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Avanços na Medição da Orientação de Moléculas Fluorescentes

Novos métodos melhoram a medição de marcadores fluorescentes, aumentando as percepções biológicas.

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Medir a orientação de moléculas fluorescentes pode dar informações importantes sobre estruturas e atividades na biologia e na ciência dos materiais. Ao anexar um marcador fluorescente a uma amostra biológica que se move com a estrutura, os cientistas podem aprender sobre o comportamento dela observando a orientação do marcador. Muitos Marcadores Fluorescentes se iluminam de uma forma específica quando são excitados por luz, então os pesquisadores podem usar microscópios especiais para ver como o padrão de luz muda. Isso pode ajudar a entender a orientação dos marcadores.

Tem várias técnicas que fazem Medições em áreas pequenas limitadas pelo tamanho da luz usada. Fazendo várias medições do mesmo ponto com diferentes configurações de luz, os pesquisadores conseguem calcular a orientação dos marcadores fluorescentes. Isso ajudou a estudar diversos fenômenos biológicos como membranas celulares, dinâmica de proteínas e diferentes materiais.

Recentemente, novos métodos permitiram que os cientistas medem moléculas individuais. Essas técnicas agora podem fornecer mais informações, incluindo a posição e a orientação das moléculas, que é valiosa para estudar coisas como como o DNA muda de forma sob estresse ou o comportamento de proteínas específicas. No entanto, esses métodos têm limitações relacionadas à rapidez com que podem fazer as medições e aos tipos de marcadores que podem ser usados.

Depois de analisar as técnicas disponíveis, foi encontrado uma lacuna na capacidade de medir tanto a orientação quanto a posição de grupos de marcadores fluorescentes. Um novo sistema chamado sistema de luz de folha de dupla visão foi proposto. Essa configuração tem dois braços para excitar e detectar luz, permitindo uma iluminação mais variada e melhor resolução ao olhar para as amostras.

Usando Polarizadores de Cristal Líquido

Nos primeiros testes, polarizadores de cristal líquido foram adicionados a ambos os braços desse novo sistema de luz de folha para ver como a orientação dos marcadores fluorescentes poderia ser medida em áreas pequenas. No entanto, combinar os dados de moléculas únicas com os métodos tradicionais usados para grupos de moléculas provou ser difícil. Uma nova abordagem, inspirada em uma técnica de imagem existente chamada imagem por ressonância magnética de tensor de difusão, foi desenvolvida para ajudar a medir a orientação tridimensional dos marcadores fluorescentes de forma mais eficaz.

Esse novo método se concentrou em usar uma Função de Distribuição de Orientação, que é uma maneira de representar e analisar a orientação dos marcadores. Isso permitiu aos cientistas identificar problemas nas medições e encontrar uma solução, chamada inclinação da luz de folha. Esse ajuste melhorou a capacidade de resolver ambiguidades de orientação. Resultados subsequentes mostraram várias estruturas em células, incluindo membranas e complexos de proteínas.

Entendendo Funções de Distribuição de Orientação (FDOs)

As funções de distribuição de orientação (FDOs) servem como modelos para representar como os marcadores fluorescentes estão orientados em uma área específica. Para muitos marcadores comuns, é razoável assumir que seus padrões de absorção e emissão podem ser simplificados para um único eixo. Ao resumir todos os marcadores em uma área pequena, os pesquisadores podem visualizar a FDO como uma função esférica, onde o tamanho da esfera representa o número de marcadores orientados em cada direção.

Os marcadores fluorescentes podem girar enquanto estão sendo medidos, levando a mudanças nas FDOs. A forma como esses marcadores são excitados e emitem luz significa que seus padrões são sempre simétricos. Assim, as FDOs podem ser efetivamente usadas para modelar o comportamento de grupos de marcadores dentro de estruturas biológicas.

Diferentes formas de FDOs podem representar vários comportamentos de marcadores fluorescentes. Por exemplo, marcadores que podem girar livremente mostrarão uma FDO esférica, enquanto aqueles que estão restritos a uma superfície assumirão formas diferentes. Entender essas FDOs é crucial para interpretar como os marcadores fluorescentes se comportam em diferentes ambientes.

Excitação e Detecção de Dupla Visão

Nesta seção, a configuração do sistema de luz de folha de dupla visão é explicada. Esse sistema é composto por duas lentes de imersão em água que podem tanto excitar quanto detectar luz. Usando essas lentes, os pesquisadores podem criar diferentes padrões de excitação para estudar as amostras. A capacidade de alternar entre diferentes configurações de iluminação permite a excitação seletiva de marcadores específicos na amostra.

O uso de decomposições harmônicas esféricas permite que os pesquisadores simulem e analisem FDOs para entender melhor seus designs. As simulações mostram como as FDOs podem ser decompostas em componentes mais simples, o que ajuda a tirar conclusões sobre as amostras em estudo.

O sistema de imagem permite medições melhoradas e pode capturar muitas informações sobre as orientações 3D dos marcadores fluorescentes. Os dados podem ser visualizados de várias maneiras, incluindo mostrando onde a maioria dos marcadores está orientada ou a densidade de marcadores em diferentes áreas.

Superando Desafios de Medição com Inclinação da Luz de Folha

Durante o processo de imagem, certos componentes angulares dos dados foram encontrados como faltando, o que levou a dificuldades em recuperar todas as orientações. Ao adicionar capacidades de inclinação ao sistema de luz de folha, os cientistas puderam iluminar a mesma área de amostra enquanto acessavam novas informações angulares.

Essa mudança ajuda a produzir melhor contraste e iluminar mais orientações, permitindo uma compreensão mais completa de como os marcadores estão orientados em três dimensões. Os pesquisadores descobriram que usar uma combinação de diferentes medições com as luzes de folha inclinadas melhorou sua capacidade de resolver as formas das FDOs e medir orientações com precisão.

A nova configuração foi validada examinando vesículas unilamelares gigantes (VUGs) e mostrou que os marcadores fluorescentes se alinharam como esperado. A capacidade de corrigir problemas de medições anteriores demonstrou os benefícios da abordagem de inclinação, levando a resultados mais precisos.

Validação com Amostras Biológicas

Depois de estabelecer que a inclinação da luz de folha melhorou a recuperação da orientação, o método foi usado para estudar várias amostras biológicas. O sistema foi testado usando VUGs, xilema de plantas e proteínas de actina em células.

Nos testes com VUGs, as FDOs e orientações de pico foram analisadas, mostrando que os marcadores consistentemente apontavam para longe da superfície como previsto. As configurações mostraram-se capazes de detectar mudanças sutis na orientação.

Ao examinar células de xilema, as FDOs refletiram as orientações esperadas das estruturas de celulose, confirmando o conhecimento anterior de estudos focados em observações bidimensionais. As medições demonstraram a precisão do sistema e a capacidade de revelar novas perspectivas sobre estruturas tridimensionais.

Finalmente, as proteínas de actina em células U2OS foram analisadas para mapear suas orientações. Os resultados confirmaram o alinhamento esperado dos filamentos de actina ao longo de seus eixos longos, mostrando a eficácia do sistema em visualizar estruturas complexas em três dimensões.

Investigando Comportamento Celular em Nanofios

O sistema foi usado para estudar fibroblastos de camundongo cultivados em matrizes de nanofios. Essa configuração ajuda a investigar como as células interagem com o ambiente ao seu redor.

As imagens mostraram que os filamentos de actina se alinharam com os nanofios mais próximos, permitindo que os cientistas explorassem o comportamento celular local. Os modelos reconstruídos indicaram populações distintas de orientações de actina e foram usados para derivar métricas que ilustram como esses filamentos interagiam com seu ambiente local.

Os pesquisadores compararam os resultados de diferentes arranjos de nanofios e descobriram que as orientações de actina variavam significativamente com base no substrato. Os dados revelaram uma correlação entre o comportamento local dos filamentos de actina e a forma geral das células, proporcionando insights sobre como a arquitetura celular se relaciona à matriz extracelular subjacente.

Considerações Finais

Os avanços em medir orientações de moléculas fluorescentes estabeleceram uma ponte entre estudos bidimensionais e insights tridimensionais. A introdução de técnicas como funções de distribuição de orientação refinou como os cientistas analisam dados de marcadores fluorescentes. O sistema de luz de folha de dupla visão, aprimorado pela inclinação da luz de folha, permitiu medições mais precisas, levando a novas descobertas sobre estruturas biológicas.

Ainda há potencial para melhorar esses sistemas de imagem, especialmente em aumentar a velocidade de medição e aprimorar a uniformidade das respostas. Trabalhos futuros podem introduzir novos marcadores fluorescentes e explorar medições resolvidas no tempo para entender melhor o comportamento dinâmico de sistemas biológicos complexos.

No geral, o trabalho ampliou as capacidades para estudar orientações moleculares, permitindo que os pesquisadores compreendam melhor fenômenos biológicos e materiais em três dimensões.

Fonte original

Título: Three-dimensional spatio-angular fluorescence microscopy with a polarized dual-view inverted selective-plane illumination microscope (pol-diSPIM)

Resumo: Polarized fluorescence microscopy is a valuable tool for measuring molecular orientations, but techniques for recovering three-dimensional orientations and positions of fluorescent ensembles are limited. We report a polarized dual-view light-sheet system for determining the three-dimensional orientations and diffraction-limited positions of ensembles of fluorescent dipoles that label biological structures, and we share a set of visualization, histogram, and profiling tools for interpreting these positions and orientations. We model our samples, their excitation, and their detection using coarse-grained representations we call orientation distribution functions (ODFs). We apply ODFs to create physics-informed models of image formation with spatio-angular point-spread and transfer functions. We use theory and experiment to conclude that light-sheet tilting is a necessary part of our design for recovering all three-dimensional orientations. We use our system to extend known two-dimensional results to three dimensions in FM1-43-labelled giant unilamellar vesicles, fast-scarlet-labelled cellulose in xylem cells, and phalloidin-labelled actin in U2OS cells. Additionally, we observe phalloidin-labelled actin in mouse fibroblasts grown on grids of labelled nanowires and identify correlations between local actin alignment and global cell-scale orientation, indicating cellular coordination across length scales.

Autores: Talon Chandler, M. Guo, Y. Su, J. Chen, Y. Wu, J. Liu, A. Agashe, R. S. Fischer, S. B. Mehta, A. Kumar, T. I. Baskin, V. Jamouille, H. Liu, V. Swaminathan, A. Nain, R. Oldenbourg, P. La Riviere, H. Shroff

Última atualização: 2024-03-12 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.09.584243

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.09.584243.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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