the molecular mechanisms of their selective recognition and binding. Here, we demonstrate the paramount role of Man-PTS in the binding of various non-studied and nearly non-homologous subclass IId bacteriocins with different activity spectra and bacteriocin-receptor binding patterns. Exploiting Man-PTS as a target for novel antimicrobials could be a promising strategy of killing diverse bacterial pathogens, including their antibiotic-resistant strains.
Autoren: Tamara Aleksandrzak-Piekarczyk, A. Tymoszewska
Letzte Aktualisierung: 2024-06-22 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.22.600115
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.22.600115.full.pdf
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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