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# Biologie# Mikrobiologie

Tailocine: Eine neue Hoffnung gegen bakterielle Infektionen

Tailocine bieten eine vielversprechende Alternative, um die zunehmende Antibiotikaresistenz zu bekämpfen.

Dorien Dams, Célia Pas, Agnieszka Latka, Zuzanna Drulis-Kawa, Lars Fieseler, Yves Briers

― 6 min Lesedauer


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Inhaltsverzeichnis

Bakterielle Infektionen sind im 21. Jahrhundert wieder ein grosses Problem für unsere Gesundheit. Mit Bakterien, die sich über den Globus verbreiten und besser gegen Antibiotika resistent werden, sind die Wissenschaftler gefordert, neue Wege zu finden, um diese Infektionen zu behandeln. Eine der spannenden neuen Ideen ist die Nutzung von etwas, das man phagenähnliche Bakteriocine nennt, kurz Tailocine.

Was sind Tailocine?

Tailocine sind einzigartige Proteinkapseln, die ein bisschen wie Viren aussehen, die Bakterien infizieren (sogenannte Bakteriophagen), aber sie können sich nicht vermehren. Stell dir einen riesigen Protein-Komplex in einem Anzug vor, aber ohne Hut oder Aktentasche. Sie sind wie die coolen Kids in der Schule, die sich nicht replizieren müssen, um Eindruck zu machen!

Wenn Bakterien gestresst sind, produzieren sie diese Tailocine, die dann andere konkurrierende Bakterien in ihrer Umgebung angreifen. Das gibt den produzierenden Bakterien einen Vorteil. Tailocine gibt es in zwei Varianten: R-Typ und F-Typ.

R-Typ Tailocine

R-Typ Tailocine haben ein Design, das einem speziellen Bakteriophagen namens T-even Phage ähnelt. Sie haben einen röhrenförmigen Teil, der in einer Hülle gewickelt ist. Um ein Zielbakterium zu töten, heften sie sich daran, bringen ihre Struktur durcheinander und stechen dann in das Bakterium wie eine Nadel. Das führt zu einem fiesen Ionenaustritt, der zum Tod des Bakteriums führt.

F-Typ Tailocine

F-Typ Tailocine sind ein bisschen anders. Sie ähneln einem anderen Bakteriophagen namens Lambda und haben ihre eigene Art, Bakterien zu töten, aber die Wissenschaftler sind sich noch nicht ganz sicher, wie das genau funktioniert. Einige Bakterien, wie Pseudomonas aeruginosa, können beide Arten von Tailocinen herstellen, was ganz schön beeindruckend ist!

Wie funktionieren Tailocine?

Die Art und Weise, wie Tailocine ihr Ziel erkennen, erfolgt durch spezielle Proteine, die Rezeptor-bindende Proteine (RBP) genannt werden. Denk an diese als das GPS der Tailocine, das sie zu ihren bakteriellen Zielen führt. Jeder Tailocin hat sein einzigartiges RBP, das in spezifische Rezeptoren passt, die auf der Oberfläche bestimmter Bakterien zu finden sind. Das Tolle daran? Diese RBPs sind wie anpassbare Schlüssel – sie können so modifiziert werden, dass sie in verschiedene Schlösser passen!

Um sie besser auf bestimmte Bakterien abzustimmen, arbeiten Wissenschaftler daran, diese RBPs umzugestalten. Durch das Kombinieren unterschiedlicher Teile hoffen sie, eine ganze Reihe von Tailocinen zu kreieren, die verschiedene Bakterienstämme effektiv anvisieren können.

Der Bedarf an Vielfalt

Tailocine, die gezielt bestimmte Bakterien angreifen, werden immer interessanter, da sie unsere guten Bakterien schonen und helfen, unser Mikrobiom im Gleichgewicht zu halten. Es gibt ein wachsendes Interesse daran, eine Bibliothek dieser speziell abgestimmten Tailocine zu entwickeln, aber die Herausforderung besteht darin, dass Tailocine derzeit nur in wenigen Bakterienarten gefunden werden.

Entwicklung neuer RBPs

Dank Fortschritten in der Ingenieurtechnik ist es jetzt möglich, die Wirtsreichweite von Tailocinen anzupassen. Indem Teile der RBPs aus verschiedenen Quellen ausgetauscht werden, können Wissenschaftler neue Kombinationen schaffen, die eine breitere Palette von Bakterien anvisieren könnten. Der am besten untersuchte Gerüst für dies ist der R2 Tailocin von Pseudomonas aeruginosa.

Die VersaTile-Technik

Hier kommt die VersaTile-Technik ins Spiel, die wie ein Set von LEGO-Steinen für den Bau dieser RBPs funktioniert. Sie ermöglicht es Wissenschaftlern, schnell eine Sammlung unterschiedlicher RBPs zu erstellen und sie in einem Schritt zusammenzusetzen. Die Flexibilität dieser Methode bedeutet, dass es einfacher ist, viele neue Tailocine schnell zu kreieren.

Konzeptbeweis

Als Test gelang es den Forschern, RBPs, die Entwickelt wurden, um das O-Antigen (einen Bestandteil, der auf der Oberfläche bestimmter Bakterien zu finden ist) anzugreifen, auf das R2 Tailocin-Gerüst zu übertragen. Sie fanden heraus, dass diese ingenieure Tailocine effektiv Bakterien mit spezifischen O-Antigenen angreifen konnten, selbst solche, die zuvor unberührt geblieben waren.

Die Produktionspipeline

Der Prozess umfasst die Erstellung einer Bibliothek von Tile-Komponenten, die nach Bedarf zusammengefügt werden, und dann die Produktion der massgeschneiderten Tailocine in speziellen, dafür ingenieurtechnisch vorbereiteten Bakterien. Die Ergebnisse dieser Tests sind vielversprechend und zeigen, dass die Fähigkeit der Tailocine, gewünschte Bakterien anzugreifen, möglich ist.

Effektivität testen

Im Labor haben Wissenschaftler die Effektivität sowohl von ursprünglichen als auch von ingenieure Tailocinen getestet. Sie haben dies durch verschiedene Methoden gemacht, einschliesslich Überlebensversuchen, um zu sehen, wie viele Bakterien bei unterschiedlichen Konzentrationen des Tailocins getötet wurden.

Ergebnisse

Sie fanden heraus, dass der native R2 Tailocin sehr effektiv war und bei niedrigen Konzentrationen töten konnte, während ingenieure Versionen manchmal weniger potent waren, aber dennoch vielversprechend. Das deutet darauf hin, dass das Anpassen dieser Proteine interessante Ergebnisse liefern kann, aber das richtige Engineering entscheidend ist für die Beibehaltung oder Verbesserung ihrer Effektivität.

Die Zukunft der Tailocine

Die Forschung geht weiter, um die Grenzen dessen zu erweitern, was wir mit diesen Tailocinen tun können. Das Ziel ist nicht nur, mehr von ihnen zu erzeugen, sondern solche zu machen, die effektiv eine breite Palette schädlicher Bakterien angreifen können. Mit fortlaufenden Verbesserungen und Studien könnten diese massgeschneiderten Tailocin-Optionen eine praktikable Alternative zu herkömmlichen Antibiotika werden.

Jenseits der Bakterien

Interessanterweise haben Tailocine und RBPs nicht nur antibakterielle Eigenschaften. Sie können auch bei Diagnosen zur Identifizierung bakterieller Stämme helfen und bieten in einigen Situationen eine clevere Alternative zur Verwendung von Antibiotika. Ihre Präzision könnte sie sogar zu besseren Kandidaten für bestimmte medizinische Anwendungen machen als traditionelle Phagen.

Tailocine vs. Phagen

Es ist wichtig, die Unterschiede zwischen Tailocinen und Phagen zu beachten. Während Phagen sich vervielfältigen und sich mit der Zeit anpassen können, bleiben Tailocine konstant. Das bedeutet, dass sie eine stabilere Option bei der Entwicklung von Behandlungen sein könnten.

Fazit

Zusammenfassend ist die Entwicklung von Tailocinen und das Engineering von RBPs ein spannendes Feld. Während die Wissenschaftler noch daran arbeiten, diese Werkzeuge im Labor zu perfektionieren, ist das Potenzial, bakterielle Infektionen zu bekämpfen, ohne unser gesundes Mikrobiom zu stören, ein Licht am Ende eines sehr dunklen Tunnels. Wenn wir aus dieser Reise etwas gelernt haben, dann ist es, dass bakterielle Resistenzen bleiben werden, aber ebenso die kreativen Köpfe, die bereit sind, sich ihnen zu stellen. Mit Tailocinen an der Spitze gibt es Hoffnung auf eine Zukunft mit gesünderen Patienten und weniger Infektionen!

Originalquelle

Titel: A VersaTile approach to reprogram the specificity of the R2-type tailocin towards different serotypes of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae

Zusammenfassung: Phage tail-like bacteriocins, or tailocins, provide a competitive advantage to producer cells by killing closely related bacteria. Morphologically similar to headless phages, their narrow target specificity is determined by receptor-binding proteins (RBPs). While RBP engineering has been used to alter the host range of a selected R2 tailocin from Pseudomonas aeruginosa, the process is labor-intensive, limiting broader application. We introduce a VersaTile-driven R2 tailocin engineering platform to scale up RBP grafting. This platform achieved three key milestones: (1) engineering R2 tailocins specific to Escherichia coli serogroups O26, O103, O104, O111, O145, O146 and O157; (2) reprogramming R2 tailocins to target for the first time capsule and a new species, specifically the capsular serotype K1 of E. coli and K11 and K63 of Klebsiella pneumoniae; (3) creating the first bivalent tailocin with a branched RBP and cross-species activity, effective against both E. coli K1 and K. pneumoniae K11. Over 90% of engineered tailocins were effective, with clear pathways for further optimization identified. ImportanceWhile tailocin engineering is a proven and promising concept, the current engineering approach lacks scalability, limiting a vast exploration. This study advances tailocin engineering by increasing its throughput. Implementing a scaled up approach, we have shown the flexibility of the R2 tailocin scaffold to accommodate diverse receptor-binding domains, expanding its functionality to target a new type of receptor (capsule) and a previously untargeted species. In addition, functional tailocins with branched receptor-binding proteins portraying dual, cross-genus activity were produced. This work lays the groundwork for a scalable platform for the development of engineered tailocins, marking an important step towards making R2 tailocins a practical therapeutic tool for targeted bacterial infections.

Autoren: Dorien Dams, Célia Pas, Agnieszka Latka, Zuzanna Drulis-Kawa, Lars Fieseler, Yves Briers

Letzte Aktualisierung: 2024-10-31 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.29.620980

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.29.620980.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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