Elementos Transponíveis: Jogadores Chave no Desenvolvimento de Zebrafish
Pesquisas mostram os papéis dos elementos transponíveis no desenvolvimento de embriões de zebrafish.
― 6 min ler
Índice
Elementos Transponíveis (ETs) são pedaços de DNA que aparecem em quase todos os seres vivos. Eles podem compor uma grande parte do material genético em alguns organismos, variando de 5% a 90%. Esses elementos conseguem se mover dentro do genoma, o que pode causar mudanças na estrutura do DNA. Esse movimento pode levar a mutações e deixar o genoma instável.
Por muitos anos, os cientistas acharam que os ETs eram só entidades egoístas, mais preocupadas com a própria sobrevivência e replicação. Eles pensavam que os ETs ficavam se copiando sem oferecer nenhum benefício ao organismo que os hospedava. No entanto, descobertas recentes mostraram que, quando os ETs se fixam no lugar dentro do genoma, eles podem, na verdade, ajudar na formação de novos genes e sequências reguladoras que ajudam o organismo anfitrião a funcionar direitinho.
Embora os cientistas tenham visto ETs sendo usados de várias maneiras ao longo da evolução, ainda tem muito a aprender sobre como esse processo começa. A maioria das pesquisas focou em ETs antigos que pararam de se mover. Recentemente, porém, surgiram descobertas que ETs jovens e ativos podem ter papéis importantes nas células. Isso desafia a ideia de que os ETs são apenas prejudiciais e apoia a noção de que eles podem ter relações cooperativas com os organismos que os hospedam.
Entendendo Bik-1 e Bik-2 no Desenvolvimento de Zebrafish
Um tipo interessante de ET é chamado de Bik-1. Esse ET é pensado como ativo no zebrafish, um organismo modelo usado para estudar o desenvolvimento inicial. Os cientistas descobriram que certos ETs, incluindo Bik-1, são expressos durante o desenvolvimento dos embriões de zebrafish. Isso sugere que eles podem ser importantes para o desenvolvimento normal e não apenas para seu próprio benefício.
A família de ETs Bik-1 inclui sequências que são encontradas no mesendoderma e nas linhagens da crista neural (CN) durante o desenvolvimento embrionário. Enquanto os cientistas usaram Bik-1 e sequências relacionadas como marcadores para certos tipos celulares, o papel real das proteínas que codificam não foi estudado a fundo.
Bik-1 é uma das várias famílias de sequências semelhantes que estão no genoma do zebrafish. Bik-1 contém partes que se pensa ajudar na formação de uma proteína chamada Gag. Essa proteína é importante para a estrutura dos retrovírus, que são vírus que inserem seu material genético no DNA do hospedeiro.
Pesquisa sobre Bik-1 e Seu Papel nos Embriões de Zebrafish
Para entender melhor o Bik-1, os pesquisadores estudaram sua história no zebrafish. Eles encontraram 196 inserções de Bik-1 no genoma do zebrafish. Algumas dessas inserções eram cópias inteiras com todas as partes intactas, enquanto outras estavam quebradas ou incompletas. Os pesquisadores analisaram essas inserções para ver como mudaram ao longo do tempo e se ainda estavam ativas.
Comparando diferentes linhagens de zebrafish, os pesquisadores perceberam que as inserções de Bik-1 variavam, indicando que ainda estavam mudando na população. O aparecimento de novas inserções mostra que Bik-1 pode se mover dentro do material genético dos zebrafish.
Para ver se Bik-1 era importante para o desenvolvimento, os pesquisadores usaram uma técnica especial para reduzir a quantidade de mRNA de Bik-1 nos embriões de zebrafish. Eles descobriram que essa redução causou problemas significativos de desenvolvimento nos embriões. A maioria dos embriões mostrou sinais claros de problemas de desenvolvimento, como corpo encurtado e organização celular anormal.
Em um estudo de acompanhamento, os pesquisadores confirmaram que os problemas vistos nos embriões eram devido aos baixos níveis de Bik-1. Eles usaram diferentes métodos para aumentar a expressão de Bik-1, o que ajudou a resolver alguns dos problemas de desenvolvimento. Isso indica que a proteína Gag produzida por Bik-1 é importante para o desenvolvimento adequado.
Proteína Gag do Bik-1 e Seus Efeitos
Os pesquisadores descobriram que a proteína Gag do Bik-1 tende a se localizar na membrana externa das células, assim como outras proteínas envolvidas na adesão celular. Isso levou a pensar que Bik-1 poderia influenciar como as células se grudam e como migram durante o desenvolvimento.
Em experimentos adicionais, os cientistas introduziram a proteína Gag do Bik-1 em embriões de galinha. Como as galinhas não têm os mesmos ETs que os zebrafish, foi um bom modelo para ver como a proteína Gag do Bik-1 afetava o desenvolvimento. Eles descobriram que a superexpressão da Gag do Bik-1 atrapalhou o desenvolvimento normal do tubo neural, que é crucial para a formação do cérebro e da medula espinhal.
A introdução da Gag do Bik-1 afetou como as células se moviam dentro dos embriões, levando a problemas com a migração celular. Semelhante aos problemas encontrados em zebrafish, esses resultados sugerem que a função da Gag do Bik-1 é essencial para o desenvolvimento adequado entre espécies.
Explorando Bik-2 e Seu Papel
Depois de estudar o Bik-1, os pesquisadores voltaram sua atenção para o Bik-2, um ET relacionado no zebrafish que afeta diferentes tipos de células, especificamente a crista neural. A proteína Gag do Bik-2 também é crucial para o desenvolvimento celular, apoiando a ideia de que ETs podem ter papéis cooperativos em seus organismos hospedeiros.
Os pesquisadores projetaram experimentos específicos para ver se a proteína Gag do Bik-2 era necessária para a migração das células da crista neural. Eles descobriram que a interrupção da expressão do Bik-2 causou padrões anormais de movimento celular, indicando ainda mais que tanto o Bik-1 quanto o Bik-2 são vitais para o desenvolvimento inicial nos zebrafish.
Importância das Descobertas
A pesquisa sobre Bik-1 e Bik-2 mostra que alguns elementos transponíveis não são apenas pedaços passivos de DNA, mas podem participar ativamente de vários processos de desenvolvimento. Essas descobertas desafiam crenças que eram tão firmes sobre a natureza dos ETs. Em vez de serem vistos como meros elementos genéticos egoístas, ETs ativos como Bik-1 e Bik-2 podem ter papéis essenciais e benéficos no desenvolvimento de organismos multicelulares.
A ideia de que os ETs podem ter papéis tão significativos levanta questões sobre seu impacto evolutivo. A relação entre os ETs e seus hospedeiros pode ser mais cooperativa do que se pensava anteriormente, levando a descobertas sobre como os organismos evoluem e se adaptam.
Resumindo, estudar ETs como Bik-1 e Bik-2 revela uma interação complexa onde esses elementos podem moldar o desenvolvimento do organismo anfitrião e se tornar parte de processos biológicos cruciais. A pesquisa contínua nessa área pode levar a novas compreensões sobre genética, evolução e biologia do desenvolvimento.
Título: Gag proteins encoded by endogenous retroviruses are required for zebrafish development
Resumo: Transposable elements (TEs) make up the bulk of eukaryotic genomes and examples abound of TE-derived sequences repurposed for organismal function. The process by which TEs become coopted remains obscure because most cases involve ancient, transpositionally inactive elements. Reports of active TEs serving beneficial functions are scarce and often contentious due to difficulties in manipulating repetitive sequences. Here we show that recently active TEs in zebrafish encode products critical for embryonic development. Knockdown and rescue experiments demonstrate that the endogenous retrovirus family BHIKHARI-1 (Bik-1) encodes a Gag protein essential for mesoderm development. Mechanistically, Bik-1 Gag associates with the cell membrane and its ectopic expression in chicken embryos alters cell migration. Similarly, depletion of BHIKHARI-2 Gag, a relative of Bik-1, causes defects in neural crest development in zebrafish. We propose an "addiction" model to explain how active TEs can be integrated into conserved developmental processes.
Autores: Cédric Feschotte, N.-C. Chang, J. N. Wells, A. Y. Wang, P. Schofield, Y.-C. Huang, V. H. Truong, M. Simoes-Costa
Última atualização: 2024-03-25 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.25.586437
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.25.586437.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.
Obrigado ao biorxiv pela utilização da sua interoperabilidade de acesso aberto.