Abwasser-Tests: Ein neuer Ansatz zur Virusüberwachung
Abwasserüberwachung liefert wichtige Einblicke in die Trends von Atemwegsviren.
Melissa Pitton, Rachel E. McLeod, Lea Caduff, Ayazhan Dauletova, Jolinda de Korne-Elenbaas, Charles Gan, Camille Hablützel, Aurélie Holschneider, Seju Kang, Guy Loustalot, Patrick Schmidhalter, Linda Schneider, Anna Wettlauffer, Daniela Yordanova, Timothy R. Julian, Christoph Ort
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Inhaltsverzeichnis
- Was ist Abwasser-Überwachung?
- Wie funktioniert die Abwassertestung?
- Ein genauerer Blick auf den neuen dPCR-Test
- Überwachung über Schweizer Kläranlagen hinweg
- Herausforderungen bei der Abwassertestung
- Was haben sie gefunden?
- Die Achterbahn der viralen Trends
- Vergleich von Abwasserdaten mit klinischen Fällen
- Zeitverzögerung zwischen Abwasser- und klinischen Daten
- Einschränkungen der Abwasserüberwachung
- Abwasserüberwachung als wertvolles Werkzeug
- Fazit
- Originalquelle
Atemwegsinfektionen sind weltweit ein grosses Thema, besonders für Kids und ältere Leute. Diese Infektionen können von verschiedenen Viren wie Influenza A und B, dem Respiratory Syncytial Virus (RSV) und SARS-CoV-2, das für COVID-19 verantwortlich ist, kommen. Normalerweise tauchen diese Viren in bestimmten Saisons auf, aber manchmal feiert die Influenza ganzjährig in manchen Gegenden. Zu verstehen, wie sich diese Viren verbreiten, ist super wichtig, aber an genaue Daten zu kommen, kann ganz schön knifflig sein, weil Leute nicht zum Arzt gehen oder Krankenhäuser ihre Berichterstattung ändern.
Was ist Abwasser-Überwachung?
Abwasser-Überwachung (WBS) ist wie ein Geheimagent, der hilft, Viren in der Gemeinde zu überwachen. Statt nur darauf zu setzen, dass Leute zum Arzt gehen, sucht WBS nach genetischem Material dieser Viren im Abwasser. Diese Methode hat besonders während der COVID-19-Pandemie an Beliebtheit gewonnen, da sie einen breiteren Blick darauf bietet, wie viele Leute möglicherweise infiziert sein könnten.
Durch die Analyse von Abwasser können Wissenschaftler einen Überblick darüber bekommen, welche Viren in ganzen Regionen zirkulieren. Eine Probe von einer Kläranlage kann Trends in einer Gemeinde aufdecken, ohne dass Leute sich testen lassen müssen. Diese Methode unterstützt auch traditionelle klinische Daten, sodass Gesundheitsbehörden schneller und genauer reagieren können.
Wie funktioniert die Abwassertestung?
WBS umfasst das Sammeln von Abwasserproben und deren Testung mit High-Tech-Werkzeugen wie quantitativer PCR (qPCR) und digitaler PCR (dPCR). Diese Methoden helfen Wissenschaftlern, spezifisches virales genetisches Material im Wasser zu finden und zu messen. Das Schöne an dieser Technik ist, dass sie mehrere Viren gleichzeitig erkennen kann. Also, während du die Reste von letzter Nacht hinunterspülst, könnten Wissenschaftler herausfinden, wie viele Influenza-Viren in deiner Stadt im Abwasser herumschwirren.
Ein genauerer Blick auf den neuen dPCR-Test
In der Schweiz haben Wissenschaftler einen neuen dPCR-Test entwickelt, der gleichzeitig vier gängige Atemwegsviren erkennen kann: Influenza A, Influenza B, RSV und SARS-CoV-2. Sie haben sogar ein bisschen Qualitätskontrolle eingebaut, indem sie das Murine Hepatitis Virus (MHV) als Marker verwenden, um sicherzustellen, dass alles gut funktioniert.
Sieh diesen Test als das Schweizer Taschenmesser der Virusdetektion an. Anstatt mehrere Tests für jedes Virus zu verwenden, kann dieser mehrere gleichzeitig angehen, was Zeit und Ressourcen spart. Er verwendet spezielle fluoreszierende Marker, um verschiedene Viren zu identifizieren, was es den Wissenschaftlern leicht macht zu sehen, was im Abwasser vorhanden ist.
Überwachung über Schweizer Kläranlagen hinweg
Das Schweizer Abwasserüberwachungsprogramm begann im Juli 2020 und hat sich weiterentwickelt, um Tests für alle vier genannten Viren einzuschliessen. Durch das Sammeln von Proben aus 14 Kläranlagen deckt das Programm einen bedeutenden Teil der Bevölkerung ab und sorgt für eine zuverlässige Darstellung des Gesundheitsstatus der Region.
Während des Studienzeitraums von Juli 2023 bis Juli 2024 führten die Forscher über 13.000 individuelle Tests durch und analysierten fast 3.600 verschiedene Proben. Durch diese Bemühungen lernten sie, wie man Probleme bei Atemwegsviren erkennt.
Herausforderungen bei der Abwassertestung
Abwasser ist nicht alles Sonnenschein und Regenbogen; es ist eine chaotische Mischung aus verschiedenen Dingen. Weil es nicht rein ist, kann es Substanzen enthalten, die die Tests stören, die als PCR-Inhibitoren bekannt sind. Die Wissenschaftler mussten Wege finden, um mit Inhibitoren umzugehen und Tests bei Bedarf zu wiederholen. Sie stellten fest, dass, obwohl die meisten Tests reibungslos liefen, es immer noch einige Schwierigkeiten im Prozess gab.
Zum Beispiel hatten sie an manchen Orten wie Basel mehr Probleme mit der Probenqualität im Vergleich zu Orten wie Solothurn. Es ist wie der Versuch, eine perfekte Tasse Kaffee in einem Café mit einer wenig beeindruckenden Wasserversorgung zu brühen; es funktioniert einfach nicht so gut.
Was haben sie gefunden?
In Bezug auf die Ergebnisse entdeckten sie Influenza A in etwa 27% der Proben, Influenza B in 42% und RSV in 38%. Was SARS-CoV-2 angeht, fanden sie es in fast jeder Probe, die sie getestet haben. Das zeigt, dass, während einige Viren seltener sind, COVID-19 während der Studie ganz schön im Umlauf war.
Interessanterweise zeigte die Testung auch Variationen in den viralen Lasten über die Zeit. Das Team stellte Spitzen in der Menge des viralen RNA im Abwasser fest, die oft mit bekannten Ausbrüchen in der Gemeinde übereinstimmten. Solche Daten helfen nicht nur dabei, aktuelle Trends zu verfolgen, sondern geben auch Aufschluss für zukünftige Massnahmen im Gesundheitswesen.
Die Achterbahn der viralen Trends
Während des Überwachungszeitraums gab es einige klare Trends. Zum Beispiel gab es einen grossen Anstieg von SARS-CoV-2-Fällen von Oktober 2023 bis Februar 2024, gefolgt von einer kleineren Welle im April 2024. Andere Viren wie RSV und Influenza A zeigten ebenfalls saisonale Muster, wobei Influenza A zu Beginn des Jahres einen Höhepunkt erreichte.
Die Forscher verwendeten eine clevere Technik namens rollierende Mediane, um die Daten zu glätten und klarere Trends über die Zeit zu zeigen. Diese Methode half, zu visualisieren, wann bestimmte Viren einen Höhepunkt erreichten, ganz ähnlich wie wenn man eine Welle im Ozean sieht, die sich aufbaut, bevor sie bricht.
Vergleich von Abwasserdaten mit klinischen Fällen
Einer der nützlichsten Aspekte dieser Studie war der Vergleich der im Abwasser erkannten viralen Lasten mit tatsächlichen klinischen Fällen, die von Gesundheitsbehörden gemeldet wurden. Sie fanden starke Korrelationen, insbesondere mit SARS-CoV-2 und Influenza A. Es ist, als könnte man vorhersagen, wann das Eiswagen ankommt, basierend darauf, wann die Leute anfangen, um die Ecke zu versammeln – das Abwasser gibt Hinweise auf die Gesundheitstrends der Gemeinde.
Allerdings fanden sie heraus, dass die Korrelation für Influenza B schwächer war, was darauf hindeutet, dass es möglicherweise nicht so viele auffällige Infektionen verursacht. Diese Diskrepanz deutete darauf hin, dass die Überwachung von Abwasser nicht nur sagt, was passiert; sie hilft auch Forschern zu verstehen, wie die Krankheit die Gemeinde beeinflusst.
Zeitverzögerung zwischen Abwasser- und klinischen Daten
Ein weiterer interessanter Punkt war die Untersuchung von Zeitverzögerungen zwischen den Daten. Das Team fand heraus, dass in einigen Fällen die Abwasserdaten Trends zeigen könnten, bevor die klinischen Daten nachziehen. Das bedeutet, dass die Abwasserüberwachung als Frühwarnsystem für potenzielle Ausbrüche fungieren könnte.
Die Verzögerungszeiten variierten jedoch je nach Virus, wobei einige nur eine Woche hintersortiert waren, während andere längere Verzögerungen hatten. Es ist wie der Versuch, einen Zug zu erwischen: Manchmal kommt man genau rechtzeitig an, während man manchmal ein bisschen am Bahnsteig warten muss.
Einschränkungen der Abwasserüberwachung
Obwohl die Arbeit, die in dieser Studie geleistet wurde, beeindruckend ist, ist es wichtig zu beachten, dass es Einschränkungen gibt. Zum einen, während die Abwassertests helfen, Trends zu identifizieren, könnten sie bei Viren mit niedriger Prävalenz Schwierigkeiten haben, Ausbrüche zu erkennen.
Ausserdem können die Daten je nach Standort und anderen Faktoren erheblich variieren, einschliesslich der Art und Weise, wie das Abwassersystem eingerichtet ist und des Verhaltens der Gemeinde. Genau wie die Bewohner einer Stadt es lieben könnten, zu feiern, aber die Gesundheitsrichtlinien ignorieren, kann die Effektivität dieser Methode von verschiedenen sozialen und umweltbedingten Faktoren abhängen.
Abwasserüberwachung als wertvolles Werkzeug
Trotz der Herausforderungen zeigen die Ergebnisse, dass die Abwasserüberwachung ein mächtiges Ergänzungsinstrument zu klinischen Daten sein kann. Sie liefert Einsichten, die sonst möglicherweise übersehen würden, besonders in Gegenden, wo das traditionelle Gesundheitssystem nicht so stark ist.
In Regionen, in denen die Überwachungssysteme nicht so robust sind, könnte WBS eine noch wichtigere Rolle im Gesundheitswesen spielen. Denk daran wie an einen Gesundheitsdetektiv, der die Hinweise zusammenfügt, um sicherzustellen, dass die Gemeinden sicher und gesund bleiben.
Fazit
Zusammenfassend hat dieser innovative Ansatz zur Überwachung von Atemwegsviren durch Abwasserüberwachung wertvolle Einsichten in die öffentliche Gesundheit geliefert. Die Entwicklung eines sechsfachen dPCR-Tests ermöglicht eine effiziente Erkennung mehrerer Viren auf einmal. Mit den in der Schweiz gesammelten Daten können Forscher sehen, wie sich diese Viren über die Zeit verhalten und wie sie mit den gemeldeten klinischen Fällen korrelieren.
Obwohl es Hindernisse zu überwinden gibt, leuchtet das Potenzial von Abwasserdaten, um die öffentliche Gesundheit zu informieren, weiterhin hell. Während die Wissenschaftler daran arbeiten, ihre Methoden zu verfeinern und die Erkennungsraten zu verbessern, könnte dieser kreative Ansatz tatsächlich zu einem Standardwerkzeug in der Gesundheitsüberwachung weltweit werden.
Also, das nächste Mal, wenn du die Toilette spülst, denk daran: Dieses Wasser trägt nicht nur das Mittagessen von gestern weg; es könnte den Gesundheitsbehörden sagen, welche Viren in deiner Gemeinde herumschwirren!
Originalquelle
Titel: A six-plex digital PCR assay for monitoring respiratory viruses in wastewater
Zusammenfassung: Wastewater-based surveillance systems can track trends in multiple pathogens simultaneously by leveraging efficient, streamlined laboratory processing. In Switzerland, wastewater surveillance is conducted for fourteen locations representing 2.3 million people, or 26% of the national population, with simultaneous surveillance of four respiratory pathogens. Trends in respiratory diseases are tracked using a novel, six-plex digital PCR assay targeting Influenza A, Influenza B, Respiratory Syncytial Virus, and SARS-CoV-2 N1 and N2 genes, as well as Murine Hepatitis Virus for recovery efficiency control. The multiplex assay was developed to ensure sensitivity and accurate quantification for all targets simultaneously. Wastewater data is also integrated with disease data obtained through both a mandatory disease reporting system and the Swiss Sentinel System (Sentinella), a voluntary reporting system for general practitioners. Comparisons between wastewater data and case data from July 2023 through July 2024 demonstrate a high level of agreement, specifically for Influenza A, SARS-CoV-2, and Respiratory Syncytial Virus. Lower correspondence is observed for Influenza B, which highlights challenges in tracking disease dynamics during seasons without pronounced outbreak periods. Wastewater monitoring further revealed that targeting the N1 or N2 gene led to divergent estimates of SARS-Cov-2 viral loads, highlighting the impact of mutations in the target region of the assay on tracking trends. The study emphasizes the importance of an integrated wastewater monitoring program as a complementary tool for public health surveillance by demonstrating clear concordance with clinical data for respiratory pathogens beyond SARS-CoV-2.
Autoren: Melissa Pitton, Rachel E. McLeod, Lea Caduff, Ayazhan Dauletova, Jolinda de Korne-Elenbaas, Charles Gan, Camille Hablützel, Aurélie Holschneider, Seju Kang, Guy Loustalot, Patrick Schmidhalter, Linda Schneider, Anna Wettlauffer, Daniela Yordanova, Timothy R. Julian, Christoph Ort
Letzte Aktualisierung: 2024-12-10 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.12.06.24317241
Quell-PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.12.06.24317241.full.pdf
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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