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# Biologia# Biofísica

Insights sobre a funcionalidade do canal Kv1.2

Pesquisa aprofunda o conhecimento sobre os canais de potássio Kv1.2 e seus mecanismos de inativação.

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Insights do Canal Kv1.2Insights do Canal Kv1.2da função e inativação do Kv1.2.Pesquisa revela os mecanismos por trás
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Canais de Potássio são proteínas importantes nas nossas células que ajudam a controlar o movimento de íons de potássio. Dentro deles, a família de canais Kv1 é bem estudada. Esses canais têm a forma de quatro unidades conectadas, cada uma com seis partes que atravessam a membrana celular. Um dos membros mais conhecidos dessa família é o canal Shaker da Drosophila, que tem sido um assunto popular de pesquisa porque é pequeno e fácil de trabalhar no laboratório.

Descoberta do Canal Shaker

O canal Shaker foi descoberto no final da década de 1980. Ele se tornou um modelo importante para estudar como os canais iônicos funcionam. O axônio gigante de lula, que é uma fibra nervosa grande, também tem uma corrente de potássio semelhante à do canal Shaker. Essa semelhança ajudou os pesquisadores a aprender mais sobre como esses canais funcionam.

Estruturas Cristalinas do Canal Kv1.2

Em 2005, pesquisadores obtiveram uma estrutura cristalina detalhada de 2,9 Å de um canal relacionado chamado Kv1.2. Essa estrutura revelou a forma geral do canal, mas tinha partes pouco claras nas áreas cruciais conhecidas como domínios sensores de voltagem. Dois anos depois, cientistas apresentaram uma estrutura mais detalhada de 2,4 Å de uma versão modificada do Kv1.2, chamada “quimera paddle.” Essa nova estrutura forneceu uma visão mais clara dos domínios sensores de voltagem, levando a uma melhor compreensão de como esses canais detectam voltagem e se abrem ou fecham. Outra estrutura, usando um método chamado microscopia crioeletrônica (cryo-EM), confirmou as descobertas anteriores.

Recentemente, os pesquisadores também obtiveram a estrutura cryo-EM do canal Shaker original. Essas estruturas do Kv1.2 e do Shaker têm sido amplamente utilizadas em pesquisas, mas mostram algumas diferenças em suas propriedades.

Processo de Inativação em Canais de Potássio

A inativação é o processo que reduz o fluxo de íons através do canal mesmo se a membrana ainda estiver ativada. Uma forma dessa inativação, chamada inativação do tipo C, envolve mudanças na estrutura do canal. Pesquisadores descobriram que certas mutações no canal podem acelerar ou desacelerar esse processo de inativação. Por exemplo, uma mutação específica no canal Shaker leva a uma perda quase completa do fluxo de íons.

Estruturas desse mutante e mutações similares mostram um alargamento significativo nas áreas que normalmente se ligam aos íons, dificultando a passagem dos íons pelo canal. Observou-se que a ausência de íons de potássio aumenta esse processo de inativação. Quando o potássio é substituído por sódio em outro canal, a região do filtro de seletividade colapsa, bloqueando a passagem de íons.

Efeitos da Concentração de Íons de Potássio

Os efeitos da baixa concentração de potássio foram examinados em vários canais. Em alguns canais, a parte externa do poro se torna menos estável quando os níveis de potássio estão baixos, removendo certos locais de ligação para íons. Em um canal diferente, o baixo potássio causa dilatação ou alargamento do filtro de seletividade. Em contraste, uma simulação mostrou que, quando o canal fecha, a água e os íons são completamente eliminados de uma determinada área, mas o filtro de seletividade permanece intacto com íons de potássio ainda ligados.

Diante desses vários efeitos, estudos recentes buscaram visualizar a estrutura do canal Kv1.2 na ausência de íons de potássio.

Toxinas e Canais de Potássio

Os canais Kv também são afetados por várias toxinas que podem inibir sua função bloqueando o fluxo de íons. Esse bloqueio geralmente ocorre no próprio poro do canal. Algumas toxinas conhecidas foram capturadas em estruturas cristalinas, mostrando seus locais de ligação. Este estudo se concentrou nas dendrotoxinas, que vêm de cobras mamba e são conhecidas por bloquear efetivamente os canais Kv.

Visão Geral da Estrutura do Kv1.2

Para o estudo atual, o canal Kv1.2 foi construído com mutações específicas para torná-lo adequado para determinação estrutural. As mutações foram projetadas para evitar interações fortes com os materiais usados para análise. Mesmo que diferentes formas do canal tenham sido expressas, muitas estruturas semelhantes foram observadas nas micrografias de cryo-EM, demonstrando que a presença de outras subunidades tem pouco efeito na estrutura geral do canal.

Os canais foram expressos em uma linhagem específica de levedura e purificados usando detergentes. Depois, foram submetidos a análise cryo-EM para obter dados estruturais detalhados dos canais em vários estados, incluindo estados abertos e inativados.

Análise Estrutural do Canal Kv1.2

As estruturas obtidas mostraram semelhanças com modelos anteriores do Kv1.2 e do canal Shaker da Drosophila. Os domínios sensores de voltagem e a parte do canal que permite o fluxo de íons estavam claramente visíveis nos mapas criados a partir dos dados de cryo-EM. Observações indicaram uma correspondência próxima entre os vários canais, confirmando que a arquitetura geral do Kv1.2 é mantida em diferentes condições.

Estrutura do Canal Aberto

A forma aberta do canal Kv1.2 foi caracterizada, mostrando que não havia barreiras para o fluxo de íons, indicando seu estado ativo. A disposição dos resíduos chave dentro dos domínios sensores de voltagem correspondia aos encontrados em outros canais estudados, destacando a conservação dessas características essenciais entre diferentes tipos de canais de potássio.

Análise da Região do Poro

Comparar as estruturas de diferentes estados revelou insights importantes sobre como o canal funciona quando está aberto em comparação com quando está inativado. Diferenças significativas foram notadas nas configurações do filtro de seletividade e da região do poro. Em particular, mudanças nas posições de resíduos específicos indicaram que o P-loop, que forma os locais de ligação de íons, passa por deslocamentos consideráveis durante a inativação.

Mecanismos de Inativação

A inativação envolve uma mudança em que resíduos específicos perdem suas interações estabilizadoras. Essas alterações resultam em uma área extracelular maior e uma disposição diferente nos locais de ligação de íons, o que afeta o fluxo de íons de potássio. É evidente que as rearrumações estruturais durante a inativação permitem mudanças na condução de íons, à medida que o canal transita de um estado aberto para um inativado.

Comparando Diferentes Estruturas de Canais

Diversas mutações em canais de potássio foram observadas, resultando em várias respostas de inativação. Ao comparar as estruturas de diferentes variantes, foi descoberto que a extensão da inativação não era uniforme entre todos os canais. As descobertas indicam que características estruturais individuais, como interações entre resíduos, desempenham um papel significativo na determinação do comportamento do canal durante a inativação.

Interação da Dendrotoxina com o Kv1.2

As dendrotoxinas bloqueiam os canais Kv ao se inserirem no poro do canal. Neste estudo, a estrutura do Kv1.2 ligado à dendrotoxina foi examinada. A toxina se liga a locais específicos dentro do canal, usando resíduos carregados positivamente para interagir com partes carregadas negativamente do canal.

Essa interação impede que os íons passem pelo canal, bloqueando efetivamente sua função. A posição dos locais de ligação foi modelada dentro do contexto da estrutura do canal, fornecendo insights sobre como as toxinas afetam a atividade do canal.

Kv1.2 em Condições Sem K+

Quando os íons de potássio são substituídos por íons de sódio, espera-se que o canal Kv1.2 passe por mudanças conformacionais. Curiosamente, a estrutura do Kv1.2 em uma solução de sódio mostrou mudanças limitadas em relação à sua estrutura em um estado ligado ao potássio. Os locais de ligação de íons ainda exibiram densidade para íons de sódio, indicando que o canal ainda poderia funcionar até certo ponto.

Estabilidade Estrutural na Ausência de Potássio

Uma descoberta notável foi a instabilidade do canal Kv1.2 na ausência de íons de potássio. A variante do canal mostrou flutuações significativas em sua estrutura, particularmente na região que conecta diferentes domínios. Essa instabilidade aponta para a importância dos íons de potássio na manutenção da formação adequada do canal.

Técnicas de Expressão e Purificação

Os canais Kv1.2 foram desenvolvidos no laboratório, com mutações cuidadosas para garantir a expressão adequada. O processo começou com a clonagem dos genes em vetores específicos e sua transformação em células de levedura. Após cultivar as células, uma série de etapas de purificação foram realizadas para isolar as proteínas do canal. Esses procedimentos incluíram lise celular, solubilização com detergentes e técnicas de purificação por afinidade para obter uma amostra limpa para análise posterior.

Aquisição e Processamento de Dados de Cryo-EM

Para visualizar os canais construídos em diferentes estados, foi empregada a cryo-EM. Essa técnica envolve preparar grades com as amostras de proteína, congelá-las rapidamente e imagina-las usando equipamentos de cryo-EM de alta resolução. Os dados passaram por um extenso processamento para refinar as estruturas e obter mapas detalhados ilustrando as diferentes conformações do canal.

Conclusão

Em conclusão, estudar o canal Kv1.2 revela insights importantes sobre como os canais de potássio funcionam, especialmente em resposta a várias condições como mudanças na concentração de íons e interações com toxinas. As estruturas detalhadas obtidas a partir desta pesquisa aumentam nossa compreensão dos mecanismos que fundamentam a ativação e a inativação do canal, estabelecendo as bases para futuros estudos focados no papel dos canais iônicos na saúde e na doença. Esse conhecimento é crucial para desenvolver terapias que visem esses canais e para entender sua importância na fisiologia celular.

Fonte original

Título: Cryo-EM structures of Kv1.2 potassium channels, conducting and non-conducting

Resumo: We present near-atomic-resolution cryo-EM structures of the mammalian voltage-gated potassium channel Kv1.2 in open, C-type inactivated, toxin-blocked and sodium-bound states at 3.2 [A], 2.5 [A], 3.2 [A], and 2.9[A]. These structures, all obtained at nominally zero membrane potential in detergent micelles, reveal distinct ion-occupancy patterns in the selectivity filter. The first two structures are very similar to those reported in the related Shaker channel and the much-studied Kv1.2-2.1 chimeric channel. On the other hand, two new structures show unexpected patterns of ion occupancy. First, the toxin - Dendrotoxin, like Charybdotoxin, is seen to attach to the negatively-charged channel outer mouth, and a lysine residue penetrates into the selectivity filter, with the terminal amine coordinated by carbonyls, partially disrupting the outermost ion-binding site. In the remainder of the filter two densities of bound ions are observed, rather than three as observed with other toxin-blocked Kv channels. Second, a structure of Kv1.2 in Na+ solution does not show collapse or destabilization of the selectivity filter, but instead shows an intact selectivity filter with ion density in each binding site. We also attempted to image the C-type inactivated Kv1.2 W366F channel in Na+ solution, but the protein conformation was seen to be highly variable and only a low-resolution structure could be obtained. These findings present new insights into the stability of the selectivity filter and the mechanism of toxin block of this intensively studied, voltage-gated potassium channel.

Autores: Fred J Sigworth, Y. Wu, Y. Yan, Y. Yang, S. Bian, A. Rivetta, K. Allen

Última atualização: 2024-03-19 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.06.02.543446

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.06.02.543446.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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