Pflanzenreaktionen auf niedrigen Sauerstoff: Ein evolutionärer Einblick
Studie zeigt, wie verschiedene Pflanzen sich an sauerstoffarme Umgebungen anpassen und welche evolutionären Auswirkungen das hat.
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Inhaltsverzeichnis
Pflanzen spielen ne wichtige Rolle in der Geschichte der Erde, besonders als sie vor etwa 480 Millionen Jahren das Land kolonisierten. Dieses Ereignis hat die Atmosphäre und die Ökologie unseres Planeten stark verändert. Der Aufstieg der Landpflanzen führte zu mehr Sauerstoff in der Luft, was für das Überleben vieler Arten entscheidend war. Fossilfunde zeigen, dass frühe Landpflanzen ähnlich wie heutige Moose waren und in feuchten Umgebungen wie Flussufern und Sümpfen lebten, oft mit Hochwasser zu kämpfen hatten.
Wenn Pflanzen überflutet werden, ist eine der grössten Herausforderungen der begrenzte Sauerstoff. Unter Bedingungen mit niedrigem Sauerstoff werden bestimmte Reaktionen in den Pflanzen ausgelöst, um sich anzupassen. Viele Studien haben sich damit beschäftigt, wie blühende Pflanzen auf niedrige Sauerstofflevel reagieren. Bestimmte Faktoren in Pflanzen, die Transkriptionsfaktoren und Enzyme genannt werden, sind daran beteiligt, diese niedrigen Sauerstofflevel zu erkennen und darauf zu reagieren. Unter normalen Sauerstoffbedingungen werden diese Faktoren abgebaut, aber wenn Sauerstoff knapp ist, sammeln sie sich an und helfen, die Genaktivität zu regulieren, damit die Pflanze mit dem Sauerstoffmangel zurechtkommt.
Trotz der bekannten Reaktionen bei blühenden Pflanzen gibt es nur wenig Infos darüber, wie andere Pflanzenarten mit der Sauerstoffwahrnehmung und -signalgebung umgehen. Diese Wissenslücke erschwert es, die Reaktionen von Pflanzen und Tieren auf niedrigen Sauerstoff zu vergleichen.
Transkriptionale Reaktionen auf niedrigen Sauerstoff
Um zu verstehen, wie verschiedene Pflanzen auf niedrigen Sauerstoff reagieren, haben Forscher verschiedene Arten untersucht, die wichtige Gruppen von Landpflanzen repräsentieren. Sie schauten sich Lebermoose, Moose, Farne und blühende Pflanzen an, um zu sehen, wie sich ihre Genexpression unter niedrigen Sauerstoffbedingungen änderte. Verschiedene Entwicklungsstadien der Pflanzen, die die Hauptteile für die Photosynthese umfassten, wurden zum Vergleich herangezogen.
Die Pflanzen wurden mit niedrigem Sauerstoff behandelt und dann mit Kontrollpflanzen verglichen, die unter normalen Sauerstoffbedingungen gewachsen sind. Durch diesen Prozess konnten die Forscher Gene identifizieren, die als Reaktion auf niedrigen Sauerstoff aktiviert oder stillgelegt wurden. Sie fanden heraus, dass blühende Pflanzen eine stärkere Reaktion hatten als Moose, was auf einen signifikanten Unterschied in der Reaktion dieser Gruppen auf niedrigen Sauerstoff hinweist.
Vergleich zwischen Pflanzenarten
Die Studie erstellte einen Zeitstrahl, wie sich verschiedene Pflanzenarten entwickelt haben, und stellte fest, dass die ersten Landpflanzen vor etwa 470 Millionen Jahren erschienen sind. Die Forscher unterteilten ihre Ergebnisse weiter in spezifische Kategorien von Genexpressionsänderungen über verschiedene Pflanzenarten hinweg. Sie bemerkten, dass, je mehr sich die Pflanzen entwickelten, die Anzahl der Gene, die an der Reaktion auf niedrigen Sauerstoff beteiligt waren, zwischen den Gruppen variierte.
Mit fortschrittlichen Methoden identifizierten die Forscher Gen-Sets, die von gemeinsamen Vorfahren der untersuchten Arten abstammen. Diese Sets, bekannt als Orthogruppen, helfen beim Vergleich, wie verschiedene Pflanzen ihre Reaktionen auf niedrigen Sauerstoff managen. Bei der Analyse dieser Gruppen fanden sie Gemeinsamkeiten und Unterschiede in der Genverwendung unter verschiedenen Pflanzenarten.
Erhaltung der Hypoxiereaktionen
Die Forscher schauten tiefer und konzentrierten sich auf die Funktionen der Gene, die durch niedrigen Sauerstoff betroffen waren. Sie verglichen diese Gene zwischen den Arten, um zu sehen, wie viele von ihnen in ihren Funktionen ähnlich waren. Die Ergebnisse zeigten, dass eng verwandte Arten ähnliche Regulationsmuster für ihre Gene hatten als weiter entfernte Verwandte.
Durch eine detaillierte Analyse identifizierten die Forscher konservierte Gene, die in vielen Pflanzenarten konsequent als Reaktion auf niedrigen Sauerstoff aktiviert oder stillgelegt wurden. Diese Gene waren mit wesentlichen Funktionen wie Metabolismus, Zellstruktur und Stressreaktionen verbunden. Ein beträchtlicher Teil der Gene, die unter niedrigen Sauerstoffbedingungen in blühenden Pflanzen aktiviert wurden, war mit metabolischen Prozessen verknüpft, die entscheidend für das Überleben unter solchen Bedingungen sind.
Die Studie hob auch die Rolle spezifischer Transkriptionsfaktoren bei der Steuerung der Reaktion auf niedrigen Sauerstoff hervor. Transkriptionsfaktoren sind Proteine, die die Genexpression regulieren helfen, und in diesem Fall helfen sie Pflanzen, sich an niedrigen Sauerstoff anzupassen. Die Ergebnisse deuteten darauf hin, dass spezifische Arten von Transkriptionsfaktoren in mehreren Pflanzenarten vorhanden waren, jedoch ihre Rollen unterschiedlich waren.
Rolle der ERF-Transkriptionsfaktoren
Die Forscher untersuchten weiter eine spezifische Gruppe von Transkriptionsfaktoren, genannt ERFVIIs. Diese Transkriptionsfaktoren sind bekannt für ihre Rolle bei der Reaktion auf niedrige Sauerstoffbedingungen. Die Studie stellte fest, dass ERFVII-ähnliche Proteine in vielen Pflanzenarten vorhanden waren, ihre Funktionalität jedoch variierte. In blühenden Pflanzen halfen diese Proteine, die Reaktion auf niedrigen Sauerstoff effektiv zu steuern, während das bei anderen Pflanzenarten nicht vollständig verstanden wurde.
Die Forscher führten Experimente durch, um zu sehen, wie die ERFVIIs von verschiedenen Pflanzen auf niedrigen Sauerstoff reagieren. Sie testeten Proteine aus Moosen und Lebermoosen und fanden heraus, dass diese Proteine unter niedrigen Sauerstoffbedingungen nicht so stabil waren wie ihre blühenden Pendants. Das deutet darauf hin, dass blühende Pflanzen einen ausgefeilteren Mechanismus zur Bewältigung von niedrigem Sauerstoffstress entwickelt haben.
Genetische Analyse der Hypoxiereaktion
Um weiter zu erforschen, wie Pflanzen auf niedrigen Sauerstoff reagieren, schauten die Forscher sich die genetischen Veränderungen bei verschiedenen Arten an. Sie identifizierten Gene-Orthogruppen, die eine entscheidende Rolle in der Reaktion auf niedrigen Sauerstoff spielten. Diese Orthogruppen wurden basierend darauf kategorisiert, ob sie konserviert oder spezifisch für bestimmte Pflanzenarten waren.
Durch eine Analyse der Genexpression fanden die Forscher heraus, dass niedrige Sauerstoffbedingungen zu einer unterschiedlichen Reaktion in der Genregulation über die untersuchten Arten führten. Interessanterweise zeigte sich, dass die blühenden Pflanzen eine signifikante Anzahl regulierter Gene aufwiesen, während die nicht-blühenden Pflanzen eine eher zurückhaltende Reaktion zeigten.
Molekulare Mechanismen der Reaktion
Die Forscher erkundeten die molekularen Mechanismen, die es Pflanzen erlauben, niedrigen Sauerstoff wahrzunehmen. Man fand heraus, dass bestimmte Enzyme und Transkriptionsfaktoren entscheidend bei der Steuerung von Genexpressionsänderungen während der Exposition gegenüber niedrigem Sauerstoff waren. Die Studie hob hervor, dass die grundlegenden Komponenten der Sauerstoffwahrnehmung in Pflanzen konserviert sind, aber die spezifischen Mechanismen sich unter verschiedenen Pflanzenlinien unterschiedlich entwickelt haben könnten.
Bestimmte Wege in blühenden Pflanzen sind verantwortlich für den Abbau spezifischer Transkriptionsfaktoren als Reaktion auf Sauerstofflevel. Diese Wege waren damit verknüpft, wie Pflanzen sich an niedrigen Sauerstoff anpassen, indem sie ihren Metabolismus und ihre Genexpression verändern.
Evolutionäre Implikationen
Die Forschung, wie Pflanzen sich an niedrigen Sauerstoff anpassen, hat breitere Implikationen für das Verständnis der Pflanzenentwicklung. Durch die Untersuchung der Unterschiede in den Reaktionen unter verschiedenen Pflanzenarten können Forscher ableiten, wie diese Anpassungen ihr Überleben und die Kolonisierung terrestrischer Umgebungen beeinflusst haben könnten.
Die Ergebnisse deuten darauf hin, dass die Mechanismen der Sauerstoffwahrnehmung in Pflanzen sich über einen langen Zeitraum entwickelt haben, wobei blühende Pflanzen fortschrittlichere Anpassungen als nicht-blühende Arten zeigen. Das deutet darauf hin, dass evolutionäre Drücke im Zusammenhang mit der Sauerstoffverfügbarkeit eine bedeutende Rolle in der Entwicklung der modernen Pflanzenphysiologie gespielt haben.
Fazit
Die Forschung bietet wertvolle Einblicke in die evolutionäre Geschichte von Pflanzen und ihre Reaktionen auf niedrigen Sauerstoff. Durch den Vergleich verschiedener Arten wird ein komplexes Bild davon entfaltet, wie Pflanzen sich im Laufe der Zeit angepasst haben, um mit Umweltproblemen umzugehen. Die Variationen in der Genexpression und der Funktionalität der Transkriptionsfaktoren heben die Bedeutung von Sauerstoff in der Gestaltung der Pflanzenentwicklung hervor.
Zukünftige Studien werden wahrscheinlich weiterhin die Feinheiten dieser Anpassungen erkunden, um Wissenslücken über die Pflanzenentwicklung und -physiologie zu schliessen. Zu verstehen, wie Pflanzen mit niedrigem Sauerstoff zurechtkommen, bereichert nicht nur unser Wissen über Pflanzenbiologie, sondern hat auch potenzielle Anwendungen in der Landwirtschaft und im Naturschutz, besonders angesichts der globalen Veränderungen der Umweltbedingungen.
Titel: The role of ERFVIIs as oxygen-sensing transducers in the evolution of land plant response to hypoxia
Zusammenfassung: The transcriptional response to low oxygen (hypoxia) in the flowering plant Arabidopsis thaliana is transduced through group VII Ethylene Response Factor (ERFVII) transcription factors, whose proteolysis is oxygen-dependent via the PLANT CYSTEINE OXIDASE (PCO) N-degron pathway. When and how this response to hypoxia evolved in land plants remains unknown. Here we investigated the conservation and divergence of transcriptional responses to hypoxia in major land plant clades. We identified induction of gene functions associated with glycolysis and fermentation as part of a conserved response across all land plant divisions. Our results indicate that ERFVIIs appeared in the last common ancestor of vascular plants with true roots, concurrently with oxygen-dependent destabilisation, to regulate hypoxia-adaptive genes. Proteins from other ERF groups have been recruited multiple times in different clades as substrates of the PCO N-degron pathway. Our results demonstrate that the response of land plants to hypoxia has been refined in derived clades through the evolution of ERFVIIs as transcriptional transducers, that occurred concomitantly with the appearance of vascular systems and roots as foraging systems through hypoxic soil.
Autoren: Michael John Holdsworth, L. Dalle Carbonare, H. van Veen, V. Shukla, M. Perri, L. T. Bui, F. Licausi
Letzte Aktualisierung: 2024-09-28 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.27.615240
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.27.615240.full.pdf
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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