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# Biologia# Biologia molecular

Avanços em Genética de Levedura com o Sistema pSPObooster

Novos métodos aumentam a eficiência da reprodução de leveduras para pesquisa genética.

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O fermento de padeiro, conhecido como Saccharomyces cerevisiae, tem sido um baita aliado na pesquisa científica por muitos anos. Esse fermento é super usado porque tem várias ferramentas disponíveis pra estudar sua genética. Uma das primeiras linhagens desse fermento a ter seu código genético todo sequenciado foi a S288C. Os cientistas geralmente usam linhagens que vêm da S288C pra muitos tipos de pesquisa. Mas, essas linhagens de fermento têm um problema: elas não se reproduzem bem durante um processo especial chamado meiose. Isso pode dificultar certos experimentos, especialmente em áreas como genética e envelhecimento.

O Problema com as Linhagens de Fermento

As linhagens derivadas da S288C, como BY4741 e BY4742, costumam ter dificuldades com a meiose. Essa limitação reduz sua utilidade em várias áreas de pesquisa. Os cientistas têm estudado os motivos genéticos por trás desse desempenho fraco e descobriram que certas mudanças no DNA dessas linhagens de fermento são as culpadas. Especificamente, três genes foram identificados como responsáveis por isso: RME1, MKT1 e TAO3. Alterações na sequência de DNA desses genes levam a uma capacidade reduzida de o fermento se reproduzir de forma eficaz.

Por exemplo, no gene RME1, uma mudança específica na sequência de DNA aumenta a expressão desse gene, o que impede que a meiose aconteça como deveria. Da mesma forma, alterações nos genes MKT1 e TAO3 também atrapalham os processos necessários pra uma esporulação bem-sucedida. Como resultado, corrigir essas mudanças nos genes pode melhorar muito a eficiência de esporulação das linhagens de fermento.

Melhorando a Eficiência de Esporulação

Nos últimos anos, os cientistas têm trabalhado pra resolver os problemas relacionados à esporulação nas linhagens de fermento. Ao corrigir as mudanças genéticas em RME1, MKT1 e TAO3, os pesquisadores conseguiram aumentar bastante a capacidade de reprodução do fermento. Uma nova linhagem de laboratório, chamada de linhagem DHY, foi criada fazendo essas correções junto com alterações adicionais pra melhorar a robustez geral do fermento. No entanto, como essa linhagem tem várias mudanças genéticas, não é fácil cruzá-la com as linhagens padrão de laboratório.

Isso levou ao desenvolvimento de um novo sistema chamado pSPObooster. O principal objetivo do pSPObooster é facilitar a melhoria da esporulação em linhagens de fermento derivadas de S288C. Esse sistema usa uma peça circular especial de DNA chamada plasmídeo, que carrega as versões corrigidas dos genes MKT1 e RME1. O plasmídeo pode ser facilmente introduzido no fermento, seja como uma peça separada de DNA ou integrado ao seu material genético.

Testando o Sistema pSPObooster

Pra ver se o pSPObooster pode realmente melhorar a esporulação, os cientistas introduziram esse plasmídeo nas linhagens BY4741 e BY4742. Eles então deixaram as células de fermento se reproduzirem sob condições controladas. Os resultados mostraram que as linhagens de fermento com o plasmídeo pSPObooster conseguiram esporular muito mais efetivamente do que as linhagens sem ele.

Após apenas três dias em um ambiente especial projetado pra promover a esporulação, as células contendo pSPObooster mostraram um aumento de 13 vezes na eficiência de esporulação em comparação com as linhagens padrão. Isso permite que os pesquisadores obtenham resultados melhores em seus experimentos e conduzam estudos adicionais de forma mais confiável.

Usando pSPObooster para Experimentos de Alto Rendimento

Uma das grandes vantagens do sistema pSPObooster é sua compatibilidade com experimentação em alto rendimento. Métodos de alto rendimento permitem que os cientistas realizem muitos testes de forma rápida e eficiente. Com o pSPObooster, os pesquisadores conseguiram otimizar o processo de testes e manipulações genéticas em fermento.

Por exemplo, uma técnica chamada tecnologia de Array Genético Sintético (SGA) foi usada pra estudar interações genéticas envolvendo um gene específico conhecido como POL32. Os pesquisadores transformaram linhagens de fermento com o pSPObooster e depois avaliaram quão bem essas linhagens se saíram em termos de interações genéticas. Os resultados indicaram que as linhagens com pSPObooster produziram colônias maiores do que aquelas sem ele, independentemente do tempo destinado à esporulação.

Isso sugere que o pSPObooster não só acelera o processo de esporulação, mas também melhora o desempenho geral do fermento em triagens de alto rendimento. Ao permitir uma maior eficiência nas manipulações genéticas, o pSPObooster pode ajudar os pesquisadores a descobrir novas interações e relações genéticas.

Conclusão

O desenvolvimento do sistema pSPObooster representa um avanço significativo no estudo da genética de fermentos. Com sua capacidade de aumentar a eficiência de esporulação e facilitar experimentos de alto rendimento, ele oferece aos pesquisadores uma ferramenta poderosa para seus estudos. Esse sistema abre portas pra manipulações genéticas mais eficientes, levando a uma melhor compreensão do fermento e suas aplicações em várias áreas científicas.

Resumindo, o sistema de plasmídeo pSPObooster aborda as limitações enfrentadas pelas linhagens de laboratório tradicionais derivadas da S288C. Ao corrigir os problemas genéticos subjacentes, ele permite uma melhor reprodução do fermento, que é crucial em muitas áreas da pesquisa. Agora, os pesquisadores podem esperar obter resultados mais confiáveis em seus estudos genéticos, abrindo caminho pra novas descobertas na biologia do fermento.

Fonte original

Título: pSPObooster: a plasmid system to improve sporulation efficiency of Saccharomyces cerevisiae lab strains

Resumo: Common S. cerevisiae lab yeast strains derived from S288C have meiotic defects and therefore are poor sporulators. Here, we developed a plasmid system containing corrected alleles of the MKT1 and RME1 genes to rescue the meiotic defects and show that standard BY4741 and BY4742 strains containing the plasmid display faster and more efficient sporulation. The plasmid, pSPObooster, can be maintained as an episome and easily cured or stably integrated into the genome at a single locus. We demonstrate the use of pSPObooster in low- and high-throughput yeast genetic manipulations and show that it can expedite both procedures without impacting strain behavior. Take AwayO_LIpSPObooster contains corrected alleles or RME1 and MKT1. C_LIO_LIpSPObooster can be maintained as an episome or integrated. C_LIO_LIpSPObooster increases sporulation efficiency by up to 13-fold. C_LIO_LIpSPObooster can be used to speed up high-throughput yeast strain engineering. C_LI

Autores: Raphael Loll-Krippleber, Y. K. Jiang, G. W. Brown

Última atualização: 2024-03-20 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.20.586023

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.20.586023.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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