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# Biologie # Genetik

Neue Wege in der Herzgenbearbeitung beschreiten

CASAAV-HDR kombiniert CRISPR und virale Techniken für die Forschung zu Herzkrankheiten.

Yanjiang Zheng, Joshua Mayourian, Justin S. King, Yifei Li, Vassilios J. Bezzerides, William T. Pu, Nathan J. VanDusen

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Fortschritte in der Fortschritte in der Herz-Genbearbeitung durch präzise DNA-Bearbeitungen. CASAAV-HDR verwandelt die Herzforschung
Inhaltsverzeichnis

CRISPR-Cas9 ist ein Werkzeug, mit dem Wissenschaftler präzise Änderungen an DNA vornehmen können. Stell dir das wie eine Art molekulare Schere vor, die DNA an bestimmten Stellen schneiden kann, um Gene zu reparieren oder zu verändern. Dieses System stammt aus dem Immunsystem von Bakterien, die es nutzen, um sich gegen Viren zu verteidigen.

Die Grundlagen der Genbearbeitung

Die Genbearbeitung mit CRISPR-Cas9 hat die wissenschaftliche Welt im Sturm erobert. Es ist beliebt, weil es relativ einfach zu programmieren ist und eine bessere Effizienz beim Anvisieren bestimmter DNA-Abschnitte bietet im Vergleich zu älteren Methoden. Diese vorherigen Methoden, wie ZFNs und TALENs, waren komplizierter und weniger effektiv.

Indem sie gezielte Schnitte in DNA setzen, können Wissenschaftler beeinflussen, wie Gene sich verhalten. Die Zelle versucht, die Schnitte zu reparieren, und während dieses Reparaturprozesses können Änderungen auftreten, die zum gewünschten Ergebnis führen. Das ist besonders nützlich, wenn es um genetische Krankheiten geht.

Was passiert als Nächstes?

Wenn CRISPR-Cas9 DNA schneidet, hat die Zelle ein paar Möglichkeiten, den Bruch zu reparieren. Normalerweise verwendet sie eine Methode namens nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), die schnell ist, aber zu zufälligen Einfügungen und Löschungen in der DNA-Sequenz führen kann. Während dies Gene stören kann, führt es manchmal auch zum gewünschten Ergebnis.

Alternativ, wenn Wissenschaftler eine Vorlage zur Reparatur bereitstellen, die als Donor-Vorlage bezeichnet wird, kann die Zelle eine präzisere Methode namens homologe Reparation (HDR) verwenden. So können Forscher spezifische Änderungen an der DNA vornehmen, wie das Beheben einer Mutation oder das Hinzufügen von neuem genetischem Material.

Die Geburt von CASAAV-HDR

Hier kommt CASAAV-HDR ins Spiel, ein neuer Ansatz, der CRISPR-Cas9 mit einer Art Virus namens adeno-assoziiertes Virus (AAV) kombiniert. Diese Plattform erleichtert es, CRISPR-Komponenten und Donor-Vorlagen zu Zellen zu bringen, wobei speziell die für die Herzgesundheit wichtigen Zellen, die Kardiomyozyten, angesteuert werden.

CASAAV-HDR ermöglicht es Wissenschaftlern, präzise Änderungen in Herz-Zellen vorzunehmen, mit einer Erfolgsquote von bis zu 45% bei Veränderungen im neonatalen Stadium. Stell dir vor, man kann einen Schalter in den Herz-Zellen umlegen und sehen, wie sie reagieren – genau das macht CASAAV-HDR!

Modellierung von Herzerkrankungen

Angenommen, Wissenschaftler wollen ein Herzproblem untersuchen. Sie können CASAAV-HDR verwenden, um spezifische Mutationen in Genen zu erzeugen, die mit Krankheiten wie dilatierter Kardiomyopathie verbunden sind. Indem sie ein Stück leuchtendes Protein (mScarlet genannt) in ein Gen einfügen, können Forscher beobachten, wie sich die mutierten Proteine in den Herz-Zellen verhalten.

Zum Beispiel könnten sie Mutationen im TTN-Gen erzeugen, das ein Protein namens Titin bildet. Dieses Protein spielt eine wichtige Rolle bei der Herzkontraktion. Die Forscher fanden heraus, dass diese Mutationen verkürzte Proteine produzieren, die nicht richtig funktionieren, weil sie wie ein halbfertiger Motor sind. Durch die Beobachtung, wie diese Proteine in Zellen platziert werden (dank der mScarlet-Markierung), gewinnen Wissenschaftler Einblicke, wie Mutationen Krankheiten verursachen.

Die Bedeutung von Phospholamban

Ein weiterer wichtiger Forschungsbereich beschäftigt sich mit einem Protein namens Phospholamban (PLN). PLN reguliert die Kalziumwerte in Herz-Zellen, was entscheidend für Herzkontraktionen ist. Eine spezifische Mutation namens R14Del im PLN-Gen kann diese Regulierung stören und zu Herzproblemen führen.

Mit CASAAV-HDR können Wissenschaftler das PLN-Gen bearbeiten, um zu untersuchen, wie die Mutation das Verhalten des Proteins beeinflusst. Sie fanden heraus, dass, obwohl der Standort des Proteins in den Zellen weitgehend unverändert bleibt, die Funktion von PLN beeinträchtigt ist, was zu Problemen bei der Kalziumbewegung in und aus den Herz-Zellen führt.

Die Kraft der massiv parallelen Reporter-Assays

In der Welt der Genregulation sind Wissenschaftler daran interessiert zu verstehen, was bestimmte Gene aktiver macht als andere. Um das zu bewältigen, haben sie Massiv parallele Reporter-Assays (MPRAs) entwickelt. Diese Assays helfen, viele Gene gleichzeitig zu untersuchen, um zu verstehen, wie verschiedene DNA-Regionen, bekannt als Enhancer, die Genaktivität regulieren.

Mit CASAAV-HDR können Forscher diese Enhancer präzise an bestimmten Stellen im Genom einfügen. Zum Beispiel zielten sie auf das Tnni1-Gen ab, das wichtig für die Herzfunktion ist. Durch die Integration von Enhancern in dieses Gen konnten sie studieren, wie viel aktiver es in den Herz-Zellen wurde.

Die Ergebnisse waren vielversprechend: Sie fanden heraus, dass bestimmte Enhancer die Genaktivität effektiv erhöhten, was den Weg für tiefere Erkundungen in der Genregulation ebnete.

Einschränkungen und Zukunftsaussichten

Obwohl CASAAV-HDR enormes Potenzial zeigt, hat es auch seine Einschränkungen. Die Effizienz der Änderungen kann variieren, je nachdem, wo die DNA angesteuert wird. Manchmal klappt das Editieren nicht so, wie die Wissenschaftler es sich wünschen, was zu gemischten Ergebnissen innerhalb desselben Gewebes führt.

Jedoch ermöglicht CASAAV-HDR den Forschern, erfolgreich bearbeitete Zellen zu kennzeichnen, was sie einfacher zu studieren macht. Selbst mit seinen Einschränkungen bietet CASAAV-HDR grossartige Möglichkeiten für Wissenschaftler, genetische Krankheiten besser zu verstehen und Wege zu finden, sie zu behandeln.

Fazit: Eine strahlende Zukunft

CASAAV-HDR stellt einen bedeutenden Fortschritt in der Genbearbeitungstechnologie dar. Es hat neue Wege im Bereich der Kardiologie geöffnet, die es Forschern ermöglichen, Krankheiten zu modellieren und Genfunktionen effektiver zu studieren. Mit diesem Werkzeug ist die wissenschaftliche Gemeinschaft besser gerüstet, um genetische Krankheiten anzugehen und potenziell neue Therapien zu entwickeln.

Während Wissenschaftler weiterhin andere mögliche Anwendungen von CASAAV-HDR, wie Gentherapie und Klonen, erkunden, können wir aufregende Fortschritte in unserem Verständnis und der Behandlung von Herzerkrankungen erwarten. All diese Arbeit deutet darauf hin, dass die Zukunft der Genetik vielversprechend ist, und wer weiss? Vielleicht können wir eines Tages gebrochene Herzen nicht nur im emotionalen Sinne reparieren!

Originalquelle

Titel: Cardiac Applications of CRISPR/AAV-Mediated Precise Genome Editing

Zusammenfassung: The ability to efficiently make precise genome edits in somatic tissues will have profound implications for gene therapy and basic science. CRISPR/Cas9 mediated homology-directed repair (HDR) is one approach that is commonly used to achieve precise and efficient editing in cultured cells. Previously, we developed a platform capable of delivering CRISPR/Cas9 gRNAs and donor templates via adeno-associated virus to induce HDR (CASAAV-HDR). We demonstrated that CASAAV-HDR is capable of creating precise genome edits in vivo within mouse cardiomyocytes at the neonatal and adult stages. Here, we report several applications of CASAAV-HDR in cardiomyocytes. First, we show the utility of CASAAV-HDR for disease modeling applications by using CASAAV-HDR to create and precisely tag two pathological variants of the titin gene observed in cardiomyopathy patients. We used this approach to monitor the cellular localization of the variants, resulting in mechanistic insights into their pathological functions. Next, we utilized CASAAV-HDR to create another mutation associated with human cardiomyopathy, arginine 14 deletion (R14Del) within the N-terminus of Phospholamban (PLN). We assessed the localization of PLN-R14Del and quantified cardiomyocyte phenotypes associated with cardiomyopathy, including cell morphology, activation of PLN via phosphorylation, and calcium handling. After demonstrating CASAAV-HDR utility for disease modeling we next tested its utility for functional genomics, by targeted genomic insertion of a library of enhancers for a massively parallel reporter assay (MPRA). We show that MPRAs with genomically integrated enhancers are feasible, and can yield superior assay sensitivity compared to tests of the same enhancers in an AAV/episomal context. Collectively, our study showcases multiple applications for in vivo precise editing of cardiomyocyte genomes via CASAAV-HDR.

Autoren: Yanjiang Zheng, Joshua Mayourian, Justin S. King, Yifei Li, Vassilios J. Bezzerides, William T. Pu, Nathan J. VanDusen

Letzte Aktualisierung: 2024-12-04 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.03.626493

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.03.626493.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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