Untersuchung der Rolle von Dynein-Motoren bei der ziliaren Bewegung
Diese Studie untersucht, wie Dynein-Motoren die Zilien-Oszillationen und deren Effizienz beeinflussen.
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Inhaltsverzeichnis
- Die Struktur und Funktion von beweglichen Zilien
- Herausforderungen bei der Messung von Geräuschen in Zilien
- Qualitätsfaktor als Mass für Geräusche
- Reaktivierung von Axonemen zur Messung
- Verständnis von Schlagfrequenz, Amplitude und Qualitätsfaktor
- Biochemische Extraktion von Dynein-Motoren
- Die Rolle von Dynein-Motoren bei der Festlegung der Schlagfrequenz
- Schlagamplitude und ihre Beziehung zu Dynein-Motoren
- Qualitätsfaktor und Anzahl der Motoren
- Einfluss der ATP-Konzentration auf das Verhalten der Zilien
- Messung der hydrodynamischen Leistungsausgabe
- Energetische Grenzen und Präzision des Oszillators
- Zusammenfassung der Ergebnisse
- Fazit
- Originalquelle
Biologische Oszillatoren sind Systeme in lebenden Organismen, die rhythmische Bewegungen erzeugen. Trotz zufälliger Schwankungen und Geräusche arbeiten diese Oszillatoren präzise. Forscher glauben, dass die Genauigkeit dieser biologischen Rhythmen davon abhängt, wie viele "Schrittmacher"-Einheiten zusammen geschaltet sind und dass sie durch den Energieverbrauch im System begrenzt ist.
Eine der interessantesten Arten von biologischen Oszillatoren sind molekulare Motoren. Diese winzigen Maschinen können oscillierende Bewegungen erzeugen und sind in verschiedenen biologischen Prozessen zu finden. Zum Beispiel helfen sie bei der Schallwahrnehmung in Haarzellen, der Bewegung in Muskelzellen, der Positionierung von Strukturen während der Zellteilung und den rhythmischen Bewegungen von Zilien, die Organismen helfen, durch Flüssigkeiten zu schwimmen.
Die Struktur und Funktion von beweglichen Zilien
Bewegliche Zilien sind dünne Ausstülpungen von der Oberfläche eukaryotischer Zellen, die typischerweise zwischen 10 und 50 Mikrometern lang sind. Sie enthalten spezialisierte Strukturen namens Dynein-Motoren, die entlang eines zentralen Gerüsts, dem Axonem, angeordnet sind. Dieses Gerüst hat eine konsistente Struktur bei verschiedenen Organismen, von einfachen einzelligen Lebewesen bis hin zu komplexen Pflanzen und Tieren.
Die Dynein-Motoren arbeiten zusammen, um Mikrotubuli zu gleiten, wodurch sich die Form der Zilien verändert. Diese Biegung erfolgt, weil das Gleiten an der Basis der Zilien eingeschränkt ist. Die Aktivität dieser Motoren ist nicht konstant; sie ändert sich je nachdem, wie das Axonem gebogen ist, was zu regelmässigen Oszillationen mit Frequenzen von 10 bis 50 Hz führt. Während Wissenschaftler noch untersuchen, wie diese Motoren genau gesteuert werden, glauben sie, dass kontrollierte Veränderungen Einblicke in theoretische Modelle der Zilienfunktion geben könnten.
Jeder Dynein-Motor arbeitet in Zyklen, die den Abbau von ATP (einem Molekül, das Energie liefert) mit der Anwendung von winzigen Kräften verknüpfen. Die Schritte in diesen Zyklen sind zufällig, daher können die beteiligten Kräfte im kleinen Massstab schwanken. Diese Schwankungen können jedoch im grösseren Massstab beobachtet werden, wobei Variationen in der Biegung der Zilien durch Lichtmikroskopie sichtbar sind.
Diese Schwankungen können beeinflussen, wie gut die Zilien funktionieren. Zum Beispiel können Variationen in der Bewegungsamplitude mikroskopischen Organismen helfen, effektiver zu schwimmen, während Unterschiede in der Zeitnahme die Synchronisation unter Gruppen von Zilien stören können, die für effektives Schwimmen und Bewegen von Flüssigkeiten unerlässlich ist.
Herausforderungen bei der Messung von Geräuschen in Zilien
Das Studieren von Geräuschen in Zilien ist ziemlich kompliziert. Langsame Veränderungen im Verhalten der Zilien können über viele Zyklen hinweg auftreten und werden durch Änderungen in den Konzentrationen von Ionen innerhalb der Zellen beeinflusst. Diese langsamen Veränderungen können sich mit den schnellen, chaotischen Schwankungen vermischen, die durch die Dynein-Motoren verursacht werden, was es schwierig macht, Ergebnisse aus experimentellen Manipulationen zu interpretieren.
Ausserdem ist die Anzahl der Dynein-Motoren in einer Zilie fest und kann während der Experimente nicht verändert werden, es sei denn durch genetische Veränderungen.
Qualitätsfaktor als Mass für Geräusche
Eine Möglichkeit, das Geräusch in ciliary Bewegungen zu messen, ist ein Qualitätsfaktor, eine Zahl, die angibt, wie sehr das Rhythmus der Oszillation im Laufe der Zeit variiert. Ein einfaches Modell deutete darauf hin, dass dieser Qualitätsfaktor in Bezug auf die Anzahl der vorhandenen Motoren zunehmen sollte.
Bis jetzt wurde diese Theorie nicht gründlich in Laborversuchen getestet. Einige frühere Studien haben ergeben, dass das Entfernen von Dynein-Motoren aus Zellen die Frequenz der Bewegung senken konnte, sich aber nicht darauf konzentrierten, wie sich die Schwankungen änderten.
Um dies weiter zu untersuchen, verwendeten Forscher Axoneme (den zentralen Teil der Zilien), die nach ihrer Isolation aus Zellen reaktiviert wurden. Dadurch konnte das Team die Anzahl der Dyneine manipulieren und beobachten, wie sich dies auf das Verhalten der Axoneme auswirkte.
Reaktivierung von Axonemen zur Messung
Axoneme können aus einer Art von grünem Algen namens Chlamydomonas entnommen werden. Nach der Extraktion können sie in einer speziellen Lösung reaktiviert werden, die Energie liefert. Mithilfe von Hochgeschwindigkeitsvideoaufnahmen können Forscher die Bewegung der Axoneme mit grosser Präzision verfolgen.
Die Form und Bewegung dieser Axoneme können charakterisiert werden, indem man beobachtet, wie sich die Winkel der Axoneme im Laufe der Zeit ändern. Die Analyse der Frequenz und Amplitude dieser Oszillationen hilft, Schlüsselparameter wie die Schlagamplitude und den Qualitätsfaktor zu definieren.
Der Qualitätsfaktor spiegelt wider, wie viele Zyklen es dauert, bis die rhythmische Bewegung ihre Konsistenz verliert. Ein höherer Qualitätsfaktor deutet auf einen stabileren und präziseren Oszillator hin.
Verständnis von Schlagfrequenz, Amplitude und Qualitätsfaktor
Die Forscher schauten sich an, wie sich der Qualitätsfaktor mit unterschiedlichen Zahlen von Dynein-Motoren verändert, indem sie zwei Methoden anwendeten: Erstens durch Untersuchung eines mutierten Chlamydomonas-Stammes, dem bestimmte Dynein-Motoren fehlen, und zweitens durch Entfernen von Motoren mit einem chemischen Extraktionsprozess.
Biochemische Extraktion von Dynein-Motoren
Um zu analysieren, wie die Anzahl der Motoren die Funktion der Zilien beeinflusst, entwickelten Forscher eine Methode zur Extraktion von Dynein-Motoren aus Axonemen. Diese Motoren kommen in zwei Haupttypen vor: innere Arm-Dyneine (IAD) und äussere Arm-Dyneine (OAD), die regelmässig entlang der Länge des Axonems angeordnet sind.
Mit einer Salzlösung konnten die Forscher beide Arten von Dynein-Motoren in Bezug auf die Konzentration des Salzes extrahieren. Sie verwendeten eine Technik, die es ihnen ermöglicht, präzise zu messen, wie viele Motoren nach der Extraktion verbleiben.
Die Forscher fanden heraus, dass sich die Anzahl der Dynein-Motoren verringerte, als sie die Salzkonzentration erhöhten. Bei Axonemen aus normalen Zellen beobachteten sie etwa einen 20% Verlust an Dynein-Motoren bei der höchsten Salzkonzentration, während die mutierten Axonemen einen Verlust von 70% zeigten.
Die Rolle von Dynein-Motoren bei der Festlegung der Schlagfrequenz
Die Schlagfrequenz, also wie schnell sich die Axoneme hin und her bewegen, stellte sich als abhängig von der Anzahl der vorhandenen Motoren heraus. Ohne jegliche Extraktion betrug die durchschnittliche Schlagfrequenz für normale Axoneme etwa 70 Hz, während sie beim mutierten Stamm bei etwa 30 Hz lag.
Mit dem Entfernen der Dynein-Motoren sank die Schlagfrequenz linear. Beide Typen der Dyneine schienen gleichmässig zur Kontrolle der Schlagfrequenz beizutragen, unabhängig von dem Typ.
Schlagamplitude und ihre Beziehung zu Dynein-Motoren
Die Schlagamplitude beschreibt, wie weit sich die Axoneme während jedes Zyklus bewegen. Forscher fanden heraus, dass diese Messung hauptsächlich von den inneren Arm-Dyneinen abhängt. Das bedeutet, dass die Amplitude konstant bleibt, selbst wenn weniger äussere Arm-Dyneine vorhanden sind.
Qualitätsfaktor und Anzahl der Motoren
Der Qualitätsfaktor, der angibt, wie stabil die Bewegungen der Axoneme sind, wurde ebenfalls gemessen. Im Vergleich zwischen normalen und mutierten Axonemen stieg der Qualitätsfaktor mit der Anzahl der gesamten Dynein-Motoren. Allerdings zeigte die mutierten Axonemen einen konstant niedrigeren Qualitätsfaktor.
Interessanterweise tauchte beim Plotten gegen die Anzahl der inneren Arm-Dyneine allein ein klarer Trend auf. Der Qualitätsfaktor stieg signifikant an, bis etwa 95% der inneren Arm-Dyneine vorhanden waren. Über diesen Punkt hinaus trug die Anwesenheit von äusseren Arm-Dyneinen nicht weiter zur Erhöhung des Qualitätsfaktors bei.
Einfluss der ATP-Konzentration auf das Verhalten der Zilien
Die ATP-Konzentration hatte ebenfalls einen Einfluss auf die Bewegungen der Axoneme. Bei normalen Axonemen, wenn die ATP-Konzentration sank, fielen sowohl die Schlagfrequenz als auch der Qualitätsfaktor, während die Amplitude grösstenteils unverändert blieb.
Das deutet darauf hin, dass die inneren Arm-Dyneine bei niedrigeren ATP-Werten effizienter arbeiten als äussere Arm-Dyneine, die bei sinkendem ATP zuerst langsamer werden.
Messung der hydrodynamischen Leistungsausgabe
Die Leistungsausgabe der schlagenden Axoneme ist im Vergleich zu Schätzungen aus früheren Studien mit Zilien, die noch an Zellen befestigt sind, ziemlich gering. Das bedeutet, dass isolierte Axoneme nicht so effizient sind und wahrscheinlich im Leerlaufmodus laufen, anstatt die Energie voll zu nutzen.
Die Forscher berechneten die durchschnittliche Leistungsausgabe für normale und mutierte Axoneme, was zeigte, dass die Bewegungen der Flüssigkeit um sie herum minimale Leistung generierten.
Die berechnete Leistungsausgabe deutete darauf hin, dass nur ein kleiner Bruchteil der Energie, die bei der ATP-Zersetzung freigesetzt wird, in nützliche Arbeit umgewandelt wird, während der Grossteil möglicherweise als Wärme verloren geht.
Energetische Grenzen und Präzision des Oszillators
Die Präzision biologischer Oszillatoren, wie Axoneme, hat Grenzen, die darauf basieren, wie viel Energie verbraucht wird. Eine theoretische Beziehung erklärt, dass es eine obere Grenze für den Qualitätsfaktor gibt, die davon abhängt, wie viel Energie während der Oszillation dissipiert wird.
Mit dieser Beziehung schätzten die Forscher, dass der während der Experimente gemessene Qualitätsfaktor niedriger war als das theoretische Maximum. Dies deutet darauf hin, dass der Qualitätsfaktor durch die Evolution möglicherweise nicht optimiert wurde, da der biologische Bedarf möglicherweise nicht die maximale Präzision erfordert.
Zusammenfassung der Ergebnisse
Die Studie zeigt, dass der Qualitätsfaktor der axonemalen Oszillationen mit der Anzahl der inneren Arm-Dyneine zunimmt. Die äusseren Arm-Dyneine tragen nur zu diesem Anstieg bei, wenn eine kritische Dichte von inneren Arm-Dyneinen vorhanden ist.
Frühere Forschungen haben Geräusche in Zilien und Flagellen festgestellt, die mit verschiedenen Parametern verknüpft sind, und die in isolierten Axonemen gemessenen Qualitätsfaktoren korrelieren gut mit früheren Ergebnissen aus lebenden Zellen. Das bestärkt die Vorstellung, dass innere Arm-Dyneine entscheidend für die Erzeugung konsistenter Bewegungen sind, während äussere Arm-Dyneine eine unterstützende Rolle spielen, um die Geschwindigkeit der Bewegung zu erhöhen.
Fazit
Die Ergebnisse heben die Bedeutung der inneren und äusseren Arm-Dyneine in ziliaren Oszillationen hervor. Innere Arm-Dyneine fungieren als die Haupttreiber des Schlages, während äussere Arm-Dyneine dabei helfen, die Geschwindigkeit zu erhöhen. Die erhaltenen Qualitätsfaktoren bieten Einblicke in die biologische Funktion der Zilien und deren Energieeffizienz. Zukünftige Forschungen werden weiterhin das Verständnis dieser biologischen Oszillatoren und ihrer Rollen in lebenden Organismen vertiefen.
Titel: Active fluctuations of axoneme oscillations scale with number of dynein motors
Zusammenfassung: Fluxes of energy generate active forces in living matter, yet also active fluctuations. As canonical example, collections of molecular motors exhibit spontaneous oscillations with frequency jitter caused by non-equilibrium phase fluctuations. We investigate phase fluctuations in reactivated Chlamydomonas axonemes, which are accessible to direct manipulation. We quantify the precision of axonemal oscillations after controlled chemical removal of dynein motors, providing an experimental test for the theory prediction that the quality factor of motor oscillations should increase with motor number. Our quantification reveals specialized roles of inner and outer arm dynein motors. This supports a model in which inner dyneins serve as master pace-makers, to which outer arm dyneins become entrained, consistent with recent insight provided by structural biology.
Autoren: Veikko F. Geyer, A. Sharma, B. M. Friedrich
Letzte Aktualisierung: 2024-06-25 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.25.600380
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.25.600380.full.pdf
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.
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